group_by

04.寻找所有亚群的差异基因并输出

基因进行文件输出rm(list=ls())library(Seurat)library(dplyr)load(file='pbmc-noann.rdata')pbmc=scepbmc.markers%group_by

科研小徐·2024-02-15 07:46

R语言-dplyr包进行条件均值

实际处理数据中，我们往往需要将某变量分组进行运算，dplyr包中的group_by和summarise函数联合使用，会让code变得更简洁。

PriscillaBai·2024-02-13 13:27

in r, 找出所有重复的元素，包括第一个 R语言｜如何筛选所有的重复行（包括第一行重复在内）

library(dplyr)data%group_by(type)%>%#根据你要筛选的列进行分组filter(duplicated(type)|n()!

生信小博士·2024-02-08 02:36

MySQL报错only_full_group_by

会被认为是不合法的sqlorderby后面的列必须是在select后面存在的select、having或orderby后面存在的非聚合列必须全部在groupby中存在如果使用了大于5.7的版本，又使用的group_by

carlos1992·2024-01-24 13:16

dplyr 1.0.0 之列操作

dplyr1.0.0之列操作加载包library(tidyverse)多列进行同样的操作比如:对数据df中的a、b、c、d列都取他们的平均值：df%>%group_by(g1,g2)%>%summarise

热衷组培的二货潜·2024-01-19 11:14

R 数据可视化 —— ggplot 箱线图和小提琴图

也可以用于比较不同变量的分布示例来个最简单的箱线图p%group_by(x)%>%summarise(y0=min(y),y25=quantile(y,0.25),y50=median(y),y75=quantile

名本无名·2024-01-11 02:53

R语言ggplot2堆积柱形图添加误差线的简单小例子

ggplot2做堆积柱形图并添加误差线的办法完整代码'''堆积柱形图添加误差线'''getwd()library(ggplot2)library(dplyr)library(see)df%na.omit()%>%group_by

小明的数据分析笔记本·2024-01-09 18:16

Day6-ZW

思维导图的结果如下：Day6-学习R包.png自我感觉今天的最难点和最兴奋点为管道操作test%>%group_by(Species)%>%summarise(mean(Sepal.Length),y=

有编制的弼马温·2024-01-04 12:57

Prometheus架构从入门到实践(7) --alert配置

resolve_timeout:5m#resolve_timeout：解析超时时间http_config:proxy_url:'http://192.168.13.190:7777'route:#route标记：告警如何发送分配group_by

負笈在线·2024-01-03 07:27

Mysql内联接inner join以后数据条数比原数据表多

解决方法：在SQL中的代码，group_by去重

一瓢西湖水·2023-12-04 20:02

MySQL8.x group_by报错的4种解决方法

在我们使用MySQL的时候总是会遇到各种各样的报错，让人头痛不已。其中有一种报错，sql_mode=only_full_group_by，十分常见，每次都是老长的一串出现，然后带走你所有的好心情，如：LIMIT0,1000ErrorCode:1055.Expression#1ofSELECTlistisnotinGROUPBYclauseandcontainsnonaggregatedcolumn

csdn_aspnet·2023-11-29 06:20

t检验（连续变量）和卡方检验（分类变量）

rm(list=ls())library(ggplot2)library(ggpubr)library(cowplot)data%group_by(Species,SepalLength)%>%summarize

hx2024·2023-11-23 10:40

解决group_by和oder_by同时使用无效的问题

数据表CREATETABLE`student`(`id`int(11)NOTNULLAUTO_INCREMENT,`name`varchar(255)NOTNULL,`score`int(11)NOTNULLDEFAULT'20'COMMENT'年龄',`create_date`timestampNULLDEFAULTCURRENT_TIMESTAMP,PRIMARYKEY(`id`))ENGIN

缓慢移动的蜗牛·2023-11-23 09:36

R报错-gather & spread 函数，有新版替代函数

做一个练习题，以为很简单，但是却碰到问题1.将iris数据框的前4列gather，然后还原iris_gather%group_by(LW)%>%mutate(id=1:n())%>%spread(LW,

7f0a92cda77c·2023-11-22 19:17

max等聚合函数和group by搭配使用的注意事项

1groupby的特点1.1定义group_by的意思是根据by对数据按照哪个字段进行分组，或者是哪几个字段进行分组。

xxx_520s·2023-10-28 13:15

Flask-SQLAlchemy中group_by用法

测试表：Goodsidiidnameac12丁一222李四533李二443王五553狗蛋164张三675李四386王五5fromsqlalchemyimportfunc...#selectiid,count(*)ascnt,sum(ac)asacsfromgoodsgroupbyiidGoods.query.with_entities(Goods.iid,func.group_concat(Goo

gstorm·2023-10-27 05:36

Prometheus学习系列（三十九）之报警模板例子

global:slack_api_url:''route:receiver:'slack-notifications'group_by:

飞雪K·2023-10-19 19:54

R语言dplyr包高效处理数据-补充函数

dplyr包补充用到的实用函数：1、函数cur_group_：数据分组组内标记#使用常见的R语言内置数据集iris#可以明确的知道当前数据属于哪个分组iris%>%group_by(Species)%>

LEEBELOVED·2023-09-21 01:42

（2）10X单细胞聚类

image.pnglibrary(Seurat)library(ggplot2)library(dplyr)options(stringsAsFactors=F)##第1步：读入表达矩阵data=250&nFeature_RNA%group_by

呆呱呱·2023-09-19 10:34

Seurat找到差异基因后筛选Top10的基因

通常情况下，我们按照logfc从大到小筛选每个cluster的top10差异基因deg1就是findallmarkers的输出结果，改成自己的就好deg1%>%group_by(cluster)%>%#

18kkk·2023-09-17 06:40

【自学开发之旅】Flask-数据查询-数据序列化-数据库关系（四）

db.sessionProductInfo.queryfilter()灵活查询filter_by()limit()限制输出条目offset()偏移量order_by()排序group_by()分组聚合.

日近长安远·2023-09-10 21:10

tidyverse|数据分析常规操作-分组汇总（sumamrise+group_by)

本文首发于“生信补给站”https://mp.weixin.qq.com/s/tQt0ezYJj3H7x3aWZmKVEQ一summarise汇总汇总函数summarize()，可以将数据框折叠成一行,多与group_by

生信补给站·2023-09-09 05:54

mysql 使用group_by 1055 错误 | sql_mode=only_full_group_by问题

今天在使用group_by时遇到错误，大概是以下样子：(cymysql.err.InternalError)(1055,"Expression#2ofSELECTlistisnotinGROUPBYclauseandcontainsnonaggregatedcolumn

一灰丶·2023-09-05 00:13

MySQL group_by错误解决

问题MySQL5.7以上版本，默认是开启了only_full_group_by模式的：>select@@sql_mode>select@@global.sql_mode;ONLY_FULL_GROUP_BY,STRICT_TRANS_TABLES,NO_ZERO_IN_DATE,NO_ZERO_DATE,ERROR_FOR_DIVISION_BY_ZERO,NO_AUTO_CREATE_USER,

zenghi·2023-09-01 07:28

R语言14-R语言中的数据整理-新建变量-过滤行-筛选列-分组汇总-数据合并

#新建变量data$new_variable18,]#筛选列selected_columns%group_by(category)%>%summarise(avg_value=mean(value

丰。。·2023-08-23 14:43

解决MySQL8.0之only_full_group_by

1、MySQL8.0进行group_by和orderby时出现报错信息mysql8.0thisisincompatiblewithsql_mode=only_full_group_by#设置mysql处理模式

qq_40278285·2023-08-23 09:35

mysql高版本(8.0+)group_by报错的处理方法

mysql高版本8.0+group_by报错的处理方法1.原因2.处理方法2.1临时方法,重启后失效2.2修改配置my.ini文件1.原因这个错误一般发生在mysql5.7以及5.7以上的版本中，其原因是mysql的默认配置中,sql_mode=“ONLY_FULL_GROUP_BY”这个配置严格执行了‘SQL92标准’,查询字段没有在groupby字段后同时出现,那么sql语句就不合法,就会抛出

*郑*·2023-08-23 09:34

数据库：group by 的使用

一.概述group_by的意思是根据by对数据按照哪个字段进行分组，或者是哪几个字段进行分组。

吃素的施子·2023-08-15 10:57

R语言列表中嵌套列名一致的多个数据框如何整合为一个数据框

载入R包library(broom)library(tidyverse)模拟数据models%group_by(city)%>%do(mod=lm(log2(sales)~factor(month),data

茅逗逗·2023-08-14 06:30

ggplot学习笔记（五）

library(tidyverse)extract_lmr%select(country,year,lifeExp)%>%group_by(country)%>%nest(data=c(year,lifeExp

财富经略·2023-08-13 14:06

库存分析R语言实现方法

library(tidyverse)library(readxl)library(patchwork)df1%mutate(month=cut(`出售年月(年月日)`,breaks="month"))%>%group_by

新欣enjoy·2023-08-01 15:24

将数据框中的数据分类取最大值

max_data=thedataframe%>%group_by(type)%>%filter(data==max(data))%>%ungroup()将数据框thedataframe

PersonaeYxxx·2023-07-19 10:35

统计fastq长度分布

val_1.fq.gz|cut-f2>Length.txt得到一列长度数length128150150150150150147150150然后在R中运行画library(tidyverse)length%group_by

煮梦斋_bioinfo·2023-07-18 13:51

groupby详解

group_by的意思是根据by对数据按照哪个字段进

雨～旋律·2023-06-21 06:34

peewee group by+ count 没有 count 字段的问题解决

q=KeywordTask.select(KeywordTask.track_source_id,fn.COUNT(KeywordTask.track_source_id)).group_by(KeywordTask.track_source_id

·2023-06-17 15:00

筛选富集分析结果 groupgo 分组富集分析

library(ggplot2)go%group_by(ONTOLOGY)%>%mutate(group_size=n())%>%filter(row_number()10,10,group_size)

Young.Dr·2023-06-14 23:09

部署Alertmanager对prometheus监控检测飞书报警通知

告警效果一、编写alertmanager.yml创建个目录存放alertmanager.yml文件mkdir-p/data/alertmanagervialertmanager.ymlroute:group_by

勤奋的树懒·2023-06-12 16:51

lesson3 对聚类细胞cluster进行注释的方法

注释方法分为手动注释与软件注释两大类手动注释1.寻找各cluster特异的高表达基因（marker）markers%select(gene,everything())%>%subset(p_val%group_by

基诺沙大老板·2023-04-21 10:12

sql注入之报错注入

这里主要记录一下xpath语法错误和concat+rand()+group_by()导致主键重复xpath语法错误利用xpath语法错误来进行报错注入主要利用extractvalue和updatexml

老了敲不动了·2023-04-08 20:45

ggplot2绘制带误差线的折线图(经典版)

ggsci)library(patchwork)传统方法传统方法依然是先整理数据，之后添加相应的几何对象，整个过程规规矩矩，无任何亮点可言p1%mutate(dose=as.factor(dose))%>%group_by

R语言数据分析指南·2023-04-05 20:48

tidyverse学习

dplyrHereisthecompletelistoffunctionsdplyroffers:select():Selectcolumnsfromyourdatasetfilter():Filteroutcertainrowsthatmeetyourcriteria(s)group_by

KK_f2d5·2023-03-29 06:53

R优雅的进行多因素方差分析

tidyverse)library(multcompView)library(stats)library(ggsci)加载数据data2%mutate(dose=as.factor(dose))计算方差anova%group_by

R语言数据分析指南·2023-03-15 12:32

R数据科学day2-4

找出每组中最差的成员flights_sml%>%group_by(year,month,day)%>%filter(rank(desc(arr_delay))%group_by(dest)%>%filter

梦幻天堂_ccd5·2023-03-14 19:43

将列的元素按类别合并成一行

想要的结果如下代码：library(data.table)，library(stringr)，library(dplyr)tb%group_by(name)%>%summarise(score=paste

重新开始_xy·2023-02-05 19:45

R语言中的dplyr包

介绍dplyr是一个常用的用于数据清洗的R包，其中主要的函数有：select()从数据中选择列filter()数据行的子集group_by()汇总数据summarise()汇总数据（计算汇总统计信息）arrange

zoujiahui_2018·2023-01-09 13:22

R语言数据预处理

筛选、排序、分段、拆分、分组、合并、拼接、转置、索引、重塑筛选1用which来筛选符合条件的值wage2_3%group_by(female)%>%filter(female==0)library(haven

kanaduowalso·2022-12-21 22:19

【R语言】报错解析：dplyr::group_by 后只显示一条记录，实际应多条记录的报错解析

今天遇到个函数失效问题，特地记录下：先上语句library("dplyr")zy1=mtcars%>%group_by(cyl)%>%summarise(sum=sum(mpg))zy1正常应该显示如图

看海的四叔·2022-12-14 11:14

分布数据图-R/python

tidyverse)library(plotrix)##全局主题设置options(scipen=999)#关掉像1e+48这样的科学符号#颜色设置（灰色系列）cbp1%select(class,cty)%>%group_by

songyi10·2022-11-19 01:46

数据预处理（第二课居多）

一、数据预处理（DataMininglec01和02）1、筛选数据select函数，返回特定列的数据sub_data4.5)3、分组group函数，将数据源按照某一特定属性分组g_a<-group_by

皮匠大大·2022-10-28 05:34

sqlalchemy的高级操作

desc()).all()asc升序db.session.query().order_by(desc()).all()limit(限制)db.session.query().limit().all()group_by

毕竟尹稳健·2022-10-25 22:10

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