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R语言glm
R语言
【utlis】——alarm():提示音或提示符
Packageutilsversion4.2.0Description给用户一个声音或视觉信号。Usagealarm()Detailsalarm()通过向控制台发送一个“\a”字符来工作。在大多数平台上,这将向用户发出铃声、嘟嘟声或其他信号(除非重定向了标准输出)。它尝试刷新控制台(请参阅flush.console)。Value没有返回有用的值。Examplealarm()
ALittleHigh
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2024-02-12 06:36
#
utils
r语言
R语言
管道操作及绘制数据集对比图和回归线的基础并简单建模
使用了
R语言
自带的数据框mtcars,里面包含了各品牌型号的车辆参数信息。
环能jvav大师
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2024-02-12 06:33
r语言
开发语言
使用
R语言
fifer包进行分层采样
使用
R语言
fifer包中的stratified()函数用来进行分层采样非常方便,但fifer包已经从CRAN存储库中删除,需要从存档中下载可用的历史版本,下载链接:Indexof/src/contrib
环能jvav大师
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2024-02-12 06:32
r语言
R语言
杂谈(一)
首先,你需要一个Rstudio,其次每一个项目需要一个文件夹以方便自己且路径中不要出现中文和空格,如果需要请用下划线替代。1.安装R包if(!require("tidyr"))install.packages("tidyr",update=F,ask=F)#或者选择安装Bioconductor上的R包if(!require("limma"))BiocManager::install("limma"
爱思考的照
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2024-02-12 03:46
R语言
RImagePalette包,图像照片提取调色板
R语言
RImagePalette包,图像照片提取调色板迁移照片颜色板Snipaste_2020-12-06_01-28-19.png001.jpg002.jpg003.pngSnipaste_2020-
youmigo
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2024-02-12 03:40
利用ggplot2制作金字塔图,展示人口结构数据
人口金字塔图是描述一个地区或国家人口结构类型的常用图示方式,今天我们介绍一下如何利用
R语言
制作金字塔图,快来看看如何作金字塔图吧!什么是人口金字塔图?
普癌新声
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2024-02-12 02:24
R语言
,rayshader包,save_3dprint函数,保存3D打印
好像不支持中文。实操失败。#FriOct1601:08:342020-#字符编码:UTF-8#R版本:Rx644.0.2forwindow10#
[email protected]
#个人笔记不负责任#——拎了个梨.rs.restartR()#save_3dprint函数,保存3D打印rm(list=ls());gc()require(rayshader)#编写可用于3D打印的立体光刻(STL)文
youmigo
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2024-02-12 01:30
聚类分析-
R语言
1,原始数据,是矩阵,有行头和列名:data2,amap包的聚类分析:library(amap)clu<-hclusterpar(matx)plot(clu,sub="",hang=-1,xlab=NA,ylab=NA,main=NA)cluster用法:hcluster(x,method="euclidean",diag=FALSE,upper=FALSE,link="complete",mem
育种数据分析之放飞自我
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2024-02-12 00:39
跟着Nature Communications学作图:
R语言
ggplot2散点图及添加文字标签
论文MiDAS4:Aglobalcatalogueoffull-length16SrRNAgenesequencesandtaxonomyforstudiesofbacterialcommunitiesinwastewatertreatmentplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-29438-7数据链接https://figshare.c
小明的数据分析笔记本
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2024-02-11 22:15
R语言
用随机森林模型的酒店收入和产量预测误差分析
全文链接:https://tecdat.cn/?p=35162在这篇文章中,我们将探讨基于随机森林模型的酒店收入和产量预测分析。我们将使用4月9日至4月15日的数据作为测试集,评估预测的准确度。我们将分别对单个酒店在三个预订渠道的总收入和总产量进行分析,并使用随机森林模型进行预测。通过对比每家酒店的间夜预测值(或收入)与实际值的结果,以及产量排名前四分之一酒店的平均误差值,我们将得出对酒店收入和产
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2024-02-11 18:33
数据挖掘深度学习人工智能算法
R语言
逻辑回归、决策树、随机森林、神经网络预测患者心脏病数据混淆矩阵可视化
全文链接:https://tecdat.cn/?p=33760原文出处:拓端数据部落公众号概述:众所周知,心脏疾病是目前全球最主要的死因。开发一个能够预测患者心脏疾病存在的计算系统将显著降低死亡率并大幅降低医疗保健成本。机器学习在全球许多领域中被广泛应用,尤其在医疗行业中越来越受欢迎。机器学习可以在预测关键疾病(例如心脏病)的存在或不存在方面发挥重要作用。如果能提前准确预测这些信息,可以为医生提供
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2024-02-11 18:20
数据挖掘深度学习人工智能算法
r语言
有限正态混合模型EM算法的分层聚类、分类和密度估计及可视化|附代码数据
原文链接:http://tecdat.cn/?p=23825最近我们被客户要求撰写关于有限正态混合模型EM算法的研究报告,包括一些图形和统计输出。简介本文介绍了基于有限正态混合模型在r软件中的实现,用于基于模型的聚类、分类和密度估计。提供了通过EM算法对具有各种协方差结构的正态混合模型进行参数估计的函数,以及根据这些模型进行模拟的函数。此外,还包括将基于模型的分层聚类、混合分布估计的EM和贝叶斯信
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2024-02-11 18:10
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
LASSO特征选择、决策树CART算法和CHAID算法电商网站购物行为预测分析
全文链接:http://tecdat.cn/?p=32275原文出处:拓端数据部落公众号本文通过分析电子商务平台的用户购物行为,帮助客户构建了一个基于决策树模型的用户购物行为预测分析模型。该模型可以帮助企业预测用户的购物意愿、购物频率及购买金额等重要指标,为企业制定更有针对性的营销策略提供参考。数据来源和处理本研究所使用的数据来自某电子商务平台的用户购物历史记录。读取数据head(data)模型构
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2024-02-11 18:39
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
中的Stan概率编程MCMC采样的贝叶斯模型|附代码数据
这对于基于MCMC采样的贝叶斯模型特别有用
R语言
中RStan贝叶斯层次模型分析示例stan简介Stan是用于贝叶斯推理的C++库。
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2024-02-11 18:08
数据挖掘深度学习机器学习算法
R语言
结构方程模型SEM、路径分析房价和犯罪率数据、预测智力影响因素可视化2案例|附代码数据
原文链接:http://tecdat.cn/?p=25044原文出处:拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于结构方程模型的研究报告,包括一些图形和统计输出。1简介在本文,我们将考虑观察/显示所有变量的模型,以及具有潜在变量的模型。第一种有时称为“路径分析”,而后者有时称为“测量模型”。2进行简单的多元回归SEM在很大程度上是回归的多元扩展,我们可以在其中一次检查许多预测变量和结果。SEM还提
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2024-02-11 18:01
数据挖掘深度学习人工智能算法
R语言
批量导入中国气象数据网站数据
问题引入从中国气象数据网站下载的数据是TXT格式,以空格隔开,但是不同列之间的空格数不一致。如下图:捕获.PNG用read.table()函数读取会出现一些问题,而scan函数却可以完美解决问题。数据导入链接到数据所在文件夹,获取数据名setwd('E:/1data/站点数据/气象网数据')tem.name<-list.files(pattern='*.TXT')数据处理先设置一个空的数据框,接着
年迈的小怪兽
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2024-02-11 16:59
Shiny-
R语言
轻松开发交互式web应用
Shiny简介Shiny是RStudio公司开发的新包,有了它,可以用
R语言
轻松开发交互式web应用。特性只用几行代码就可以构建有用的web应用程序—不需要用JavaScript。
生信交流平台
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2024-02-11 09:01
R语言
泡泡图— —小泡泡如何变大泡泡?
我们使用R绘制泡泡图时,可能会遇到这样一种情况,即count点太小,但又不知道应该如何调大,如下图:图1泡泡图附代码:library(ggplot2)pathway=read.csv("1KEGG.csv",header=TRUE,row.names=1,check.names=FALSE)p=ggplot(pathway,aes(Pvalue,pathway))p=p+geom_point()p
赵玉鑫0507
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2024-02-11 06:30
医学
R语言
快速入门与数据清洗1 2021-01-10
关键词和要点:数据预处理的方法数据分析:对软件要求不高数据可视化:数据作图RStudio
R语言
安装,Rstudio安装,Rstudio基本设置CRANTaskViewsCRANpackages核心包注释中有个
卡西莫多霉素
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2024-02-11 05:12
R语言
安装ggcor包
找了很多方法,一直安装不上去,后来把包下载了本地,用本地安装的方法,也还是报错。后来兜兜转转找到了这个方法,非常好用!参考了看见你啦,自己根据实际情况,也稍作修改。1.下载ggcor包到本地ggcor包的链接链接:https://pan.baidu.com/s/1S6w93IjfO6sU8IHGvvCa1w提取码:23902.将zip压缩包解压缩,放到R的library文件夹内(这个要看自己的保存
Rosebud的记录本
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2024-02-11 00:09
R
r语言
R语言
构建多项式回归应该使用什么函数?
R语言
构建多项式回归应该使用什么函数?目录
R语言
构建多项式回归应该使用什么函数?
R语言
是解决什么问题的?
R语言
构建多项式回归应该使用什么函数?
sdgfbhgfj
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2024-02-10 22:28
机器学习
数据挖掘
人工智能
r语言
数据分析
可以用 Python 编程语言做哪些神奇好玩的事情?
目前的数据工作中,数据科学家使用最多的工具语言就是Python,排在第二的工具语言是
R语言
。但这里有一个有趣的现象,那就是同时使用Python或者
R语言
的人,推荐别人使用Python的却远高于
R语言
。
交大全栈智能工程师
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2024-02-10 20:15
跟着ISEM学作图:
R语言
ggtree+ggplot2组合进化树和气泡图
论文Conservedandreproduciblebacterialcommunitiesassociatewithextraradicalhyphaeofarbuscularmycorrhizalfungiimage.png今天的推文我们来重复一下论文中的Figure2image.png没有找到论文提供的原始数据,这里数据我自己构造一份首先是左侧的进化树文件(((A8:0.9735669859
小明的数据分析笔记本
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2024-02-10 17:59
R语言
编程-Tidyverse 书籍 - 第三章 - 统计建模
1整洁模型结果-broom包tidyverse主张以‘‘整洁的”数据框作为输入,但是lm,nls,t.test,kmeans等模型的输出结果,却是‘‘不整洁的”列表。broom包实现将模型输出结果转化为整洁的tibble,且列名规范一致,方便后续取用;另外,与tidyr包中的nest()/unnest()函数以及purrr包中的map_*()系列函数连用,非常便于批量建模和批量整合模型结果。bro
Hello育种
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2024-02-10 16:12
ChatGLM2-6B模型的win10测试笔记
ChatGLM2-6B使用了
GLM
的混合目标函数,经过了1.4T中英标识符的预训练与人
月疯
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2024-02-10 13:06
【NLP】
人工智能
在Python和
R语言
中使用Auto ARIMA构建高性能时间序列模型
想象一下,你的任务是预测下一部iPhone的价格,并提供了历史数据。这包括季度销售、月度支出,以及苹果资产负债表上的一大堆东西。作为一个数据科学家,你会把这个问题归类为什么?当然是时间序列建模。从预测产品的销售到估计家庭的用电量,时间序列预测是任何数据科学家都应该知道的核心技能之一,如果不是精通的话。有很多不同的技术可供您使用,在本文中,我们将介绍一种最有效的技术,称为AutoARIMA。我们将首
公子曼步
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2024-02-10 07:17
R语言
|CMplot包绘制环形曼哈顿图
R包-CMplot绘制环形曼哈顿图今天小编给大家分享的是
R语言
绘制环形曼哈顿图的方法,主要用到的是CMplot包,它是绘制SNP密度、曼哈顿图和QQ图的一个很实用的R包。大家感兴趣的话可以瞅瞅。
维凡生物
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2024-02-10 05:10
基于
R语言
的微生物群落组成多样性分析——物种丰度计算及可视化
引言 在对样本的微生物群落组成多样性分析过程中,除了Alpha多样性与Beta多样性的分析,最重要的一个部分就是对样本中微生物具体的群落结构组成情况进行分析。一般我们从门水平及属水平上计算优势物种的相对丰度并通过表格或者柱状堆积图进行展示。正文—代码设置工作目录并加载包rm(list=ls())#clearGlobalEnvironmentsetwd('D:\\桌面\\物种丰度计算及可视化'
科研那点事儿
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2024-02-10 01:26
TCGA新版数据库表达矩阵提取
本文首发于公众号:医学和生信笔记医学和生信笔记,专注
R语言
在临床医学中的使用,
R语言
数据分析和可视化。主要分享
R语言
做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。
医学和生信笔记
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2024-02-10 00:22
Meta分析入门工具介绍
主要目的是先能够简单的复现一些论文的研究方法,按照计划是了解Revman,stata与
R语言
的相关分析方法即可。
Jabes
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2024-02-09 22:00
DAY5-zzw
6.表格在
R语言
中改名叫数据框_7.别只复制代码,要理解其中的命令、
张纸薇
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2024-02-09 21:39
R语言
可视化学习笔记之ggridges包
作者:严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,
R语言
爱好者,爱开源。严涛老师的绘图教程还有:gganimate|诺奖文章里面的动图布局教程来了!!
生信宝典
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2024-02-09 21:25
R
生物信息
生物信息
可视化
基于
R语言
如何实现偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)?
偏最小二乘法判别分析,即我常说的PLS-DA(PartialLeastSquaresDiscriminantAnalysis),经常被用来处理分类和判别问题。这种方法和PCA分析方法是比较类似的,区别在于二者是否有监督,一般PCA是无监督的,而PLS-DA是有监督的。 当碰到样本组间差异大而组内差异小的情况,常见的PCA分析方法是可以很好地区分组间差异的,但是遇到样本组间差异不大的情
科研那点事儿
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2024-02-09 17:27
R语言
ggplot2:第九章 数据操作
第9章数据操作9.1plyr包简介plyr包中的ddply()函数能够同时在数据的多个子集上做统计汇总。ddply(.data,.variables,.fun,...):data是用来作图的数据,variables是对数据取子集的分组变量,fun是要在各子集上运行的统计汇总函数。subset()用来对数据取子集的函数,选择数据中前n个(x%)个观测值,或者再某个阈值之上或下的观测值。transfo
王叽叽的小心情
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2024-02-09 15:45
statsmodels专栏6——专业洞见:Python中的Statsmodels库高级线性模型
目录写在前面1广义线性模型(
GLM
)1.1
GLM
的基本理念1.2使用Statsmodels进行
GLM
建模1.2.1使用线性回归1.2.2使用logistic回归处理二分类问题2高级线性混合效应模型2.1
theskylife
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2024-02-09 14:31
数据分析
数据挖掘
python学习之旅
python
概率论
机器学习
数据分析
数据挖掘
R语言
中,cbind和rbind区别
cbind:根据列进行合并,即叠加所有列,m列的矩阵与n列的矩阵cbind()最后变成m+n列,合并前提:cbind(a,c)中矩阵a、c的行数必需相符rbind:根据行进行合并,就是行的叠加,m行的矩阵与n行的矩阵rbind()最后变成m+n行,合并前提:rbind(a,c)中矩阵a、c的列数必需相符————————————————Rversion3.6.2(2019-12-12)--"Dark
Seurat_
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2024-02-09 06:55
R语言
rmarkdown使用
1、安装install.packages('rmarkdown')library(rmarkdown)install.packages('tinytex')tinytex::install_tinytex()2、新建RMarkdown3、基本框架红色框内为YAML:包括标题、作者和日期等黄色框内为代码块:执行后面的代码,并可以设置展示的结果。蓝色框内为Markdown文本4、运行代码产出结果5、导
weixin_49320263
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2024-02-09 05:50
常用方法
r语言
由内而外释放R的力量||摘自《R大数据分析实用指南》
数据必须读入内存R核心是单线程的R是一种解释语言使用ff和ffbase超越内存限制主要用于大数据的转换聚合与建模:深入ffandffbase
R语言
操作my
周运来就是我
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2024-02-09 05:37
从列表中删除元素|自学生信Python(第十六天)
了解到生物信息学要有编程基础,尤其是要会一门编程语言,例如:
R语言
、Python、Perl等,还要熟悉Linux系统,作为生信小白,听说Python挺简单的,于是就自学了Python,花了两天时间了解了
天明豆豆
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2024-02-08 22:40
最新1区9+非肿瘤纯生信,逻辑清晰易懂,机器学习筛选关键基因的纯生信也可以发高水平期刊,抓紧上车!
研究概述:本研究首先使用
R语言
在三个
生信小课堂
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2024-02-08 22:54
r语言
svr模型_使用
R语言
建立一个决策树回归模型
决策树是一种简单但使用广泛的分类算法,根据目标变量的类型,决策树分为分类决策树(目标变量为因子型)与回归决策树(目标变量为连续数值型)。在这里,我们使用R建议一个回归决策树模型。决策树简单介绍对于一个分类问题,我们可能需要多个属性值来构建问题,通过回答这些问题(比如长度大于多少,宽度大于多少,重量大于多少),有序地得到问题的答案,并重复问题到我们得到最后的分类,把上面的过程(问题、答案)有组织的组
weixin_39849888
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2024-02-08 20:22
r语言svr模型
【
R语言
入门与数据分析-2】 数据的读取与写入
使用过程中发现自己的
R语言
基础太差了,回头补课。P28-P33所学视频:https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?
森尼啊
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2024-02-08 13:15
跟着Nature Genetics 学画图:
R语言
ggplot2一次性画好多个饼状图
今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png今天试着重复的图片对应着的是论文附件中的Figure8b,很多个饼状图放到一起image.png最基本的想法就是单独画好多个饼状图,然后通过拼图实现,但是因为之前重复
小明的数据分析笔记本
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2024-02-08 08:56
非约束排序1—概述 (数量生态学:
R语言
的应用第五章)
非约束排序1—概述(数量生态学:
R语言
的应用第五章)在这之前我们已经学习了聚类分析,聚类分析的目的在于寻找数据的间断性,排序的目的就在于寻找数据的连续性(通过连续的排序轴展示数据的主要趋势)。
fafu生信小蘑菇
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2024-02-08 07:20
in r, 找出所有重复的元素,包括第一个
R语言
|如何筛选所有的重复行(包括第一行重复在内)
library(dplyr)data%group_by(type)%>%#根据你要筛选的列进行分组filter(duplicated(type)|n()!=1)%>%#将该列中有重复的行挑选出来ungroup()方法二#示例向量x<-c(1,2,3,2,4,5,5,6)#找出所有重复的元素(包括第一次出现的)duplicates<-duplicated(x)|duplicated(x,fromLa
生信小博士
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2024-02-08 02:36
r语言
开发语言
docker数据科学与spark镜像源与使用常见问题疑难解答
rocker/tidyverse:此镜像包含用于
R语言
的tidyverse数据科学包。jupyter/scipy-notebook:此镜像包含用于Python语言的SciPy科学计算库。rstudio
DreamNotOver
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2024-02-08 01:16
eureka
java
spring
cloud
46期生信第五天-一加一等于几
(6)表格在
R语言
中改名叫数据框_(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命
茶黄素
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2024-02-08 00:34
跟着Nature Communications学作图:
R语言
ggtern包画三元相图(Ternary plots )
论文Ahighlyconservedcorebacterialmicrobiotawithnitrogen-fixationcapacityinhabitsthexylemsapinmaizeplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31113-w本地pdfs41467-022-31113-w.pdf数据代码链接https://github.
小明的数据分析笔记本
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2024-02-07 22:30
R语言
入门笔记2.3
for循环for循环用于多次执行相似的代码。其基本语法如下:for(variableinsequence){#在每次迭代中执行的代码}其中:variable是一个变量,用于在每次迭代中存储序列中的当前元素。sequence是一个向量,可以是数字序列、字符序列或其他可迭代对象。在每次迭代中,variable会依次取sequence中的每个元素的值,然后执行for循环中的代码块。例1:>n=c(1,2
Mrji1995
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2024-02-07 19:04
笔记
R语言
入门笔记2.2
ifelse语句结构:ifelse(条件,表达式1,表达式2)#满足条件,则进入表达式1,否则为表达式2例1:>a=1>ifelse(a<0,"a小于0",ifelse(a==0,0,"a大于0"))[1]"a大于0"a=1-这行代码给变量a赋值为1。ifelse(a<0,"a小于0",ifelse(a==0,0,"a大于0"))-这是一个嵌套的ifelse语句。它的结构是ifelse(condi
Mrji1995
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2024-02-07 19:03
r语言
笔记
开发语言
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