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r语言逻辑回归
R语言
dlnm包在时间序列空气污染数据的分布滞后线性和非线性模型的应用(2)
本期应粉丝要求复现一篇6分左右文章的图片,文章名称是:Airpollutionandcoronaryheartdisease–relatedhospitalvisitsinBeijing,China:time-seriesanalysisusingageneralizedadditivemode(空气污染和冠心病相关医院访问,中国北京:时间序列分析应用广义加性模型)作者研究了多种空气污染物与冠心病
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:23
R语言
r语言
开发语言
R语言
基于Matching包进行倾向评分匹配(PSM)
倾向评分匹配(PropensityScoreMatching,简称PSM)是一种统计学方法,用于处理观察研究(ObservationalStudy)的数据,在SCI文章中应用非常广泛。在观察研究中,由于种种原因,数据偏差(bias)和混杂变量(confoundingvariable)较多,倾向评分匹配的方法正是为了减少这些偏差和混杂变量的影响,以便对实验组和对照组进行更合理的比较。为什么需要做倾向
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:22
R语言
r语言
开发语言
R语言
rhdf5读写hdf5文件(.h5)展示文件组织结构和数据索引
h5只是一种简单的数据组织格式【层级数据存储格式(HierarchicalDataFormat:HDF)】,该格式被设计用以存储和组织大量数据。在一些单细胞文献中,作者通常会将分析的数据上传到GEO数据库保存为.h5格式文件,而不是我们常见的工程文件(rds文件,表格数据等),所以为了解析利用这些数据需要对hdf5格式的组织结构有一定的了解。(注:在Seurat包中有现成的函数Seurat::Re
Nh_code
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2023-11-30 08:19
r语言
Linux 下用
R语言
打开hdf5(.h5)文件异常的解决方案
6月10日从GEO数据库下载了作者上传的表达矩阵h5格式文件,需用从中提取出表达矩阵然后重构Seurat分析对象;该exp_matrix.hdf5文件在我的Window系统上,可以通过rhdf5::H5Fopen和hdf5r::H5File$new两种方法打开读取文件内容。但是由于文件太大,有6个G,在我24G内存的Windows系统上没办法完全加载出矩阵。于是就把文件上传到服务器集群进行处理,以
Nh_code
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2023-11-30 08:19
r语言
R语言
gWQS包在加权分位数和回归模型的应用
在流行病学研究中,相较于单一因素的暴露,多因素同时暴露的情况更为常见。传统模型在评价多因素联合暴露时存在数据维度高、多重共线性等问题.WQS回归模型的基本原理是通过分位数间距及加权的方法,将多种研究因素的效应综合成为一个指数,再进行回归分析。不同因素赋予的权重反映了其对结局的影响程度。使用该模型时应满足各研究因素对结局影响的方向相同这一基本假设.模型的一般形式为:式中:c表示污染物种类;β0表示截
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:16
R语言
r语言
回归
kotlin
R语言
学习DAY04:回归分析
Allmodelsarewrong,butsomeareuseful—GeorgeBoxR本身是一门统计语言,主要用于统计分析,前面的语法部分算是基础,接下来开始进入统计模型应用。首先从最常用的回归分析说起。有关线性回归分析模型的基本假定需要注意:1)关于随机干扰项的高斯-马尔科夫定理;2)关于自变量的:不存在共线性;3)关于模型的:模型设定正确。模型拟合lm函数:用最小二乘法估计模型参数x<-s
sonder_943f
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2023-11-30 07:54
R语言
ggplot2绘制Y轴截断柱形图
有时候做柱形图如果其中某一两个数值非常大,作图的时候其他柱子就非常低,看起来就不是很美观,其中一种办法是对Y轴进行截断,如果单纯使用ggplot2的代码实现起来还是相对比较麻烦的,Y叔(ggtree/clusterProfiler等R包的作者)开发的ggbreak可以很方便的实现Y轴截断参考链接SetAxisBreakforggplot2(r-project.org)
小明的数据分析笔记本
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2023-11-30 03:37
人工智能基础_机器学习045_
逻辑回归
的梯度下降公式推导_更新公式---人工智能工作笔记0085
然后我们上面有了
逻辑回归
的损失函数,以后,我们再来看
逻辑回归
的梯度下降公式可以看到上面是
逻辑回归
的梯度下降公式,这里的阿尔法是学习率,这里的后面的部分是梯度也就是步长,这个阿尔法是,通过调节这个来控制梯度下降的快和慢对吧然后我们再来看
逻辑回归
可以看到这里上面是
脑瓜凉
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2023-11-30 02:58
人工智能
机器学习
逻辑回归
逻辑斯蒂回归导函数推导
逻辑回归梯度下降公式推导
吴恩达机器学习课后作业Python实现 03 Multi-class Classification & Neural Network
文章目录题目描述数据集介绍
逻辑回归
(多元分类)神经网络题目描述在本练习中,将使用
逻辑回归
和神经网络来识别手写数字(从0到9)。
shy~
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2023-11-30 01:27
机器学习
python
机器学习
吴恩达机器学习课后作业Python实现 02 Logistic Regression
文章目录
逻辑回归
正则化
逻辑回归
逻辑回归
题目描述设想你是某大学相关部分的管理者,想通过申请学生两次测试的评分,来决定他们是否被录取。现在你拥有之前申请学生的可以用于训练
逻辑回归
的训练样本集。
shy~
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2023-11-30 01:57
机器学习
python
机器学习
R语言
绘制小RNA丰度条形图
R语言
绘制小RNA丰度条形图小RNA中的丰度分布十分不均,少数种类小RNA的丰度占全部的比例较高,研究重点也都放在丰度较高的小RNA上,小RNA长度分布图可以有效筛选丰度较高的小RNA,我们以文献CharacterizationofmouseserumexosomalsmallRNAcontent
纪伟讲测序
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2023-11-30 00:09
IF:4+ 鉴定与股骨头坏死软骨氧化应激相关的Hub基因和通路
点击关注,桓峰基因桓峰基因生物信息分析,SCI文章撰写及生物信息基础知识学习:
R语言
学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你75篇原创内容-->公众号现在肿瘤的文章已经很多很多了
90066456ace6
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2023-11-30 00:53
学习小组Day4-Bossa
day4mind.png初识
R语言
软件的安装R软件的安装从官网下载对应版本,下载地址为:
R语言
官网。
七比比
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2023-11-30 00:57
2020-05-13 常用的数据分析与挖掘工具
常用的数据分析与挖掘工具
R语言
是由奥克兰大学统计系的Robert和Ross共同开发的,并在1993年首次亮相。其具备灵活的数据操作、高效的向量化运算、优秀的数据可视化等优点,受到用户的广泛欢迎。
程凉皮儿
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2023-11-29 19:39
R绘制堆积柱形图
前面给大家讲了☞【
R语言
】百分比表格删除两行重新计算百分比,有小伙伴对文中的两个堆积柱形图比较感兴趣。那么今天我们就来聊聊这两张图是如何绘制出来了。
生信交流平台
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2023-11-29 19:15
《
R语言
实战》自学笔记56-方差分析术语
第9章方差分析9.1术语速成为便于理解方差分析的相关名词,我构建一个案例:假如我们研究氮肥用量和玉米品种对玉米产量影响。设置一个田间试验,试验包括氮肥用量两个N1(200kg/ha)和N2(300kg/ha),玉米品种两个先玉335(XY335)和郑单958(ZD958),3次重复,测定指标为玉米产量。1、田间试验相关概念试验处理(experimentaltreatments):事先设计好的实施在
zjh9280
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2023-11-29 19:12
R语言
rvest包网络爬虫
R语言
网络爬虫初学者指南(使用rvest包)钱亦欣发表于今年06-0414:505228阅读作者SAURAVKAUSHIK译者钱亦欣引言网上的数据和信息无穷无尽,如今人人都用百度谷歌来作为获取知识,了解新鲜事物的首要信息源
weixin_33883178
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2023-11-29 15:26
r语言
爬虫
runtime
一文详解人工智能:线性回归、
逻辑回归
和支持向量机(SVM)
简介:在人工智能领域,线性回归、
逻辑回归
和支持向量机是常见的机器学习算法。本文将详细介绍这三种算法的原理和应用,并提供相应的代码示例。
RRRRRoyal
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2023-11-29 12:47
人工智能
线性回归
逻辑回归
R语言
实现MapReduce的协同过滤算法
原文地址:http://www.tuicool.com/articles/63EjqiAuthor:张丹(Conan)Date:2013-04-07Weibo:@Conan_ZEmail:
[email protected]
:http://www.fens.me/blogAPPs:@晒粉丝http://www.fens.me@每日中国天气http://apps.weibo.com/chin
张小琦
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2023-11-29 12:28
数据挖掘
R sort、rank、order、arrange排序函数
本文转载自:https://www.cnblogs.com/hider/p/10019536.html
R语言
中排序有几个基本函数:sort()、rank()、order()、arrange()一、总结sort
淡水鱼Ada
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2023-11-29 11:31
“SRP模型+”多技术融合在生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价及拓展应用
生态环境脆弱性驱动力研究生态环境脆弱性研究热点二、文献可视化软件介绍及常用功能介绍VOSViewer文献可视化及研究热点分析;Citespace文献可视化及研究热点分析;ArcGIS软件介绍及安装技巧
R语言
环境部署
Teacher.chenchong
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2023-11-29 08:18
生态
经验分享
SRP模型丨生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价;地理探测器运行等;集成云端、桌面端等环境,结合遥感云计算、GIS空间分析、
R语言
统计分析的优势
集成云端、桌面端等环境,结合遥感云计算、GIS空间分析,
R语言
统计分析的优势,以分析生态环境脆弱性的时空演变为主线。
小艳加油
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2023-11-29 08:47
生态
SRP模型
生态环境脆弱性评价
时空格局演变分析
RSEI
指数
地理探测器
shell语言练习for循环和if判断的小脚本
目录需求:ping一下当前网段下的所有地址,能ping通的加入一个文件,不能ping通则加入另一个文件这个fo
r语言
写法是仿C写法,可能是之前语言的印象比较深吧,也可以使用foriin{1..254}for
丨析木丨
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2023-11-29 07:32
linux
shell
linux
服务器
网络
机器学习K近邻算法
K近邻算法与
逻辑回归
不同的是:K近邻可以解决多分类问题,而
逻辑回归
是解决二分类问题的(但是工作当中
逻辑回归
用的还是比较多的)我之所以建议学习机器学习先学K近邻算法,是因为大多数算法需要数学方面的基础特别多
可爱的泥鳅
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2023-11-29 07:31
机器学习
K近邻
机器学习
算法
入门简单
r语言
相关性作图_
R语言
:多个基因的相关性分析与展示
R语言
:多个基因的相关性分析与展示。关于批量相关性分析,我们发过两个帖子。单基因批量相关性分析的妙用,又是神器!基于单基因批量相关性分析的GSEA。
weixin_39747721
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2023-11-29 03:03
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_用
R语言
进行相关性分析:画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值...
excel表格的,对于读取excel,此处有一个小技巧读取excel方法1.把excel文件另存为CSV文件1png2.png3.png4.png2.按照读取csv文件方法读取dat此名为excel1文件被
R语言
读取二
JunyuanLI
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2023-11-29 03:03
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_
R语言
绘图:相关性分析及绘图展示
rm(list=ls())#先把我们的R清空一下datafile="C:\\Users\\gaom\\Desktop\\
R语言
绘图\\相关性分析\\",header=T,=1,sep="\t")#读取数据
董振业
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2023-11-29 03:02
r语言
相关性作图
ROC及曲线面积汇总学习
目录ROC基础生成模拟数据率的计算
R语言
计算测试ROCR:pROCROC绘制单个ROC两个ROCLogistic回归的ROC曲线timeROCROC基础ROC曲线的横坐标是假阳性率,纵坐标是真阳性率,需要的结果是这个率表示疾病阳性的率
hx2024
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2023-11-29 03:32
学习
r语言
相关性作图_
R语言
做相关性分析
衡量随机变量相关性的方法主要有三种:pearson相关系数,spearman相关系数,kendall相关系数:1.pearson相关系数,亦即皮尔逊相关系数pearson相关系数用来衡量两个随机变量之间的相关性
R语言
中求两个随机变量
黑潮制作所
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2023-11-29 03:32
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_R绘图:相关性分析与作图
公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程:生物信息学教学相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑选一些基因做相关性分析,并用不同的R包展示。load(file="mRNAdata.Rda")#加载数据library(tidyv
知乎剧综
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2023-11-29 03:32
r语言
相关性作图
R语言
rayrender包,microfacet微面材料
R语言
rayrender包,microfacet微面材料#TueJul1303:14:532021-#字符编码:UTF-8#R版本:R4.1x64forwindow11#cgh163email@163.
youmigo
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2023-11-28 23:58
机器学习:线性回归与
逻辑回归
一、单变量线性回归(LinearRegressionwithOneVariable)以预测住房价格为例子,单变量线性回归是指只有一个特征(输入变量),这里以房子的大小来预测房价。假使我们回归问题的训练集(TrainingSet)如下表所示:将要用来描述这个回归问题的标记如下:代表训练集中实例的数量代表特征/输入变量;代表目标变量/输出变量;(,)代表训练集中的实例;((),())代表第个观察实例;
passerby58
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2023-11-28 17:35
机器学习
人工智能与神经元的内容梳理(持续更新)
《DeepLearning》四、社区与资源五、工具与框架六、学习路径1.
逻辑回归
,线性回归2.损失函数七、相关论文[^1]一.计算机视觉相关(ComputerVisionRelatedSurveys)A
妇男主任
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2023-11-28 15:23
AIGC
机器学习的复习笔记1
常见的监督学习算法有线性回归、
逻辑回归
、支持向量机等。无监督学习:与监督学习不同,无监督
大滑稽儿
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2023-11-28 15:18
机器学习
笔记
人工智能
R语言
-matrix函数创建矩阵特殊情况
R语言
-matrix函数创建矩阵特殊情况创建矩阵的函数为matrix(data=x,nrow=y,ncol=z,byrow=FALSE,dimnames=NULL)data参数为矩阵元素;nrow参数:
dogplays
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2023-11-28 14:32
r语言
DNA 11. 识别肿瘤蛋白质三维结构上突变热点(HotSpot3D)
点击关注,桓峰基因桓峰基因生物信息分析,SCI文章撰写及生物信息基础知识学习:
R语言
学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你125篇原创内容-->公众号桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程
90066456ace6
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2023-11-28 14:46
R语言
量化投资相关
R语言
在金融领域提供了很多的金融计算框架和工具,当你具备金融理论知识和市场经验,你可以利用这些第三方提供的技术框架来构建自己的金融模型。
Liam_ml
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2023-11-28 07:34
R语言
统计系列第13篇-K-M生存曲线与logrank检验
今天是各类统计方法
R语言
实现的第13期,我们主要介绍
R语言
统计系列第13篇-K-M生存曲线与logrank检验。
拾光_2020
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2023-11-28 04:04
R语言
结果输出方法
R语言
结果输出方法在
R语言
中,有多种方法可以将结果输出到控制台或保存到文件中。下面将介绍几种常用的输出方法,并提供相应的源代码示例。
DevCyberX
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2023-11-28 01:37
r语言
开发语言
R语言
代做data课程设计作业、代写R程序设计作业、代做
R语言
作业、代做linear model作业代写
R语言
编程|帮做C/C++编程
ProblemAConsiderthemodellingofhousesellingprice.ThedatacanbedownloadedintoRusing:read.table(url(“http://pages.uwf.edu/acohen/teaching/glm/house.txt”))Thedatacontainsthefollowingvariables:price(in$1000
zoumangu
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2023-11-28 01:19
机器学习入门之
逻辑回归
:泰坦尼克号生存预测
前言小白的机器学习的入门必备项目科赛网上有着这个项目详细的讲解对小白十分友好1.了解项目概况RMS泰坦尼克号沉没是历史上最臭名昭着的沉船之一。1912年4月15日,在她的处女航中,泰坦尼克号在与冰山相撞后沉没,在2224名乘客和机组人员中造成1502人死亡。这场耸人听闻的悲剧震惊了国际社会,并为船舶制定了更好的安全规定。造成海难失事的原因之一是乘客和机组人员没有足够的救生艇。尽管幸存下沉有一些运气
阿斯顿820
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2023-11-28 01:32
R语言
编程-Tidyverse 书籍-第一章(2)
此部分的内容,全部是对张敬信博士书籍的学习总结。出发点:因为tidyverse简洁编码,使R代码更加易读。我就想系统再次学习下R,这样让自己写的R代码更加简洁。关于“for循环运行速度慢”的说法,实际上已经过时了,现在的R、Matlab等软件经过多年的内部优化已经不慢了,之所以表现出来慢,是因为你没有注意两个关键点:提前为保存循环结果分配存储空间;为循环体中涉及的数据选择合适的数据结构。apply
Hello育种
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2023-11-27 18:06
知识补给站20230419-20230421
10.贷款五级分类11.B端业务和C端业务(参考人人都是产品经理的文章)12.欺诈检测-多分类13.过拟合14.广义线性模型15.经验风险+结构风险16.极大似然估计-求最优参数17.
逻辑回归
18.混淆矩阵
Charming&M
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2023-11-27 16:45
人工智能
大数据
python
学习方法
【R的网络提取】CSDN博客列表和url的提取
最近在读《基于
R语言
的自动数据收集》,在连续看了几天之后,手痒开始进行实践,这本书总体来说不错,推荐入坑。
Ryan_Yang_
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2023-11-27 14:53
R
r语言
爬虫
R语言
实现OTU表的抽平分析
R语言
实现OTU表的抽平分析好久没有更新文章了,抱歉,今天我们先来讲一下抽平。相信大家平常在16sRNA测序后,一般都会对测序数据划分后生成的OTU表进行抽平,保证保证样本测序序列的均一性。
fafu生信小蘑菇
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2023-11-27 13:03
时间序列深度学习:seq2seq 模型预测太阳黑子
作者:徐瑞龙,量化分析师,
R语言
中文社区专栏作者博客专栏:https://www.cnblogs.com/xuruilong100本文翻译自《TimeSeriesDeepLearning,Part2:PredictingSunspotFrequencyWithKerasLstminR
R语言中文社区
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2023-11-27 12:06
自己动手写随机森林(Random Forest)
比如,统计学最爱的
逻辑回归
直线,它只有这2个变量,就是这条直线的斜率,
A君来了
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2023-11-27 07:02
迭代器模式
我们使用fo
r语言
遍历数组,也是一种迭代。结构体对象实现Iteratortrait,创建自定义的迭代器,只需要实现一个next方法的定义。
i-neojos
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2023-11-27 07:09
rust
编程开发
迭代器模式
【
R语言
】maftools包计算肿瘤突变负荷(TMB)
相信很多小伙伴都听过肿瘤突变负荷(tumormutationburden,TMB),它是指肿瘤基因组去除胚系突变后的体细胞突变数量。定义为每百万碱基中被检测出的体细胞基因编码错误、碱基替换、基因插入或缺失错误的总数(mut/Mb)。肿瘤突变负荷是一种定量的生物标志物,它反映了肿瘤细胞所携带的突变总数。具有高TMB的肿瘤细胞具有较高的新抗原水平,被认为可以帮助免疫系统识别肿瘤并刺激抗肿瘤T细胞的增殖
生信交流平台
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2023-11-27 06:13
R语言
:写入文件
如何将数据写入文件在
R语言
中,我们可以使用多种方法将数据写入文件。无论是将计算结果保存到本地文件还是生成数据报告,将数据写入文件是数据分析和科学研究中的常见任务之一。
飘逸轻舞
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2023-11-27 04:00
r语言
前端
开发语言
R语言
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