列表向量的元素要求是同类型，列表则可以组合不同类型的元素。>j=list(name="Joe",salary=55000,union=T)#包含等字符串，数字等>j$name[1]"Joe"$salary[1]55000$union[1]TRUE>students=list(names=c("Tom","Ammy","BioInfoCloud"),ID=c(1,2,3))>students$nam

今天在使用R绘制风险三联图时，我跟着教程的命令输进去，R确不断报错，教程的命令如下：fit<-cph(Surv(time,status)~ANLN+CENPA+GPR182+BCO2,LIRI)#使用数据中的ANLN、CENPA、GPR182和BCO2四个基因的表达值构建COX比例风险模型我跟着输进去，结果出错了，Errorineval(predvars,data,callenv)：没有发现XXX

浅谈二分类回归模型COX回归分析不少见，但是简单异性的以二分类结局进行的回归分析更多，由于研究设计的研究便行，也是初次投稿的小白们比较理想的选择对象，二者的过程基本相似，但所用函数略有区别，从浅到深，先以二分类结局的Logistic回归为例，讲解一下案例数据说明有一组102例患者，来分析6个变量（old+bedriddentime+EN+Probiotics+Albumin+Antibacteri

前言：经验之谈继续上次的话题（R语言绘制列线图构建（以二分类Logistic为例）超详细-CSDN博客），基于Logistic回归模型构建的列线图之后，一般都是要进行模型验证的。

step1:导入ggplot2库文件library(ggplot2)step2：带入自带的iris数据集iris<-datasets::irisstep3：查看数据信息dim(iris)维度为[150,5]head(iris)查看数据前6行的信息step4：利用ggplot工具包绘图plot1<-ggplot(iris,aes(x=Petal.Length,y=Petal.Width))+them

折线图添加误差线是非常常用的一种可视化方法，今天的推文介绍一下使用R语言的ggplot2作图的代码。

小编推测提问者是想问“使用R语言绘图时怎么把不同的图形绘制在同一个坐标系中”。那么这个问题的本质上其实是进行图形叠加。

桑基图作为相对复杂的图表种类，平时很少用到，不仅仅是因为它的引用场景相对狭窄，另一方面则是制作难度相对较大，门槛较高。不过针对第一个问题，如果你能很好地理解自己所涉及到的业务数据结构及想要表达和呈现的维度信息，那么关键时刻使用桑基图确实会让你的报告锦上添花。桑基图用于表达流量分布于结构对比，最初的发明者使用它来呈现能量的流动与分布。百度百科给了桑基图相对完善的解释：桑基图(Sankeydiagra

你知道如何使用R语言绘制桑基图吗？小锐当然知道啦，并且教你绘制酷炫的桑基图。

它能够有效地揭示两组随机变量之间的相互(线性依赖)关系例如研究生入学考试成绩与本科阶段一些主要课程成绩的相关性将研究两组变量的相关性问题转化为研究两个变量的相关性问题此类相关为典型相关#2分类：总体典型相关样本典型相关3R语言提供的计算函数

Shiny是R里面一个非常出名的包，有了它，可以用R语言方便开发交互式web应用。

师出名门，未来可期ChatGLM-6B是一个基于GLM的生成式对话模型。由清华大学团队开发，旨在改进对话机器人的生成质量和逻辑。

ChatGLM基于GLM130B千亿基础模型训练，它具备多领域知识、代码能力、常识推理及运用能力；支持与用户通过自然语言对话进行交互，处理多种自然语言任务。

检索关键字：R语言三维3d3DR语言三维图像R语言3D模型R语言立体图像三维体积计算微信截图_20200903095506.png微信截图_20200903100834.png微信截图_20200903101830

查看EGL对应的OpenGL版本，发现版本过低，没有使用openglshader语言；查看显卡型号：lspci|grepVGA查看使用的是哪个版本的OpenGLDRI_PRIME=1glxinfo|grep"OpenGLrenderer

文案生成贴心小助手✨ChatGLM-6B是一个开源的、支持中英双语问答的对话语言模型，基于GeneralLanguageModel(GLM)架构，具有62亿参数。

聚类实例step1：计算距离dist(x,method="euclidean")step2:聚类hclust(d,method="complete")step3:cutree函数进行分支>df1#注意输入的数据框的结构，每行为一个样本，计算样本间两两间的距离heightweightBMItom1807523.14815cindy1655821.30395jimmy1757223.51020sam1

Packagetaxlistversion0.2.4Description在撰写关于生物多样性的文章时，可以使用名称自动插入到文件中，包括学名不同元素的典型斜体格式。函数print_name既可以应用于Markdown文档，也可以应用于图形。在Rmarkdown文档中，使用*Cyperuspapyrus*L.插入格式化的物种名称。Usageprint_name(object,...)##S3met

Packagetaxlistversion0.2.4Description这是一系列功能，旨在快速编码替换，既作为内部功能，也用于处理存储在向量和数据帧中的信息的工作流中。此类函数在处理存储在taxlist对象中的功能特征时特别有用。replace_x（）用于替换向量中的值。replace_idx（）通过匹配索引或条件来更改向量中的值。函数replace_na（）的工作方式与replace_idx

Packagetaxlistversion0.2.4Description为数据库中的新元素创建标识符。id_solver()方法将比较一组标识符并修改第二个标识符以避免重复的id。Usageid_generator(len,minvalue=1,nchar=10,mode=c("numeric","character"),...)id_solver(insert,to,suffix=c("num

今天的学习内容是R语言的基本数据结构：Day5学习内容.png在这些数据类型里，我们主要学习的是向量与数据框这两种。

基础数据结构image.pngapply族函数概述apply族函数是R语言数据处理的一组核心函数，它们对array（包括vector、matrix）、dataframe或list按照元素或元素构成的子集合进行迭代

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rWCVP：世界维管植物名录的R包介绍1.参照github安装与简单例子1.1安装rWCVP1.2安装rWCVPdata1.3github的例子2.rWCVP原始文献阅读2.1前言（背景）2.2功能概要2.2.1名称匹配（wcvp_match_names(),wcvp_match_exact(),wcvp_match_fuzzy()）2.2.2匹配后名称解析2.2.3空间整合和分布映射（wcvp_

Packagetaxlistversion0.2.4Description分类层次结构可以设置为taxlist对象中的级别，按从低到高的顺序排列。在taxlist对象中为特定分类概念添加分类级别。此外，概念限制的变化可能涉及其分类层次结构的变化。Usagelevels(x)##S3methodforclass'taxlist'levels(x)levels(x)<-value##S3replace

Packagetaxlistversion0.2.4Description将分类概念合并为单个taxlist对象。Usagemerge_taxa(object,...)##S3methodforclass'taxlist'merge_taxa(object,concepts,level,print_output=FALSE,...)Arguments参数【object】：taxlist对象。参数【

Packagetaxlistversion0.2.4Description将taxlist对象打印分类层次结构（等级和父子关系）输出为缩进列表。Usageindented_list(object,...)##S4methodforsignature'taxlist'indented_list(object,filter,keep_children=TRUE,keep_parents=TRUE,ra

文章目录前言双因子方差分析数学模型主效应分析交互效应分析正态性检验绘制3个品种产量数据合并后的正态Q-Q图（数据：example8_2）练习前言本篇将继续介绍方差分析的知识。双因子方差分析考虑两个类别自变量对数值因变量影响的方差分析称为双因子方差分析（two-wayanalysisofvariance）（分析两个因子(因子A和因子B)对实验结果的影响）分析时有两种情形：只考虑两个因子对因变量的单独

Packagetaxlistversion0.2.4Description字符向量中提供的名称将使用函数stringsim（）与存储在类taxlist对象中的插槽taxonNames中的名称进行比较。Usagematch_names(x,object,...)##S4methodforsignature'character,character'match_names(x,object,UsageI

文章目录前言例题例题一例题二例题三例题四例题五例题六例题七总结前言本篇介绍的是有关方差知识的题目介绍。例题例题一（数据：exercise7_3.RData）为研究上市公司对其股价波动的关注程度，一家研究机构对在主板、中小板和创业板上市的190家公司进行了调查，得到如下数据：检验上市公司的类型对股价波动的关注程度是否独立。（α=0.05）解：提出假设：H0:上市公司的类型对股价波动的关注程度是独立的

ElegantBookdown3.R语言包lifecycle，生命周期提供了一组工具和约定来管理导出功能的生命周期。

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刚开始学习R语言，安装R和Rstudio过程中碰到了一些问题。这两个软件从官网下载安装包都炒鸡慢。R的话还好可以从国内的镜像网站下载，我用的是清华镜像。

框架R语言基础.png准备工作预先打开电脑中任意文件夹，查看文件夹名称为中文还是英文如若前面是中文，则将其改为英文，如此才可以使下载的Rstudio可用，否则打开后界面可能问空白，并且不能正常运行有时Rstudio

我们在做数据分析的时候，经常需要产生一些重复序列。例如，GEO芯片数据差异表达分析时需要用到的分组变量，cytoscape构建ceRNA网络的节点文件中的RNAtype列等等。今天小编就来给大家介绍一下R中生成重复序列的函数rep。你可以把它看作时repeat这个英文单词的缩写，就很容记住了。函数形式：rep(x,time=,length=,each=,)参数说明：x：代表的是你要进行复制的对象，

所以我们后面会陆陆续续介绍有关R语言圈图的绘制。circlize是Circos的R语言实现，但并不是生成Circos配置文件的前端封装，而是完全基于R语言风格的统计和图形语法实现的。比如下

因为涉及矩阵操作，我们使用介绍过的GLM库。

Nathan写于2020.08.15群体的地理分布，是做文章经常放的第一张图，其表明你的群体材料在地理上分布的情况（感觉是一句废话）01input首先输入数据是样品分组，以及每个样品对应的经纬度。实例数据如下：随便编的数据有了这个数据就直接用下面的R代码进行画图就可以了。library(ggplot2)library(sp)library(maps)library(maptools)library

上篇推文我们介绍了使用Python-pykrige包实现了克里金(Kriging)插值计算及对应的可视化结果绘制，详细内容点击下方链接：Python-pykrige包-克里金(Kriging)插值计算及可视化绘制，相比你也感受到了Python的简单方便性。本期推文，我们就推出使用R-gstat包实现克里金(Kriging)插值的计算及对应结果的可视化绘制，主要知识点如下：gstat.krige()

前言:微博参与话题#给你四年时间你也学不会生信#————导师赠与之醒世名言ApplyaFunctionOveraRaggedArray|x-y绘图Usagelayout(mat,widths=rep.int(1,ncol(mat)),heights=rep.int(1,nrow(mat)),respect=FALSE)layout.show(n=1)lcm(x)Arguments|参数mat:是矩

看书笔记——R语言Chapter8从数据中寻找优质用户8.1项目背景、目标和方案8.1.1项目背景8.1.2项目目标8.1.3项目方案8.2项目技术理论简介8.2.1逻辑回归的基本概念8.2.2建模流程

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看书标记——R语言Chapter1模式的数据挖掘1.1聚类分析1.1.1k-means聚类用法示例1.1.2k-medoids聚类用法示例1.1.3分层聚类用法示例1.1.4期望最大化（EM）用法示例1.1.5

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看书标记——关于R语言chapter3互联网运营指标的建立3.1项目背景、目标及方案3.1.1项目背景3.1.2项目目标3.1.3项目方案3.2项目技术理论简介3.2.1骨灰级流量指标1.PV（pageviews

文章目录前言方差分析方差分析的原理什么是方差分析误差分解单因子方差分析数学模型效应检验练习前言本片开始介绍有关方差分析的知识。方差分析方差分析的基本原理是在20世纪20年代由英国统计学家RonaldA.Fisher在进行实验设计时为解释实验数据而首先引入的。方差分析是一种统计方法。目前，方差分析方法广泛应用于分析心理学、生物学、工程和医药的实验数据。本章首先介绍方差分析的基本原理，然后介绍只涉及一

看书标记——R语言Chapter2序列的数据挖掘2.1模式2.1.1Eclat频繁项集的挖掘用法用eclat找到成年人行为的相似点查找数据集中的频繁项目集中于最高频率的示例2.1.2arulesNBMiner