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Lammps
lammps
模拟喷丸过程
lammps
模拟喷丸过程的方法比较多,比如速度冲击法、fixdeposit沉积法等。原理基本类似,给球体一个特定的速度撞击基体。
lammps_jiayou
·
2022-12-01 04:44
lammps模拟案例
分子动力学模拟
分子动力学
lammps
lammps培训
ovito
LAMMPS
+Gaussian专题
其中分子动力学软件
LAMMPS
可以模拟气态、液态、固态及混合态体系,并且计算速度快,计算能力强,采用不同的力场和边界条件来模拟全原子,聚合物,生物,金属,粒状和粗粒化等。
lixuegaoyunfeng
·
2022-12-01 04:39
材料
java
服务器
算法
LAMMPS
实操系列(二): 大量FCC-CoCrCuFeNi高熵合金建模与最稳定结构筛选
上一期我们介绍了对于格点原子无序的FCC-CoCrCuFeNi高熵合金理论模拟中的建模思想,以及
LAMMPS
的程序实现。
测试狗科研
·
2022-11-10 14:21
科研测试
材料测试
统一建模语言
分子动力学后处理自编程系列(3)---纳米颗粒外基液数密度分布
本程序利用
LAMMPS
输出的dump文件,目标在于计算基液原子在距离纳米颗粒表面d埃位
阿磊的MD记录簿
·
2022-10-15 07:55
MD表征参数自编程计算
lammps
matlab
2022-10-04
Lammps
关于水模型设置的求助
问题描述如下:模拟选用SPC/E模型进行处理,但是加上用SPC/E对应的bondcoeff设置为0anglecoeff设置为0以后添加fixshake命令之后run的时候发现运行会被卡住,并不会进行计算,这种现象很怪异TIP3P长程力作用和SPC/Ebondcoeff设置为0以后计算不出结果同样是使用fixshake命令的TIP3P模型短程带能量的结构就可以运行出结果,不知道为什么会出现这种问题,
Listaer
·
2022-10-04 19:50
Ubuntu22.04+
lammps
+CUDA11.7+FFTW3.3.10+GPU
ubuntu系统的安装1:制作U盘1:进入Ubuntu官网,找到最新版Ubuntu下载Ubuntu官网下载网址2:用UltralSO软碟通,将Ubuntu镜像文件写入U盘中进入UltraSO-选择文件-选择自己下载Ubuntu系统的镜像文件-启动-写入硬盘映像。3:重启,F2或F12进入BIOS界面,在bootmanager中关闭secureboot。4:重启,选择U盘启动5:进入Ubuntu安装
熵减为生
·
2022-09-13 07:26
ubuntu
linux
运维
DeepMD-kit和
LAMMPS
的安装&测试
一、DeepMD-kit、
LAMMPS
安装1.1docker拉一个镜像此处采用2.3.1cuda使用本机的cuda-11.7dockerpullghcr.io/deepmodeling/deepmd-kit
清榎
·
2022-07-23 08:30
杂项
分子动力学模拟
深度学习
创意时刻:
lammps
复杂模型建模,学会可以给女朋友做表白墙了
今天给大家介绍一种比较有意思的
lammps
建模方法。如下图所示:用到的软件有:Atomsk、python、Ovito。
lammps_jiayou
·
2022-04-28 10:17
lammps教程
lammps
分子动力学模拟
Lammps
远程并行安装Windows7/Win8/Win10/Ubuntu/Mac系统
Lammps
软件网上有非常多的安装教程,但很多新手在安装过程中总会碰到这样那样的错误,往往要折腾好几天。
仿真学术
·
2021-11-04 21:03
北京8月分子动力学模拟
LAMMPS
初级研讨会
开源的分子动力学模拟软件
LAMMPS
具有有良好的并行扩展性,可以支持包括气态,液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原
AICloud
·
2021-06-20 00:46
CentOS中安装
Lammps
等软件参考过的文章链接
在虚拟机中运行CentOS系统,在CentOS系统中安装fftw,mpich,
Lammps
。
LL今天更优秀了吗
·
2021-06-13 21:35
lammps
怎么编译gpu版本_GPU版本的vasp5.4.4或者vasp6.1.0安装
一、VASP软件简介VASP(ViennaAb-initoSimulationPackage)是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。它是目前材料模拟和计算物质科学研究中十分流行的商用软件之一,VASP是基于贋势平面波基组的第一性原理密度泛函计算程序,VASP软件作为目前国内国际上权威的第一性原理计算软件,可以研究多种体系,包括金属及其氧化物、半导体、晶
weixin_39927288
·
2020-11-24 14:31
lammps
怎么编译gpu版本
ubuntu下
lammps
的安装
文章目录---------ubuntu下
lammps
的安装---------1、前提条件2、安装
lammps
3、配置环境---------ubuntu下
lammps
的安装---------1、前提条件笔者所用操作系统为
xukang95
·
2020-09-16 00:08
配置环境
Ubuntu下
LAMMPS
的安装与测试
注:安装环境:Ubuntu16.04LTS,
LAMMPS
-14May16,MPICH3.2,FFTW3.3.4,VMD1.9.3
LAMMPS
(Large-scaleAtomic/MolecularMassivelyParallelSimulator
weixin_30650859
·
2020-09-16 00:11
运维
matlab
记录 ——
lammps
####################
lammps
错误记录########################Inputscript:**units**:lj(基于定义的reducedvalue确定unit
sorchalyttle
·
2020-08-25 08:53
simulation
vasp在win10子系统Ubuntu下的安装过程
子系统Ubuntu安装过程请参考
lammps
在win10子系统(Ubuntu)下的简易安装。
Jasonkun_3
·
2020-08-22 16:17
VASP
win10下基于wsl-Ubuntu 的
LAMMPS
超便捷安装
前言本文为学习过程中第一次进行总结和编撰,诸多问题详略不当还望谅解。如此拙见,若有幸相助,那必是荣幸之至。简介本次安装是基于Manual,使用win10下Ubuntu子系统中,apt应用商店的扩展软件源进行的一键式安装。其原因如下:Win10是主系统,日常的文件处理等均在Win10进行。友好的图形界面常用的办公软件等。(槽点)Win10的WSL支持十分良心,且与linux子系统的文件交互十分方便。
Maple-yu
·
2020-08-05 17:24
Lammps学习
ubuntu
lammps
windows
多线程
LIGGHTS开发组在第二届
LAMMPS
研讨会上报告的整理编译
增强
LAMMPS
的潜在能力-颗粒模型,编码概念,CAD交互能力以及与连续介质的耦合方法1报告内容1-1.简介:开发团队与目标1-2.模型:颗粒接触模型,传热模型,SPH,多球元模型1-3.CAD交互能力
xxyhjy
·
2020-07-12 17:17
CFD&DEM
CFDEM后处理:如何用paraview读取颗粒数据? :用lpp将dump转换成vtk文件
liggghts(
lammps
)输出的文件格式是dump但是paraview只能处理chunk类型文件,也就是说,paraview能够处理的类型是.vtk文件于是需要转换文件格式.查看了一下tutorials
beidou111
·
2020-07-12 13:14
CFDEM
搭建高性能计算环境(六)、应用软件的安装之
lammps
1,上传需要的软件包
lammps
-stable.tar.gz。
Patrick11111
·
2020-07-09 11:27
Centos下远程连接断开后让程序继续运行解决办法
/lmp_gpu-sfgpu-coff
lammps.sh文件,内容即上文的“mpirun-np2./lmp_gpu
凯旋-静水深流
·
2020-07-08 09:32
Centos
LAMMPS
输出【Output】的问题
转自http://blog.sina.com.cn/s/blog_6e56343801014qpb.html谈谈关于
LAMMPS
输出【Output】的问题2009-09-2519:40无论任何模拟,我们都是想从模拟中得到我们想要的数据
wuhui1993
·
2020-07-06 09:31
LAMMPS
服务器安装过程
由于我之前已经在服务器里装好了gromacs和NAMD,因此openmpifftw等都已经装好了。假装所有的依赖包都没有安装,那么在root权限下输入下面的命令:apt-getinstallgccapt-getinstallg++apt-getinstallmpi-default-*apt-getinstalllibfftw3*即可把这些包都安装好。直接安装lammpstar-xvflammps-
hdpai2018
·
2020-07-04 17:29
纳米技术
科研
lammps
在win10子系统(Ubuntu)下的简易安装
其实大多数的教程都是把
lammps
官网的安装教程翻译成了中文,当然,作为一名小白,我也不会例外,毕竟还是要相信官方。凡是从简到繁,从易到难,这是目前最简单的安装方法(不包括编译,我还没学会编译!)。
Jasonkun_3
·
2020-07-04 06:43
怎么在win中安装并运行
lammps
(串行)
零基础小菜鸡为了完成网课作业需要用到
lammps
,碰壁两天终于安好了,下面给一些经验(仅适合只想安好计算一下的新手,大佬勿喷)。首先,从
lammps
网站找到win版本的安装包。注意下载下图这个就可以。
cosmic_potato
·
2020-04-17 18:24
建水盒子
(2)(3)VMD文件转存为
Lammps
文件2.2读取模型(1)进入要读取模型的目录(2)读取Lammpsdata文件命令:(3)载入psfpdb模型命令:molloadpsfwater30528.ps
冯阳
·
2020-04-11 11:00
CP2K-4.1的编译
作为一个交叉学科的学生,去年第一次接触到这种第一性原理计算的软件,当时有一个大师兄带我入门,VASP和
LAMMPS
的编译也是师兄做的,没我啥事儿,也没觉得这事儿有多麻烦。
神的第57个名字
·
2020-03-20 05:10
LAMMPS
一键安装shell脚本
本脚本仅在Ubuntu16.04LTS版本下测试,任处于测试版,不保证能用,一键安装
LAMMPS
#!
Phonon_mode
·
2020-03-05 10:31
2019-7-(15-21)夏季第一周总结
在这个工作的基础上,我如果需要进一步掌握他们的固液相变诊断方法,就可以基于
LAMMPS
计算LOP,更深的物理意义如果需要搞
旧时的溪
·
2020-02-10 15:58
关于
LAMMPS
输出(Output)的问题
转自http://blog.sina.com.cn/s/blog_6e56343801014qpb.html谈谈关于
LAMMPS
输出【Output】的问题2009-09-2519:40无论任何模拟,我们都是想从模拟中得到我们想要的数据
经常吃错药
·
2019-12-28 23:57
Lammps
入门手册
1
Lammps
输入脚本结构1.1初始化命令设置在创建原子或从文件中读取原子之前需要定义的参数。
Yuanshuo
·
2019-11-21 20:32
Lammps
入门基础课程在线讲课
根据经验,在无人指导学习
Lammps
的情况下:3天学会软件安装7天学会模拟流程10天学会编写in文件官方帮助文档2000+页!
仿真学术
·
2019-11-18 23:26
Lammps
命令与in文件
LAMMPS
即Large-scaleAtomic/MolecularMassivelyParallelSimulator(大规模原子分子并行模拟器),是由美国能源部桑迪亚国家实验室开发的一种开源的经典分子动力学模拟代码
Bree-No1
·
2019-01-07 20:00
搭建高性能计算环境(六)、应用软件的安装之
lammps
1,上传需要的软件包
lammps
-stable.tar.gz。
·
2015-11-13 05:46
高性能
lammps
CUDA 编译
cuda7.5.18
lammps
10Aug15compiledon2015/09/15-------------------tar–zxvfopenmpi-1.4.5.tar.gzcdopenmpi-1.4.5
潜在的码农
·
2015-09-15 00:23
软件编译
技术
LAMMPS
安装总结
硬件:SMP服务器,4个CPU(XeonE7450),内存64G,ATI显卡软件:RedHatEnterprise4,gcc3.4.6前言:由于服务器比较老,而且我没有root权限,安装起来很不方便,各种软件和库都没有,都是下载后手工编译安装的,用了3天时间,除了GPU和CUDA因为是ATI显卡的原因无法安装外,成功安装了各个包InstalledYES:packageASPHEREInstalle
shixha
·
2013-08-30 21:00
源码
redhat
makefile
编译器
双核的机子如何编译
lammps
[转贴]
最近有好多人在问我,双核的机子该如何编译
lammps
。其实就是实现并行的功能。如果不能充分的利用多cpu的优势,其实是很可惜的。
蹦蹦熊
·
2010-04-10 08:00
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