dose

ID转换、利用clusterProfiler做GO、KEGG富集分析

首先需要加载的包library(AnnotationHub)library(org.Hs.eg.db)library(clusterProfiler)library(DOSE)#GO分面用library

欧阳松·2024-02-04 10:15

vue element-ui 表格动态添加行编辑行删除行

表格动态添加行编辑行删除行代码展示新增删除提交exportdefault{name:"Index",data(){return{historyForm:{tableData:[{diseaseName:'',drugName:'',dose

ALSO666·2024-01-15 15:20

【R>>ggplot2】坐标轴刻度位置调整

ToothGrowth为例：rm(list=ls())library(tidyverse)library(ggsci)data(ToothGrowth)head(ToothGrowth)ToothGrowth$dose

高大石头·2024-01-08 18:48

hive的复杂json数组对象中包含的数组对象扁平化解析

"groupCode":"TJ-hba1cG7L8-ageG60-bmiG28","regimenType":"drug","regimens":[{"drugTypes":[{"drugs":[{"dose

有语忆语·2023-11-20 00:34

clusterProfiler包学习

BiomedicalKnowledgeMiningusingGOSemSimandclusterProfiler(yulab-smu.top)部分使用#GOclassificationlibrary(clusterProfiler)data(geneList,package="DOSE

hx2024·2023-11-19 15:12

7、科研作图之箱型图详解——ggplot2

一、数据准备#数据准备data("ToothGrowth")ToothGrowth$dose=factor(ToothGrowth$dose)head(ToothGrowth)使用R自带的数据库进行测试

做不了杜甫·2023-10-26 07:12

Festival 3

Howmanyseasons…..”howmany”后面一定跟复数，因为这个问句本来就是问多少数量的Whatarethere（they）InthespringIcanplantstrees.Can、do、dose

甜橙树上的橄榄·2023-10-20 11:16

安装clusterProfiler包

在R-3.4.3版本中，这次重新安装总是报错：无法载入程辑包‘DOSE’Error:packageornamespaceloadfailedfor‘DOSE’inreadRDS(pfile)其实之前是真的已经载入了的

miao_hzaupo·2023-10-17 03:02

Mac安装Ecplise产品报错：dose not contain the JNI_CreateJavaVM symbol

1.絮絮叨叨工作中需要借助EcpliseMemoryAnalyzer(MAT)分析dump文件，直接下载、安装、运行MAT报错询问同事后，同事说可以先安装Ecplise，再以插件的形式安装MAT下载、安装好Eclipse，点击运行仍然报错，且错误信息一致笔者使用JDK17.0.6，ls-l报错的目录，libjvm.dylib是存在的同时，笔者使用的是MacM2aarch64架构（MacM2芯片），

晓之木初·2023-10-03 14:00

文章学习36“Low-Dose CT with a Residual Encoder-Decoder Convolutional Neural Network (RED-CNN)”

TMI2017的作品，本文的主要思想和2016年NIPS的RED基本一致，网络采用AE的结构，先用卷积层进行编码，再用反卷积层进行解码，中间通过skip结构连接，如下图所示。下图是16年RED的结构，和本文一样遵循先入先出的原则，通过residuallearning进行去噪，所以本文的结构就是followRED。实验数据包括两部分，一个是AAPM比赛的10位病人的HDCT和LDCT图像，另一个是作

Carrie_Hou·2023-09-18 13:21

boxplot

image.pngggplot(ToothGrowth,aes(x=dose,y=len,color=supp))+geom_boxplot(position=position_dodge(1))+scale_color_manual

一路向前_莫问前程_前程似锦·2023-09-12 23:28

GSEA 从数据到美图

library(GSEABase)library(clusterProfiler)library(DOSE)library(org.Hs.eg.db)library(ggplot2)library(stringr

小洁忘了怎么分身·2023-09-12 18:46

win7硬盘安装centos7 /dev/root dose not exist

首先U盘启动虽然安装不了centos7，一直报scripttimeout等总是，但最终还是能入命令行提示符#切换到dev目录#cd/dev#ls会看到你的U盘，一般是第二块硬盘，比如sdbx好，那么记住这个，比如查看到是/dev/sdb4，现在reboot重新启动，进入启动菜单选项，按e进入编辑模式，将菜单中vmlinuzinitrd=initrd.imginst.stage2=hd:LABEL=

sean_liu_01·2023-09-10 23:37

.\.vscode\launch.exe‘ dose not exist

VSCode问题：launch:program'...\.vscode\launch.exe'dosenotexist问题描述解决过程参考内容问题描述按照博客大佬们的指导，给VSCode配置C++语言环境，参考推荐：菜得扣↑的博客。根据指导，配置了launch.json，task.json和c_cpp_properties.json三个文件。运行.cpp文件时报错。原图来自：https://www

猎猫骑巨兽·2023-08-28 07:17

易混词分享

瑰]给大家分享一点干货，一些经常会弄混的单词↓快来学习一下吧词汇lie躺、说谎vs.lay放置dose 一剂药 vs.doze 打盹lonely 孤独的 vs.alone 单独的protest 抗议 vs.protect

Annazhang5165·2023-08-27 02:09

Diffusion Probabilistic Priors for Zero-Shot Low-Dose CT Image Denoising

Zero-Shot低剂量CT图像去噪的扩散概率先验论文链接：https://arxiv.org/abs/2305.15887项目链接：https://github.com/DeepXuan/Dn-DpAbstract低剂量CT图像去噪是医学图像计算中的一项关键任务。近年来，基于监督的深度学习方法在这一领域取得了重大进展。然而，这些方法通常需要对低剂量和正常剂量的CT图像进行训练，这在临床环境中很难

通街市密人有·2023-08-24 21:16

spring读取resources文件夹下的文件报错：cannot be resolved to absolute file path because it dose not reside in th

spring、springboot读取resources文件夹下的文件报错：cannotberesolvedtoabsolutefilepathbecauseitdosenotresideinthefilesystem:jar:file:xxx1.问题描述在做一个项目的上传功能的时候，需要提供上传文件的模板下载功能，后端的实现方式是：将模板文件放在resources文件夹下，然后提供一个接口，接口

我的小幸运呢·2023-08-01 03:45

js闭包

面试题1：varname='global';varobj={name:'obj',dose:function(){this.name='dose';returnfunction(){returnthis.name

秀萝卜·2023-06-13 07:31

论文学习18“Real-time image reconstruction for low-dose CT using deep convolutional generative adversa...

本文是采用去噪的思想，FCN网络作为去噪的生成器，再加上判别器和IRIMAGE的损失，形成网络的学习模式，完成去噪的功能。X域是LDCT，Y域是无噪声的CT，G作用就是完成X到Y的转换。作者为这个模型定义了三个损失函数，第一个是生成器的去噪损失。噪声CT图像可以定义为去噪后的图像加上噪声两部分：，假设图像各像素之间独立同分布，那么，作者定义了去噪后的图像和原始图像x之间的平方差为：所以第一个关于G

Carrie_Hou·2023-04-20 17:16

ggplot2绘制带误差线的折线图(经典版)

library(tidyverse)library(ggsci)library(patchwork)传统方法传统方法依然是先整理数据，之后添加相应的几何对象，整个过程规规矩矩，无任何亮点可言p1%mutate(dose

R语言数据分析指南·2023-04-05 20:48

Android中Webview出现的问题：This XML file dose not appear to have any style information associated with ...

问题场景：我在正常加载一个页面的时候，出现如图的错误，查了一系列的资料并没有解决，每次删除应用再安装新的App时可以打开的，然后返回再打开，就出现如图的错误device-2019-02-28-102653.png从图片的msg看出：访问拒绝，链接已无效。我开始怀疑是不是Webview做了缓存，因为我是添加了webSettings.setCacheMode(WebSettings.LOAD_CACH

lang_un·2023-03-27 04:25

R优雅的进行多因素方差分析

，下面来看具体例子安装并加载R包library(tidyverse)library(multcompView)library(stats)library(ggsci)加载数据data2%mutate(dose

R语言数据分析指南·2023-03-15 12:32

day1--英语学习（疑问句）

时态一般现在时（do/dose）一般过去时(did)一般将来时(begoingtodo)现在完成时过去完成时将来完成时现在进行时(bedoing)过去进行时将来进行时现在完成进行时过去完成进行时将来完成进行时时态的分类时间现在过去将来过去将来特点一般

往事一块六毛八·2023-03-13 05:37

R语言2 图形初阶

图形初阶文章目录图形初阶图形参数符号和线条颜色文本属性图形尺寸与边界尺寸添加文本、自定义坐标轴和图例标题坐标轴参考线图例文本标注图形的组合图形参数par()eg:#数据：dose<-c(20,30,40,45,60

X__Poppy·2022-12-24 18:09

Artifact and Detail Attention Generative AdversarialNetworks for Low-Dose CT Denoising阅读笔记

目录摘要介绍方法A.GeneratorArchitectureB.DiscriminatorStructureC.LossFunction实验结果和分析A.ExperimentalSettingsB.ParameterSelection摘要提出了一种多通道生成器：主特征提取通道+伪影和噪声关注通道+边缘噪声关注通道。提出了一种称为多尺度Res2Net鉴别器的新结构，通过提取图像同一尺度下的多尺度特

wangtao990503·2022-12-07 16:38

r语言ggplot画两条曲线_R语言画折线图？

一基本折线图折线图1# 加载R包2library(ggplot2)34# 构造数据集5df <- data.frame(dose=c("D0.5", "D1", "D2

weixin_39939530·2022-12-04 02:07

【数据分析入门】R语言入门之方差分析及应用实例

=mean)##方差分析fitdoseToothGrowth$dosefitsummary(fit)install.packages("HH")library(HH)interaction.plot(dose

如果我是温帅帅·2022-12-03 16:36

【R画图学习10.1】箱图和显著性检验1

library(ggpubr)library(RColorBrewer)data("ToothGrowth")head(ToothGrowth)先画个基本的箱图：ToothGrowth$dose<-as.factor

jjjscuedu·2022-10-29 18:25

ggplot2|从0开始绘制折线图

一绘制单条折线图载入数据及函数包library(ggplot2)df<-data.frame(dose=c("A","B","C"),len=c(5.16,10.10,30))head(df)dose

生信补给站·2022-02-21 10:47

文章学习19“Generative Adversarial Networks for Noise Reduction in Low-Dose CT”

本文是IEEETRANSACTIONSONMEDICALIMAGING17年的作品，作者是荷兰的一个医学中心的人用gan来做LDCT的去燥，文章的亮点是体素级的设计，网络总结构如下图所示：生成器是输入低剂量的CT图像，然后经过7个连续的卷积层输出图像中的噪声，然后用输入的低剂量图像减去噪声得到模拟高剂量图像。和普通的网络的不同是作者没有将CT作为图像处理，而是转化为体素值（HU）进行处理，除了最后

Carrie_Hou·2022-02-07 07:37

r语言ggplot2误差棒图快速指南

library(ggplot2) df <- ToothGrowth df$dose <- as.factor(df$dose) head(df) ## len supp dose ## 1 4.2 VC

·2021-09-01 19:11

ggplot2修改坐标轴

library(ggplot2)data(ToothGrowth)ToothGrowth$dose<-factor(ToothGrowth$dose)p<-ggplot(ToothGrowth,aes(

生信编程日常·2021-06-22 21:49

富集分析与可视化：R 实现

https://bioconductor.org/biocLite.R")#options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")#biocLite("DOSE

挽山·2021-06-13 07:24

一月复盘——Input matters, so dose output.

1月份匆匆而过，紧张又忙碌的一个月。参加了晨读课，听了讲座，收获满满。有几点感触写一下，温故知新，也鞭策自己。1、每日一词这个月学了很多词，backpedal,sidetrack,popularize等等。我特别喜欢backpedal这个词，读起来朗朗上口，更实用。跟老公在平时的对话中，还用上了，哈哈。当时顿觉印象加深了好多。自己平时再学习中，也在刻意摸索一些方法，能够将词和用法记得更牢。有次在看

Yvettetaitai·2021-06-07 08:00

101.前言+Where Dose It All Begin

开始前说明一下。《beyondfeeling》这本书是在笑来的推荐下决心作为2017年目标来实现的。匆忙过了10月才惊觉应该完成它。于是我停掉了人人都能用英语的课程学习，所以在我的另一个文集《人人都能用英语》中从第90开始做这本书的笔记。然后现在觉得应该单独拿出来，它应该不仅是一个英语学习笔记，还应该是个读书笔记。所以我单独开了一个文集。但不是从头开始，因为上一个文集已经写了10篇，这里开始的是c

法雲·2021-04-24 23:02

R语言-绘制双坐标图直方图与折线的结合方式

5,5,3,4)+0.1)#似乎是设置图片位置bardose=c(20,30,40,50,60)>drugA=c(16,20,27,40,60)>drugB=c(15,18,25,31,40)>plot(dose

·2021-04-19 17:37

R语言入门--第二节（图形入门）

R语言的作图功能有多强大就不多做介绍了，可以自行百度；这里简单介绍下R作图的一些知识先简单做个图吧rm(list=ls())dose<-c(20,30,40,45,60)drugA<-c(16,20,27,40,60

小贝学生信·2020-10-19 18:05

NAVICAT 链接MYSQL 显示 CLINET DOSE NOT SUPPORT AUTHENTICATION PROTOCOL REQUEST BY SERVER ;CONSIDER UPGRA

NAVICAT链接MYSQL显示CLINETDOSENOTSUPPORTAUTHENTICATIONPROTOCOLREQUESTBYSERVER;CONSIDERUPGRADINGMYSQLCLIENT1在命令窗口输入mysql-uroot-p首先通过cmd进入mysql2更改加密方式mysql>ALTERUSER'root'@'localhost'IDENTIFIEDBY'password'P

GregGao大仙·2020-09-17 16:35

R：绘图——文本、自定义坐标轴和图例

>plot(dose,drugA,type="b",col="red",lty=2,pch=2,lwd=2,main="药物A效果",sub="这是部分数据",xlab="药量",ylab="疗效

老狼8848·2020-09-15 22:14

R语言（R studio）画各类统计图形

（第一次写博客，hhh~）啥都甭说了，上代码~1.普通折线图rm(list=ls())dose<-c(20,30,40,50,60)drugA<-c(16,20,27,40,60)drugB<-c(17,20,30,45,50

冬二四·2020-09-15 09:07

python : "unindent dose not math any outer indentation level"

参看资源：【1】Python脚本运行出现语法错误：IndentationError:unindentdoesnotmatchanyouterindentationlevel-heimanba-博客园https://www.cnblogs.com/heimanba/p/3783022.html（1）问题的说明：命名已经对齐了，但仍然显示（2）问题的原因：Python中的缩进有自己严格的规范，在这里是

橘子甜不甜·2020-09-15 05:50

python笔记：运行脚本出现Unident dose not match any outer indentation level错误

之前在Notepad++上写了一个python脚本，后来用pycharm打开时遇到这个错误错误原因：缩进对齐时空格与TAB键混用了。四个点为四个空格，一个箭头为一个TAB键，新的python语法中，缩进是不支持空格和TAB混用的。解决办法：空格取代TAB键。Notepad++中设置-->首选项-->语言，勾选替换为空格，以后输入TAB键会自动转变为4个空格

Sleepy丶head·2020-09-15 04:01

R可视化之图形控制和布局基础

R语言的图形参数主要由par()函数控制，图形布局主要由layout()函数控制图形参数我们以如下数据为例剂量(dose)对药物A的响应(drugA)对药物B的响应(drugB)201615302018402725454031606040dose

一窗星乱银河静·2020-09-13 04:10

R语言中的单因素协方差分析

产下幼崽的体重均值为因变量，怀孕时间为协变量attach(litter)table(dose)dose05505002019

红豆和绿豆·2020-08-23 07:09

GEO数据挖掘-从数据下载到富集分析-各种绘图（学习笔记）

############rm(list=ls())source("http://bioconductor.org/biocLite.R")#beforeinstallpackagebiocLite('DOSE

obwte·2020-08-20 21:11

R-可视化（四）：添加误差棒

1.添加均值和误差棒library(tidyr)library(ggplot2)library(ggpubr)长型数据框-线图ggline(ToothGrowth,x="dose",y="len",add

obwte·2020-08-18 12:58

How Dose DDS Work？（Data Distribute Service，数据分发服务）

HighLevelData-CentricInterfacesReplaceMessage-CentricProgramming【以数据为中心的高级接口取代了以消息为中心的编程】ThemaingoalofDDSistosharetherightdataattherightplaceattherighttime,evenbetweentime-decoupledpublishersandconsum

DDS数据分发服务·2020-08-15 21:27

VS Code,launch:program ‘路径....exe‘dose not exsit，undefined reference to `std::cout‘

最近打算用visualstudiocode写C++（感觉这个软件挺酷的），但是在安装配置开发环境的过程中遇到了一系列的问题，难怪网上很多建议说不建议编程小白用VScode。。。复制了一段很基础的C++程序之后发现除了问题，但是同样的程序在VC6.0上运行是没有问题的。问题如下图：点击“DebugAnyway”后弹出如下警告网上找了很多帖子，众说纷纭，，，试过了都不好使。浪费了大半晚上的时间，最后看

核聚变Q·2020-08-13 11:23

【R语言学习笔记】10、R如何画图之一

https://blog.csdn.net/Clairezwj/article/details/811348141.简单的画图例子相关数据集：执行命令进行画图：>dosedrugAdrugBplot(dose

正午12:00·2020-08-12 11:18

R语言简单绘图（一）

dose<-c(20,30,40,45,60)dragA<-c(16,20,27,40,60)dragB<-c(15,18,25,31,40)plot(dose,dragA,type="b")plot(

开开_王子·2020-08-10 17:25

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