Nature

Nature｜奥密克戎毒株致病性显著减弱！

图源百度五山生物|报道SARS-CoV-2奥密克戎变异毒株的出现是一个紧迫的全球健康问题。研究者的统计模型表明，奥密克戎变异毒株在包括南非在内的几个国家的传播速度比Delta变异毒株更快。细胞培养实验表明，奥密克戎变异毒株的融合率低于Delta变异毒株，也低于SARS-CoV-2的祖先毒株。尽管Delta的S蛋白被有效地切割成两个亚基，这有助于细胞与细胞的融合，但是与Delta变异毒株、祖先SAR
五山生物·2023-10-09 18:53

用 CloudFlare 加速网站

Nature谷歌云2019对多内信用卡用户不再送$300，放弃服务器同步博客方案，使用GithubPages+CDN方案。
一肩月光·2023-10-09 14:40

跟着Nature学作图：R语言ggplot2画带有置信区间的折线图展示核心基因和非必需基因的数量

论文Achickpeageneticvariationmapbasedonthesequencingof3,366genomesimage.png本地存储s41586-021-04066-1.pdf鹰嘴豆基因组重测序论文，涉及到了泛基因组。最近朋友圈好多人转发这个论文。就找到原文来看了看。论文里的Figure1a基本上泛基因组的论文都会涉及到，正好论文提供了作图的原始数据，所以我们用原始数据尝试来
小明的数据分析笔记本·2023-10-08 19:33

懂你英语 Nature Animals

Atalltree.Thistreeistallandgreen.Ariver.Thisriverislong.Apond.Fishandfrogsliveinthispond.Anocean.Wecan'tdrinkoceanwater.Amountain.Somemountainsareveryhigh.Aforest.Aforesthasmanytrees.Alittledog.Thisli
清水Jenny·2023-10-08 10:56

python并行计算numpy_【Nature文章摘录】NumPy: 从单机到分布式并行计算

原标题：【Nature文章摘录】NumPy:从单机到分布式并行计算点击上图，查看详情本公众号的推送以互联网大数据技术为主，是《互联网大数据处理技术与应用》《Python爬虫大数据采集与挖掘》等课程的配套号
小红薯谈小红书·2023-10-07 19:40

2022-03-17

Nature|免疫细胞改变癌细胞基因解码方式原创榴莲不酥图灵基因收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：榴莲不酥IF=49.962推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：当免疫细胞引发色氨酸短缺时，癌细胞会产生一种蛋白质，
图灵基因·2023-10-07 07:28

The dreamlike fungi that thrives in nature’s damp corners

梦幻般的真菌，茁壮成长在大自然潮湿的角落里。WhileshelteringathomeintheNetherlands,thisphotographerwatchedanarrayoffungiappearamidtherottingwoodandforestlitter.当他在荷兰的家中躲避疫情时，这位摄影师观察到了一系列真菌出现在腐烂的木材和森林枯叶植被上。Oneofthebest-known
__深蓝__·2023-10-07 06:22

2022-02-15科学研究的可重复性到底指的是什么？

今天看到一个让我一眼看去很吃惊的论断：Replicationeffortshavelimitedepistemicvalue（Nature|Vol599|11November2021，byKauêMachadoCosta
Thinker·2023-10-07 05:33

让 AI 释放科研系统的 7 宗罪之一？出版业正在试行 AI 同行评审员，但做决定的仍是人类

Nature一篇最新文章
马行健·2023-10-06 22:09

癌症免疫疗法 CAR-T 的基本原理是什么？

很好的问题，就着新出了一篇nature文章，返朴请来菜菜老师，来为我们讲一讲CAR-T疗法和癌症细胞逃脱CAR-T的“移祸江东”的诡计。
Seurat_Satija·2023-10-06 02:24

2021-11-29

Nature|AI病理预测未知原发性癌症的起源原创榴莲不酥图灵基因今天收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：榴莲不酥IF=49.962推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：不明原发性癌症因为无法确定肿瘤的原发性主要解剖部位
图灵基因·2023-10-06 01:03

Nature Machine Intelligence | “化学元素知识+功能提示”双驱动，探索分子预测新方法

论文题目：Knowledgegraph-enhancedmolecularcontrastivelearningwithfunctionalprompt论文链接：https://doi.org/10.1038/s42256-023-00654-0项目地址：GitHub-HICAI-ZJU/KANO:CodeanddatafortheNatureMachineIntelligencepaper"Kn
奈何辰星无可奈·2023-10-05 20:25

Nature Methods | 空间组学数据库推荐：SODB

此前小编已经为大家介绍过两个空间组数据库SpatialDB和STomicsDB。2023年2月，《NatureMethods》发表了一个综合性的空间组学数据库：SODB。为什么要搭建SODB？主流空间组学技术包含空间转录组、空间蛋白质、空间代谢组等。随着技术的发展，大量的空间组学数据快速产生，并存储在各种异构数据平台中。在具体数据分析之前，首先，研究者必须下载原始数据，然后将其正确处理为标准格式，
wen05054105·2023-10-05 01:17

论文写作一些注意事项

“按照nature/science的语言风格润色文字”4.“完善逻辑并按照nature/science的语言风格润色文字”
ciki_tang·2023-10-04 11:44

Nature Genetics发布最大规模生菜全基因组重测序研究

深圳华大生命科学研究院、深圳国家基因库在四年前启动了生菜重测序计划，与荷兰遗传资源中心合作，对该中心保有的2500多份生菜及野生育种材料展开种质数字化。项目团队对一期的445份重测序数据进行了分析，4月12日，研究成果以“Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedl
尐尐呅·2023-10-04 02:22

Nature重磅发现：人睡着时，肿瘤苏醒，癌细胞在睡眠期间加速分裂和转移扩散

乳腺癌，是目前世界第一大癌症，据世界卫生组织国际癌症研究署（IARC）发布的2020年全球癌症负担数据，全世界每年新增超过226万乳腺癌患者。通常情况下，乳腺癌是肿瘤中预后较好的类型，如果及早发现，患者通常对治疗反应良好。然而，乳腺癌易发生转移，当循环中的癌细胞脱离原肿瘤，并通过血管在体内传播到其他器官或阻止形成新的肿瘤，就发生了癌症转移。如果癌症出现了转移，治疗就会变得非常棘手。然而，目前的癌症
454c5c7ac3a8·2023-10-03 23:38

符合广义相对论的预测，M87黑洞最新研究成果登上Nature

9月27日，《自然》（Nature）杂志发布由45个机构组成的国际科研团队的最新研究成果。
疯狂创作者·2023-10-03 17:45

忆阻器阵列学习笔记

最近阅读组里忆阻器阵列的nature文章，搞清楚很多问题，特别是CNN的算法如何在忆阻器上实现这点，特来整理一波。
icfg66·2023-10-03 13:08

聊聊“充实”这个事情

nature-3038804__480.jpg我不清楚为别人的“充实”的感觉是怎样的?但我感觉一直都不是“充实”的状态。
丁昆朋·2023-10-03 00:57

R plot图片背景设置为透明_万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等...

你和PPT高手之间，就只差一个iSlideExcel改变了你的基因名，30%相关Nature文章受影响，NCBI也受波及特点可以用命令将交互式R图或ggplot2、Lattice或baseR图保存到MicrosoftWor
weixin_39780962·2023-10-02 23:30

2021-11-12

Nature|靶向多肽的CAR-T突破传统限制原创图灵基因图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制费城儿童医院（CHOP）的研究人员开发了一种新的方法来靶向癌细胞内对肿瘤生长和存活至关重要的蛋白质，他们声称这是治疗侵袭性实体癌的一项突破
图灵基因·2023-10-02 05:03

跟着Nature学作图:R语言ggplot2簇状柱形图完整示例

论文Aglobalreptileassessmenthighlightssharedconservationneedsoftetrapodshttps://www.nature.com/articles
小明的数据分析笔记本·2023-10-02 03:41

综述盘点|Nature：利用空间转录组技术探索组织结构

近日，美国纽约大学科研团队在Nature发表综述文章，回顾了常见的空间转录组技术，讨论了这些方法产生的数据的探索原则，检验了空间转录组技术在不同实验设计中的效用，并强调了该技术通过与其他数据模式的整合在生物学上的应用前景
百奥益康·2023-10-01 23:00

gwas数据根据eaf Z 和N 求beta和se

https://www.nature.com/articles/s41590-023-01588-w#Sec10
帅锅不识字·2023-10-01 15:39

Nature重磅综述：单细胞测序技术在癌症免疫治疗领域的应用

今天给大家分享的是2021年4月份发表在NaturereviewsClinicalOncology（IF=53.276）上的综述Applyinghigh-dimensionalsingle-celltechnologiestotheanalysisofcancerimmunotherapy。本文阐述了使用以scRNA-seq为主的单细胞分析技术取得的进展，特别是在肿瘤临床治疗、免疫疗法方面，讨论了
概普生信·2023-10-01 14:54

2022-10-11

揭示静脉输入普通摄入剂量的800倍的维生素C剂量可以有效治疗癌症和白血病摘自：顶尖医学期刊研究报告，扒一扒维生素C你不知道的那些事_干细胞www.sohu.com/a/503317231_121017709《Nature
RENEO博士·2023-09-30 15:05

2022-07-20

Nature|单细胞测序揭示核染色体的位置决定了分离错误的频率原创骄阳似我图灵基因2022-07-2007:13发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制语音朗读本文音频：00:0009:48撰文：骄阳似我
图灵基因·2023-09-30 13:03

宏基因组数据资源 | Nature子刊发表来自人类肠道微生物组的204,938个参考基因组数据集

2020年7月，由欧洲分子生物学实验室欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）领导的国际合作研究团队在《NatureBiotechnology》发表了迄今为止最全面的人类肠道微生物组序列资源：统一的人类胃肠道基因组（UHGG）和人类胃肠道蛋白质（UHGP）目录，包括4,644个肠道微生物的204,938个非冗余基因组以及625,255,473个蛋白全长序列。“这个庞大的目录是微生物组研究的里程碑，
尐尐呅·2023-09-29 17:14

Chinese students in the US: Taking a stand @Nature

GeoffBrumfielisNature'sWashingtonDCphysicalsciencescorrespondent.TopofpageAbstractAprotestbyChinesegraduatestudentsatYaleUniversityhasrevealedtheplightofavulnerableworkforceinUSlabs.GeoffBrumfielinves
weixin_30677475·2023-09-29 13:03

跟着Nature Genetics学画图：R语言ggplot2画曼哈顿图展示XP-CLR score

今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png今天试着重复的图片对应着的是论文中的Figure3a,，曼哈顿图展示的是XP-CLRscore，这个分支具体是什么含义还得仔细学习，群体基因组类的论文通常都有这个数据
小明的数据分析笔记本·2023-09-29 10:27

跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析：R语言ggplot2作图展示方差分解的结果

关于方差分解的内容之前已经分享过两篇推文之前的推文分享过一篇内容是重复了一篇NatureEcology&Evolution期刊论文的方差分解过程，虽然对运行过程还是不太理解，但是能得到结果。今天的推文我们利用得到的结果复现一下论文中的Figure4aimage.png前面的计算过程可以参考推文现在是假设我们已经拿到了计算结果，需要作图，组图用到的示例数据如下image.png（这里不再提供示例数据
小明的数据分析笔记本·2023-09-29 01:08

复现《nature communications》图表（四）：ggplot画多组富集气泡图

还是NC的文章，这次我们探讨下Figure2a，这个富集气泡图可能平平无奇，但是仔细看发现它的横坐标是4个分组。这就值得去学习了，同时复现这个气泡图是为了任何气泡图达到举一反三的效果。图片首先自己构建一个数据，包含GOterms、分组和P值，读入文件。setwd("F:/生物信息学")A%as.data.frame()%>%mutate(group=rep(c("cluster1","cluste
KS科研分享与服务·2023-09-28 04:58

Nature子刊：“臭味相投”，性格相似的人更容易成为情侣！

2023年8月31日，一篇发表在NatureHumanBehaviour杂志上的综述文章吸引了我们的注意。该研究揭示了伴侣间存在相似的特征，不仅包括外在的特征上，如身高、外貌和体型，也在更深层次的特征上进行了探究，如政治观点、宗教信仰、教育水平和智力水平等。我们在生活中经常会发现夫妻之间会越来越相像，也就是常说的“夫妻相”，且现在有越来越多的研究来探究这一现象。这篇文章通过几个不同特性对伴侣之间的
weixin_44693403·2023-09-28 03:57

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画分组折线图和置信区间

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com
小明的数据分析笔记本·2023-09-27 22:17

Nature | 国际半干旱热带作物研究中心携手华大等机构，完成鹰嘴豆大规模基因组研究

北京时间11月11日，国际顶级学术期刊《自然》（Nature）在线发表了题为《全球3,366份鹰嘴豆种质的遗传变异图谱》的研究，通过对鹰嘴豆全球种质资源开展大规模基因组测序和分析，加深了我们对于鹰嘴豆的认识
尐尐呅·2023-09-27 22:44

Biodiversity and Ecosystem Functioning（生物多样性和生态系统功能）

“Biodiversityandstabilityingrasslands”.Nature.367(6461):363–365”和“
柚柚柚子爱吃葡萄柚·2023-09-27 12:18

传说的“长生药”烟酰胺单核苷酸抗衰老吗，谈谈nmn的功效与作用是什么？

近期，烟酰胺单核苷酸（简称NMN）被讨论火热，《Science》、《Cell》、《Nature》等顶级学术期刊上都曾刊登过NMN的相关研究。那么，烟酰胺单核苷酸能抗衰老吗？
王燕腹瑾凉·2023-09-26 21:12

Nature子刊｜Binning宏基因组+单菌验证

土壤砷污染是全球性环境问题，在水稻土壤中主要以二甲基砷（DMAs）形态存在，过量积累DMAs会诱发“直穗病”，影响水稻结实。目前尚无有效的防控措施。今天给大家带来的分享是南京农业大学赵方杰教授团队与中科院微生物所东秀珠团队在土壤二甲基砷脱甲基，缓解水稻直穗病相关领域的研究成果。题目：ISME｜宏基因组binning研究揭示土壤微生物群协同互作二甲基砷脱甲基机制期刊：TheISMEJournal影响
SHANGHAILINGEN·2023-09-26 18:28

国产AI登上《自然》：盘古大模型破解气象领域一大难题

来源：中国青年报国产AI登上国际学术期刊《自然》(Nature)了。北京时间7月6日，《自然》杂志发表了华为云盘古大模型研发团队研究成果——《三维神经网络用于精准中期全球天气预报》。
乐享技术·2023-09-26 14:08

四五年之后的相约，下一次待定

上一次我们一起约饭的时候，还是我去日本之前，张nature刚博士毕业，还在计划下一步要干什么，陈女士，与我，我男朋友都挣扎在博士毕业的圈圈里，如树懒的闪电同志博士毕业在本校做了博后，那时候，我们都差不多
Echo_Mz·2023-09-25 12:58

代码分析 | 单细胞转录组质控详解

前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞
生信宝典·2023-09-25 08:00

Nature Communications | 张阳课题组：端到端深度学习实现高精度RNA结构预测

RNA分子是基因转录的主要执行者，也是细胞运作的隐形功臣。它们在基因表达调控、支架构建以及催化活性等多个生命过程中都扮演着关键角色。虽然RNA如此重要，但由于实验数据的缺乏，准确预测RNA的三维空间结构仍然是目前计算生物学面临的重大挑战之一。近日，新加坡国立大学张阳教授团队在《NatureCommunications》杂志上发表了题为“Integratingend-to-endlearningwi
weixin_4528312·2023-09-25 02:13

Nature | 人工智能模型越大就越好吗？

针对这个趋势，著名科技杂志《Nature》最近发表AnilAnanthaswamy博士的专题文章“人工智能模型总是越大型越好吗？”（InAI,isbiggeralwaysbetter?）。
weixin_4528312·2023-09-25 02:12

Nature引领：于万万细胞中，唯独打击你

近日，顶级期刊《Nature》发表了关于癌症治疗的重磅文章。由牛津大学及约翰•霍普金斯大学的科学家们带来的一篇题为TargetingTRIM37-drivencent
科研猫_2020·2023-09-22 16:44

教育不是灌满一桶水，而是点燃一把火丨25幅漫画犀利对比中西教育

如今，教育家们一直在讨论对于孩子的成长发展，Nature（先天基因）和Nurture（后天环境）哪个影响更大？除了无法改变的先天基因以外，其实教育大多都是在后天环境中被塑造而成。
铱修幸福研习社·2023-09-22 15:03

强化学习实现智能城市规划，清华团队最新成果登Nature子刊

由于城市地理空间的多样性和巨大的动作空间，给城市布局用地和道路是一件非常复杂而困难的任务，长久以来一直依靠人类规划师的经验和直觉。如今，城市规划领域也有了自己的AlphaGo。近日，清华大学电子系城市科学与计算研究中心与建筑学院跨学科合作，首次提出了强化学习的城市社区空间规划模型与方法，并实现了人类规划师与人工智能算法协作的城市规划流程，为智能城市的自动化规划提供了全新思路。该成果以“基于深度强化
数据派THU·2023-09-22 04:42

日更是持续思考自身问题的方式

nature-3289812__480.jpg在微信公众号上持续更新了24天,最大的体会如下:日更会把你的一切存储榨干,直到你一无所有,此时显现的才是你的精华。
丁昆朋·2023-09-21 15:17

基因通路富集分析

Followingtutorialfrom2019NatureProtocol(https://www.nature.com/articles/s41596-018-0103-9)PrerequisiteProjectdirectory
尘世中一个迷途小书僮·2023-09-21 11:58

COVID疫苗加强针来袭，是否该接种？

Sience子刊新研究揭示：COVID-19病毒影响人体线粒体功能，或成治疗新途径NatureMedicine：脑雾、记忆和注意力不集中可能是新冠感染引发的血栓导致的Nature揭秘--为什么有些白人感染新冠病毒后不会生病
生信宝典·2023-09-20 11:46

背靠背 Nature 新方向 - 蛋白质结构家族图谱的“潘多拉魔盒”

NBT-Foldseek快速准确搜索结构相似的蛋白，AlphaFold蛋白质数据库提供了一个快速的搜索工具AlphaFold的极限:高中生揭示人工智能在生物信息学挑战中的缺陷AlphaFold2开源了，不是土豪也不会编程的你怎么蹭一波？对蛋白结构的大规模分析揭示了蛋白质中前所未见的结构单元和蛋白蛋白之间出乎意料的关联关系。GoogleDeepMind利用AlphaFold神经网络预测了几乎所有已知
生信宝典·2023-09-20 11:44
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