snp

ODI 启动agentscheduler报错研究

agentscheduler时报错：错误如下： 11/18/2014 09:57:42 上午(DwgCmdScheduler): SnpAgent.getAgentForThisMachine : Snp
·2015-11-13 08:05

MI & CI

  识别阶段的第一项工作是使用共信息测度穷举搜索候选 SNP 集合中的 SNP 交互
·2015-11-11 17:48

GWAS

GWAS的数据形式：SNP数据，即各个SNP位点的aa,Aa,AA基因型与疾病状态（0正常，1患病）的样例-对照数据。
·2015-11-11 17:41

互信息应用于SNP特征选择的局限

  互信息已广泛应用于特征选择问题，但应用在 SNP 选择上还存在着一些局限。第一，互信息只能衡量一个 SNP 组合与表型的相关性， 无法衡量多个 SNP 与表型的相关性。
·2015-11-11 17:36

oracle定时任务失效

查得如下原因： 　　当任务运行失败时，SNP过程在1分钟后将再次试图运行该任务。如果这次运行又失败了，下一次尝试将在2分钟后进行，再下一次在4分钟以后。任务队列每次 加倍重试间隔直到
·2015-11-11 04:47

sup框架 控件的约束

iconView.snp_makeConstraints{(make)->Voidin make.centerX.equalTo(view.snp_centerX) make.bottom.equalTo
A1003052589·2015-11-07 22:59

让oracle做定时任务

故小作记录，以备忘之： 1．确保Oracle的工作模式允许启动任务队列管理器  Oracle定时执行“Job Queue”的后台程序是SNP进程，而要启动SNP进程，首先要确保整个系统的模式是可以启动
·2015-10-31 09:16

Sequencher_v4.1.4 DNA 序列分析的工业标准软件

它可以和所有的自动序列分析仪一同工作，并且因为它的极速Contig组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具，以及卓越的技术支持闻名Mutation.Surveyor.v2.2.rar基因变异(SNP)、
rrjjzzyy00·2015-09-11 09:00

Sequencher_v4.1.4 DNA 序列分析的工业标准软件

它可以和所有的自动序列分析仪一同工作，并且因为它的极速Contig组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具，以及卓越的技术支持闻名Mutation.Surveyor.v2.2.rar基因变异(SNP)、
rrjjzzyy00·2015-09-11 09:00

TypeError: distinct() takes exactly 2 arguments (3 given)

出现原因，错误的写法：table.distinct('snp',{'pid':'xxx'})正确的写法table.find({'pid':'xxx'}).distinct('snp')
xtj332·2014-11-25 13:00

在windows 2003 sp2 或者 2008 rac环境中，可能会由于默认的SNP（ Scalable Networking Pack）特性会导致 实例驱逐或者节点驱逐

在windows2003sp2或者windows2008rac环境中，可能会由于默认的SNP（ScalableNetworkingPack）特性会导致实例驱逐或者节点驱逐参考原文：RAConWindows
msdnchina·2014-07-23 07:00

DBMS_Job包的用法

1．确保Oracle的工作模式允许启动任务队列管理器 Oracle定时执行“Job Queue”的后台程序是SNP进程，而要启动SNP进程，首先要确保整个系统的模式是可以启动SNP进程的，这需要以DBA
oywl2008·2014-07-14 09:00

[翻译自mos文章]提交的一个job 不运行

诊断列表（diagnosticchecklist）a) 是否有snp进程在运行？SVRMGR>co
msdnchina·2014-07-09 21:00

简单Oracle JOB定时调度

作业队列是由后台运行的snp进程控制，这个进程用于实现数据库快照和作业队列。
进修中的大牛·2014-07-04 14:00

ORACLE 8i 遇到报错：ORA-01631: max # extents (505) reached in table

最近在客户的一个8i生产库上使用statspack，发现alert中有报错：MonJun1613:17:522014Errorsinfile/oracle/8.1.7/admin/prod/bdump/snp0
q947817003·2014-06-18 14:00

SNP

单核苷酸多态性（英语：SingleNucleotidePolymorphism，简称SNP，读作/snip/）指的是由单个核苷酸—A,T,C或G的改变而引起的DNA序列的改变，造成包括人类在内的物种之间染色体基因组的多样性
rogerzhanglijie·2014-05-06 13:00

genome.js DNA与开源的碰撞

使用步骤如下：从支持的医疗机构获取DNA序列SNP文件利用dna2json将SNP文件转为SNP-JSON格式将转换好的SNP-JSON文件导入到genosets工具中进行分析使用GQL语言（Genome
weakish·2013-12-03 00:00

SNP

从理论上来看每一个SNP位点都可以有4种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为1:2。
rogerzhanglijie·2013-11-01 13:00

我的工具类

1：将带宽流量转换单位 package com.chinacache.snp.TransferChannelAlarm.util; import java.text.DecimalFormat;
这些年·2013-10-24 23:00

【积累】表格列表CSS样式

HTML示例源代码： Latinname fastqfile fastafile snp Article Latimeriachalumnae fastq fasta snp article
lutinghuan·2013-10-21 15:00

oracle定时任务

更改系统的会话方式为disenablerestricted,为snp的启动创建条件altersystemdisenablerestrictedsession;job_queue_processes=10
heshw·2013-09-09 17:50

酵母同义和非同义的snp的程序

usestrict; usewarnings; my$filename; my@filename; my$i; #氨基酸hash my(%genetic_code)=( 'TCA'=>'S',#Serine 'TCC'=>'S',#Serine 'TCG'=>'S',#Serine 'TCT'=>'S',#Serine 'TTC'=>'F',#Phenylalanine 'TTT'=>'F',
gaorongchao1990626·2013-09-02 18:00

酵母同义和非同义的snp的程序

usestrict; usewarnings; my$filename; my@filename; my$i; #氨基酸hash my(%genetic_code)=( 'TCA'=>'S',#Serine 'TCC'=>'S',#Serine 'TCG'=>'S',#Serine 'TCT'=>'S',#Serine 'TTC'=>'F',#Phenylalanine 'TTT'=>'F',
gaorongchao1990626·2013-09-02 18:00

使用telnet测试邮件服务器是否正常

[snp@date Flux]$ telnet anonymousrelay.chinacache.com 25 Trying 61.135.207.214...
这些年·2013-08-14 14:00

SSR标记与SNP标记

SSR：简单序列重复，SSR标记纪录的是对一段重复的简单序列的编码（编码一般都不是binary的）SNP：单点多态，SNP标记纪录的是一个等位位点上的不同碱基（编码一般是binary的，除非位点不是biallele
swuteresa·2013-04-16 10:00

续定时任务

在做定时任务前一定要看定时任务的snp,首先看系统模式是否支持sql>altersystemenablerestrictedsession;或sql>altersystemdisablerestrictedsession
ciznx·2012-12-18 10:00

定时任务

效率高;如果用系统级定时,会增加很多编程工作,成本增加了,还很容易出错,事情越简单出错的几率越小.再使用job queue之前,我们还要简单配置下,oracle定时执行job queue 的后台进程是SNP
ciznx·2012-12-17 15:37

perl应用：snp提取后续处理：非ATGC行的删除

有如下的数据结构，我们知道DNA中碱基只有四种，ATGC，但是因为测序过程中的种种原因，可能出现R，M等情况，也就是所谓的兼并碱基，可参考前面的标准核酸表。如下面中第三行中有一个R，但是我们在分析的过程中，希望把这样的行给去掉。25806202TTCTTTTTTCTTTTTTTTT 25806240CCCCCCCCCCCCCTCCCCC 25806305GGGAARGAAGGGGGGGAGA 25
gaorongchao1990626·2012-11-23 19:00

perl应用：提取snp后续处理：删除带有“—”的行remove-.pl

原来的数据结构如下：10000470AAAAAA-AAAA-CAA-A-A 10000552CCCCCC-CCCC-TCC-C-C 10000565GGTGGG-G-TG-TGG-G-G 10000566TTCTTT-T-CT-CTT-T-T 10000567TTGTTT-T-GT-GTT-T-T 10000685GG-GGG-A--G--GA-A-G 10000690TT-CTT-T--T--T
gaorongchao1990626·2012-11-23 19:00

perl应用：SNP的提取（4）：信息的补全all.pl和重复区域的删除repeat_move_all_information.pl！

我们在上一篇文章中看了最后的输出结果如下：posTAIRburcanctedihiknlermtnooyporschsftsuwilwswuzu 1000G-A---------------- 10000003C-----G------------ 10000013A--R--------------- 10000021G-----------C------ 10000034C----------
gaorongchao1990626·2012-11-21 20:00

CUDA by Example 4.2.2 一个有趣的例子 之 #include "gl_helper.h"

参考链接：http://code.google.com/p/snp-gpgpu/source/browse/trunk/f/common/gl_helper.h?
fulva·2012-11-21 16:00

perl应用：SNP的提取（2）：从对比序列中找到SNP位点并输出 a.pl

我们从第一步中得到的是一个如下的文件：##mafversion=1scoring=lastz.v1.02.00 #lastz.v1.02.00--ambiguous=iupac--notransition--step=20--nogapped--format=maf # #hsp_threshold=3000 #gapped_threshold=3000 #x_drop=910 #y_drop=9
gaorongchao1990626·2012-11-21 16:00

perl应用：SNP的提取（1）：lastz

现在有18个sample（样品）的DNA序列，然后有一个对比序列ref，我们的任务就是对照ref序列，从18个sample中提取出SNP位点。
gaorongchao1990626·2012-11-21 16:00

dbms_job(调度作业)

作业队列是由后台运行的snp进程控制，这个进程用于实现数据库快照和作业队列。
ianLi·2012-09-04 14:00

access NCBI database programitically-a snp case

这里提供一个检索snp信息的例子：use LWP::Simple;use List::MoreUtils qw/ uniq /
以致宏大，以致高远·2012-09-03 16:00

创建的定时任务为什么没有按时执行呢？

1．确保Oracle的工作模式允许启动任务队列管理器 Oracle定时执行“Job Queue”的后台程序是SNP进程，而要启动SNP进程，首先要确保整个系统的模式是可以启动SNP进程的，这需要以DBA
孟雪雪·2012-08-01 10:00

关于oracle数据库中job的总结

oracle数据库采用SNP进程来管理和运行JOB，SNP进程和实例中其他进程最大区别是这个进程被杀掉后，系统就会自动重新启动一个SNP，因此并不影响oracle实例运行.SNP进程本身也是被系统周期性地调用去查看数据字典中的
weiyangcau·2012-07-20 15:00

生物信息_Call_snp_by_soapsnp_全基因组

生物信息_Call_snp_by_soapsnp_全基因组数据：人全基因组（100多G，两个gz文件，已去接头，pe测序，90读长）方法：call_snp_by_soapsnp每步估计需要投多大（仅作参考
BBka_717·2012-04-20 15:16

Q-Q plot 在GWAS中的意思

在GWAS研究中Q-Qplot的X和Y轴主要是代表各个SNP的-lg
likelet·2012-03-21 13:00

OR（odd ratios）

计算公式如下：Oddratio,95%CI假定我们要鉴别一个基因（或者标记位点SNP）有两个等位基因（等位）:记为Allele1Allele2Allele1Allele2病例AB对照CDodds值在病例和对照可以计算如下
likelet·2012-03-20 13:00

ODI逆向工程的bug

SNP_TABLE"."TABLE_ALI
qingqingxuelang·2012-01-30 14:00

修改ODI接口中的目标存储数据模型信息

没有把开发环境的目标数据库的模型的逻辑架构设置正确，现在需要把接口中目标存储逻辑架构指向正确的逻辑架构，操作步骤如下1、修改模型上的定义信息，如Name，Code，logicalschema和指定Context2、到数据库后台找到snp_pop
qingqingxuelang·2011-12-12 23:00

Give Microsoft’s Scalable Networking Pack Another Look

WindowsServer2003SP2introducedasetofnetworkingperformancefeatures—collectivelyknownastheScalableNetworkingPack(SNP
xxqcpj·2011-11-15 15:38

ODI工作资料库底层数据结构研究（二）

子文件夹     --包        --方案     --接口     --过程  --包  --接口  --过程 --变量 --序列 --用户函数 --知识模块 --标记 对应的数据底层结构如下：snp_project
qingqingxuelang·2011-06-03 17:00

ODI工作资料库底层数据结构研究（一）

对于ODI的模型层面，如下图所示： 从图上可以看出，模型大概分了4层： 模型文件夹 --模型   --关系图    --表          对应的数据库底层则为：snp_mod_folder  --snp_model
qingqingxuelang·2011-06-03 15:00

Oracle中实现后台自动执行的定时操作(定时器)

1．确保Oracle的工作模式答应启动任务队列治理器:　　Oracle定时执行“Job Queue”的后台程序是SNP进程，而要启动SNP进程，首先要确保整个系统的模式是可以启动SNP进程的，这需要以DBA
yde986·2010-11-11 16:00

is-is&ospf 、eigrp&ospf&rip对比

OSPFIS-IS Tcp/ipClnp/clnsLsaLsaPDU(LSP)HelpHelloHelp pdu hellokeepalive序列号序列号sequenceno       PSNP部分序号报文SNP
zhouren5·2010-05-19 18:40

is-is&ospf 、eigrp&ospf&rip对比

OSPFIS-IS Tcp/ipClnp/clnsLsaLsaPDU(LSP)HelpHelloHelp pdu hellokeepalive序列号序列号sequenceno       PSNP部分序号报文SNP
zhouren5·2010-05-19 18:40

利用Crontab实现对Oracle数据库的定时备份

在第一种方法中需要数据库启动后台进程SNP，并且需在Oracle的初始化文件中加入任务队列的启动参数，而第二种方法不需对数据库做任何改动即可完成。
flash7783·2010-05-18 09:00

ODI导入功能失败：违反唯一索引AK_SNP_GRP_STATE

使用ODI导出存储库，然后导入时，会出现如下错误引起此问题的原因是字符集问题，导出存储库时提示字符集，如下图，默认字符集不支持中文，导致汉字变为”？”，导致引起唯一索引错误解决办法，导出时要设置相应的支持中文的字符集，例如UTF-8 本文转自:http://www.itjaj.com/viewthread.php?tid=3701&extra=page%3D1%26amp%3Bfilter%3Dt
meteorlWJ·2010-03-30 15:00
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