r语言随机森林第87页

bioconvert计算测序覆盖度并使用R语言ggplot2画折线图进行可视化展示

参考基因组下载自NCBIhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/FN433596下载原始测序数据最近发现了两个新方法一个是bioconvert可以直接下载还有一个工具是kingfisher这个好强大git主页链接https://github.com/wwood/kingfisher-download我试了一下这个kingfisher这个工具kingfisherge

小明的数据分析笔记本·2023-03-24 15:14

木小亘·2023-03-24 11:25

集成学习之Bagging和RF

一、什么是随机森林二、随机森林的两个随机三、随机森林算法过程四、为什么如此受欢迎五、随机森林算法的优缺点六、RF特征选择*****************************************

小小orange·2023-03-24 06:32

Adaboost理解笔记(matlab实现)

目前集成学习有bagging、boosting算法，两者异同可以参考这篇博客随机森林（RandomForest）是一种bagging的方法；Adaboost、GBDT、XGBoost都是一种boosting

zoulala·2023-03-24 04:31

数据分析必读干货：简单而实用的3大分析方法

如果有人建议你去学习R语言、tableau、PowerBI，那么我建议你不如先从最基础也是最核心的数据分析方法学起。

hzbooks·2023-03-24 02:06

R语言空间分析、模拟预测与可视化

【高阶版】R语言空间分析、模拟预测与可视化目录R语言空间数据介绍及数据挖掘关键技术R语言空间数据高级处理技术R语言多维时空数据处理技术与数据清洗整合R语言地统计与空间自相关、空间插值方法R语言机器学习与空间模型预测及不确定性评估

PhyliciaFelicia·2023-03-23 21:16

R语言学习之基础绘图详解

目录散点图曲线图条形图饼图R语言内置了一些基础的绘图函数，主要包括散点图曲线图条形图饼图plotcurvebarplotpie这些绘图函数参数各异，但有个别参数相对来说比较通用，包括main图像标题xlim

·2023-03-23 20:50

R语言三种方法绘制饼图

R语言中绘制饼图，有基础绘图包的pie()函数，但是做出来的图不够美观。ggplot2及其拓展包做出来的图美观。下面提供三种以ggplot2及其拓展包绘制饼图的方法。

Whuer_deng·2023-03-23 19:59

学习小组Day4笔记-胡莹

还沉浸在学会使用Linux的成就感中，今天就开始了新的挑战---R语言学习！

胡莹crystal·2023-03-23 18:46

机器学习简史

姓名：米芃学号：16040520018［嵌牛导读］全面介绍机器学习发展的历史，从感知机、神经网络、决策树、SVM、Adaboost到随机森林、DeepLearning。

南城城南·2023-03-23 17:13

GPL文件一个探针对应多个symbol 整理成data.frame 【已解决】

虽说简单，但对R语言不熟悉的人来说还是需要指点一下，才会用。首先是GPL下载的文件，以GPL96为例。提取最感兴趣的3列。好的，接下来需要得到每个probe对应单个symbolname的数据框。

yadandb·2023-03-23 16:32

GWAS 数据格式说明

全基因组关联分析（GWAS）大家都不陌生，今天我们给大家介绍下各种格式之间转化在R语言是怎么实现的。

陈光辉_花生所·2023-03-23 16:33

大数据分析案例-基于随机森林算法预测共享单车租赁数量

如果文章对你有帮助的话，欢迎评论点赞收藏加关注+喜欢大数据分析项目的小伙伴，希望可以多多支持该系列的其他文章大数据分析案例合集大数据分析案例-基于随机森林算法预测人类预期寿命大数据分析案例-基于随机森林算法的商

艾派森·2023-03-23 13:10

大数据分析案例-基于决策树算法预测ICU患者是否需要插管

如果文章对你有帮助的话，欢迎评论点赞收藏加关注+喜欢大数据分析项目的小伙伴，希望可以多多支持该系列的其他文章大数据分析案例合集大数据分析案例-基于随机森林算法预测人类预期寿命大数据分析案例-基于随机森林算法的商

艾派森·2023-03-23 13:10

R语言实战—1

R语言介绍help("foo")或?

七白七白七七白·2023-03-23 12:35

R语言系列4：图形初阶

R语言系列4：图形初阶此文内容为《R语言实战》的笔记，人民邮电出版社出版。

爱吃汉堡薯条·2023-03-23 10:59

1 . spark ml 随机森林练习代码讲解

一,算法简介随机森林是决策树的集成算法。随机森林包含多个决策树来降低过拟合的风险。随机森林同样具有易解释性、可处理类别特征、易扩展到多分类问题、不需特征缩放等性质。

丑图高手·2023-03-23 08:23

R语言pheatmap热图色条控制小技巧

使用的是R语言的pheatmap包，先生成随机数据：set.seed(100)data1<-c(runif(20,min=-2,max=2),rnorm(380,2,2))data1<-matrix(sample

Seurat_·2023-03-23 03:56

《自控力》

我想要意志力挑战：到年底，集中精力完成R语言学习，掌握基本的数据分析；当下“玩手机的渴望”最有可能分散我的注意力。01我要做，我不要，我想要：什么是意志力？为什么意志力至关重要？1、“

Baiting·2023-03-23 03:40

【R实战入门】从安装到散点图绘制

本系列的全部内容均参考《R语言实战》1R与RS

佳奥·2023-03-23 02:17

R语言中xlsx包安装方法

xlsx包依赖于Java环境，在安装前需要首先装Java(我的R时64位的Java也装64位)，并配置环境变量。1、首先需要安装rJava和xlsxjars两个包解决办法：1、如果没有java运行环境，则需安装对应版本的jre,如R64就需要安装jre64位的，并且要注意在系统环境变量中指定java_home2、如果有java运行环境，则是jre版本对应的java_home设置有问题，需重新设置正

xiaoyu89·2023-03-23 01:49

图神经网络05-基于Graph的传统机器学习理论

图的机器学习任务主要是以下三种：NodeLevel:节点级别LinkLevel：边级别GraphLevel：图级别并且三部分难度依次是由浅入深的传统ML流程定义和设计节点/边/图的特征对所有训练数据构造特征训练ML模型（1）随机森林

致Great·2023-03-23 01:16

R语言格式化百分比数据

（一）通过函数实现百分比格式化#百分比格式化format_percnet<-function(x){return(paste0(format(x*100,digits=2),"%"))}

lucier19981·2023-03-22 20:56

编程语言排行：C、Python、Java

python学习交流·2023-03-22 20:03

python 人工智能算法之随机森林流程详解

目录随机森林优缺点总结随机森林(RandomForest)是一种基于决策树（前文有所讲解）的集成学习算法，它能够处理分类和回归两类问题。

·2023-03-22 16:15

R语言学习之字符串和时间格式化详解

目录字符串格式化转义字符时间格式化字符串函数字符串格式化R语言字符串可用单引号''或双引号""来表示，二者唯一的区别是，单引号字符串不含单引号，双引号字符串不含双引号。

·2023-03-22 16:14

关于R环境的配置

进入Rstudio之后编辑file.edit('~/.Rprofile')参考《R语言实战》的脚本进行配置，按照自己的情况有所调整#Thingsyoumightwanttochange#下面是常规设置，

熊逸Byron·2023-03-22 07:26

R语言与医学统计图形-【27】ggplot2图形组合、字体、保存

ggplot2绘图系统——图形组合、字体选择、保存输出1.图形组合一页多图在基础包中利用par和layout函数来切分画布。ggplot2是先铺好网格背景，再进行绘图，所以要通过切分网格背景来实现一页多图。gridExtra包（grid扩展包）可用于图形排列组合、表格对象排列组合、规则多边形及椭圆的排列组合。library(grid)#在画布上画8图（列表）gs<-lapply(1:8,funct

Bioinfarmer·2023-03-22 06:30

R语言|绘制散点图

今天小编来分享一下R语言绘制散点图的代码~1.小编使用的是R自带的数据集，先调用出数据集；#调用R自带数据集library(gcookbook)head(heightweight)image.png2.

维凡生物·2023-03-22 04:11

R语言安装xlsx包遇到的报错及解决办法

第一次安装遇到的报错是Error:packageornamespaceloadfailedfor‘xlsx’:.onLoadfailedinloadNamespace()for'rJava',details:call:fun(libname,pkgname)error:NoCurrentVersionentryinSoftware/JavaSoftregistry!Tryre-installing

小明的数据分析笔记本·2023-03-22 00:15

实用 | 分享一个决策树可视化工具

下面这个例子是在鸢尾花数据上，采用随机森林的方法训练出来的包含多棵决策树的模型，我们对其中一棵决策树进行可视化。

人工智能遇见磐创·2023-03-22 00:45

R语言合并TCGA中CNV矩阵

上一期给大家介绍了如何从TCGA数据库下载拷贝数变异（CNV）数据☞如何下载TCGA拷贝数变异（CNV）数据今天我们来聊一聊如何将每一样本的CNV数据，合并成一个矩阵，方便后续的处理和分析。前面小编已经跟大家介绍过☞R代码合并新版TCGA数据库RNAseq表达谱数据☞零代码合并新版TCGA数据库RNAseq表达谱数据☞R代码合并TCGA体细胞突变数据☞R代码合并TCGA数据库中DNA甲基化数据☞合

生信交流平台·2023-03-21 22:30

R语言 server

reactive()：包装一个正常表达式来创建一个反应式表达式。从概念上讲，反应式表达式是一种表达式，其结果将随时间而变化。renderTable()：创建适用于分配给输出槽的反应表{UsagerenderTable(expr,striped=FALSE,hover=FALSE,bordered=FALSE,spacing=c("s","xs","m","l"),width="auto",alig

D_MarsD·2023-03-21 19:04

XGBoost（二）：R语言实现

原文链接：XGBoost（二）：R语言实现微信公众号：机器学习养成记之前在XGBoost（一）：与同类算法的差异对比一文中介绍了Bagging与Boost、AdaBoost与GradientBoost、

三猫后端·2023-03-21 19:34

学习小组Day4笔记--王灵

R语言指令(运行快捷键：ctrl+enter)(赋值符号：alt+-)查看当前工作目录getwd()更换工作目录setwd(dir="文件夹/文件夹/文件夹")显示文件列表dir()计算1+21+2函数

土豆龙123·2023-03-21 18:46

搭建金融信贷风控中的机器学习模型-(8)梯度提升算法

在分类任务中，除了逻辑回归、SVM、决策树等简单模型外，还有例如随机森林之类的集成模型，GBDT就是其中一类代表的梯度提升模型。

GQRstar·2023-03-21 14:40

在数据分析、挖掘方面，有哪些好书值得推荐？

StatisticsforBusinessandEconomics-商务与经济统计PythonforDataAnalysis-利用Python进行数据分析IntroductiontoDataMining-数据挖掘导论如果你是学R的，可以再加一本R语言实战为什么选这三本书呢

python大数据分析·2023-03-21 13:01

R笔记之《R语言之书-编程与统计》第二部分编程

第二部分编程包含4个章节调用函数条件和循环编写函数异常值、计时和可见性调用函数R中3个重要的环境：全局环境、包环境和命名空间、本地和词汇环境全局环境是用户自定义工作对象的区域，ls函数会输出当前全局环境中所有内容的名字。每个包环境代表控制搜索对象不同方面的环境。本地环境也叫做词汇环境，这个环境包括所有被创建的对象、变量和可见函数，包括在其执行过程中所提供的任何参数。用search()查看R的搜索路

我是Peace·2023-03-21 11:01

初学者R语言：热图基础画法及个性化调整详解

热图（Heatmap）：用颜色变化直观的表达数据之间差异的图，是对实验数据进行质制和差异数据的展现，是数据挖掘类文章的标配。Rplot1.jpeg例如上图，每个小方格表示每个基因，其颜色表示该基因表达量大小，表达量越大颜色越深（红色为上调，蓝色为下调）。每行表示每个基因在不同样本中的表达量情况，每列表示每个样品中所有基因的表达量情况。上方树形图表示对来自不同实验分组的不同样品的聚类分析结果Draw

mayoneday·2023-03-21 07:18

[R语言练习题]R语言中级练习题

这是生信技能树论坛R语言的中级测试题，其中大部分是GEO数据挖掘和TCGA数据库的一些操作，虽然我目前用不到，但是却可以通过查看大佬的代码来提高自己的认识水平，也可以对其他领域有个粗浅的认识。

巩翔宇Ibrahimovic·2023-03-21 07:54

R语言：菌群Alpha多样性分析和Boxplot箱形图

导读箱型图（Boxplot）或者盒图是一种能同时展示一组或多组数据的极值、四分位数、中位数和离群值，显示数据离散情况的统计图。下面介绍一下如何在R软件中利用箱形图可视化两组微生物群的Alpha多样性指数。过程分为以下几步：1）模拟原始数据；2）模拟分组；3）标准化；4）计算多样性；5）T检验；6）ggplot绘制Boxplot，保存结果。完成以上步骤将得到如下结果：1.png1模拟丰度矩阵set.

小白菜学生信·2023-03-21 03:31

单细胞测序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高级分析、文章复现

R语言和Seurat已以势如破竹之势进入4.0时代，天问一号探测器已进入火星乌托邦平原了，你还不会单细胞吗？那么为了不被时代抛弃的太远，跟着我们一起通过学习seurat系列教程入门单细胞吧。

Seurat_Satija·2023-03-21 03:46

R语言ggplot2作图小技巧：柱形图如何让y轴的起始点不是0

答案是在coord_cartesian(ylim=c(5,10))函数里设置y坐标的范围library(ggplot2)dat<-data.frame(x=LETTERS[1:10],y=10)ggplot(data=dat,aes(x=x,y=y))+geom_col(aes(fill=x),show.legend=FALSE)ggplot(data=dat,aes(x=x,y=y))+geom

小明的数据分析笔记本·2023-03-21 02:18

R语言——ggplot

导入所需包install.packages("tidyverse")library(tidyverse)绘图模板：ggplot(data=)+(mapping=aes())【注】ggplot()的第一个参数是要在图中使用的数据集，函数geom_point()向图中添加一个点层，这样就可以创建一张散点图。mapping参数总是与aes()函数成对出现，aes()函数的参数分别指定了映射到x轴的变量与

小新122·2023-03-21 00:16

sor语言对环境负向观

s我因为学习成绩不好，老师经常在全班同学面前批评我。o我觉得在同学们面前抬不起头来，一想到上学就心慌。一看到学校大门就头晕恶心。r我不去上学了。so我因为学习成绩不好，老师经常在全班同学面前批评我。我觉得在同学们面前抬不起头来，一想到上学就心慌。一看到学校大门就头晕恶心。os我觉得在同学们面前抬不起头来，一想到上学就心慌。一看到学校大门就头晕恶心。因为老师在全班同学面前经常批评我。还说我笨sr我因

阳光明媚的·2023-03-20 23:53

R语言爬虫2

接上篇。参考文章大道无形x我有型的文章安装R包rvest与xml2install.packages("xml2");library("xml2")install.packages("rvest");library("revst")爬取数据以新浪网为例http://finance.sina.com.cn/roll/index.d.html?cid=56589&page=1使用嵌入selectorga

生物系烟酒僧·2023-03-20 22:56

如何用R语言实现单个率/单臂实验的meta分析（包括二分类变量与连续型变量教程）

各位读者朋友们大家好啊，最近有不少读者私信我说关于单臂实验的meta分析能不能出个教程，尤其是对于单臂连续型变量，找遍了全网都不知如何用R实现，不要着急，相信看完本期教程，你会获益匪浅的。（需要本教程的原始数据及完整程序命令的可在公，众号（全哥的学习生涯）内回，复“单个率meta”。）01单个率meta分析的理论基础单个率的Meta分析是一种只提供了一组人群的总人数和事件发生人数，基于原始研究为横

吃一口小肉丸·2023-03-20 21:29

Python 招聘信息爬取及可视化

于是为了更加确定有多少可能找到工作，就用python写了个爬虫爬取招聘信息，数据处理，最后用R语言进行可视化呈现。项目地址：GithubRepo求关注。

程序员爽爽·2023-03-20 19:39

R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记之ggplot2

4.3ggplot2简介4.3.1ggplot2和图形语法ggplot2可以用来创建优雅的图形，由于它的灵活，简洁和一致的接口，可以提供美丽、可直接用来发表的图形，吸引了许多用户，特别是科研领域的用户。ggplot2使用grid包来提供一系列的高水平的函数，并将其延伸为图形语法，即独立指定绘图组件，并将它们组合起来，以构建我们想要的任何图形显示。图形语法包含6个主要成分：data,transfor

zd200572·2023-03-20 18:22

word插入图片保持清晰度的一个小技巧

自己之前在写论文的时候配图的处理方式是：使用R语言作图，然后导出为pdf格式，再使用AdobeAcrobat打开pdf文件，另存为tiif格式图片，然后再插入word，tiff格式的图片分辨率如果设置的稍微大一点的话文件就会非常大

小明的数据分析笔记本·2023-03-20 13:35

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