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r语言随机森林
2019-12-05 Day4 学习
R语言
基础
安装R和Rstudio第一步:查看你的电脑用户名是中文还是英文如果是中文-百度[当Rstudio杠上中文用户名](我这个电脑是英文)搜狗微信搜索:“果子学生信给自己一个全新的
R语言
环境”教程下载
R语言
https
卅衣
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2023-12-20 23:47
解决
R语言
中文乱码问题
解决
R语言
中文乱码问题在
R语言
中,处理中文字符时可能会遇到乱码问题。这种问题通常出现在数据读取、数据处理和图形输出等环节。本文将介绍一些常见的乱码问题及其解决方法,并提供相应的源代码示例。
coding远方
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2023-12-20 18:48
r语言
开发语言
R语言
R语言
--19
函数:定义函数mean,var,stderrmymeansqtest1(,4)#缺省值x=3[1]5>sqtest1(6,8)[1]10
白猫警长ic
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2023-12-20 18:43
R语言
生物群落(生态)数据统计分析与绘图实践技术
R语言
作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂,涉及众多统计分析方法。
weixin_贾
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2023-12-20 13:09
地理
遥感
生态模型
生态系统服务
景观格局
r语言
经验分享
R:数据结构
中常见的数据结构向量矩阵数据框:经常使用的一种数据结构列表因子R中常见的数据结构数值型:数值可以用于直接结算,加减乘除字符串型:可以进行连接,转换,提取等逻辑型:真或者假日期型1.2向量向量概述向量是
R语言
中最基本的数据结构
尔玉RGX
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2023-12-20 12:59
R语言
--20/21/22
cor相关性:cor():cor(x,y,method=c("pearson","kendall","spearman"))计算x,y的相关性,x,y需要为向量,若为矩阵则计算x列,y列的相关性。method指定相关性计算的方法,默认情况下是Pearson相关性系数。Pearson,spearman计算方法见笔记本cor.test():cor.test()使用方法.pngcor()只给出相关性值,
白猫警长ic
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2023-12-20 11:28
机器学习---bagging与
随机森林
1.bagging算法集成学习有两个流派:一个是boosting派系,它的特点是各个弱学习器之间有依赖关系。另一种是bagging流派,它的特点是各个弱学习器之间没有依赖关系,可以并行拟合。Bagging的弱学习器之间的确没有boosting那样的联系,是“随机采样”。随机采样(bootsrap)就是从训练集里面采集固定个数的样本,但是每采集一个样本后,都将样本放回。也就是说,之前采集到的样本在放
三月七꧁ ꧂
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2023-12-20 11:17
机器学习
机器学习
人工智能
R语言
专题班(训练营:2023.10.23~10.30)
茗创科技专注于脑科学,涵盖(EEG/ERP,fMRI,结构像,DTI,ASL,FNIRS)等,欢迎留言讨论及转发推荐,也欢迎了解茗创科技的脑科学课程,数据处理服务及脑科学工作站销售业务,可添加我们的工程师(微信号MCKJ-zhouyi或17373158786)咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技
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2023-12-20 09:17
【
R语言
】estimate包计算免疫相关分值
前面小编给大家介绍了☞肿瘤免疫分值数据库—ESTIMATE☞肿瘤微环境生信高分套路☞如何合并ESTIMATEScore和生存时间☞合并TCGA表达谱数据,生存状态和生存时间在介绍ESTIMATE数据库的时候,小编就提到,目前该数据库中只提供25种肿瘤的Stromalscore,Immunescore和ESTIMATEscore这三种分值。(https://bioinformatics.mdande
生信交流平台
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2023-12-20 08:44
文献计量学方法与应用、主题确定、检索与数据采集、VOSviewer可视化绘图、Citespace可视化绘图、
R语言
文献计量学绘图分析
目录一、文献计量学方法与应用简介二、主题确定、检索与数据采集三、VOSviewer可视化绘图四、Citespace可视化绘图五、
R语言
文献计量学绘图分析六、论文写作七、论文投稿更多应用文献计量学是指用数学和统计学的方法
小艳加油
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2023-12-20 06:10
语言类
Citespace
vosviewer
文献计量学
文献可视化
R语言
生物群落(生态)数据统计分析与绘图丨
R语言
基础、tidyverse数据清洗、多元统计分析、
随机森林
模型、回归及混合效应模型、结构方程模型、统计结果作图
R语言
的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂,涉及众多统计分析方法。
小艳加油
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2023-12-20 06:01
生态
r语言
生物群落
生态
结构方程模型
贝叶斯
GO.db:存储Gene Ontology信息的R包
在生信分析领域,
R语言
由于其简单易用的特点和良好的生态环境,占用重要的一席之地。其中,Bioconductor作为生信分析专用的
R语言
社区,提供了许多的R包。
生信修炼手册
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2023-12-20 02:58
日月光华 Python数据分析 - 机器学习 - 自然语言处理
随机森林
#多分类importpandasaspdimportsklearndata=pd.read_csv('./iris.data',header=None,#重新用names去命名headernames=['sepal_length_cm','sepal_width_cm','petal_length_cm','petal_width_cm','cla'])data.head()image.pngda
薛东弗斯
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2023-12-20 01:40
R语言
采集获取58商铺出租转让信息
在
R语言
中,你可以使用rvest等包从58等网站抓取商铺出租和转让信息。以下是一个使用伪代码的步骤计划:1、加载必要的R库(如rvest,htt
q56731523
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2023-12-19 22:48
r语言
开发语言
swift
爬虫
php
python
R语言
绘制频率直方图
频率直方图是数据统计中经常会用到的图形展示方式,同时在生物学分析中可以更好的展示表型性状的数据分布类型;R基础做图中的hist函数对单一数据的展示很方便,但是当遇到多组数据的时候就不如ggplot2绘制来的方便。1.基础做图hist函数hist(rnorm(200),col='blue',border='yellow',main='',xlab='')1.1多图展示par(mfrow=c(2,3)
种地的pele
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2023-12-19 22:31
R语言
之简单图表制作1
比如简单画一个图foo=5],y[y>=5],pch=4,col="darkmagenta",cex=2)points(x[y=5&x-5&y=5&x-5&y15)&(y>-5&y15)&(y>-5&y<5)])lines(x,y,lty=4)arrows(x0=8,y0=14,x1=11,y1=2.5)legend("bottomleft",legend=c("overallprocess","
知识分享小能手
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2023-12-19 22:25
R语言简单画图1
数据可视化
R绘图_几种多重比较方法
本文参考:基于
R语言
的七种多重比较方法若研究目的是方差分析有统计学差异后,想知道哪些组间的均数有差异,便是事后比较。事后比较的常用方法有SNK、Turkey、Scheffe和Bonferroni法。
谢俊飞
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2023-12-19 21:14
学习小组Day4笔记--Jeremy
R语言
基本操作Rstudio界面图片来源于生信星球查看目录及文件查看目录及文件基本算术基本算术赋值与删除赋值与删除作图图1图2
Jeremy_bin
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2023-12-19 20:53
R语言
基础(1)——数字、字符与向量
向量1、向量的赋值第一种赋值方法:c()xx#进一步有y3)#结果显示为FALSEany(c(1,2,3,4,5,6)>3)#结果显示为TRUE6、缺失数据用NA表示某处的数据缺省或缺失x<-c(1,2,3,NA)y<-is.na(x)#结果为is.na()函数是检测缺失数据的函数,如果返回值为值(TRUE),则说明此数据是缺失数据,如果返回值为假(FALSE),则此数据不是缺失数据
令平子
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2023-12-19 17:29
R语言
R语言
:转换—宽数据↔长数据
博客来源于我的语雀专栏:
R语言
·语雀更多内容同步更新请关注我的语雀:令平子·语雀参考资料:部分已引用到各段落宽转长二维数据转长r-Reshapingdata.framefromwidetolongformat-StackOverflow
令平子
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2023-12-19 17:29
R语言
r语言
【
R语言
】--- 回归分析最优拟合模型及作图
因变量和自变量间的拟合关系对于生态学而言极其重要,很多因变量和自变量间关系是一元线性回归,然而很多数据并不一定是直线关系,而是需要探索其曲线拟合关系。这种曲线关系并非直观看出,而是需要进行统计检验,通过比较拟合度及其显著性,来选择最优拟合模型。赤池信息准则(Akaikeinformationcriterion,AIC)和贝叶斯信息准则(Bayesianinformationcriterion,BI
生态数据
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2023-12-19 15:05
跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析:
R语言
做方差分解的一个简单小例子
之前好多人在公众号留言问这个方差分解的内容,但是之前自己也没有听说过。最近看到有人分享了公众号推文一种简单易行的方差分解方法。看了这个推文我目前理解的是方差分解的主要作用是量化回归模型Y=b0+b1x1+b2x2+…中x1,x2,x3…对Y贡献的相对大小,以及不同X所属的因素类别(如生物因素,非生物因素)对Y的贡献大小。这篇推文以已经发表的论文中的数据为例子进行了介绍,论文是image.png这篇
小明的数据分析笔记本
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2023-12-19 15:22
R语言
——基本操作(一)
目录一、基本操作二、R包的安装及使用三、获取帮助四、内置数据集五、数据结构六、向量索引七、向量运算参考Rstudio控制台常用快捷键Ctrl+↑:查看所有历史记录,比直接使用↑查找更方便Esc:中断操作,可中断未完成的操作(未完成回车后是+),也可以清空命令。Ctrl+L:清空屏幕Alt+Shift+K:显示Rstudio中所有的快捷操作一、基本操作getwd():显示当前工作目录setwd('E
Billie使劲学
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2023-12-19 13:00
R语言
r语言
《数量生态学:
R语言
的应用》—第四章聚类分析1 概述
数量生态学:
R语言
的应用—第四章聚类分析之前我们了解了关联测度与矩阵,主要是Q模式与R模式。从今天开始给大家带来《数量生态学:
R语言
的应用》—第四章聚类分析。
fafu生信小蘑菇
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2023-12-19 10:09
R语言
中do.call函数学习
虽然
R语言
有类型很丰富的数据结构,但是很多时候数据结构比较复杂,那么基本就会用到list这种结构的数据类型。
学好生信
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2023-12-19 10:18
使用
R语言
对SSR数据做主成分分析(PCA)的一个简单小例子
昨天的推文介绍了使用
R语言
对比对后的DNA序列做主成分分析的一个简单小例子,推文下有朋友留言问如何对0,1矩阵做主成分分析(PCA)查了一下参考资料找到了一个办法参考资料的链接1、https://cran.r-project.org
小明的数据分析笔记本
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2023-12-19 09:00
How can I write the %Var explained into the text or excel in R?
我在使用
随机森林
做回归分析时,最后会有%Varexplained出现在面板,但当数据量很多事之前的就会被覆盖反正也不知道为什么就是看不到前面%Varexplained的情况了,怎样才能把%Varexplained
冬天的西瓜
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2023-12-19 07:50
R语言
怎么绘制热图(一)
1.什么是热图?在组学研究的相关文章中,我们常常可以看到热图(Heatmap)的展示。这些红绿相间且色彩变化丰富的热图总是能吸引读者的眼球,从而为文章增添不少亮色。当然,作为严谨的科学研究论文,图表的展示当然不可能仅仅是为了好看。热图作为一种对实验数据及其分析结果的直观的表达方式,在很多文章中都有着不可或缺的地位。它是一种将规则化矩阵数据转换成颜色色调的常用的可视化方法,其中每个单元格对应数据的某
心有灵犀啦
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2023-12-19 05:01
JupyterNotebook VS JupyterLab 如果jupyter安装成功,点击jupyterlab即可进入lab环境
一般来说,如果是使用
R语言
的话,使用Rstudio居多,使用Python的话,使用Jupyter居多。
生信小博士
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2023-12-19 05:44
jupyter
大数据/人工智能/EXCEL/
R语言
精品教材推荐
泰迪智能科技携手人民邮电出版社通过采用任务式、项目式等多种教材编写模式,教材内容注重实践能力培养,贴合教师教学实际和学生实践实验,已经被1500余所院校选用为教材。图书优势理实一体化本系列教材注重学生的实践能力培养,针对高校实践教学中的痛点,首次提出“鱼骨教学法”的概念。以企业真实需求为导向,学生学习技能时紧紧围绕企业实际应用需求,将学生需掌握的理论知识,通过企业案例的形式进行衔接,达到知行合一、
泰迪智能科技
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2023-12-18 19:57
图书教材推荐
大数据
人工智能
notes2
机器学习ROC曲线、AUC、PR曲线等决策树,ID3、C4.5、CART决策树,
随机森林
、Adaboost、GBDT决策树,XGBoost、LightGBM逻辑回归,L1L2正则化熵,KL散度,交叉熵micro-f1
lym94
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2023-12-18 14:53
R语言
【rgbif】——什么是多值传参?如何在rgbif中一次性传递多个值?多值传参时的要求有哪些?
rgbif版本:3.7.8.1什么是多值传参?您是否在使用rgbif时设想过,给某个参数一次性传递许多个值,它将根据这些值独立地进行请求,各自返回独立的结果。rgbif支持这种工作模式,但是具体的细节需要进一步地学习才能掌握,避免在使用时出现事与愿违的结果。如何在rgbif中一次性传递多个值?在使用rgbif的方法时,向某个参数传入多个值,用户的表达语句差之毫厘,代码结果就会失之千里。比如说下面的
ALittleHigh
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2023-12-18 10:50
R语言
r语言
开发语言
R语言
【rgbif】——rgbif将物种分布数据转换为地图格式的详细说明
RGBIF(R包)是一个用于访问和使用物种分布数据的工具。它可以将物种分布数据转换为地图格式,以便更好地可视化和分析。下面是使用RGBIF将物种分布数据转换为地图格式的详细说明:步骤1:安装RGBIF包要使用RGBIF包,首先需要在R环境中安装该包。可以通过以下命令将RGBIF包安装到R中:install.packages(“rgbif”)步骤2:导入RGBIF包在使用RGBIF包之前,需要将其导
ALittleHigh
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2023-12-18 10:50
R语言
r语言
开发语言
R语言
【rgbif】——使用rgbif获取非行政单位区域内的物种记录信息(以泛喜马拉雅地区为例)
使用occ_search获取非行政单位区域内的物种记录信息(以泛喜马拉雅地区为例)1.分析使用rgbif的一些函数1.1使用name_suggest()的一些要点1.2使用occ_count()的一些要点1.3使用occ_search()的一些要点2.数据的准备工作和检验2.1空间表达(用WKT表示该地区)2.1.1非行政区域的边界坐标点提取2.2.2非行政区域的边界坐标点检验2.2物种列表(物种
ALittleHigh
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2023-12-18 10:49
R语言
r语言
开发语言
毕业论文知识点记录(六)——基于
R语言
优化maxent模型
毕业论文知识点记录(六)——基于
R语言
优化maxent模型第一步:R安装这个网上都有很多详细的步骤,就不再详细介绍了。
遥遥遥遥遥遥感
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2023-12-18 10:18
r语言
开发语言
R语言
【rgbif】——occ_search对待字符长度大于1500的WKT的特殊处理真的有必要吗?
一句话结论:只要有网有流量,直接用长WKT传递给参数【geometry】、参数【limit】配合参数【start】获取所有记录。当我在阅读【rgbif】给出的用户手册时,注意到【occ_search】强调了参数【geometry】使用的wkt格式字符串长度。文中如是写道:当处理长WKT字符串(>1500个字符)时,可以通过参数geom_big进行设置:asis:此值为默认值。不做任何处理,只传递W
ALittleHigh
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2023-12-18 10:17
R语言
r语言
数据库
开发语言
R语言
小作业-中级
学习了一段时间的R,开始做些题,来加深所学的知识。1.根据R包org.Hs.eg.db找到下面ensembl基因ID对应的基因名(symbol)1.新建TXT,将题中基因复制到TXT,并命名。然后导入到R。a<-data.table::fread("1.txt",header=F)2.导入R后发现得进行小数点分割,由于lappy和str_split比较复杂,因此采用separate函数,a2<-s
鱼啸九天
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2023-12-18 09:04
R可视化——Mantel test分析及可视化
此前我们已经讲过了如何使用
R语言
计算两列数据相关性的分析方法,今天,我们来看一种检验两个矩阵相关关系的方法——Manteltest方法,这种分析方法可用在植物微生物群落与生态环境之间相关性的检验以及人体肠道微生物群落与人体疾病相关性检验等领域
科研那点事儿
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2023-12-18 02:29
R语言
文本分析《三国演义》
数据读取与包的加载由于最近对文本分析比较感兴趣,所以分析三国演义的文本。getwd()setwd("E:\\三国")library(jiebaR)library(ggplot2)library(jpeg)library(reshape2)library(wordcloud)读取前十行>sanguosanguo[1:10]#展现数据前十行[1]"三国演义明?罗贯中"[2]"致读者"[3]"“大江东去
乔巴爱雪雪
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2023-12-18 01:31
R语言
R
文本分析
词频统计
[原创][
R语言
]股票分析实战[2]:周级别涨幅趋势的相关性
[简介]常用网名:猪头三出生日期:1981.XX.XXQQ联系:643439947个人网站:80x86汇编小站https://www.x86asm.org编程生涯:2001年~至今[共22年]职业生涯:20年开发语言:C/C++、80x86ASM、PHP、Perl、Objective-C、ObjectPascal、C#、Python开发工具:VisualStudio、Delphi、XCode、Ec
我不是代码教父
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2023-12-18 01:49
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R语言大数据分析
r语言
股票
大数据
数据挖掘
提升
R语言
分析效率:如何精准定位CRAN中你想要的高质量R包?
对于数据科学家和
R语言
爱好者来说,寻找合适的R包以满足特定需求是一项重要但往往令人困惑的任务。
R语言数据分析视界
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2023-12-18 00:19
r语言
开发语言
学习小组Day5笔记--没有眼镜
R的数据结构向量&数据框
R语言
数据结构.png使用数据框中的变量作图options(stringsAsFactors=T)a<-data.frame(case=paste0("S",1:9),values
没有眼镜
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2023-12-17 23:15
R语言
_ifelse()函数用法
ifelse()函数Usageifelse(test,yes,no)ifelsereturnsavaluewiththesameshapeastestwhichisfilledwithelementsselectedfromeitheryesornodependingonwhethertheelementoftestisTRUEorFALSE.如果test成立,执行yes,否则执行no,可以对数据
谢俊飞
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2023-12-17 21:46
机器学习笔记
关键词:数据模型预测2.机器学习算法分类2.1监督学习数据集有标签监督学习三要素:模型算法策略2.1.1分类classification离散型数据常用算法:Knn,朴素贝叶斯,svm,决策树与
随机森林
,
偏偏偏执先生
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2023-12-17 17:40
不同分布的QQ图绘制
研究动机在
R语言
中常用qqnorm()绘制QQ图的散点图,qqline()用于在图上添加一条参考直线。
庄闪闪
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2023-12-17 16:08
R数据科学
r语言
2020-07-01 大型吃书现场之NEwR(001)
答:NEwR:NumericalEcologywithR(数量生态学——
R语言
的应用)然后解释一下,为什么叫大型吃书现场?
SmallJam
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2023-12-17 16:22
R语言
|分面中嵌入趋势线
简介关于分面的推文,小编根据实际科研需求,已经分享了很多技巧。例如:分面中添加不同表格分面中添加不同的直线基于分面的面积图绘制分面中的细节调整汇总基于分面的折线图绘制最近科研中又遇到了与分面相关的需求:在分面中添加拟合线。本期就针对该问题,绘制出以下图形:图形含义:随着时间的推移,展示多个测试产品退化累积量的箱线图。这些产品涵盖了两种不同的退化性能(PC)。图中的红线表示通过提出的模型拟合得到的平
庄闪闪
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2023-12-17 16:07
r语言
开发语言
代做COMP0037、代做Planning Algorithms、Python编程语言代写、代写Python代写
R语言
程序|代做数据库S
COMP0037Coursework1Term2,2019“PathPlanninginaKnownWorld”InvestigatingPathPlanningAlgorithmsCOMP0037Assignment1SimonJulier(
[email protected]
),DanButters(
[email protected]
),JuliusSustarevas(j
longwanggua
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2023-12-17 15:02
【
R语言
】R package -- ggpubr
ggpubrggpubr专门为学术期刊绘图而生,据说是能画出editor最喜欢看的图。1.安装和加载由于这个包放在cran上,所以安装也方便,直接install.packages().install.packages("ggpubr")library("ggpubr")2.绘图示例GeneexpressiondataBoxplotsViolinplotsStripchartsanddotplots
巩翔宇Ibrahimovic
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2023-12-17 15:15
非线性回归的实现方式
非线性回归的实现方式1.多项式回归:2.决策树回归:工作原理3.
随机森林
回归(更高级的集成方法):工作原理4.支持向量回归(SVR):工作原理5.K近邻回归(KNN回归):工作原理6.神经网络回归:工作原理总结本文介绍多种非线性回归的实现方法
twinkle 222
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2023-12-17 13:00
回归
数据挖掘
人工智能
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