Hmisc

R语言画相关性热图

R语言进行聚类热图install.packages("corrplot2")install.packages("Hmisc")install.packages("pheatmap")library(Hmisc
还没秃头的程序猿-D·2024-02-19 14:02

使用R时出现警告：The following objects are masked from ‘package:base’: format.pval, units

在使用R下载一个程序包的时，有时候会出现这种情况：原因：这里的mask本意是“面罩”，引申“掩饰”，就是说有A包掩饰了B包（不一定B包时你需要的），只是系统在调取这个Hmisc包时，至少有A、B两个package
宽嘴鱼汤·2024-01-29 14:04

微生物组学中的相关

2Hmisc包的rcorr可以计算matrix之间两两的相关系数。3ppcor可以计算偏相关系数。4mentel.rtest可以计算矩阵之间的相关。
yilunanxia·2024-01-11 12:25

6_ggplot可视化addmodule得到的炎症评分自己选择颜色 自定义更改显示的颜色 seurat得到的单细胞数据

6_ggplot可视化addmodule得到的炎症评分自己选择颜色ggplot自定义更改显示的颜色library(Hmisc)library(patchwork)library(ggplot2)library
生信小博士·2023-11-03 01:15

记一次用ggplot2做双因素条形（Bar）图+显著性p值+errorbar

2导入数据集从spss导入数据集，同时加载相关R包，代码如下：library(ggplot2)library(ggsignif)#添加显著性library(Hmisc)#利用该包的SPSS.get函数从
捣乱_Psy·2023-10-12 22:56

Hmisc包函数（变量名批量修改、变量标签、变量描述性统计）

Hmisc包函数1、upData函数（批量重命名变量）upData(object,...,subset,#相当于对于数据变量的筛选/条件判断表达式；rename,#批量名称/变量名修改；drop,#去掉数据中的哪些变量
LEEBELOVED·2023-09-21 01:45

2021-08-01 R语言相关系数

source=rssinstall.packages("Hmisc")install.packages("ggplot2")library(Hmisc)library(ggplot2)导出：logout
L6511·2023-09-09 15:30

2021-08-01 变量选择

考虑p值library(Hmisc)res0.5)|all(Var_Cor%createDataPartition(p=0.8,list=FALSE)train.data%predict(test.data
L6511·2023-06-18 22:35

使用R中ggplot2和Hmisc绘制带误差线的柱状图

>BiocManager::install("Biobase",version="3.8")>library("Hiiragi2013")>data("x")>dim(Biobase::exprs(x))>selectedProbes=c(Fgf4="1420085_at",Gata4="1418863_at",+Gata6="1425463_at",Sox2="1416967_at")>libr
热衷组培的二货潜·2023-03-19 05:45

【简单掌握】不同基因表达间的相关系数计算及作图

atestdata#cor，只能得到相关系数cor_dat=cor(atestdata,use="all.obs",method="pearson")#rcorr得到相关系数andP值library(Hmisc
yadandb·2023-03-17 06:32

ComplexHeatmap相关性分析绘制热图

加载包、数据使用Hmisc包rcorr()函数计算一个矩阵的所有可能的列的皮尔逊或斯皮尔曼相关系数，对于大量的基因数据，该方法非常快。ComplexHeatmap制作热图。
像鸟一样飞过你的高山·2023-02-06 09:59

R语言caret包的安装问题

我不知道应该更新哪些包，直接将所有下载的包都更新了，更新之后顺利安装了caret包备注：已经下载的包除了Rstudio自带的包还有ggplot2、VIM、rpart、randomForest、pROC、Hmisc
姜姜是社会好青年·2023-01-21 01:22

R语言安装第三方包

一点点学哈比如要安装Hmisc这个包，那么安装的代码就是：install.packages("Hmisc")
呆萌的代Ma·2023-01-05 23:37

missForest的R实现

在R中，能处理缺失值的包有很多，比如VIM,mice,Amelia,missForest,Hmisc,mi,等等，那为什么本文偏偏选择missForest作为处理包呢？
一个人旅行*-*·2023-01-05 23:05

R语言处理缺失数据的5个常用包

R语言处理缺失数据的5个常用包1.常用缺失数据处理包2.MICE包2.1基本介绍2.2实例展示3.Amelia包3.1基本介绍3.2实例展示4.missForest包4.1基本介绍4.2实例展示5.Hmisc
shlay·2023-01-05 23:01

R语言绘图基础教程

R语言绘图基础教程一、R语言绘图初阶首先下载包，绘制一张图：#install.packages(c("Hmisc","RColorBrewer"))#install.packages(c("vcd","
Annaaphq·2022-12-24 08:28

R语言数据相关性分析（相关系数和p值）及可视化

此篇为转载R语言学习笔记之相关性矩阵分析及其可视化数据相关性分析及可视化1.新建数据集2.Hmisc3.可视化相关系数矩阵4.chart.Correlation()来自于包PerformanceAnalytics5
小Li先生·2022-12-14 17:27

Seurat之细胞周期评分 cellcircle大小写转换 Hmisc 注意scaledata时候 需要把所有的基因都scale

https://www.jianshu.com/p/983658ae7f25getwd()path="G:/silicosis/sicosis/xfy/cell_circle_score/"dir.create(path)setwd(path)getwd()load("D:/Win10System/Documents/WeChatFiles/wxid_f27yna03e0v622/FileStor
YoungLeelight·2022-12-07 04:30

[个人笔记]R语言：缺失值NA处理

目录前言缺失值分布评估看有多少行有缺失值：VIM：看一下缺失值的分布、比例情况缺失值填补方法Hmisc或e1071包：均值、中位数、随机填充DMwR2包:中心填充centralImputation和knn6
YuQiao0303·2022-12-05 23:51

【R画图学习13.1】散点图---拟合曲线和置信区间

我们还是随机生成了一组测试数据library(Hmisc)library(ggplot2)data<-data.frame(gene1=sort(runif(50,min=3,max=7))[c
jjjscuedu·2022-11-06 16:14

R语言使用Hmisc包的label函数为dataframe中的特定变量（数据列）添加变量标签（variable labels）

R语言使用Hmisc包的label函数为dataframe中的特定变量（数据列）添加变量标签（variablelabels）目录
statistics+insight·2022-03-17 07:34

R语言导入数据文件（数据导入、加载、读取）、使用Hmisc包的spss.get函数导入SPSS中的por格式文件

R语言导入数据文件（数据导入、加载、读取）、使用Hmisc包的spss.get函数导入SPSS中的por格式文件目录
statistics+insight·2022-03-16 07:00

R绘图合并

gridExtra包的grid.arrange函数library(Hmisc)library(ggplot2)library(gridExtra)set.seed(7)x<-sort(rnorm(1000,10,100
茶苯海·2022-02-15 22:25

R基本统计分析

一、描述性统计分析基本描述性统计summary()比fivenum多一个均值fivenum()最大最小值外加三个分位数Hmisc::describe()变量和观测的数目，缺失值、唯一值的数目，均值，分位数
Derrick_Xu·2021-05-16 15:28

spss正态性检验_R笔记：正态分布的检验

从SPSS中载入数据，采用函数spss.get{Hmisc}。spss.get(file,lowernames=FALSE,datevars=NULL,us
weixin_39622521·2020-12-09 06:53

STM32MIni板入门-跑马灯

硬件连接原理图如下：实验中我们主要用到的固件库文件有：stm32f10x_gpio.c/stm32f10x_gpio.hstm32f10x_rcc.c/stm32f10x_rcc.hmisc.c/misc.hstm32f10x_usart
1024zx·2020-09-16 09:13

【R作图】如何画带标准差的柱状图

画带标准差的柱状图，除了barplot之外，还需要用到Hmisc包中的errbar。
a12141986·2020-09-16 02:02

R语言 安装Hmisc包 ggplot2包 installer更新r版本

无经验尝试安装Hmisc的目录1.探索中，想办法2.更新R的版本3.将新版R链接到Rstudio4.大功告成5.总结1.探索中，想办法既然要安装Hmisc，我先看一下电脑里有没有这个包啊>library
哪壶不提买买提·2020-08-19 05:40

R语言 描述性统计分析1

1.方法对于基础安装，summary()提供最大值、最小值、四分位数和数值型变量的均值，及因子向量和逻辑向量的频率统计Hmisc包的describe()可返回变量和观测的数量、缺失值和唯一值得数目、平均数
Megajojo·2020-08-18 10:10

使用R进行描述性统计分析（连续性变量）

使用R进行描述性统计分析（连续性变量）对于描述性统计来说，R可以实现的方法有很多，基础自带的有summary()函数，还有其他packages，如Hmisc包，pastecs包，psych包提供了计算更多内容的函数
走在码农路上的医学狗·2020-07-12 11:13

R语言中的基本统计分析

（1）描述性分析（2）频数表和列联表（3）相关系数和协方差（4）t检验（5）非参数统计具体的实现以上各个数据项（1）描述性分析若干用户贡献包都提供了计算描述性统计量的函数，其中包括Hmisc、pastecspsych
红豆和绿豆·2020-07-12 02:31

R语言（绘图入门）

我现在这里先给出本博文用到的包：library(Hmisc)Loadingrequiredpackage:latticeLoadingrequiredpackage:
ikeguang·2020-07-01 22:03

数据预处理（python,R matlab 对同一个数据转换）

`这个就是原始数据，加黑框的是一组数据（每组里面3行2列），需要转换成一行六列，并且每组里面2个数据挨在一起R语言代码“-1library(dplyr)library(Hmisc)lr<-as.data.frame
weixin_daizuo166·2020-06-27 09:38

R使用笔记：相关系数:cor.test();corr.test();rcorr()

本次笔记内容：cor.test()和cor()rcorr(){Hmisc}corr.test(){psych}相关系数（correlationcoefficient）用于描述两个变量之间的相关程度。
GPZ_Lab·2019-12-30 02:27

Hmisc包

推荐一个Hmisc包下载好后使用#res=rcorr(as.matrix(rt))#这个函数可将rt列表中的任意两个基因展示相关系数与P值cormatrix=function(cor,p){ut=upper.tri
刘大帅1·2019-08-24 12:45

相关性计算

correlation-matrix-a-quick-start-guide-to-analyze-format-and-visualize-a-correlation-matrix-using-r-software【超赞的资料】相关性热图#计算相关性require(Hmisc
fatlady·2019-03-07 13:12

R语言-上海二手房数据分析

案例:通过分析上海的二手房的数据,分析出性价比(地段,价格,未来的升值空间)来判断哪个区位的二手房性价比最高1.载入包library(ggplot2)library(Hmisc)library(car)
月上贺兰·2018-04-07 22:00

R语言学习笔记1

boxplot或help(boxplot)2、添加注释#3、载入包library([要载入的包名])如：library（MASS）4、下载包install.packages(“Hmisc”)或用RStudio
flowser·2016-04-15 21:17

R语言笔记 计算描述性统计量的函数

其中包括Hmisc、pastecs和psych。由于这些包并未包括在基础安装中。
jackwxh·2016-04-07 11:37

R语言笔记 计算描述性统计量的函数

其中包括Hmisc、pastecs和psych。由于这些包并未包括在基础安装中。
jackwxh·2016-04-07 11:37

R language

setwd("E:\\Postgraduate\\R-workbench");设置工作空间install.packages("packages\\Formula_1.1-2.zip") library("Hmisc
唐荣·2014-11-14 22:00
上一页 1 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他