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R语言自学笔记
安徽某高校《
R语言
与统计建模》期末上机题复习
考点1一元线性回归模板#假设我们有以下数据x<-c(1,2,3,4,5)#自变量y<-c(2,4,6,8,10)#因变量#使用lm()函数进行线性回归model<-lm(y~x)#查看回归分析的结果summary(model)例题两组数据,分别是最大积雪深度X和当年灌溉面积Y,请回答:X5.13.57.16.28.87.84.55.68.06.4Y1907128727002373326030001
我不是saint
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2023-12-31 15:17
专业课复习
安徽某高校系列
r语言
开发语言
《高效
R语言
编程》5-高效输入输出
软件配置几个包:install.packages(c("rio","readr","data.table","feather","WDI"))关于数据I/O的高级技巧
R语言
自己的文件格式是.Rds,可以使用
zd200572
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2023-12-31 15:44
R语言
实现快速去除孟德尔随机化研究中的混杂因素(1)
#Removeconfoundingfactors#BasicanalysisforMRlibrary(TwoSampleMR)library(phenoscanner)#Exposuredata:aspirin----ukb-b-8755aaa<-extract_instruments(outcomes='ukb-b-8755',clump=TRUE,r2=0.001,kb=10000,acce
weixin_49320263
·
2023-12-31 14:10
GWAS
r语言
R语言
实现计算MR工具变量F-staistics(1)
#F-statistics#Basicanalysis#导入包library(TwoSampleMR)library(MRPRESSO)#导入暴露变量数据:aspirin----ukb-b-8755aaa<-extract_instruments(outcomes='ukb-b-8755',clump=TRUE,p1=5e-08,r2=0.001,kb=10000,access_token=NUL
weixin_49320263
·
2023-12-31 14:10
GWAS
r语言
R语言
孟德尔随机化研究工具包(1)---friendly2MR
friendly2MR是孟德尔岁随机化研究中的一个重要补充工具,可以批量探索因素间的因果关系,以及快速填补缺失eaf的数据,但是存在细微差异需要注意。remotes::install_github("xiechengyong123/friendly2MR")library(friendly2MR)library(friendly2MR)#BasedonTwosampleMR,toinvestiga
weixin_49320263
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2023-12-31 13:02
GWAS
r语言
[原创][
R语言
]股票分析实战[5]:加载股票数据
[简介]常用网名:猪头三出生日期:1981.XX.XXQQ联系:643439947个人网站:80x86汇编小站https://www.x86asm.org编程生涯:2001年~至今[共22年]职业生涯:20年开发语言:C/C++、80x86ASM、PHP、Perl、Objective-C、ObjectPascal、C#、Python开发工具:VisualStudio、Delphi、XCode、Ec
我不是代码教父
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2023-12-31 13:31
#
R语言大数据分析
r语言
股票分析
大数据
sql
自学笔记
(二十)——MySQL8.0版本的新特性(十)
窗口定义window_fun(tioncexpr)OVER(PARTITIONBY...//对数据先进行分组ORDERBY...//分组之后的数据进行排序frame_clause...//它是进一步来限定窗口)这些选项的效果CURRENTROW它表示我们当前要处理的这一行数据MPRECEDING表示当前行的往上M行NFOLLDAING表示当前行的往下N行UNBOUNDEDPRECEDING表示分区
itczt
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2023-12-31 10:35
计算机网络
自学笔记
:应用层协议的原理
应用软件通常在网络边缘的端系统中运行,而不是在网络核心的交换机和路由器上运行,这种模式促进了大量应用的开发和部署。网络核心的交换机和路由器只专注于数据包(分组)的转发。1网络应用程序体系结构应用程序都有一个体系结构。网络应用程序所使用的两种体系结构包括:客户机/服务器(C/S)体系结构或对等(P2P)体系结构。在客户机/服务器体系结构中,有一个总是打开的主机称为服务器,它服务于来自许多其他称为客户
云时之间
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2023-12-31 10:13
R语言
进行相关性分析
相关性分析相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或环境因子)之间进行相关性分析。两个变量之间的相关性可以用简单相关系数(例如皮尔森相关系数等)进行表示,相关系数越接近1,两个元素相关性越大,相关系数越接近0,两
Seurat_Satija
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2023-12-31 09:46
2020-03-30 线性时间序列案例学习—汽油价格
www.math.pku.edu.cn/teachers/lidf/course/fts/ftsnotes/html/_ftsnotes/fts-ltscases-gas.html这一章用三个实例来详细讲解如何用
R语言
和线性时间序列模型分析实际数据
程凉皮儿
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2023-12-31 09:45
R语言
【CoordinateCleaner】——cc_cen(): 移除或标记政治国家和省份的地理质心周围半径内的记录。生物数据库中地理参考较差的发生记录经常被错误地地理参考为质心。
PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_cen(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",species="species",buffer=1000,geod=TRUE,test="both",ref=NULL,verify=FALSE,value="clean",verbose=TRU
ALittleHigh
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2023-12-31 00:17
#
r语言
数据库
开发语言
R语言
【base】——cat() 输出对象,连接表示法,其运行的转换比 print 少得多
Packagebaseversion4.3.2Parameterscat(...,file="",sep="",fill=FALSE,labels=NULL,append=FALSE)参数【...】:R对象。参数【file】:一个connection,或一个命名要打印到的文件的字符串。如果是""(默认值),cat会打印到标准输出连接,即控制台,除非被sink重定向。参数【sep】:字符串向量,用于
ALittleHigh
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2023-12-31 00:47
#
R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【CoordinateCleaner】——cc_zero(): 删除或标记经度或纬度为零的记录,以及经度和纬度为零的点周围的半径。这些问题通常是由于错误的数据输入或地理参考造成的
PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_zero(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",buffer=0.5,value="clean",verbose=TRUE)参数【x】:data.frame。包含地理坐标和物种名称。参数【lon】:字符串。具有经度坐标的列。默认值=“decim
ALittleHigh
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2023-12-31 00:47
#
r语言
开发语言
数据库
R语言
【CoordinateCleaner】——cc_cap(): 删除或标记国家/地区首都周围特定半径范围内的记录。生物数据库中地理参考性差的发生记录经常被错误地地理参考为首都。
PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_cap(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",species="species",buffer=10000,geod=TRUE,ref=NULL,verify=FALSE,value="clean",verbose=TRUE)参数【x】:dat
ALittleHigh
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2023-12-31 00:47
#
r语言
数据库
开发语言
R语言
【base】——使用library判断是否已经安装第三方软件包:library(package, logical.return=TRUE)
Packagebaseversion4.3.2Parameterslibrary(package,help,pos=2,lib.loc=NULL,character.only=FALSE,logical.return=FALSE,warn.conflicts,quietly=FALSE,verbose=getOption("verbose"),mask.ok,exclude,include.onl
ALittleHigh
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2023-12-31 00:46
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R语言【base】
r语言
开发语言
51-
R语言
机器学习:时间序列与因果关系
《精通机器学习:基于R第二版》学习笔记1、数据理解与数据准备使用的数据记录的是年度异常数据,它由某一年的年度地表温度中位数与参考年度(1961~1990)平均温度的差构成。>climatestr(climate)##'data.frame':95obs.of3variables:##$Year:int1919192019211922192319241925192619271928...##$CO2
wonphen
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2023-12-30 23:34
java大数据和javaee哪个好,java与大数据之间的关系
Sourcecodedownload:本文相关源码大数据是目前互联网流行的技术语言,处理大数据的编程语言比较有优势的也很多,比如java、python、go、
R语言
、Hadoop等等,按道理来说每种编程语言都可以处理大数据
chatgpt001
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2023-12-30 17:14
java
代做MATH202-19S2作业、代写Java/c++课程设计作业、Python编程语言作业调试代写
R语言
编程|代做
R语言
编程
MATH202-19S2AssignmentA1Due—4pm,23AugustYourcompletedassignmentshouldbehandedinviatheMATH202boxinthereceptionareaonLevel4oftheErskinebuilding.Youmaydotheassignmentonyourown,orasapairwithoneotherstuden
fujianjia
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2023-12-30 15:07
R语言
【base】——merge(): 通过共同列名或行名合并两个数据帧
Packagebaseversion4.2.0Parametersmerge(x,y,...)##DefaultS3method:merge(x,y,...)##S3methodforclass'data.frame'merge(x,y,by=intersect(names(x),names(y)),by.x=by,by.y=by,all=FALSE,all.x=all,all.y=all,sor
ALittleHigh
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2023-12-30 15:38
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R语言【base】
r语言
数据库
vue.js
回顾2023,自己做了啥呢 |
R语言
绘图
2023年总结2023年即将结束,我们即将迎来2024年。2023年,我们做了什么呢??这个是个值得深思的问题…?12月份是个快乐且痛苦时间节点。前一段时间,单位需要提交2023年工作总结,真的是憋了好久才可以下笔,但下笔后一直在沉思,再回想自己2023年到底做了什么呢?杂事做了很多,但没有成果。害!这就难办了,我们平时在开会时,你口述可以说,我做了这样,做了那样…等等。但是,在写工作总结时,可不
小杜的生信筆記
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2023-12-30 15:38
R语言精美图形绘制教程
r语言
R语言
开发语言
KEGG富集分析
生物信息学
组学
组学分析
2023教程发布最后一个教程 |
R语言
绘图汇总
2023年总结2023年即将结束,我们即将迎来2024年。2023年,我们做了什么呢??这个是个值得深思的问题…?12月份是个快乐且痛苦时间节点。前一段时间,单位需要提交2023年工作总结,真的是憋了好久才可以下笔,但下笔后一直在沉思,再回想自己2023年到底做了什么呢?杂事做了很多,但没有成果。害!这就难办了,我们平时在开会时,你口述可以说,我做了这样,做了那样…等等。但是,在写工作总结时,可不
小杜的生信筆記
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2023-12-30 15:37
R语言精美图形绘制教程
r语言
开发语言
KEGG
富集分析
KEGG富集
生物信息学
R语言
学习笔记:
R语言
基础
文章目录一、
R语言
简介二、选择R的原因三、R基本数据对象(一)向量(二)矩阵(三)数组(四)因子(五)列表(六)数据框(七)函数四、基本函数应用示例五、自定义函数(一)自定义函数定义(二)自定义函数示例
howard2005
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2023-12-30 13:43
R语言基础
学习
笔记
r语言
r语言
独立性检验
卡方检验>library(vcd)>mytablechisq.test(mytable)Pearson'sChi-squaredtestdata:mytableX-squared=13.055,df=2,p-value=0.001463#由上述的内容可以看出:本次检验治疗和改善之后的效果是否与原有的效果显著,由于p=0.001,小于显著性水平,拒绝原假设,接受对立假设,效果是显著的。>mytabl
肖玉贤
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2023-12-30 03:31
R语言
ggplot2画右三角方块热图的简单小例子
还是这幅图image.png本来以为今天的推文可以重复出来的,但还是高估自己了,实现过程遇到了问题,暂时还不知道如何解决,后面想到办法再来介绍吧!今天的推文先介绍右上角的方块热图实现办法吧!首先是方块四周的灰色边框这里使用到的是geom_tile()函数。把填充设置为白色,然后把边框线设置为灰色就可以达成这种效果下面是一个简单小例子示例数据image.png代码library(readxl)df5
小明的数据分析笔记本
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2023-12-30 02:26
Python办公自动化Day3-python-docx
查询段落数删除段落内容但未删除段落插入段落插入分页符段落样式对齐方式自带样式缩进与间距Run介绍/读取Run添加/修改/删除RunRun样式小案例文章声明⭐⭐⭐该文章为我(有编程语言基础,非编程小白)的Python办公自动化
自学笔记
知识来源为
斯丢匹德先森
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2023-12-29 20:03
关于Python
python
开发语言
HarmonyOS自学-Day4(TodoList案例)
TodoList小案例文章声明⭐⭐⭐该文章为我(有编程语言基础,非编程小白)的HarmonyOS
自学笔记
,此类文章笔记我会默认大家都学过前端相关的知识知识来源为HarmonyOS官方文档,归纳为自己的语言与理解记录于此不出意外的话
斯丢匹德先森
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2023-12-29 20:03
关于HarmonyOS
harmonyos
华为
HarmonyOS自学-Day3(做个登录功能小案例)
登录功能小案例文章声明⭐⭐⭐该文章为我(有编程语言基础,非编程小白)的HarmonyOS
自学笔记
,此类文章笔记我会默认大家都学过前端相关的知识知识来源为HarmonyOS官方文档,归纳为自己的语言与理解记录于此不出意外的话
斯丢匹德先森
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2023-12-29 20:32
关于HarmonyOS
harmonyos
华为
R语言
| 缺失值判断
缺失值判断一、缺失值判断通常用“NA"表示,判断数据是否存在缺失值的常用方法使用函数is.na()使用函数is.na(),该函数是判断缺失值的最基本的函数。可以用于判断不同的数据对象,如向量、列表和数据框.其函数的基本书写格式为:is.na(x)判断数据集中是否存在缺失值,如果存在,返回TRUE;如果不存在,则返回FALSE例:>library(DMwR)>data("algae")>sum(is
mint1104
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2023-12-29 19:01
R语言
数据分析
数据挖掘
r语言
R语言
:缺失值处理
前言 一个完整的处理方法通常包含以下几个步骤: (1)识别缺失数据; (2)检查导致数据缺失的原因; (3)删除包含缺失值的实例或用合理的数值代替(插补)缺失值。 但遗憾的是,仅有识别缺失数据是最清晰明确的步骤。知道数据为何缺失依赖于你对数据生成过程的理解,而决定如何处理缺失值则需要判断哪种方法的结果最为可靠和精确。 统计学家通常将缺失数据分为三类。它们都用概率术语进行描述,但思想都非
猪逻辑公园
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2023-12-29 19:31
R语言
R语言
arabic2kansuji包,将阿拉伯数字转换为汉字数字。
WeChatScreenshot_20210109104046.png#SatJan0910:36:192021-#字符编码:UTF-8#R版本:Rx644.0.3forwindow10#
[email protected]
#个人笔记不负责任#——拎了个梨.rs.restartR()require(arabic2kansuji)rm(list=ls());gc()arabic2kansuji(2
youmigo
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2023-12-29 17:17
R语言
【base】——sprintf():接受格式化文本和变量值来搭建字符型向量。
Packagebaseversion4.2.0Parameterssprintf(fmt,...)gettextf(fmt,...,domain=NULL,trim=TRUE)参数【fmt】:格式字符串的字符向量,每个字符串最多8192个字节。参数【...】:要传递给参数【fmt】的值。仅支持逻辑向量、整数向量、实数向量和字符向量,但会进行一些强制。最多100。参数【trim,domain】:参见
ALittleHigh
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2023-12-29 16:21
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【base】——names():用于获取或设置对象名称的函数
Packagebaseversion4.2.0Parametersnames(x)names(x)<-value参数【x】:一个R对象。参数【value】:与参数【x】长度相同的字符向量,或者NULL。Detailsnames是一个通用访问函数,而names<-是一个通用替换函数。默认方法用于获取和设置向量(包括列表)或配对表的"names"属性。对于环境env,names(env)会给出相应列表
ALittleHigh
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2023-12-29 16:21
#
R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【base】——读取或设置类矩阵对象的行或列名:rownames() 和 colnames()
Packagebaseversion4.3.2Parametersrownames(x,do.NULL=TRUE,prefix="row")rownames(x)<-valuecolnames(x,do.NULL=TRUE,prefix="col")colnames(x)<-value参数【x】:一个类似矩阵的R对象,colnames至少有两个维度。参数【do.NULL】:逻辑。如果为FALSE且
ALittleHigh
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2023-12-29 16:51
#
R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【stats】——处理R对象中的缺省值:na.fail(), na.omit(), na.exclude(), na.pass()
Packagestatsversion4.3.2Parametersna.fail(object,...)na.omit(object,...)na.exclude(object,...)na.pass(object,...)参数【object】:R对象,通常是一个数据帧。参数【...】:特殊方法可能需要的其他参数。目前,它们只能处理向量、矩阵以及由向量和矩阵组成的数据帧。如果na.omit删除了
ALittleHigh
·
2023-12-29 16:51
R语言
r语言
开发语言
R语言
【base】——which():给出逻辑对象的 TRUE 索引,允许使用数组索引。
Packagebaseversion4.2.0Parameterswhich(x,arr.ind=FALSE,useNames=TRUE)arrayInd(ind,.dim,.dimnames=NULL,useNames=FALSE)参数【x】:逻辑向量或数组。允许省略NA(视作FALSE)。参数【arr.ind】:逻辑;当参数【x】是一个数组时,是否应返回数组索引?除了单个真值外,其他任何值都会
ALittleHigh
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2023-12-29 16:51
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【base】——dir.exists()和dir.create()目录和文件权限的操作
Packagebaseversion4.3.2Parametersdir.exists(paths)dir.create(path,showWarnings=TRUE,recursive=FALSE,mode="0777")Sys.chmod(paths,mode="0777",use_umask=TRUE)Sys.umask(mode=NA)参数【path】:是一个字符向量,包含一个路径名。参数
ALittleHigh
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2023-12-29 16:20
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【rgbif】——name_backbone()和name_backbone_verbose()在 GBIF 分类树中查找名称。
Packagergbifversion3.7.8Parametersname_backbone(name,rank=NULL,kingdom=NULL,phylum=NULL,class=NULL,order=NULL,family=NULL,genus=NULL,strict=FALSE,verbose=FALSE,start=NULL,limit=100,curlopts=list())nam
ALittleHigh
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2023-12-29 16:20
#
rgbif
r语言
人工智能
R语言
【base】——file.path() 构建文件路径
Packagebaseversion4.3.2Parametersfile.path(...,fsep=.Platform$file.sep)参数【...】:字符矢量。不支持长向量。参数【fsep】:要使用的路径分隔符(假定为ASCII)。由于该函数在R中被广泛使用,因此其实现设计得非常快(比paste更快)。它也可用于PATH和R_LIBS等环境路径,使用fsep=.Platform$path.
ALittleHigh
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2023-12-29 16:20
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【base】——将单个 R 对象写入文件并将其还原的函数:saveRDS(),readRDS() 和 infoRDS()
Packagebaseversion4.3.2ParameterssaveRDS(object,file="",ascii=FALSE,version=NULL,compress=TRUE,refhook=NULL)readRDS(file,refhook=NULL)infoRDS(file)参数【object】:要序列化的R对象。参数【file】:连接或R对象保存或读取的文件名。参数【ascii
ALittleHigh
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2023-12-29 16:20
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
整洁编码的12大原则
对于
R语言
新手,也建议大家规范编码。刚开始可能不习惯,但如果坚持练习,很快就能适应并成为你的第二天性,看着不规范的代码就难受,代码完美主义技能get。本文我们就来学习一下
R语言
整洁编码的12大原则。
简说基因-专业生信合作伙伴
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2023-12-29 16:50
r语言
开发语言
R语言
【base】——字符转换和大小写:chartr(),tolower(),toupper(), casefold()
Packagebaseversion4.3.2Parameterschartr(old,new,x)tolower(x)toupper(x)casefold(x,upper=FALSE)参数【x】:字符向量,或可通过as.character强制转换为字符的对象。参数【old】:字符串,指定要转换的字符。如果提供的字符向量长度为2或更长,则使用第一个元素并发出警告。参数【new】:指定转换的字符串。
ALittleHigh
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2023-12-29 15:13
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
学习笔记-R包的安装
推荐在线安装,可以解决包与包之间的依赖关系。1.首先在RGui:2.在RStudio的console下:如安装ggplot2包,则:install.packages("ggplot2")生信方面:首先安装:install.packages("BiocManager")则就可以这样安装ggplot2包:BiocManager::install("ggplot2")
生信研究猿
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2023-12-29 10:12
R语言课程笔记
学习
2019-04-19 R读取csv文件 绘制散点和密度图代码
原csv文件部分截图:字段名
R语言
绘图首先需要加载包install.package(ggplot2)#如果已经下载就不用install.packageinstall.package(reshape2)#
今年二圆可以到一百吗
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2023-12-28 18:27
机器学习系列--
R语言
随机森林进行生存分析(1)
随机森林(Breiman2001a)(RF)是一种非参数统计方法,需要没有关于响应的协变关系的分布假设。RF是一种强大的、非线性的技术,通过拟合一组树来稳定预测精度模型估计。随机生存森林(RSF)(Ishwaran和Kogalur,2007;Ishwaraan,Kogalur、Blackstone和Lauer(2008)是Breimans射频技术的延伸从而降低了对时间到事件数据的有效非参数分析。R
天桥下的卖艺者
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2023-12-28 16:59
R语言
机器学习
机器学习
r语言
随机森林
R语言
机器学习与临床预测模型36--随机森林Random Forest
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】01什么是随机森林?
科研私家菜
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2023-12-28 15:21
HTML
自学笔记
摘要本片是在老师理论知识的指导下进行自己尝试总结(理论有部分搬运了老师的教程),自己并做了一些尝试,最后结果还是很丑陋。但是我会不断完善的。之后又自学了一些相关课程文章目录摘要一、HTML简介二、HTML文档结构:fire:HTML元素:fire:文本格式:fire:超链接:fire:图片及文件路径:fire:表格:fire:列表:fire:表单Form:fire:其它三、结果四、补充视频学习:s
lee_824
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2023-12-28 14:31
WEB学习
html
css
web
R语言
|ggtreeExtra包绘制进化树
R包-ggtreeExtra绘制进化树ggplot2提供的geom_tile图层可以画热图了,ggplot2的geom_point或者ggstar的geom_star可以绘制点图层。为了扩展ggtree在点和布局中的系统发育树的外环上呈现相关数据,开发的ggtreeExtra包提供了一个函数,geom_fruit用于将图形与树对齐,相关图表将在树的外部面板的不同位置对齐。还开发geom_fruit
维凡生物
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2023-12-28 10:47
【
R语言
科研绘图】--- 柱状图
R语言
科研绘图——柱状图柱状图
R语言
科研绘图——柱状图前言一、柱状图二、使用工具1.所使用的包2.数据特征3.绘图3.1两组均值之间的比较3.2多组均值之间的比较后记前言使用
R语言
绘制能够发表的图片,ggplot2
生信小鹏
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2023-12-28 09:12
科研绘图
R
for
Data
Science
r语言
【
R语言
科研绘图】——韦恩图
构建数据set.seed(20190708)genes<-paste("gene",1:1000,sep="")x<-list(A=sample(genes,300),B=sample(genes,525),C=sample(genes,440),D=sample(genes,350))使用ggVennDiagram绘制韦恩图比较经典的韦恩图是使用venndiagram作图,但是缺点是不能使用pd
生信小鹏
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2023-12-28 09:12
科研绘图
数据挖掘
r语言
数据分析
R语言
机器学习与临床预测模型25--净重新分类指数
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】01什么是净重新分类指数NRI?
科研私家菜
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2023-12-28 09:42
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