row.names

R语言 数据导出和导入 csv tsv xls xlsx

【R语言】Excel导出为Excel的xls、xlsx#【-------导出数据--------】write.table(data2,file="train1.xls",sep="\t",row.names
仿生bug·2025-02-23 05:52

ggplot2绘制环状聚类热图

本文是要把昨天画的聚类热图给“掰弯”，gene<-read.csv(file="clipboard",header=T,sep="\t",check.names=F)#读入数据row.names(gene
钿璎纍纍佩珊珊·2024-02-29 17:01

R实用绘图--相关性热图

/corr.csv',row.names=1)#读取显著水平矩阵pvalue
数据之帆·2024-02-19 14:57

读取表达矩阵创建SeuratObject

#Rcodelibrary(Seurat)mat_5<-read.table("GSM4037992_peripheral_donor_5_enriched_expression.tsv.gz")row.names
Bioinfoer·2024-02-13 18:32

R语言拆分测试集和训练集（1）

拆分数据集#生成模拟数据集set.seed(5)data_mo<-data.frame(a1=rnorm(20,30,5),a2=rgamma(20,50,10),a3=rnorm(20,13,4),row.names
weixin_49320263·2024-02-13 00:34

R语言泡泡图— —小泡泡如何变大泡泡？

可能会遇到这样一种情况，即count点太小，但又不知道应该如何调大，如下图：图1泡泡图附代码：library(ggplot2)pathway=read.csv("1KEGG.csv",header=TRUE,row.names
赵玉鑫0507·2024-02-11 06:30

棒棒糖图

inputFile="cnvMatrix.txt"#输入文件rt=read.table(inputFile,header=T,sep="\t",check.names=F,row.names=1)#对符合条件的行求和
一只小脑斧·2024-02-03 19:44

R语言read.csv函数读取数据时的一个报错

读取数据用到的命令是df<-read.csv("example.csv",header=T,row.names=1)报错信息是Errorinmake.names(col.names,unique=TRUE
小明的数据分析笔记本·2024-01-25 10:39

R语言【taxa】——as_data_frame()：将 taxa 的对象 转换为 data.frame

Usageas_data_frame(x,row.names=NULL,optional=FALSE,...,stringsAsFactors=FALSE)Arguments参数【x】：由taxa定义的一个对象
ALittleHigh·2024-01-24 19:30

Mastering Data Analysis with R-笔记

setwd('D:\\Rdata\\Books学R语言\\R语言数据分析美盖尔盖伊')library(hflights)write.csv(hflights,'hflights.csv',row.names
茶苯海·2024-01-21 16:57

R语言【utils】——write.table()，write.csv()，write.csv2()：将数据写入文件

Packageutilsversion4.2.0Usagewrite.table(x,file="",append=FALSE,quote=TRUE,sep="",eol="\n",na="NA",dec=".",row.names
ALittleHigh·2024-01-19 14:07

R柱状图绘制1

#柱状图绘制sheep=read.csv("TableS1-3.csv",sep=",",header=T,row.names=1)View(sheep)objects(sheep)sheep$name
随风20212021·2024-01-13 15:17

R语言【utils】——read.table()：以表格式读取文件，并从中创建一个数据帧，其中大小写对应于行，变量对应于文件中的字段。

Packageutilsversion4.2.0Usageread.table(file,header=FALSE,sep="",quote="\"'",dec=".",numerals=c("allow.loss","warn.loss","no.loss"),row.names
ALittleHigh·2024-01-10 15:26

R语言使用小技巧

1.使用R语言在保存文件的过程中，如果保存的文件是这样的，比如：只需要在代码种加上如下参数：row.names=FALSE,quote=FALSE即可write.table(df1,file="a.txt
不懂python不懂R·2024-01-09 13:40

生信星球学习小组31期Day5-李一恒

x,y,z)1:10seqrep从向量中提取元素a.根据元素位置b.根据值2.数据框工作目录下的本地数据可以直接读取getwd（）设置行名和列名colnames()查看行名rownames()查看列名row.names
LRivers·2024-01-06 22:14

丑到怀疑人生的相关性热图

corrplot)#Loaddatafromatextfilecalled'AR19_Ex1_corrplot.txt'plotCorMat<-read.table('demo.txt',header=TRUE,row.names
咩小饬·2023-12-28 14:28

R语言可视化（十六）：PCA图绘制

))设置工作目录setwd("C:/Users/Dell/Desktop/R_Plots/16pca/")加载示例数据data<-read.table("demo_pca.txt",header=T,row.names
Davey1220·2023-12-22 08:39

R语言读取数据行名问题

正常读取文件rt<-read.csv("genes.csv",header=T,check.names=F,row.names=1)#第一列作为行名有时候第一列有重复就会报错，可以用如下代码：rt<-read.csv
落寞的橙子·2023-12-06 22:50

使用R语言的write.csv函数保存CSV文件

write.csv函数的语法如下：write.csv(x,file,row.names=TRUE,col.names=TRUE,sep=",",quote
技术征服冒险·2023-12-02 01:44

六. 基因表达相关性分析与作图（R语言“corrplot”包）

image.png2.R代码install.packages("corrplot")#安装包library("corrplot")#加载包za<-read.csv("E:/R/12345.csv",header=T,row.names
小飞虎·2023-12-01 08:48

R绘制堆积柱形图

语言】百分比表格删除两行重新计算百分比中的数据为例#读入数据a<-read.table(file="sample_bacteria_percentage.txt",sep="\t",header=T,row.names
生信交流平台·2023-11-29 19:15

2022-01-11 常用函数解析

d210))})>ncol(Exp_miRNA)*0.25),]##row.names=1,第一列变行名##check.names=FALSE，读入后杠不会变成点Exp_miRNA<-read.table
小白兔和小毛驴·2023-11-28 05:38

使用R语言的read.table函数读取文件数据方法详解

read.table函数的基本语法如下：read.table(file,header=FALSE,sep="",quote="\"'",dec=".",row.names,
风吹麦很·2023-11-25 06:19

R语言读文件“-“变成“.“

如果使用read.table函数，需要check.names=FALSEdata<-read.table("data.tsv",header=TRUE,row.names=1,check.names=FALSE
hx2024·2023-11-21 23:52

ggplot2绘图-1：柱形图

data<-read.table("R7111114.TRB.clones.txt",header=T,row.names=1,sep="\t")pdf("top10cdr3aa.pdf")p=ggplot
bio_橡树·2023-11-02 08:17

id转换

)options(stringsAsFactors=F)res<-read.csv(file="condition_tumor_results.csv",check.names=F,header=T,row.names
庄小尽·2023-10-24 23:12

踩坑记录-GB_ACC转换基因-不允许有重复的‘row.names‘-R语言零基础基因/数据差异分析（三）

文章目录GB_ACC转换成基因直接利用GEO分析**GB_ACC的第二种方法（繁琐）**不允许有重复的'row.names'解决问题GB_ACC转换成基因直接利用GEO分析在上个系列中，我们记住了GB_ACC
Frms·2023-10-17 14:55

R语言读文件防止行名、列名中有的字符变成点号

的表达谱文件，用Excel打开长这样：image.png我用R的read.table功能读取该表格：e<-read.table("TCGA-LAML.htseq_counts.tsv",header=TRUE,row.names
Seurat_·2023-10-11 13:54

R的一些奇奇怪怪的功能

1.欧氏距离计算df<-data.frame(x=1:10,y=1:10,row.names=paste0("s",1:10))euro_dist<-as.matrix(dist(df))2.集合运算union
竹舞清风_忆·2023-09-20 08:47

R语言绘制热图

Desktop/0000/code-main/热图')#设置工作路径#加载R包library(pheatmap)#读取数据df<-read.table(file="data.txt",sep="\t",row.names
清纯世纪·2023-09-18 01:55

R中read.table()漏行的问题

>a=read.table("01.Formelt.txt",header=T,sep="\t")>aw=write.table(c,"ForMeltTest.txt",row.names=F,quote
RaoZC·2023-09-13 20:17

详细解读DeepGS

数据：write.table(Markers,file="C:/Users/Administrator/Desktop/dataset/Markers.txt",row.names=F,quote=F)
zjguilai·2023-08-18 06:06

自制函数【rep_words】

rm(list=ls())library(tidyverse)AA<-read.table("测试文档.txt")class(AA)length(row.names(AA))#x=AAc=6a=3for
医只蜗牛·2023-08-17 14:34

read.table详解

www.cnblogs.com/xianghang123/archive/2012/06/06/2538274.htmlDATA<-read.table(file="data.txt",         head=T,row.names
茅逗逗·2023-08-14 06:01

R合并多个格式相同的文件

.*\\.txt$")data=read.table('pleio_bbj-a-6.txt',header=T,row.names=1,sep='\t')for(iinfile_list){data1=
帅锅不识字·2023-08-05 20:15

KEGG Pathway通路结果绘制气泡图

getwd()setwd("D:/Desktop/")#查看和修改工作目录library(ggplot2)#加载ggplot2包pathway=read.csv("kegg.csv",header=TRUE,row.names
小灰灰want_to_fly·2023-08-02 23:42

PlotEnrichDotPlot ggplot2画图拆解

returnheatcolorsofgivenlengthGetMyHeatCols50){ht.col25){results<-results[1:25,]my.cols<-my.cols[1:25]}df<-data.frame(Name=factor(row.names
Young.Dr·2023-07-21 22:54

R语言学习——绘制热图

read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/32R热图/32_eatmap/MIR_DEG_fc_2.5_pval_0.01.txt',header=T,sep='\t',row.names
帅锅不识字·2023-07-19 14:07

R语言ggplot2——散点图

read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/33lesson33ggplot2散点图（一）/33_ggplot2/BMI.txt',sep='\t',header=T,row.names
帅锅不识字·2023-07-19 14:07

R语言ggplot2——柱形图

BMI=read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/33lesson33ggplot2散点图（一）/33_ggplot2/BMI.txt',header=T,row.names
帅锅不识字·2023-07-19 14:07

R语言学习——韦恩图

limma=read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/31R韦恩图/31_venn/voom-DEG-res.txt',sep='\t',header=T,row.names
帅锅不识字·2023-07-19 14:36

R语言ggplot2——折线图

read.table('/Users/zhangzhishuai/Downloads/33lesson33ggplot2散点图（一）/33_ggplot2/BMI.txt',header=T,sep='\t',row.names
帅锅不识字·2023-07-19 14:02

利用R语言中pheatmap绘制热图

包需要安装vegan包，利用命令install.packages("vegan")如图显示，表明安装成功并加载2.导入数据利用read.table()函数来导入原始数据header=T表示将第一行设置为列名，row.names
生信学习小达人·2023-07-15 04:11

R和python中dataframe读取方式总结

./6group_count.csv",row.names=1)
我的心永远是冰冰哒·2023-07-15 02:55

R语言边学边记3-数据的导入与导出

setwd("C:/Users/Jerry/Desktop/工作目录")#重新设置工作目录>datan1n2hwrite.csv(h,"RR.csv")>write.csv(h,"RR.csv",row.names
Jerry_5543·2023-06-22 01:49

R语言学习系列之“多变的热图”

生物信息学教学前段时间我们更新过一篇推文热图系列1，隶属R语言学习系列，今天我们继续热图系列2导入数据library(pheatmap)TEST=read.csv("TEST.csv",sep=',',header=T,row.names
生信小课堂·2023-06-12 20:13

2020-04-20 Go analysis (clusterProfile)

row.names=FALSE行名不输出或者col.names=NAreadable=TRUE#geneID转换为genesymbol##################################
xiaoguolaile·2023-05-03 09:09

将表转变为扁平格式（即去列联化）

cols<-dim(df)[2]x<-NULLfor(iin1:rows){for(jin1:df$Freq[i]){row<-df[i,c(1:(cols-1))]x<-rbind(x,row)}}row.names
LY婷·2023-04-16 02:21

文件的读入和写出

read.table(file,header=FALSE,sep="",quote=""'",dec=".",numerals=c("allow.loss","warn.loss","no.loss"),row.names
pedagogoose·2023-04-09 12:02

R语言数据框data.frame行和列求和方法

c(167,193,190,161,181)thingys<-c(182,166,170,171,186)daily.prod<-data.frame(widgets,gadgets,thingys,row.names
czliutz·2023-04-01 19:26
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