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Nature
代码分析 | 单细胞转录组clustering详解
聚类可视化NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(
Nature
重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞
生信宝典
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2023-09-20 04:14
Back to
nature
-带孩子走进宫崎骏的夏天,与大自然的偶遇
2021年暑假,原本有很多的期待和计划-心心念念和几个宝妈的唐家河之旅因为突如其来的疫情取消了,这是5年后几个妈妈和孩子们的期待再聚的机会,就这样被取消。再加上工作中遇到的烦心事,心中确实沮丧到了极点。不过心中有一个声音告诉自己出去走走,也许会有小收获。于是我开始计划着这个两天的家庭旅行。虽然已是立秋,但是还是八月,想抓住夏天的尾巴,水就是夏天孩子们的最爱。于是目标确定之后就好安排自己的行程了。其
gloria尹
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2023-09-20 01:25
NATURE
HEALCARE NMN是什么?应该怎么选择?
NMN,全名β—烟酰胺单核苷酸,NMN是人体内NAD+的直接前体物质。在了解NMN之前,我们先来了解NAD+。什么是NAD+?NAD+又叫辅酶Ⅰ,全称烟酰胺腺嘌呤二核苷酸,这是一种广泛分布在人体细胞中的辅酶,参与人体上千种生物催化反应,也就是说NAD+参与人体细胞的物质代谢、能量合成、细胞修复等多种生命活动。科学研究发现,体内NAD+随着年龄的增长而下降,所以我们人体有必要补充NAD+以维持正常的
自然营养科技
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2023-09-19 21:08
Nature
genetics|病毒与癌症
今天跟大家分享的是三月份发表在naturegenetics杂志(IF:25.455)上的一篇文章Thelandscapeofviralassociationsinhumancancers,文章主要讲的是对38种癌型的肿瘤样本进行全基因组和转录组的分析,研究了癌症样本与其中潜在的病毒病原体的关系。并具体的分析了几种病毒在癌症中的特征。Thelandscapeofviralassociationsin
概普生信
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2023-09-19 17:37
Nature
综述:单细胞和空间转录组的数据整合
器官包含了众多类型的细胞,其中不同的细胞在空间上的相互作用,与其功能密切相关。然而,单细胞测序破坏了细胞间的空间关系,而空间转录组并不能区分出特定的细胞。如何将这两类数据整合使用,自然遗传学综述21年6月的论文“整合单细胞和空间转路组数据,来阐述组织空间细胞间动态的论文,概述了相关方法。空间转录结合单细胞,可应用于对组织内稳态,组织发育,疾病微环境,肿瘤和免疫细胞组织的微环境中,不同类型的细胞如何
概普生信
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2023-09-19 14:02
【文献分享】植物醌受体的鉴定!
写在前面这次分享的是前段时间发表在
Nature
的长文,"Quinoneperceptioninplantsvialeucine-rich-repeatreceptor-likekinases"。
巩翔宇Ibrahimovic
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2023-09-18 08:54
【野生小科普】碳中和
10月19号在《
Nature
》网站有一条关于中国承诺在2060年之前实现碳中和目标的讨论。下一周的26号,同一个网站发表对欧盟承诺2050年实现碳中和目标的质疑。
乔伊nikkie
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2023-09-18 08:52
Nature
Plants:一种新型植物基因工程CRISPR-Cas12b编辑工具问世
图片下载:右键此处另存为可保存此图片提示:欢迎点击上方「PaperRss」↑关注我们!马里兰大学研究人员建立了一种用于植物基因工程新的CRISPR-Cas12b系统。图片下载:右键此处另存为可保存此图片CRISPR基因编辑。图片来源:国立卫生研究院在新出版的《NaturePlants》的中马里兰大学植物科学系助理教授YipingQi首次建立了一种在植物中可行的新CRISPR基因组工程系统:CRIS
PaperRSS
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2023-09-16 06:28
借力计算机视觉及深度学习,纽卡斯尔大学开发实时、自动化奶牛跛行检测系统
目前,该研究成果已发表在《
Nature
》上。关键词:奶牛跛行畜牧业机器学习因口蹄疫等疾病造成的奶牛跛行对畜牧业而言,已成为一个全球性话题。相关科普显示,它不仅会导致奶牛产奶量降低、繁
HyperAI超神经
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2023-09-15 13:28
ScienceAI
深度学习
计算机视觉
人工智能
Nature
| 培养"不可培养的"人体微生物群的培养揭示了新的分类群和广泛的孢子形成
humanmicrobiotarevealsnoveltaxaandextensivesporulation中文:培养“不可培养的”人体微生物群的培养揭示了新的分类群和广泛的孢子形成单位:WellcomeTrustSanger研究所,宿主微生物群互作实验室杂志:
nature
小白菜学生信
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2023-09-14 16:43
跟着
Nature
学作图:R语言ggplot2画误差线展示广义线型模型的比值比(odds ratio)
论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接,可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的
小明的数据分析笔记本
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2023-09-14 11:23
Plasticity of ether lipids promotes ferroptosis susceptibility and evasion
本文选自2021年的
nature
,喜欢的可以自行下载阅读,这个难度你感受一下摘要:铁死亡是一种铁依赖的非凋亡细胞死亡过程,与各种退行性疾病有关,并代表某些癌症的靶向易感性。
一个没有感情的文献阅读机
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2023-09-13 12:40
2021-02-04曹原
2月1日1996年出生在成都的中国“天才少年”曹原又发
Nature
了这是他的第5篇曾2次一天连发2篇
Nature
2018年曹原曾一天连发2篇
Nature
2020年5月7日他再次一天连发2篇
Nature
2018
mwxs
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2023-09-13 02:47
OpenAI:LLM能感知自己在被测试,为了通过会隐藏信息欺骗人类
前几天,由图灵奖得主Benjio参与的一个研究项目刊登上了
Nature
,给出了一个初步的答案:现在没有,但是未来可能有。按照这个研究中的说法,AI现在还不具备意识,但是已经有了意识的雏形。
疯狂创作者
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2023-09-10 15:33
量子技术
/
元宇宙
/
其他
汽车
/
芯片
/
医疗
/
信息技术
/
头条要事
人工智能
2022-08-24
Nature
|人体免疫系统的物理连接图(2)原创图灵基因图灵基因2022-08-2410:23发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析由WellcomeSanger研究所和ETHZürich的研究人员领导的一个科学家团队绘制了一幅全面的
图灵基因
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2023-09-10 08:32
Nature
Plants:将节节麦基因组导入小麦作为谷物改良的基础
2021年5月,河南大学作物逆境适应与改良国家重点实验室等多家机构的科研团队开发了一个快速渐渗技术平台,利用该技术体系可将A.tauschii(节节麦)丰富的遗传变异转入小麦基因组。相关研究结果已发表在《NaturePlants》上。此项研究中4个新参考基因组的组装数据和注释文件已存储于国家基因库生命大数据平台(CNGBdb),项目编号为:CNP0001325。研究背景增加作物产量对于养活世界上不
尐尐呅
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2023-09-10 04:01
研究 | 运动 = 提高记忆力
这项发表在《
Nature
自然》杂志上的研究强调了体育锻炼对
乐刻健身研训中心
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2023-09-08 21:25
转录组测序数据分析
本文参考文献https://www.
nature
.com/articles/nprot.2016.095#materials进行bulkRNA-seq数据分析首先进行原始数据的下载,当然因为文章中已经有了链接进行数据的下载
柴本
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2023-09-08 20:26
Nature
重磅封面:科学家成功复活死亡猪脑
而今年4月18日,耶鲁大学的这项研究正式发表在了
Nature
封面文章上。图片发自App今天,
Nature
封面重磅发布耶鲁大学最新研究:猪大脑在死亡4小时后成功复活,并维持了至少6小时。
潮鞋木子
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2023-09-08 19:59
【文献速递】小鼠大脑皮层细胞多样性的分子表征
文章信息标题:Molocularlogicofcellulardiversificationinthemousecerebralcortex期刊:
nature
日期:June23,2021Themammaliancerebralcortexhasanunparalleleddiversityofcelltypes
六博说
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2023-09-08 14:41
本周最新文献速递20220410
Mappinggenomiclociimplicatesgenesandsynapticbiologyinschizophrenia不想看英文题目:解析精神分裂症的易感基因和突触生物学杂志和影响因子:
Nature
橙子牛奶糖
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2023-09-08 10:32
跟着
Nature
Communications学数据分析:R语言DESeq2包做otu差异丰度分析及火山图展示结果
论文Microbiomedifferentialabundancemethodsproducedifferentresultsacross38datasets数据链接https://figshare.com/articles/dataset/16S_rRNA_Microbiome_Datasets/14531724代码链接https://github.com/nearinj/Comparison_
小明的数据分析笔记本
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2023-09-08 02:07
【搬砖】计算HRD(first try)
MigratingtheSNParray-basedhomologousrecombinationdeficiencymeasurestonextgenerationsequencingdataofbreastcancer,npjBreastCancer,https://www.
nature
.com
yadandb
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2023-09-07 21:11
单细胞测序在发育生物学的应用
2019《
Nature
》:哺乳动物胚胎发生的分子足迹加州大学旧金山分校的研究人员开发了一种进行单细胞读数的灵活,高通量,多通道分子记录仪进行进化谱系示踪,绘制小鼠从受精卵到原肠胚形成图谱。
today_is_geqi
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2023-09-07 10:34
Nature
:微生物空转 2022-11-17
2022年11月16日,
Nature
发表了弗雷德·哈钦森癌症研究中心(FredHutchinsonCancerResearchCenter)的研究者们的最新微生物空间转录组研究成果!
笺牒九州的怪咖
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2023-09-06 15:05
每日一词 34 ESSENCE
essence:themostbasicandimportantqualityofsth最基本、最重要的特质——“精髓”、“内核”、“本质”【同义词】essence/
nature
/core/soul【例句
silverplane
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2023-09-06 04:55
Nature
Reviews Genetics:3D基因组组织工程
今天是在NYU搬砖的最后一天了~下周一就要去MSKCC报道了。心里还是有一些些小惆怅的~但是文献的学习还是不能停下的,不然到新的实验室会闹笑话~这篇笔记记录的是一篇发表在NatureReviewsGenetics上的综述(影响因子41)。发表时间是今年的2月8号。文章题目:Engineering3Dgenomeorganization目前关于3D基因组组织的解释和研究越来越多。3D基因组与基因表达
生信start_site
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2023-09-05 15:52
文献复现--freewater-DTI-单壳数据的自由水成像
文献链接:https://www.
nature
.com/articles/s41598-021-86505-7importos,sysimportnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltfromdipy.core.gradientsimportgradient_tablefromdipy.dataimportget_fnamesfromdipy.io.gradie
MRI_lab
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2023-09-04 15:49
python
numpy
matplotlib
Nature
commun |晚期胰腺导管腺癌中自发进化的祖细胞niches逃避Yap癌基因成瘾
“致癌基因成瘾”用于描述癌细胞通常表现出对一种或多种致癌驱动因素的严格依赖性以维持肿瘤生长和进展的现象。几乎所有肿瘤在药物缓解后都会出现最终的肿瘤复发。那么,在晚期胰腺导管腺癌(PDAC)中结合RNA-seq和Cut&Tag技术对肿瘤自发复发研究有什么样的影响呢?看看今天我们带来的文章。发表单位:美国华盛顿乔治敦大学医学中心期刊:Naturecommunications(IF:16.6)发表日期:
爱基百客
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2023-09-04 06:04
CUT&Tag
组蛋白修饰
转录因子
其他
国自然热点 | CUT&Tag解析组蛋白乳酸化H3K18la修饰在小鼠和人组织中的全基因组分布特征
文章中提到了几种新型组蛋白修饰:丙酰化、丁酰化、琥珀酰化、丙二酰化、戊二酰化、巴豆酰化和乳酸化等,其中组蛋白乳酸化修饰是2019年新发现的,一经发表就登上了
Nature
[1],该研究将细胞代谢与表观遗传调控联系起来了
爱基百客
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2023-09-04 06:34
CUT&Tag
ChIP-seq
其他
9.2018-04-18 《Personality》——
Nature
or Nurture
作者简单的镜子转载请标明原作者和出处也可以关注我的PERSONALITYISCOMPOSEDOFNATUREANDNURTURE FrancisGaltoncountedmanygiftedindividualsamonghisrelatives,includingtheevolutionarybiologistCharlesDarwin.Soit’snotsurprisingthatGalto
简单的镜子
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2023-09-03 09:02
轰动学界的
Nature
重磅进展:生信研究迎来史诗级大爆发
现如今生命科学领域最火的技术之一便是基因编辑,基因编辑领域又属CRISPR系统应用最为广泛,《
Nature
》2017年度人物均授予了CRISPR相关技术的突破,2020年CRISPR技术获得诺贝奖,短短不到十年时间
生信宝典
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2023-09-02 19:30
Nature
发布首个人类心脏细胞图谱
2020年9月24日,来自美国、英国、德国等多机构研究团队在《
Nature
》发布首个人类心脏细胞图谱,定义了成年人健康心脏的细胞和分子特征,提升大家对人类心脏的了解,并为心脏疾病的研究提供健康“对照”数据资源
尐尐呅
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2023-09-02 14:29
Nature
| 论2023年最新“ 颠覆性 ”技术,人工智能在基因组学与单细胞直线开挂
一、科研背景生物医学是综合医学、生命科学和生物学的理论和方法而发展起来的前沿交叉学科,基本任务是运用生物学及工程技术手段研究和解决生命科学,特别是医学中的有关问题。机器学习技术能利用复杂的算法在大规模、异质性数据集中进行运行,在生物医学方面、人类基因组项目、癌症全基因组项目、等项目上都表现出了巨大的潜力,收集并分析与医学疗法和患者预后相关的大量数据集或能将医学转化称为一种数据驱动、以结果为导向的学
秀材
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2023-09-01 16:32
机器学习
人工智能
深度学习
误执行Disable Maven
Nature
在工程右键菜单中,我不小心执行了DisableMavenNature,结果导致工程变为一般的java工程。为恢复此工程为MAVEN工程,方法如下:工程右键--->Configure--->ConverttoMavenProject转为maven工程,如下图:图一(操作前),图二(操作后)。图一图二
诀窍的心灵
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2023-09-01 11:53
eclipse
MAVEN
maven
eclipse
非负矩阵分解(NMF)-Non-negative Matrix Factorization
[toc]一、简介著名的科学杂志《
Nature
》于1999年刊登了两位科学家D.D.Lee和H.S.Seung对数学中非负矩阵研究的突出成果。
longgb246
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2023-09-01 01:24
阴性结果也能发
Nature
?
Nature
:推动科学进步,需重视阴性结果
2023年8月9日,
Nature
杂志就有发表一篇。这篇文章题为NOEv
生信宝典
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2023-08-31 02:58
人工智能
Nature
:AI新技术助力面部瘫痪患者思维交流
来源:NoahBerger在分别发表于8月23日的《
Nature
》(IF2022=64.8)杂志上,两个研究团队描述了将脑信号转化为文本或合成语音的脑机接口(BCI)。
生信宝典
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2023-08-31 02:57
人工智能
2021-12-23
Nature
|染色体外DNA驱动癌症机理原创风不止步图灵基因2021-12-2309:00收录于话题#前沿分子生物学机制撰文:风不止步IF=49.962推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:染色体外DNA(extrachromosomalDNA
图灵基因
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2023-08-30 21:06
用DNA直接存储图像,「活细胞相机」分辨率达96像素 |
Nature
子刊
克雷西发自凹非寺量子位|公众号QbitAIDNA可以用来拍照了,而且是直接存进去的那种!新加坡国立大学的研究团队成功将图像投影到DNA上并进行了存储,分辨率达到了96像素。甚至,利用同一段DNA序列,还能存储多张!传统的DNA存储需要从头开始构建DNA序列,并通过人工合成的方式编码。但这一成果直接使用从大肠杆菌中提取到的DNA,将图像转换成DNA数字信号的编码器也是活细胞。于是,通过将细菌(Bac
QbitAl
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2023-08-30 14:11
数码相机
计算机视觉
人工智能
补齐最后一块基因拼图|
Nature
这项重磅研究刊登在最新一期
Nature
之上。该序列提供了人类Y染色体完整的62,460,029个碱基对。其中有30,000,000个是本次新发现的,上面带有41个额外的蛋白质编码基因。
QbitAl
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2023-08-30 14:10
人工智能
范德波尔方程详细介绍与Python实现(附说明)
当时,范德波尔在
Nature
杂志报告了基于这个微分方程的霓虹灯实验,发现当驱动信号具有某种自然频率时,会听到毫无规律的“噪音”。
cnjs1994
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2023-08-30 04:52
风机关键部件以及轴承故障诊断
基于生成对抗网络的智能故障诊断
python
信号处理
系统动力学
Nature
:LK-99不是超导体
来源|量子位作者|鱼羊寄晚导的LK-99,今天一早又让
Nature
一把给摁地上了。头版头条文章里,标题明晃晃地写着“LK-99不是超导体”。肿么肥事,这是直接把棺材板钉上了?
夕小瑶
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2023-08-30 01:13
人工智能
重磅!2022最新SCI影响因子发布,三大名刊NCS及国内期刊TOP10排名有变化(内附2022年最新影响因子)
世界公认的三大名刊NCS世界公认的三大名刊主要是指:
Nature
,Cell,Science。整体来说今年三大刊的表现非常亮眼,影响因子分数均有较大提升,其中cell上升分数最多。
易基因科技
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2023-08-29 13:09
行业解读
生物学
生物信息学
经验分享
数据挖掘
机器学习
【R>>IMvigor210CoreBiologies】免疫反应
2018年的
Nature
上公开了一份尿路上皮癌(BLCA)的免疫治疗队列数据,而这份数据就储存在IMvigor210CoreBiologies包中。
高大石头
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2023-08-29 09:43
【科研论文配图绘制】task5 SciencePlots绘图包入门
SciencePlots作为一个专门用于科研论文绘图的第三方拓展工具包,提供了主流英文科技期刊(如
Nature
、Science和IEEE等)的Matplotlib图样式(MatplotlibStyles
宏辉
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2023-08-29 07:25
python
这本
Nature
旗下的6.4分SCI接收了经典的生信数据挖掘预后模型文章!
注意:知识星球的用户请自行去知识星球免费下载阅读,无需付费!非要付费我不给你退的。我们都在说现在基于数据库挖掘的预后模型文献已经烂大街了,然鹅!有人又默默的在一个正统的6.4分杂志上发文章了,啥是正统呢?就是除外咱们耳熟能祥的经典灌水杂志。2020年5月13日英国诺丁汉大学医学院诺丁汉乳腺癌研究中心等单位学者发表的数据挖掘文章发现了一个:基于两个基因的预后标签,影响因子6.4分。文章简介这项研究旨
医科研
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2023-08-29 06:06
2022-04-08 COVID-19感染后的中长期心血管风险
发表了关于新冠感染后心血管长期风险的文章,Long-termcardiovascularoutcomesofCOVID-19,YanXie,EvanXu,BenjaminBowe,ZiyadAl-Aly(https://www.
nature
.com
朗月斋主
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2023-08-29 02:51
NATURE
:基因-环境协同诱导的表观遗传程序起始肿瘤发生
文章的题目是:Agene–environment-inducedepigeneticprograminitiatestumorigenesis杂志:
Nature
这篇文章利用了胰腺上皮细胞的不同状态作为模型
生信start_site
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2023-08-28 13:24
SciencePlots 基本语法及特点
SciencePlots作为一个专门用于科研论文绘图的第三方拓展工具包,提供了主流英文科技期刊(如
Nature
、Science和IEEE等)的Matplotlib图样式(MatplotlibStyle
timerring
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2023-08-27 20:52
科研论文配图指南
python
matplotlib
scienceplots
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