Nature

Nature重磅综述 |关于RNA-seq，你想知道的都在这

摘要RNA测序（RNA-seq）在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术(NGS)的发展，RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究，比如单细胞基因表达、RNA翻译（translatome）和RNA结构组（structurome结构组学）。新的有意思的应用，如空间转录组学（spatialomics）也在积极研究
生信宝典·2022-02-17 06:35

2019年6月week3 宫颈癌 landscape Nature

IntegratedgenomicandmolecularcharacterizationofcervicalcancerTheCancerGenomeAtlasResearchNetworkNaturevolume543,pages378–384(16March2017)全文摘要我们报道了228例原发性宫颈癌的广泛分子特征，这是迄今为止宫颈癌最大的综合基因组研究之一。我们观察到显著的APOBEC
aprilllm·2022-02-17 04:42

【文献解读】NATURE COMMUNICATIONS：An effector protein of the wheat stripe rust fungus targets chloropla...

背景：1.Pst-12806：条锈菌效应蛋白2.TaISP:Pst-12806筛选到的靶标(aputativecomponentofthecytochromeb6-fcomplex)结果：WorkingmodelofthefunctionofPst_12806duringPst–wheatinteractions.日积月累：Secretome:n.分泌蛋白质组Chloroplast:[ˈklɔːr
sensen·2022-02-17 03:31

转||发邮件向国外作者索要论文原文

上周，看到一期Nature上的文章，但在网上检索不到该期杂志的下载，加之宿舍网络无法登陆Nature数据库下全文，就尝试联系
董八七·2022-02-15 03:43

如何在顶尖期刊上发论文？编辑们给了这几点建议.

2013年，Nature共收到11000篇论文投稿，最终只发表了856篇，发表比例为7.8%。那么，想在顶尖期刊发表论文，除了研究本身之外，还需要注意些什么呢？
燃烧论文期刊发表指导·2022-02-13 16:29

R语言代码-Nature主刊中相关系系数热图绘制

example.png出自https://www.nature.com/articles/s41586-019-1032-7应用场景评价基因对免疫浸润的影响，甚至可以批量筛选出影响免疫浸润的候选基因。
统计大师·2022-02-13 11:04

曲率已驱动了头发——深度分析谷歌AlphaGo击败职业棋手

包括把那5盘棋各打了两遍的谱，包括从Nature官网上把那篇谷歌的报告花了200元下载下来研究它的算法（后来发现谷歌网站上可以免费下载的），包括也查阅了很多其他文献资料。
weixin_30472035·2022-02-12 16:14

Nature | 2型糖尿病肠道微生物群的宏基因组关联研究

文章信息：标题：Ametagenome-wideassociationstudyofgutmicrobiotaintype2diabetes中文：2型糖尿病肠道微生物群的宏基因组关联研究杂志：Nature
小白菜学生信·2022-02-10 07:00

【Nature Reviews Genetics】文献阅读

这篇文献学习笔记分享的是一篇有关于增强子和启动子的综述。文章在今年2月发表在了NatureReviewsGenetics。这是一篇长笔记，没有时间看的同学可以收藏起来慢慢看，对于认识启动子和增强子的作用还是很有帮助的。当然更推荐大家下载英文原文阅读。题目：Determinantsofenhancerandpromoteractivitiesofregulatoryelements国内下载不了的童鞋
生信start_site·2022-02-10 02:29

与过去四个世纪相比，格陵兰岛的冰盖“破表”融化

与过去四个世纪相比，格陵兰岛的冰盖“破表”融化根据2018年12月5日发表在《自然》(Nature)杂志上的一项新研究，格陵兰岛厚达一英里的冰盖表面的融化在19世纪中叶开始增加，然后在20世纪和21世纪初急剧增加
wumingzhi111·2022-02-07 03:34

2018-08-16

8月8日，一篇发表在《Nature》杂志上的文章引起了业内的广泛关注：ExosomalPD-L1contributestoimmunosuppressionandisassociatedwithanti-P
南博屹生物医学·2022-02-06 16:03

*Nature* **521,** 436–444 (2015).

&Hinton,G.Deeplearning.Nature521,436–444(2015).论文地址：LeCun,Y.,Bengio,Y.
小熊coder·2022-02-06 13:23

NCB|心咽发育多样化的单细胞转录轨迹分析

单细胞文献解读·CNS：Cell深度|一套普遍适用于各类单细胞测序数据集的锚定整合方案Nature系列|整合单细胞转录组学和质谱流式确定类风湿性关节炎滑膜组织中的炎症细胞状态|详细解读Nature首次对阿尔茨海默病进行单细胞转录组分析
生信宝典·2022-02-05 20:55

跟着Nature Methods学画图：R语言ggplot2画小提琴图

今天的推文继续学习Asingle-cellatlasoftheperipheralimmuneresponseinpatientswithsevereCOVID-19论文中的代码。今天推文的主要内容是介绍如何使用R语言绘制散点图并且添加拟合曲线和置信区间这篇论文是在土豆学生信分享的内容看到的。的链接是https://www.jianshu.com/p/bbf9cb13b41a论文是image.pn
小明的数据分析笔记本·2022-02-05 08:09

Green Nature赴上海首展“米兰展”之约

恭喜首届米兰国际家具展完美落下帷幕米兰国际家具博览会将上海展览中心还原成“英国广场，全方位展示英国生活方式，让人们完全沉浸在意英国的氛围之中，并感受英国之美。—ITALYFOOTBALLWORLDCUP—球迷福利：英国足球冠军奖杯展现场演奏的意大利音乐会浓缩成15分钟的英国风情全景图GreenNature现场大片此次米兰上海站首秀带来经典产品GreenNature爵士椅,Richardseatin
绿色自然GREENNATURE·2022-02-05 04:41

哇！单细胞测序-配体受体互作分析原来可以这么简单又高大上！

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞
生信宝典·2022-02-03 14:05

Paper-36 肠道菌群，细菌代谢产物和结直肠癌(Nature Reviews Microbiology) 2021-01-16

原文：Thegutmicrobiota,bacterialmetabolitesandcolorectalcancer杂志：NatureReviewsMicrobiologyvolume12,pages661–672(2014)DOI：10.1038/nrmicro3344作者：HarryJ.Flint单位：MicrobiologyGroup,RowettInstituteofNutritiona
RashidinAbdu·2022-02-03 08:27

Bandari第2张专辑：Silence With Sound From Nature（寂静山林）

打开了《寂静山林》，打开了一扇奇异的，让听者欢欣的崭新的音乐天地。Silence，的确是非常的安静，没有过多的渲染层次，没有过多的音乐角度，淡淡的音乐，自然的氛围，迎面而来得却是如此的熟悉的旋律，感觉相识，却又是如此的不一样，都是我们最喜欢的歌曲，但是经bandari的全新的诠释后，是给我们一种纯音乐角度的美感。寂静山林，寂静的是让我们静静的，没有任何的干扰，淡淡的再一次聆听过去，聆听新世纪音乐对
小鱼来了_Conan·2022-02-03 08:01

2021-12-31科学论文案例分析之四——领略专业杂志直击主题的写作风格

Aninferior-superiorcolliculuscircuitcontrolsauditorycue-directedvisualspatialattentionFeiHuandYangDanNeuron(2021.10)doi:10.1016/j.neuron.2021.10.004Neuron是一个专业的脑科学的顶级杂志，我们来看一下面向专业读者和面向大众读者的杂志（比如Nature
Thinker·2022-01-01 07:28

复现《nature communications》图表（五）：GWAS曼哈顿图和qq图复现

NC文章的全基因组部分，关于GWAS的一些图本来不想复现，但是看到近期很多文章包括单细胞总是会挖掘GWAS用于自己的研究，而小编负责的课题也涉及到这一部分，所以还是决定试一下。复现的图是文章的FigureS6，数据下载链接（a，b图的）：ftp.ebi.ac.uk:/pub/databases/gwas/summary_statistics/GCST90014001-GCST90015000/GC
KS科研分享与服务·2021-12-15 18:33

基因组文章 | 蝾螈《Nature》2018

蝾螈可以再生四肢、心脏、脊椎等等组织，是研究发育，再生等等的重要材料，但由于其基因组庞大（是人类基因组的10倍）和含有大量的重复序列对其基因组解析带来了困难。近期在中国和欧洲各实验室的合作下，完成了D/D蝾螈基因组的测序和组装，下面让我们一起来探索其神秘。一、摘要蝾螈是一类重要的研究发育、再生和进化的四足类动物模型，其中墨西哥蝾螈（Ambystomamexicanum）是研究分子机制的代表性蝾螈。
生信师姐·2021-12-14 19:08

Python深度强化学习之DQN算法原理详解

论文：Human-levelcontrolthroughdeepreinforcementlearning|Nature代码：后续会将代码上传到Github
·2021-12-11 11:39

复现《nature communications》图表（一）：一模一样的Figure1

近期，看到一篇发表在NC上的文章，是关于新冠多组学的文章，因为看到这篇文章提供了详细的数据，所以对其进行复现下，从nature子刊出发，循序渐进。
KS科研分享与服务·2021-12-10 11:26

天地间

蓝天白云绿水青山，花草虫鱼飞鸟走兽，晨昏潮汐日月星辰风雷雨雪，江河湖海树木森林……百科中说大自然（nature）是指狭义的自然界。它是与人类社会相区别的物质世界。即自然科学所研究的无机界和有机界。
林雪林·2021-12-04 04:41

中科院DeepMind联手，用深度学习揭示大脑如何识别人脸｜Nature子刊

梦晨发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAIDeepMind和中科院神经科学研究所联手了。他们用无监督深度学习揭示出大脑识别人脸的机制。具体来说，大脑会把面部特征分解成一些语义特征，如年龄、性别或是否在微笑，而且是单个神经元对应某个具体特征。△图源MartaGarnelo此外，他们构建的模型利用少量神经元的信号就能还原出整个面部图像，相关论文发表在最新一期NatureCommunications上
QbitAl·2021-11-14 19:53

写文章登录Nature子刊：基于深度学习预测家族性阿尔兹海默症患者临床前功能性脑老化

静息态功能连接（rs-fMRI）磁共振成像能够对即将发展为阿尔兹海默症（AD）患者的早期损伤进行检测。这种损伤可以用来对AD患者出现临床症状前就进行筛查。我们构建了一个模型，可以根据静息态(rs)-fMRI数据预测大脑年龄，并评估AD的遗传决定因素以及β-淀粉样蛋白(Aβ)病理是否会加速大脑衰老。使用来自多个地点的1340名18-94岁之间认知未受损参与者的数据，结果表明从rs-fMRI构建的模型
思影科技·2021-11-11 10:59

Nature：哈佛&牛津开发基因致病性预测模型，现已成功预测3600万个致命基因突变...

博雯发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI直接从基因层面预测疾病，这一直是近现代医学研究的主要方向之一。然而，全体人类的基因变异体数量远超现有的探测技术，甚至仅仅是不同个体的蛋白质区编码也会展现出巨大的差异性。因此，超过98%的基因变异给人体带来的影响依旧是未知且无法预测的。但最近，来自哈佛医学院和牛津大学的科学家合作开发了一种AI模型，成功预测了3219个疾病基因中超过3600万个变体的致病性
QbitAl·2021-10-28 16:39

针灸研究登上Nature：哈佛团队找出刺激穴位治疗疾病背后原理

鱼羊发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI今天，一篇有关“针灸”的研究论文登上了Nature。
QbitAl·2021-10-14 12:06

【优化预测】基于matlab蝙蝠算法优化BP神经网络预测【含Matlab源码 1379期】

一、BP神经网络简介1BP神经网络概述BP（BackPropagation）神经网络是1986年由Rumelhart和McCelland为首的科研小组提出，参见他们发表在Nature上的论文Learningrepresentationsbyback-propagatingerrors
紫极神光·2021-10-07 14:06

能源系统建模：利用gcam_reader批量导出GCAM database数据

点赞发Nature关注中ScienceGCAM计算结果我们可以用modelinterface直接查看，在modelinterface中直接复制结果即可。
Cmmm丶·2021-10-05 09:11

一张GPU一秒生成200万平方公里天气雷达图，AI开始对英国天气重拳出击了 | Nature...

博雯发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI明明晚上预报也看了，第二天出门前也在手机上确定了实时降雨概率很低。结果出门一个小时后，还是被突如其来的风雨交加吹成了杀马特。一天之内四季随机播放，这谁顶得住？（英国天气：你喊我？）除去日常生活，航空领域中的短期天气预报一拉跨，飞机可能就得延误。农业、水资源、应急管理的一些项目，在短期天气无法得到准确预测时，还可能造成更严重的后果。于是，DeepMind和
QbitAl·2021-09-30 13:21

《Nature》 和 《 Science》 的区别是什么？

非要说nature和science区别的话：nature是英国，science是美国；nature的影响因子稍高于science一点；nature的创刊时间比science早一些。
振华OPPO·2021-09-29 11:29

三星&哈佛：直接复制粘贴神经元 | Nature子刊

而且据介绍，这项研究是当前的技术无法企及的，因此最近还登上了Nature子刊。具体而言，就是通过将大脑神经元连接图，“复制粘贴”到固态存储器的高密度3D存储网络上。
QbitAl·2021-09-28 13:32

曹原学弟周昊欣一天发2篇Nature，还是石墨烯领域，网友：中科大少年班人才辈出！...

明敏丰色发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI一天连发2篇Nature，还都是一作。石墨烯领域又迎来一位新星——周昊欣。这怎么有点曹原的感觉啊？还别说，他们之间还真的颇有渊源。
QbitAl·2021-09-19 13:50

曹原学弟周昊欣一天发2篇Nature，还是石墨烯领域，网友：中科大少年班人才辈出！...

明敏丰色发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI一天连发2篇Nature，还都是一作。石墨烯领域又迎来一位新星——周昊欣。这怎么有点曹原的感觉啊？还别说，他们之间还真的颇有渊源。
QbitAl·2021-09-19 13:50

曹原学弟周昊欣一天发2篇Nature，还是石墨烯领域，网友：中科大少年班人才辈出！...

明敏丰色发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI一天连发2篇Nature，还都是一作。石墨烯领域又迎来一位新星——周昊欣。这怎么有点曹原的感觉啊？还别说，他们之间还真的颇有渊源。
QbitAl·2021-09-19 13:50

曹原学弟周昊欣一天发2篇Nature，还是石墨烯领域，网友：中科大少年班人才辈出！...

明敏丰色发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI一天连发2篇Nature，还都是一作。石墨烯领域又迎来一位新星——周昊欣。这怎么有点曹原的感觉啊？还别说，他们之间还真的颇有渊源。
QbitAl·2021-09-19 13:50

10X单细胞（10X空间转录组）TCR数据分析之TCRdist(1)

TCRdist的知识，大家可以参考文献Quantifiablepredictivefeaturesdefineepitope-specificTcellreceptorrepertoires，IF49分（nature
单细胞空间交响乐·2021-09-13 14:46

2021-09-13

Nature|病毒衍生肿瘤相关抗原识别和表征肿瘤反应性CD8T细胞原创huacishu图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：huacishuIF=49.960推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1、研究表明在
图灵基因·2021-09-13 10:30

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画基因结构示意图

今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8c，基因结构图，论文中文字部分对图的描述是GenestructureofLsat_6X11620.Closedb
小明的数据分析笔记本·2021-09-08 19:45

文献阅读 | 相分离与VDJ重排 （2019, Nature Communication)

原文链接：KhannaN,ZhangY,LucasJS,DudkoOK,MurreC.Chromosomedynamicsnearthesol-gelphasetransitiondictatethetimingofremotegenomicinteractions.NatCommun.2019;10(1):2771.Published2019Jun24.doi:10.1038/s41467-01
阿狸的窝·2021-08-30 19:23

老韩日记2021-08-22

最近Nature杂志发表的一篇“慢性孤独会导致果蝇暴饮暴食”的文章刷爆了朋友圈和各个自然科学的公众号。说真的，我现在特别讨厌这些公众号，同质化严重，拼命的互相抄互相抢热度。好在这次的研究还是非常靠谱。
老韩的学习笔记·2021-08-22 22:45

非因解读 | DSP空间全转录组+单细胞测序 描绘新冠患者多器官空间组织图谱

DSP空间全转录组+单细胞测序描绘新冠患者多器官空间组织图谱由麻省理工学院，麻省总医院，哈佛大学的多个研究团队领导的一项在新冠病毒感染者的大型研究近日在《Nature》上发表。
FynnBio·2021-08-20 11:15

文献阅读 | GAM：基于ligation-free方法捕获基因组中增强子间的复杂互作 (Part II：数据分析）

BeagrieRA,ScialdoneA,SchuelerM,etal.Complexmulti-enhancercontactscapturedbygenomearchitecturemapping.Nature
阿狸的窝·2021-08-18 10:45

文献阅读 | GAM：基于ligation-free方法捕获基因组中增强子间的复杂互作 (Part I：文章梳理）

BeagrieRA,ScialdoneA,SchuelerM,etal.Complexmulti-enhancercontactscapturedbygenomearchitecturemapping.Nature
阿狸的窝·2021-08-18 10:17

Glioma Papers1-2016_Nature_IDH-O

文章概览题目：Single-cellRNA-seqsupportsadevelopmentalhierarchyinhumanoligodendroglioma中文题目：单细胞转录组分析揭示了人类少突胶质瘤的发育层次第一作者：ItayTirosh,AndrewS.Venteicher通讯作者：AvivRegev,MarioL.Suvà（作者里面拿出任何一个人来都是一本教科书。。。）日期：2016.
江湾青年·2021-07-19 14:09

【ICML2021】 9篇RL论文作者汪昭然：构建“元宇宙”和理论基础，让深度强化学习从虚拟走进现实...

www.neurondance.com/论坛：http://deeprl.neurondance.com/来源：转载自AI科技评论作者|陈彩娴深度强化学习的故事，可以追溯到2015年：当时，位于英国伦敦的一家小公司DeepMind在《Nature
深度强化学习实验室·2021-07-13 08:42

本周最新文献速递20210711

精细解读文献一文献题目：BANPopenschromatinandactivatesCpG-island-regulatedgenes不想看英文题目：BANP打开染色质并激活CpG岛调控基因杂志和影响因子：Nature
橙子牛奶糖·2021-07-11 19:03

RNAvelocity系列教程1：RNA速率简介及scVelo安装

(Nature,2018)引入了RNA速率的概念，利用新转录的未剪接的前体mRNA和成熟的剪接mRNA可以在常见的单细胞RNA-seq流程中区分的事实，可以恢复定向动态信息，前者可通过内含子的存在检测。
Seurat_Satija·2021-07-08 09:48

Nature：读博难，在中国读博难上加难

综自：机器之心，生物学霸11月18日，Nature报道了近十年最大规模的全球博士现状调查结果（每两年一次）。
德国留学小哥哥·2021-06-26 04:19
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