E-COM-NET
首页
在线工具
Layui镜像站
SUI文档
联系我们
推荐频道
Java
PHP
C++
C
C#
Python
Ruby
go语言
Scala
Servlet
Vue
MySQL
NoSQL
Redis
CSS
Oracle
SQL Server
DB2
HBase
Http
HTML5
Spring
Ajax
Jquery
JavaScript
Json
XML
NodeJs
mybatis
Hibernate
算法
设计模式
shell
数据结构
大数据
JS
消息中间件
正则表达式
Tomcat
SQL
Nginx
Shiro
Maven
Linux
multiqc
Multiqc
(转录组分析之质量评估)
一个样本生成一个报告,当样本量过多时,逐一查看样本质量就稍显不方便,
multiqc
是一个基于Python的模块,用于整合其它软件的报告的软件,能将fastqc生成的多个报告整合成一个报告的软件,这样能方便的查看所有测序数据的质量
stanford_strive
·
2020-06-25 18:05
NGS分析流程
NGS实验步骤核酸提取与检测、文库构建与文库检测、上机测序生信分析步骤1.质量分析fastqc、
multiqc
、SolexaQA测序数据的质量好坏会影响我们的下游分析。
hanli0902
·
2020-06-23 12:59
NGS分析
NGS
二代测序分析
RNA-seq摸索:1.配置环境
这篇写的特别好:RNAseq-workflowRNA-seq流程RNA-seq一般流程本科生搞定RNA-seq上游数据分析所需要的软件-数据下载:sra-tools-质控:fastqc,
multiqc
;
没有猫但是有猫饼
·
2020-06-06 14:12
Chip-Seq分析过程
Multiqc
安装使用过程的问题
Anaconda下载
multiqc
软件后运行命令报错:
multiqc
*zip-o.
Htt_1996
·
2020-04-25 20:50
Day 5 软件安装
软件安装难易优先级以下软件都可以用condainstall-y来完成此时都可以在rna或者wes这样的小环境下安装,不会污染大环境blast,blat质控,需要fastqc及
multiqc
,trim-galore
陈宇乔
·
2020-04-10 06:04
生信星球转录组培训第一期Day4--郝志刚
数据质控:检测原始数据质量如何,有没有接头,低质量碱基,用到软件fastqc和
multiqc
。其中
multiqc
整合多个样本的fastqc结果于一个文件中。
Captain_8659
·
2020-04-08 11:19
微生物组16S rRNA数据分析小结:从fastq测序数据到OTU table
以下为双端测序(pair-end)产生的fastq格式数据常规分析流程,包括:fastqc及
multiqc
(
GPZ_Lab
·
2019-12-12 01:53
MultiQC
软件安装运行过程
(本文因
MultiQC
安装时出现的很多问题尚未解决,仅供参考,后期如果解决还会更新)
MultiQC
简介:fastqc是一款基于java的软件,能够对测序数据的质量进行评估。
媛媛_生信
·
2019-11-23 13:34
MultiQC
MultiQC
用于对测序数据进行质量评估,但它不同于FastQC之类的软件,FastQC只能对单个样本进行评估生成报告,而
MultiQC
能将fastqc生成的多个报告整合成一个报告(HTML和PDF格式
麋鹿吃了颗草莓
·
2019-11-22 21:53
MultiQC
使用
一、
MultiQC
的安装1.先安装conda我们先前安装过,但是发现不能用了,在网上查询后,发现问题,下面是解决方法下载conda时选择是否自动添加环境变量时,这里选择no,因为自动添加会干扰系统,致使
粥粥zz
·
2019-11-21 21:19
Duplication rate:NGS测序重复率计算
先说一下问题,我的这组数据fastqc报告的重复率特别高,但是fastp结果还好,如图:
multiqc
-fastqcfastpreport(onesample)为什么出现这个问题,到底哪个可信?
NICE_AGIS
·
2019-08-14 20:13
上一页
1
2
下一页
按字母分类:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
其他