R语言课程笔记

跟着Microbiome学作图：R语言ggplot2画堆积柱形图展示微生物门水平的相对丰度

论文Reduceddiversityandalteredcompositionofthegutmicrobiomeinindividualswithmyalgicencephalomyelitis/chronicfatiguesyndrome本地文件Giloteaux2016_Article_ReducedDiversityAndAlteredComp.pdfimage.png今天的推文我们来重复
小明的数据分析笔记本·2024-01-26 04:46

Day 4 生信小组学习笔记 御风而行

今日任务：R语言基础1R语言基础环境配置无需云服务器，直接在windows操作系统进行注意避免中文安装路径，否则无法识别（已提前安装成功）Rstudio调节镜像源Rstudio内可直接调节默认设置安装Rpackagesinstallpackages
sario0416·2024-01-25 22:11

黑马 python课程笔记4——list

数据容器python中的数据容器：一种可以容纳多份数据的数据类型，容纳的每一份数据称之为1个元素。每一个元素，可以是任意类型的数据，如字符串、数字、布尔等。list列表基本语法：#字面量[元素1,元素2,元素3,元素4,...]#定义变量变量名称=[元素1,元素2,元素3,元素4,...]#定义空列表变量名称=[]变量名称=list()#案例演示：name_list=['tom','jack','
Minus478256·2024-01-25 19:43

公文写作与处理课程笔记01

学习目标与要求能全面系统的掌握机关公文写作与处理的基本理论、基本知识与基本技能，认识机关公文形成与处理的基本规律，了解和熟悉我国国家机关与组织现行的公文种类、体式与稿本、行文规范、法定公文文种和其他常用文种的写作要求与技能，以及机关公文办理、公文立卷与归档的程序、原则与方法。培养和提高撰拟公文和处理公文的能力。课程主要内容分为十章第一章公文概述第二章公文写作原理第三章指挥决策类公文第四章公布知照类
DoneForMe·2024-01-25 16:11

R语言可视化分面图、假设检验、单变量分组多水平t检验并指定参考水平、可视化单变量分组多水平分面箱图（faceting boxplot）并添加显著性水平、指定显著性参考水平

R语言可视化分面图、假设检验、单变量分组多水平t检验并指定参考水平、可视化单变量分组多水平分面箱图（facetingboxplot）并添加显著性水平、指定显著性参考水平目录
statistics.insight·2024-01-25 15:45

R语言数据排序

#数据排序#在R中，可以使用Order()函数对一个数据框进行排序。默认的排序顺序是升序。#在排序变量的前面加一个减号即可得到降序的排序结果#例子#order()函数返回的是被排序的列从小到大的依次的位置order(leadership$age)newdata<-leadership[order(leadership$age),]newdata#降序newdata<-leadership[orde
小白15138·2024-01-25 12:12

R语言ggplot画双坐标-柱状图、折线图

ggplot一般不用来画双坐标，有些图双坐标结合起来看比较好，比方说条形图和柱状图。1.画双坐标要用到函数scale_y_continuous，这个函数规定次坐标与主坐标的换算关系，用sec_axis(~./57.69231）来设置，其中57.69231这个换算系数可以根据实际情况调整；2.画了双坐标，需要指定谁在次坐标上显示，那么在次坐标要缩小的倍数，在需要显示在次坐标的数据就需要提升多少倍，这
daydayup8888·2024-01-25 12:37

R语言-检验正态性

1.为什么要检验正态性首先需要明确正态性与正态分布是有区别的，正态分布（标准分布）是统计数据的分布方式，是个钟形曲线，已平均值为对称轴，数据在对称轴两侧对称分布。正态性是检验实际数据与标准正态分布的相似程度，相似程度高，说明具有正态性。很多的统计方法是基于正态分布使用的，如T检验、方差检验等，因此需要检验数据的正态性。2.检验正态性的方法检验正态性常用的方法包括：1.看分布正态分布是个钟形分布，因
daydayup8888·2024-01-25 12:34

R语言VRPM包绘制多种模型的彩色列线图

列线图，又称诺莫图（Nomogram），它是建立在回归分析的基础上，使用多个临床指标或者生物属性，然后采用带有分数高低的线段，从而达到设置的目的：基于多个变量的值预测一定的临床结局或者某类事件发生的概率。列线图(Nomogram)可以用于多指标联合诊断或预测疾病发病或进展。近些年来在高质量SCI临床论文中用的越来越多。列线图将回归模型转换成了可以直观的视图，让结果更容易判断，具有可读性，例如：咱们
天桥下的卖艺者·2024-01-25 12:34

R语言【taxlist】——对多样性记录的物种列表使用 taxlist 的指南

1.起步（安装与加载）taxlist包通过一个对象类和功能（方法）处理分类数据。同名对象类taxlist可以进一步与生物多样性记录联系起来(例如，用于植被样地的观测)。taxlist包是在repositoryGitHub(https://github.com/kamapu/taxlist)上开发的，可以使用devtools包安装在R-session中：library(devtools)instal
ALittleHigh·2024-01-25 12:04

自律仪式感课程笔记

1.每周的学习内容2.冥想3.自律仪式感种瓜得瓜种豆得豆4.行动，是思维的管道5.早上不用刷朋友圈6.定三只青蛙7.复盘8.选出自己高效的时间段9.做早餐10.静心11.具象未来12.运动起来13.自律清单图片发自App图片发自App图片发自App
百思方成Helen·2024-01-25 12:22

嵌入式培训机构四个月实训课程笔记（完整版）-Linux ARM平台编程第二天-ARM汇编（物联技术666）

链接：https://pan.baidu.com/s/1bG0tuVaACATvjLwD05j1FQ?pwd=1688提取码：1688上午：ARM编程模型下午：常用ARM指令教学内容：1、ARM数据类型字节（Byte）：在ARM体系结构及常见的8位/16位处理器体系结构中，字节的长度均为8位字（Word）：在ARM体系结构中，字的长度为32位，而在8位/16位处理器体系结构中，字的长度一般为16位
vx349014857·2024-01-25 11:32

嵌入式培训机构四个月实训课程笔记（完整版）-Linux ARM平台编程第三天-自己编写Bootloader---基本功能流程（物联技术666）

链接：https://pan.baidu.com/s/1KE2cq_kHaRW5HsP29hgL6w?pwd=1688提取码：1688CPU上电后会从IO空间的某地址取第一条指令。但此时：PLL没有启动，CPU工作频率为外部输入晶振频率，非常低;CPU工作模式、中断设置等不确定;存储空间的各个BANK(包括内存)都没有驱动，内存不能使用。在这种情况下必须在第一条指令处做一些初始化工作，这段初始化程
vx349014857·2024-01-25 11:32

嵌入式培训机构四个月实训课程笔记（完整版）-Linux ARM平台编程第三天-Bootloader编写（物联技术666）

链接：https://pan.baidu.com/s/1KE2cq_kHaRW5HsP29hgL6w?pwd=1688提取码：1688链接脚本0.Contents1.概论2.基本概念3.脚本格式4.简单例子5.简单脚本命令6.对符号的赋值7.SECTIONS命令8.MEMORY命令9.PHDRS命令10.VERSION命令11.脚本内的表达式12.暗含的连接脚本1.概论编译的过程得到的obj文件，
vx349014857·2024-01-25 11:02

嵌入式培训机构四个月实训课程笔记（完整版）-C++和QT编程第六天-Qt UDP编程（物联技术666）

链接：https://pan.baidu.com/s/1-u7GvgM0TLuiy9z7LYQ80Q?pwd=1688提取码：1688在Qt中提供了QUdpSocket类来进行UDP数据报（datagrams）的发送和接收。这里我们还要了解一个名词Socket，也就是常说的“套接字”。Qt网络之UDP网络基础学习是本文要介绍的内容，UDP（UserDatagramProtocol即用户数据报协议）
vx349014857·2024-01-25 11:27

R语言read.csv函数读取数据时的一个报错

读取数据用到的命令是df<-read.csv("example.csv",header=T,row.names=1)报错信息是Errorinmake.names(col.names,unique=TRUE):invalidmultibytestring1解决办法：重新将这个csv文件另存为一个新的csv文件，注意选择下面的CSV(逗号分隔)（.csv），而不是CSVUTF-8（逗号分隔）（.csv
小明的数据分析笔记本·2024-01-25 10:39

R语言作业之两个文件中相同列匹配加文件合并

冬至快到了，祝大家快乐，今天要和大家分享的是：在R语言中，如何将两个文件中样本名称相同的列匹配并且将相同的样本名称的其余信息一起匹配合并。
wx科研风雨路·2024-01-25 09:59

GEO数据挖掘学习笔记二

学习教程来源于《手把手教你GEO数据库差异基因分析》本次学习笔记内容为通过GEO2R在线工具进行差异基因分析通过了解，个人觉得这个方法相比R语言的优势是更普适性，以及更加“傻瓜”，方便学不明白R语言的同学
slim_zhang·2024-01-25 06:30

R语言rvest爬虫如何设置ip代理？

在R语言中使用rvest进行网络爬虫时，可以使用代理服务器来隐藏真实IP地址。有一些R包可以帮助爬虫中设置代理，其中一个常用的包是httr。
一连代理·2024-01-25 06:07

长投基金初级课程笔记 第二天 开扒基金家族

今天是基金课学习的第2天，我们的复习如约而至。还没有听课的小伙伴记得赶紧抽空去听一下课程哟~每天三件事，听课是首要的。现在呢~学长带着大家一起开扒基金家族在第一节里，百合学姐先告诉了基金可以从四个维度进行分类，这四个维度分别是：1.按投资品种分类；2.按交易渠道分类；3.按运作方式分类；4.按投资方式分类这四个维度具体都是如何分类的呢？我们一起来看看首先，按照投资品种分，基金可以分为4类，分别是：
爱喜和·2024-01-25 05:40

240124作图：R做横向barplot

参考的以下内容进行堆积条形图的制作：R语言可视化:堆积柱状图和百分比堆积柱状图-知乎(zhihu.com)但是做完了的图一长条，不太好看，想改成横向的：在ggplot作图代码后加上一个coord_flip
丁优雅ya·2024-01-25 05:23

读书变现Day28

DAY28:如何借力打力，用最小成本启动一个属于自己的读书会，变身知识IP时间：2019年12月18日学员：无敌小飞虾一、课程笔记：本节课主题：启动一个线下读书会彼得.德鲁克：现代管理学之父“知识经济的大幕即将拉起
无敌小飞虾·2024-01-25 04:16

Linux课程笔记——Linux相关指令（3）进阶指令

1、df-h（显示磁盘空间）-h：表示转换格式，以可读性较高形式显示大小2、free-m（查看内存使用情况）-m：表示以MB格式显示内存大小3、head作用：查看一个文件的前n行格式：head-n文件路径-n：表示数字，如果不指定则默认显示前10行4、tail（tail：尾部）作用：查看一个文件的尾10行格式：tail-n：n表示数字，如果不指定则默认显示前10行5、less（less：少）作用：
人类清洗计划·2024-01-25 03:45

R语言实战--第7章

7.1描述性统计分析1.描述性统计量命令--自带如：summary(mtcars[vars])#var代表mtcars中的某一个变量注：summary()函数提供了最小值、最大值、四分位数和数值型变量的均值，以及因子向量和逻辑型向量的频数统计。--自带函数fivenum()可返回图基五数总括（Tukey’sfive-numbersummary，即最小值、下四分位数、中位数、上四分位数和最大值）。-
明明就_faf8·2024-01-24 23:24

R语言对数据进行标准化处理

有时候，在分析数据时，需要对数据进行直线转换，也就是将数据做标准化处理，标准化处理的结果称为标准分数，标准化处理的转换公式如下：举例说明：首先，导入数据其次，转换成标准分数，并以向量形式输出最后，保留小数点位数data<-read.table("clipboard",header=T)#导入数据A<-as.matrix(data[,2:4])#将数据框转换为矩阵colnames(A)<-NULL#
小记专家·2024-01-24 21:14

R语言：将数据框转化为矩阵并进行相关矩阵运算

一般情况下，R语言直接导入的数据都是有标题的数据框，那么在进行计算矩阵相关的运算时，要首先将数据框的数据转化为矩阵形式。
小记专家·2024-01-24 21:13

R语言【taxa】——is_*()：检查对象是否为某个类

is_classification(x)检查对象是否为classification类。is_internode(x)检查每个分类单元是否为节间。节间是指一个分类单元恰好有一个上级分类单元和一个下级分类单元。这些分类群可以在不丢失它们之间的关系信息的情况下被移除。xxis_taxon(x)[1]TRUE>is_taxon(1:2)[1]FALSEis_taxonomy(x)检查对象是否为taxono
ALittleHigh·2024-01-24 21:27

R语言【taxa】——leaves()和n_leaves()：每个分类群的冠群和冠群数量

Packagetaxaversion0.4.2leaves(x,value=NULL,...)获取每个分类单元的冠群索引或其他每个分类单元的值。leaves是没有下级分类群的分类群。参数【x】：获取leaves的对象，比如taxonomy。参数【value】：要返回的东西，而不是索引。长度必须与分类群数相同。参数【...】：其余参数。>x1:Carnivora├─2:Felidae│└─3:Pan
ALittleHigh·2024-01-24 21:57

跟着Nature Genetics学作图：R语言ggplot2散点图及多图共享图例

论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.p
小明的数据分析笔记本·2024-01-24 20:34

UnityShader实例09:Stencil Buffer&Stencil Test

好在unity的shaderlab和D3D，OpenGL等shader语言是一致的，还可以从它们的相关解释来了
lupeng0330·2024-01-24 19:39

R语言【taxa】——as_data_frame()：将 taxa 的对象 转换为 data.frame

Packagetaxaversion0.4.2Description将taxa对象包含的信息转换为data.frame，信息保存在列中。如果使用as_tribble则转换为表格。Usageas_data_frame(x,row.names=NULL,optional=FALSE,...,stringsAsFactors=FALSE)Arguments参数【x】：由taxa定义的一个对象。比如tax
ALittleHigh·2024-01-24 19:30

R语言rayrender包，csg_torus圆环体

R语言rayrender包，csg_torus圆环体image.png#ThuJun1722:33:202021-#字符编码：UTF-8#R版本：Rx644.1forwindow10#cgh163email
youmigo·2024-01-24 18:44

R语言【taxlist】——as()：将 taxlist 对象强制转换为 list 对象

Packagetaxlistversion0.2.4Description可以应用S4对象到list对象的强制转换来探索它们的内容，避免由它们的验证引起的错误。UsageS4_to_list(x)Argument参数【x】：一个taxlist类对象或任意S4类。Details将taxlist对象强制转换为list对象。Value一个list类对象。Examples将taxlist对象转换为list
ALittleHigh·2024-01-24 18:23

R语言【taxlist】——add_concept()，update_concept()：将新的分类概念添加到 taxlist 类对象中

Packagetaxlistversion0.2.4Descriptioin将新的分类概念添加到现有的taxlist对象中的可替换方法。Usageadd_concept(taxlist,TaxonName,...)##S4methodforsignature'taxlist,data.frame'add_concept(taxlist,TaxonName,...)##S4methodforsign
ALittleHigh·2024-01-24 18:52

R语言【taxlist】——backup_object()，load_last()：创建和加载 R 对象备份

Packagetaxlistversion0.2.4Description当处理数据变得有风险时，最佳实践是生成备份文件。backup_object()方法是save()方法的包装器，向结果文件（扩展名为*.rda的R映射文件）的名称添加时间戳和后缀。load_last()方法识别这种格式，并将最新备份版本加载到会话中。Usagebackup_object(...,objects=characte
ALittleHigh·2024-01-24 18:52

R语言【taxa】——internodes()：获得中间节点

Packagetaxaversion0.4.2Description获取每个分类单元或其他每个分类单元值的节点间索引。节间是一个恰好有一个上级分类群和一个下级分类群的分类群。这些分类群可以在不丢失剩余分类群之间关系信息的情况下被移除。Usageinternodes(x)Argument参数【x】：用来获取中间节点的对象，比如一个taxonomy对象。Examplex1:Carnivora├─2:F
ALittleHigh·2024-01-24 18:49

2021-09-30财富之法：财富战略就是一张地图

2021-09-30财富之法：财富战略就是一张地图课程笔记：一、逆流层没有自由，消耗很多的时间精力，处在压力、抱怨、散漫、迷茫，甚至无助的状态里面。
生命是一场觉醒之旅·2024-01-24 16:47

R语言【taxa】——as_taxon()：转换为 taxon 对象

Packagetaxaversion0.4.2Description将其他对象转换为taxon向量。taxon构造器可能将基础向量转换为taxon向量。Usageas_taxon(x,...)Arguments参数【x】：要转换为taxon向量的对象。参数【...】：其余参数。Examplesxa33554|CarnivoraBowdich1821|orderb9681|FelidaeFische
ALittleHigh·2024-01-24 14:45

绘图提高篇 | R-gstat-ggplot2 IDW计算及空间插值可视化

R-gstat进行IDW插值计算和使用ggplot2进行可视化绘制，主要涉及的知识点如下：R-gstat包IDW插值计算R-ggplot2IDW插值结果可视化绘制R-gstat包IDW插值计算得益于优秀且丰富的R语言第三方包
数据魅力(DataCharm)·2024-01-24 14:39

R语言【taxa】——df_ref()：有效的 分类信息数据库

Packagetaxaversion0.4.2Description定义可以被taxon_db对象使用或使用taxon_db对象的有效分类数据库，例如taxon_id和taxon。使用db_ref$get查看数据库的详细信息。用户可以使用db_ref$set创建自定义的数据库，并添加到数据库列表中。每个数据库都必须包含下列信息：数据库对应的网站的URL一段简短的描述定义有效的类群ID的正则表达式数
ALittleHigh·2024-01-24 10:15

陈艺新老师高情商课程笔记

每一份抱怨的背后都有期待，每一个指责背后都有需求。你有权利有期待，并且你要为这个期待负责，假如对方做不到，我允许对方达不到我的期待。因为没有人有义务满足我的期待，感恩的反义词是应该。1.察觉自己的期待2.清晰地表达自己的期待3.合理的看待期待.4.允许对方做不到.转念，培养自己的成长型思维。理性的信念：有希望，向往，并不可怕，高挫折忍受力，接受成长型思维。1.我是对的，别人也未必是错的.2改变总是
卡玫·2024-01-24 09:30

R语言绘制moran散点图坐标原点不在（0，0）处以及如何给点加上标签的问题

其实如果仔细看可以发现该图的原点不在（0，0）处，但是所有的论文及参考书目中moran散点图的原点都是（0，0），事实上，这是因为原始数据未进行scale标准化的结果，即如果想得到原点在（0，0）处的图只需要在R语言
球球今天好好学习了吗？·2024-01-24 09:11

R语言专题班（训练营：2023.10.23~10.30）

茗创科技专注于脑科学，涵盖（EEG/ERP，fMRI，结构像，DTI，ASL，FNIRS）等，欢迎留言讨论及转发推荐，也欢迎了解茗创科技的脑科学课程，数据处理服务及脑科学工作站销售业务，可添加我们的工程师（微信号MCKJ-zhouyi或17373158786）咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技·2024-01-24 07:10

R语言之grep函数和正则通配符查询

mod=viewthread&tid=5162&extra=page%3D1https://blog.csdn.net/piaoyu94/article/details/76416355在R语言的道路上又学到了一个新知识
renyige1021·2024-01-24 07:41

R语言ggtree：将进化树中的序列id改成物种名称

本篇推文介绍一下使用R语言的ggtree包实现这个目的这个问题是来源于公众号的一位读者的提问Snipaste_2021-01-14_10-32-30.png大家可以关注我的公众号小明的数据分析笔记本留言相关问题
小明的数据分析笔记本·2024-01-24 07:33

R语言【taxa】——classification()：储存分类树的分类信息

Packagetaxaversion0.4.2Usageclassification(x=NULL,taxonomy=NULL,.names=NULL)Arguments参数【x】：以下之一：一个列表，每个元素表示一组嵌套的类群。列表内容允许是任何能够转换为taxon的格式。一个taxonomy对象中单个taxon对象的索引或名称，taxonomy对象由参数【taxonomy】指定。长度不限，但必
ALittleHigh·2024-01-24 06:43

毕向东课程笔记——Java语言基础

Java语言基本组成关键字Java中的关键字标识符在程序中定义的一些名称,由26个英文字母大小写、数字、0-9符号、_、$组成。定义合法标识符规则：数字不可以开头不可以使用关键字Java中严格区分大小写注意：在取名时，为了提高阅读性，要尽量有意义Java中的名称规范：包名：多单词组成时所有字母都小写：xxxyyyzzz类名接口名：多单词组成时，所有单词的首字母大写：XxxYyyZzz变量名和函数名
XenaLiu·2024-01-24 06:12

嵌入式培训机构四个月实训课程笔记（完整版）-Linux ARM平台编程第一天-嵌入式系统概述（物联技术666）

链接：https://pan.baidu.com/s/1-u7GvgM0TLuiy9z7LYQ80Q?pwd=1688提取码：1688上午：嵌入式系统概述下午：嵌入式系统的搭建教学内容：1、什么是嵌入式系统以应用为中心，以计算机为基础，软硬件可裁剪，适用需求，对性能、要求、成本、体积、功耗等有严格要求。2、制作boot\kernel\yaffs三个文件的流程：一、安装交叉编译器#cd/home/l
vx349014857·2024-01-24 04:34

嵌入式培训机构四个月实训课程笔记（完整版）-Linux ARM平台编程第一天-ARM常见问题1-100问（物联技术666）

链接：https://pan.baidu.com/s/1-u7GvgM0TLuiy9z7LYQ80Q?pwd=1688提取码：1688第1问:Q:请问在初始化CPU堆栈的时候一开始在执行movr0,LR这句指令时处理器是什么模式A:复位后的模式,即管理模式.第2问:Q:请教:MOV中的8位图立即数,是怎么一回事0xF0000001是怎么来的A:是循环右移,就是一个0—255之间的数左移或右移偶数位
vx349014857·2024-01-24 04:34

嵌入式培训机构四个月实训课程笔记（完整版）-Linux ARM平台编程第一天-ARM常见问题101-289问（物联技术666）

链接：https://pan.baidu.com/s/1-u7GvgM0TLuiy9z7LYQ80Q?pwd=1688提取码：1688第101问:Q:单步调试i2cINT.C在ISendStr中启动总线后,程序怎么又跑到vectors.o中,进行初始化了呢A:由于VIC的限制,程序不能在0x18停下来,否则执行非向量中断.如果没有设置,则非向量中断为0,将从0地址执行.建议:有中断时不要单步执行程
vx349014857·2024-01-24 04:34
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