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GOCI数据下载
解决 seaborn 报错 URLError: <urlopen error [WinError 10060] 由于连接方在一段时间后没有正确答复或连接的主机没有反应,连接尝试失败。>
导入数据集时报错解决方法根据seaborn的使用手册,需要的数据集可以从https://github.com/mwaskom/seaborn-data下载,无法导入数据是因为,电脑无法访问该网址,此时可将
数据下载
到本地
__744
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2023-04-14 03:31
机器学习
数据分析
如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据(somatic mutation)
前面给大家介绍了新版的TCGA数据库,通过文字和视频给大家讲解了如何从TCGA数据库下载RNAseq数据和miRNAseq数据☞新版TCGA数据库RNAseq
数据下载
☞新版TCGA数据库miRNA
数据下载
以及如何合并成矩阵
生信交流平台
·
2023-04-13 12:52
新版TCGA中RNAseq数据基因名居然有重复?!
小编也是在第一时间给大家展示了TCGA数据库的变化,用图文的方式详细介绍了新版TCGA数据库RNAseq
数据下载
方法。
生信交流平台
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2023-04-13 08:34
RNA-seq入门实战(一):上游
数据下载
、格式转化和质控清洗
RNA-seq入门实战整体分析流程本节概览:1.在文章中找到GEOaccessionnumber,从NCBI获取数据SRR号2.在linux中使用prefetch命令根据SRR号下载SRA文件3.使用fasterq-dump/fastq-dump命令将SRA文件转为FASTQ格式,pigz软件多线程压缩(可选)4.使用fastqc和multiqc进行测序数据的质控查看5.使用trim-galore
嘿嘿嘿嘿哈
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2023-04-12 12:16
TCGA
数据下载
工具
简介在前一篇文章中,小编和大家分享了GEO数据的下载方法,作为GEO数据的姊妹篇,TCGA数据库中的数据也是生信分析常用的数据之一。TCGA(TheCancerGenomeAtlas)是由NationalCancerInstitute(NCI,美国国家癌症研究所)和NationalHumanGenomeResearchInstitute(NHGRI,国家人类基因组研究所)合作,在2006年建立的癌
xw_欢乐豆
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2023-04-12 11:44
跟着Nature microbiology学画图:R语言pheatmap包画热图展示密码子RSCU值
EvolutionaryoriginsoftheSARS-CoV-2sarbecoviruslineageresponsiblefortheCOVID-19pandemicimage.png本地文件s41564-020-0771-4.pdf代码和
数据下载
链接
小明的数据分析笔记本
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2023-04-12 09:45
【数据分析师-数据分析项目案例二】泰坦尼克号生还者预测案例
泰坦尼克号生还者预测案例1数据1.1
数据下载
1.2数据字段介绍2数据加载和基本的ETL2.1模块导入和数据加载2.2数据清洗2.2.1缺失值处理2.2.2分类数据独热编码和数值数据分箱3数据探索式分析3.1
百木从森
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2023-04-12 05:36
数据分析师
python
机器学习
事故预测
分类
kaggle
RNA-seq从入门到自闭(
数据下载
)
使用TBtools,大家可以轻松从NCBI和ENA获得文件的下载地址。接下来就是下载SRA文件。sra文件的下载方式有很多种,你可以用迅雷离线拖,百度离线下载,也可以用选择网页下载。在这里我简单介绍上述方法外的三种下载方式。1.wget下载wget是linux下常用的下载方式,首先你需要安装linux。如果你是win10系统,把系统升级到最新版也能安装一个linux系统。具体安装方法可以参考下面的
邵扬_Barnett
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2023-04-11 18:24
mac下如何使用ENA File Downloader与Aspera下载相关文件
EMBL-EBI
数据下载
本人的电脑系统为Macos12准备工作ENAFileDownloader软件下载ENAFileDownloader[https://github.com/enasequence/
我的大宝剑
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2023-04-10 19:47
基础 | Pyecharts绘图基础之图例配置项--LegendOpts
文章目录️LegendOpts基本参数1.默认参数实例2.设置参数实例️更多设置实例(源码+
数据下载
)大家好,我是【Python当打之年(点击跳转)】今天给大家介绍pyecharts绘图中常见的图例配置项设置
Python当打之年
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2023-04-10 17:02
Pyecharts基础
python
前端
开发语言
Pandas+Pyecharts | 全国吃穿住行消费排行榜,最‘抠门’的地区居然是北京!!!
全国各地区人均可支配收入地图3.3全国各地区消费支出占比地图3.4‘衣’-全国衣着消费排行榜3.5‘食’-全国吃货大省排行榜3.6‘住’-全国住房消费排行榜3.7‘行’-全国交通消费排行榜️可视化源码+
数据下载
大家好
Python当打之年
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2023-04-10 17:32
Pyecharts系列
Python可视化系列
pandas
python
数据分析
使用GIS空间分析进行植物生长区域选址(附练习
数据下载
)
经过观察可以发现某种珍贵植物在山区的某个区域位置生长状况明显要比其他区域好很多,通过研究了解到这种植物生长具有严格的生长条件。为了能更好地保护该种植物的生长环境,现在需要使用GIS空间分析方法,将适合植物生长的区域找出来。需要的数据包括该山区的等高线数据和山区若干观测点采集的年平均温度和年总降水数据。植物生长条件主要包括4个:(1)这种植物一般生长在河流两侧500m的区域内;(2)这种植物喜阴;(
GIS前沿
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2023-04-10 07:48
arcgis
gis
windows下使用word2vec训练维基百科中文语料全攻略!(一)
训练
数据下载
我们使用维基百科训练词向量,维基百科数据的下载地址为:https://dumps.wikimedia.org/zhwiki/lates
LeadAI学院
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2023-04-10 06:10
springboot 启动加载数据 commandLineRunner
项目启动时,我们需要加载一些数据或启动定时任务执行
数据下载
或同步,此时可以用到commandLineRunner类。
茶本无香
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2023-04-10 05:58
spring
boot
合并新版TCGA表达矩阵R代码叒更新了—基因名字也给你提出来
TCGA数据库在2022年4月初进行更新之后,小编第一时间给大家展示了TCGA数据库的变化,用图文的方式详细介绍了新版TCGA数据库RNAseq
数据下载
方法。
生信交流平台
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2023-04-09 19:40
ArcGIS批量栅格重采样(ArcPy方法)
本系列文章的开发环境为:ArcGIS10.2.2+Python2.7、ENVI5.3+IDL8.5ArcGIS批量计算栅格数据平均值(ArcPy方法)GLDAS
数据下载
及处理(NC转TIF)ArcGIS
bestYou_
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2023-04-09 17:11
遥感
ArcGIS
ArcPy
ArcPy
遥感
栅格重采样
重采样
栅格数据处理
GEO数据库视频学习笔记(芯片
数据下载
和数据读取)
之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这个数据库。趁着还没复工,再多学一点新知识~这次的笔记是生信技能树的视频笔记,视频是对公众开放的,地址如下:生信技能数b站视频地址:https://space.bilibili.com/338686099/channel/detail?cid=95141视频还是很浅显易懂的,写这个笔记的
生信start_site
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2023-04-09 07:06
在Arcgis中对nc格式的气象数据处理方法
Arcgis中对nc格式的气象数据处理的方法:以国家地球系统科学数据中心的《1901-2021年中国1km分辨率逐月降水量数据集》为例更多教程:树谷资料库资源大全(3月16日更新)(1)
数据下载
链接:http
树谷-胡老师
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2023-04-09 06:22
教程
arcgis
手把手教你用nodejs 模拟人工输入账号密码自动登录,爬取网页数据生成xlsx
这时候想把这些数据全部放在xlxs里,手动的话,得一条一条复制就是有200条信息,你也得复制2-3小时,但是用本程序,可以自动批量把数据导入到xlsx,只要你运行程序,数秒就把
数据下载
qq1520869979
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2023-04-09 01:23
了不起的nodejs
node.js
爬虫
2021-02-24--TCGA 拷贝数变异数据分析
GISTIC2分析TCGA拷贝数变异数据及可视化全过程一、
数据下载
1、Segment_data
数据下载
TCGA官网下载下载地址它有如下CNV类型,而在TCGA数据库里面我们通常关心的是somaticCNV
FFwizard
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2023-04-08 19:47
KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载
KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载KEGGpathwayKEGG数据库pathway相关
数据下载
我们下载KEGG数据库的目的是为了研究目标蛋白参与了那些pathway。
赵会成
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2023-04-08 07:05
AIS
数据下载
该网址可以免费下载美国及其国际海域的船舶AIS数据https://marinecadastre.gov/ais/
网格小生
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2023-04-08 06:54
GIS
c++
CMIP6
数据下载
之前没有用过模式数据,因此记录一下首先下载可以用这个网站CMIP6Homepage下面红框的四个网站可以任意选择之后选择参数,我用到的是分辨率,experimentID,frequency,和变量但是我之后发现这里下载下的不快,而且有时候下载不下来。然后我就换了个网站https://data.ceda.ac.uk/badc/cmip6/data/CMIP6/CMIP/AWI/AWI-CM-1-1-
就是一只白
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2023-04-08 06:12
download
CMIP6
AIS
数据下载
并处理(python)
最近由于项目需求,需要下载AIS数据,其实也就是船舶位置数据。首先通过百度发现目前一些网站下载的AIS数据都是收费的,如船达通等等。船达通是只能查找近一个月的船舶轨迹信息,下载需要支付收费。但是最后我终于找到了一个免费下载AIS数据的网站,并且下面附上了处理说明,可以通过python代码批量处理通过以下的文档可以详细了解如何下载数据,将AIS数据中的时间、经度、纬度、航速提取出来。最后通过ArcM
就是一只白
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2023-04-08 06:07
data
process
arcgis
python
python
ais
arcgis
转录组实战01: 从
数据下载
到定量fastp+STAR
生信交流与合作请关注公众号@生信探索01.建立工作目录cd ~mkdir -p Project/Human_16_Asthma_Bulkcd Project/Human_16_Asthma_Bulk# 建立数据存放目录 datamkdir -p data/rawdata data/cleandata/fastp# 建立STAR目录mkdir STAR02.环境准备micromamba creat
生信探索
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2023-04-07 18:40
程序人生
R代码合并TCGA体细胞突变数据
☞新版TCGA数据库RNAseq
数据下载
☞新版TCGA数据库miRNA
数据下载
无论是RNAseq,miRNAseq还是体细胞突变
生信交流平台
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2023-04-06 10:05
StaMPS中使用GACOS数据进行大气校正,解缠、计算形变速率
StaMPS中使用GACOS数据进行大气校正1GACOS
数据下载
2查看GACOS用法3在StaMPS中使用GACOS进行大气校正4stamps6相位解缠stamps7时间形变速率5制图1GACOS
数据下载
Vigo*GIS_RS
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2023-04-06 01:46
StaMPS
#
InSAR
stamps
PSInSAR
GACOS
[R]TCGAbiolinks包:数据准备--query、download、prepare
TCGAbiolinks包是一站式分析TCGA数据的R包工具,它集成了TCGA
数据下载
、分析、可视化的全部流程。此次系列笔记主要跟着TCGAbiolinks帮助文档重新学习下TCGA数据挖掘流程。
小贝学生信
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2023-04-05 23:50
GEO数据库视频学习笔记(差异分析、可视化、GSEA)
笔记回顾:1.GEO数据库视频学习笔记(芯片
数据下载
和数据读取)2.GEO数据库视频学习笔记(ID转换)3.GEO数据库视频学习笔记(了解你的表达矩阵)这一讲的视频地址是:[https://www.bilibili.com
生信start_site
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2023-04-05 21:43
Python-爬虫-凯斯西储轴承
数据下载
1.背景久闻凯斯西储数据集大名,最近开了个新坑,打算用CWRU数据做一下验证,网上简单搜了一下没有找到现成的数据,遂前往官网手动下载然后手动命名。在下载十几个数据之后,忽然想起为什么不用python来下载?本文提供了python下载CWRU数据的程序,以及汇总数据。(后话)下载完才发现有几个百度云资源,这里一并整理在“4.数据集下载”中。2.工具python+re+request3.程序impor
猫猫丸
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2023-04-05 19:39
python
制造
1.基于深度学习的轴承故障诊断--凯斯西储大学轴承数据集介绍
本章主要介绍来自凯斯西储大学的轴承实验
数据下载
地址西储大学下载地址:http://csegroups.case.edu/bearingdatacenter/pages/download-data-file
秋雨行舟
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2023-04-05 19:57
基于深度学习的轴承故障诊断
cnn
人工智能
神经网络
利用R包TCGAbiolinks进行各种
数据下载
TCGAbiolinks的优点在于具备一体化的下载整合,无需再使用复杂的方法对下载的单个数据重新进行整合,换句话说,就是TCGAbiolinks包下载的数据是合并了的,不需要整理(TCGAbiolinks
数据下载
生信start_site
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2023-04-05 05:27
NASA EARTHDATA GES DISC不用爬虫基于插件DownThemAll批量下载数据
NASAEARTHDATAGESDISC不用爬虫批量下载
数据下载
插件DownThemAll找到数据集下载链接列表启动插件由于NASAEARTHDATAGESDISC的数据集需要登录下载,使用爬虫下载不仅需要获取
冬_冬_
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2023-04-05 04:28
笔记
爬虫
chrome
大数据
gis
download
PowerBI基础 ——第三天 分组求和summarizecolumns等同于SQL中的分组汇总group by
本文的
数据下载
地址:https://download.csdn.net/download/weixin_44435602/161285641、从官方给出summarizecolumns的解释:返回组组的摘要表语法
骑士坑天下
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2023-04-05 04:56
PowerBI入门
分组求和
powerbi
去重
NASA
数据下载
文档
第一页中:导入研究区范围SHP—在这个页面最下方可以调节云量和日期1990,1998年选Landsat4,52006年选Landsat72014,2022年选Landsat8第二页选择需要的产品数据—Landsatlevel2第三页不管第四页就开始显示结果下载即可
借巨塔许愿望
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2023-04-05 04:44
数据下载
时序数据库
大数据
地球物理及空间物理相关
数据下载
总结了一些常用的
数据下载
地址(持续更新ing…)。
IGSzt
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2023-04-04 12:37
电离层数据下载
日地物理数据下载
非相干散射雷达
数据库
matlab怎样获取输出文件_MATLAB处理CMIP5模式输出数据(NetCDF格式),附
数据下载
地址和M文件代码...
CMIP5是世界气候研究项目(WorldClimateResearchProgramme,WCRP)组织的第5次气候模式对比计划(CoupledModelIntercomparisonProject5)。目前,该项目(WCRP)正在开展第6次气候模式对比计划(CMIP6)。其中,来自全球各国家的46个气候模式参加了CMIP5,这些气候模式输出的二维气候变量约有40个左右,像表面温度(ts),海平面
Yao King
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2023-04-04 09:00
matlab怎样获取输出文件
CMIP6
数据下载
教程大全(含批量)
CMIP6
数据下载
教程大全(含批量)注意:CMIP6数据网站属国外网站,比较卡,需耐心等待及其下载。
长安归故里啊
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2023-04-04 09:49
未来气候
CMIP6
栅格数据
跟着Nature microbiology学作图:R语言ggplot2做簇状柱形图并在坐标轴添加分组标记
EvolutionaryoriginsoftheSARS-CoV-2sarbecoviruslineageresponsiblefortheCOVID-19pandemicimage.png本地文件s41564-020-0771-4.pdf代码和
数据下载
链接
小明的数据分析笔记本
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2023-04-03 23:10
利用scanpy进行单细胞测序分析(一)预处理和聚类
https://scanpy-tutorials.readthedocs.io/en/latest/pbmc3k.html这个软件的官网分了几个部分进行介绍,每一个部分的练习数据都不一样,这一部分的练习
数据下载
地址
生信start_site
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2023-04-03 20:41
转录组实战之SRA
数据下载
(上) 2019-05-07
数据下载
两种方式打开链接,下载id:https://www.ncbi.nlm.nih.gov//geo/query/acc.cgi?
Bio小盼
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2023-04-03 19:17
数据获取及处理
AD%E4%B8%80%E4%B8%AA%E5%AE%8C%E6%95%B4%E7%9A%84%E8%BD%AC%E5%BD%95%E7%BB%84%E9%A1%B9%E7%9B%AE/听张旭东老师的课
数据下载
工具
嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀
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2023-04-02 23:00
单细胞测序分析: Seurat V3联合harmony进行单细胞数据整合分析
HarmonyintegratesspatiallyresolvedtranscriptomicwithdissociatedscRNAseqdatasets#R包导入library(Seurat)library(cowplot)library(harmony)#数据
数据下载
JeremyL
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2023-04-02 12:52
m6A原始数据识别差异甲基化——使用RADAR分析MeRIP-seq数据
www.ebi.ac.uk/ebisearch/error.ebi数据展示:双末端:SRR7763560_1.fastq.gzSRR7763560_2.fastq.gz;单末端:SRR9029562.fastq.gz
数据下载
Apache_lin
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2023-04-02 12:03
《ArcGIS Runtime SDK for Android开发笔记》——离在线一体化技术:离线矢量
数据下载
【原文链接:http://www.cnblogs.com/gis-luq/p/5858048.html】1、前言1.1、环境准备:ArcGISforDesktop10.4.1(10.2.1以上版本即可)ArcGISforServer10.4.1(10.2.1以上版本即可)PostgreSQL、MicrosoftSQLServer、或Oracle设置企业级地理数据库。1.2、发布具有同步能力的Fea
duyi324
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2023-04-02 09:36
osm
数据下载
【附实例】
目录1.OSM官网下载数据集1.1直接导出(不推荐)1.2其他摘录OSM数据的网站2.通过QGIS插件下载(推荐推荐推荐)2.1下载并安装QGIS软件2.2插件使用方法3.通过Arcgis工具箱下载4.小结1.OSM官网下载数据集1.1直接导出(不推荐)直接进入OSM主页面点击导出数据。缺点:无法根据行政区划导出数据; 导出数据格式为.osm无法直接添加到arcgis中进行处理1.2其他摘录O
我是个烧饼啊
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2023-04-02 01:35
学习
arcgis
gis
qgis
hive:表数据从一台机器导入到另一台机器的 hive 中
hive:表数据从一台机器导入到另一台机器的hive中1进入老机器目录新建dirTmp文件夹2原机器中
数据下载
到本地3打包文件4文件传输到新机器5解压文件6创建hive表,并指定hdf目录和分割方式7将文件传到新机器
小何才露尖尖角
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2023-04-02 00:11
Hive
hive
hadoop
大数据
数据迁移
hive表
chip-seq数据分析流程
chip-seq数据分析流程1.chip-seq
数据下载
及更换名称1.1.根据文献提供的ncbi的编号,下载sra数据。1.2.更换文件名:更换后的文件名能表明数据所对应的实验组。
梁兄_小白
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2023-04-01 17:46
天涯论坛——python可视化(kmeans聚类+情感分析)(三)
通过使用pyecharts实现数据分析
数据下载
:https://download.csdn.net/download/weixin_43906500/14141832使用的情感分析库:https://github.com
金鳞本鲤
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2023-04-01 12:41
态势感知
合并新版TCGA表达矩阵R代码叕更新了—RNA类型也给你提出来
TCGA数据库在2022年4月初进行更新之后,小编第一时间给大家展示了TCGA数据库的变化,用图文的方式详细介绍了新版TCGA数据库RNAseq
数据下载
方法。
生信交流平台
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2023-04-01 10:09
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