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snp
swift
snp
布局
pngfuncsetupUI(){letgrayView=UIView()grayView.backgroundColor=UIColor.grayself.addSubview(grayView)grayView.
snp
.makeConstraints
曾柏超
·
2020-03-03 16:50
novogene-多重 PCR_
SNP
基因分型检测2020-01-07
转载自诺禾致源多重PCR_
SNP
基因分型检测(医口方向)一.多重PCR_
SNP
基因分型检测简介多重PCR_
SNP
基因分型检测是一种多重PCR和高通量测序相结合的高效
SNP
检测技术。
爬山小虎
·
2020-03-02 03:02
AmyTree算法
1.input要求:四个文件,Y-
SNP
基因型,树文件,编译名称文件,参考序列2.CallQualitytest:高质量则用ref+变异一起做分析,低质量则用变异做分析3.Y-
SNP
来判断个个节点的状态
orz_wohencai
·
2020-02-23 22:03
[iOS] 使用 SnapKit 时 view 向下滑出屏幕的写法
privatefunchideCalendarViewWithAnimation(){UIView.animate(withDuration:0.33,animations:{self.viewContain.
snp
.updateConstraints
CharlesQiu
·
2020-02-23 21:21
Taylor2014 GS精度
虽然已经提出了许多分析方法来联合估计高密度单核苷酸多态性(
SNP
)效应,但在最佳线性无偏估计的框架
董八七
·
2020-02-23 14:23
snp
-calling pipeline
/calling-
snp
-pipeline.sh-r/path/reference.fa-ssample.txt[-tthreads]catcalling-
snp
-pipeline.sh#!
sober01
·
2020-02-23 01:17
Namroud2012
SNP
检查人工选择对遗传多样性的影响
NamroudM,BousquetJ,DoerksenT,BeaulieuJ(2012)ScanningSNPsfromalargesetofexpressedgenestoassesstheimpactofartificialselectionontheundomesticatedgeneticdiversityofwhitespruce.EvolAppl5(6):641–656.使用来自709
董八七
·
2020-02-22 15:51
iOS开发 | swift中自动布局框架SnapKit的使用
letredView=UIView()self.view.addSubview(redView)redView.backgroundColor=UIColor.red创建约束//创建约束redView.
snp
.makeC
无夜之星辰
·
2020-02-20 20:49
SnapKit踩到"坑"
问题复原:首先给一个view设置宽度,宽度是根据高度来设置的(以下只是示例代码,为了说明问题,实际开发场景要比这个复杂)self.vi.
snp
.makeConstraints{(maker)inmaker.left.right.equalToSuperview
Michale_Zuo
·
2020-02-20 14:56
✨双十一活动打折爆款✨
£19/支驴奶补水面膜双十一特价:£18/盒猪鼻贴三部曲双十一特价:£7/五贴SHO七天小肉毒+马油眼霜双十一特价:£21/盒精油手膜脚膜(可重复使用200-300次)双十一特价:£37/套(手+脚)
SNP
katie在梦游
·
2020-02-18 01:35
日常遇到的坑 from 2018-2-27
self.bottomBar.
snp
.makeConstraints({makeinmake.top.equalTo(picView.
snp
.bottom).offset(5)make.left.equalTo
阿尔伯特儿
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2020-02-16 19:01
基因检测有什么意义以及适合哪些人?
基因检测,通过体液、血液检测,经提取和扩增其基因信息后,通过基因芯片技术或超高通量
SNP
Whiskey_b0d7
·
2020-02-15 02:12
SNP
对转录因子结合及基因表达的影响
单核苷酸多态性(
SNP
)是基因组DNA序列变异的主要形式。但大多数的
snp
并不影响蛋白质序列,这些
SNP
主要通过对基因表达调控来影响生物个体。
sober01
·
2020-02-12 12:02
已售
爱丽小屋眉笔灰色4号色2个58爱丽小屋眉笔浅灰色5号色1个28兰芝唇膜1个兰芝绿色隔离1个382.5可莱丝三倍补水面膜10个645+72=717水光橙色面膜5个105+380=485
SNP
动物面膜水獭款
你看到的我是蓝色的
·
2020-02-10 23:31
PCAWG计划-原发肿瘤的WGS数据整合分析
TCGA的Pan-Cancer早在2013就系统性提出来并且规划好了,见Nat.Genet.201345:1113),因为TCGA计划涉及到数据类型比较多,仅仅是DNA层面就有WGS、WES、
SNP
6.0
生信技能树
·
2020-02-08 02:31
SNP
SNP
通常联合基因表达进行分析
SNP
主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。
一路向前_莫问前程_前程似锦
·
2020-02-08 00:00
第33章 常见的基因检测方案差异所体现的不同价值
珜守约基因检测的消费市场中产品多种多样,使用者很难分的清背后真实价值,除了和上一章节中提到的市场超前了基因检测在各领域的使用,还和几种常见检测技术的差异有关,有的基因检测技术只能检测部分的基因,有的只能检测最常见的
SNP
珜守約
·
2020-02-06 21:12
这些高通量测序名词你都知道吗
全基因组重测序的个体,通过序列比对,可以找到大量的单核苷酸多态性位点(
SNP
),插入缺失位点(InDel,Insertion/Deletion)、结构变异位点(SV,StructureVariation
我是爱哭虫小鱼
·
2020-02-06 10:46
lml_picAndTitleView的
snp
的问题
1,init控件方法里面就必须要有
snp
来调整view和view子控件的问题,2,以及blocktypealiasbtnBlock=()->Voidpublicfunccancleblock(_block
一个人zy
·
2020-02-06 06:02
提取参考基因组某个位置的碱基
引言前几天,有一同学询问如何快速获取到
SNP
位点上游和下游各100bp区间的序列呢?
Chipcui
·
2020-02-06 05:02
陈巍学基因视频学习笔记--视频7:RNA-seq方法和应用
前期笔记陈巍学基因视频学习笔记--视频1:Illumina测序化学原理RNA-seq的应用检测所有mRNA的表达量的差异;检测RNA结构差异:可变剪接、融合基因、基因但点突变导致的
SNP
第一部分:RNA-seq
冻春卷
·
2020-02-04 15:22
家畜基因组选择:原理,应用和展望
发展张望包括:选择新的性状和新的育种目标;采用基于因果变异(
SNP
)信息的稳健方法;
虾里巴人
·
2020-02-01 15:59
swift 可点击的富文本label
()label.isShowUnderLine=truelabel.font=UIFont.systemFont(ofSize:14)self.view.addSubview(label)label.
snp
.makeConstraints
目染江夏
·
2020-01-29 13:04
使用metaCCA进行单/多个
SNP
与多表型的典型相关性分析
欢迎来到"bio生物信息"的世界新年的第一篇更文。祝大家新春快乐!身体健康!18号回家以后,经历了如下过程。20号喉咙痛21号喉咙痛22号喉咙痛咳嗽23-24号咳嗽25号咳嗽为主鼻塞夜间咳嗽加剧26号咳嗽为主鼻塞流鼻涕夜间咳嗽加剧27号咳嗽为主鼻塞流鼻涕打喷嚏夜间咳嗽加剧28号咳嗽为主鼻塞流鼻涕打喷嚏夜间咳嗽加剧换了多种药物,均不见效。索性也少关注新型病毒肺炎的事了,缓解些焦虑感。好了,以上是交代
橙子牛奶糖
·
2020-01-28 16:00
SnapKit源码分析
其实NSLayoutAnchor是一个工厂类,类似NSNumber这样的设计思想.开始当我们开始写约束的时候,一般都从view.
snp
.makeConstraints()方法开始,通过点击
snp
我们进到里面看
五月飞
·
2020-01-08 17:13
GATK4.0找
SNP
####下载GRCm38
snp
和indelvcf文件####ftp://ftp-mouse.sanger.ac.uk/REL-1303-SNPs_Indels-GRCm38/###hisat比对,samtoolssort
njmujjc
·
2020-01-07 09:57
8 GATK完整流程
总目录:三阴性乳腺癌全外显子分析(wes)建议读或观看以下内容1深入了解
snp
-calling流程2CloudComputingforNext-GenerationSequencingDataAnalysis3https
Y大宽
·
2020-01-07 05:19
TCGA的28篇教程之CNV那点事
TCGA的28篇教程之CNV那点事拷贝数变异情况可以由
SNP
6.0等比较基因组杂交芯片得到,也可以由WES测序得到,当然了,WGS测序会更好,不过很大概率上选择什么样的实用技术,往往受限于资金和设备。
生信技能树
·
2020-01-06 00:41
MirSNP:miRNA相关
SNP
位点数据库
在
SNP
研究领域,通过GWAS或者eQTL等手段,发现了大量与疾病或者某种复杂性状相关的
SNP
位点,而这些
SNP
的具体功能还需要进一步分析和挖掘。
生信修炼手册
·
2020-01-05 19:05
爱神菲
SNP
_ 一夜回春,白到发光
SNP
升级版品牌,更加针对各种肤质、人群去提升护肤产品的品质和配方。
p22131731
·
2020-01-05 07:54
关于
SNP
的过滤(1):如何使用vcftools进行
SNP
过滤
前言很多关注我这个专题的朋友都在后台留言,说想了解更多关于
SNP
过滤的东西。是的,确实这是一个比较重要的问题。
lakeseafly
·
2020-01-04 15:40
【转】全基因组重测序分析
)通过高通量测序识别发现denovo的somatic和germline突变,结构变异-SNV,包括重排突变(deletioin,duplication)以及copynumbervariation)以及
SNP
oddxix
·
2020-01-03 06:35
基因组重测序
SNP
_calling
•
SNP
强调群体在这个位点有多样性。•Genotype强调个体在这个位点
nnlrl
·
2020-01-01 12:11
用Python处理vcf文件的代码
我把这些样品中的一个样品作为参考基因组,将剩余样品比对到这个样品上,然后callSNP,最终得到数百个vcf文件,这些vcf文件包含了这些样品相对于参考基因组的
SNP
,写一个脚本将这些
SNP
分别连接起来作为一条序
孤独巡礼_435a
·
2019-12-31 22:31
文献解读--通过RNA测序解析玉米籽粒复杂的调控网络
作者通过对368份玉米多样性材料授粉后15天的籽粒进行RNA测序分析,获得了28769个基因的表达量,这些基因数约占玉米注释基因的60%,同时还获得了360万来自基因内的
SNP
标记。
正踪大米饭儿
·
2019-12-31 15:07
实时荧光定量 PCR
实时荧光定量PCR,简称RT-QPCR,属于Q-PCR的一种,目前该技术已得到广泛应用,如:扩增特异性分析、基因定量分析、基因分型、
SNP
分析等。
Zhigang_Han
·
2019-12-31 13:53
Swift Charts3.0 用法简析
基本功能及属性如下:本文主要讲解的是折线图:)//添加ChartsletlineChart=LineChartView()chartView.addSubview(lineChart)lineChart.
snp
.makeConstraints
Ziruma
·
2019-12-29 23:26
Fujitsu(富士通)LH531 win10下崩溃问题 解决
自从win10升级以来,家里老电脑就经常蓝屏,每次都是
snp
2uvcWIN10.sys错误,查找后发现是摄像头驱动问题,装回官网提供的设想头驱动就好。
TreviD
·
2019-12-29 05:30
LD SCore计算基因多效性、遗传度、遗传相关性(the LD Score regression intercept, heritability and genetic correlation)
LDSCore除了查看显著
SNP
位点对表型是否为基因多效性外,还额外补充了怎么计算表型的遗传度和遗传相关性。
橙子牛奶糖
·
2019-12-28 08:08
bwa+samtools+picardtools+GATK call
SNP
流程
callSNPGATKbwa+samtools参考文档GATKcallsnp流程图一、原始数据处理测序得到的RAWDATA,使用NGSQCToolkit进行过滤$PATH/IlluQC.pl-peread1.fastqread2.fastq2A-l70-s20-p2-zg-pepaire-end数据2=PairedEndDNALibraryA=AutomaticdetectionofFASTQva
bio
·
2019-12-25 08:13
lncRNome:综合性的人类lncRNA数据库
genome.igib.res.in/lncRNome/在该数据库中,提供了以下几种lncRNA的信息染色体位置基因类型功能描述相关疾病除此之外,利用多组学分析,还提供了以下两种信息lncRNA相互作用的蛋白lncRNA上的
SNP
生信修炼手册
·
2019-12-24 08:06
做了个简陋的网页娱乐版HLA分型
可以用
snp
芯片数据实现HLA分型,任意的
SNP
芯片,只要位点数足够即可(几十万)。由于本人几乎没有前端和后台水平,所以应用相当简陋,请谅解。
zd200572
·
2019-12-22 12:01
精细定位——降低 GWAS的复杂度
ReducingGWASComplexity(https://doi.org/10.1080/15384101.2015.1120928)一句话总结:用精细定位来缩小候选功能SNPs的范围关键词:GWAS;
SNP
rapunzel0103
·
2019-12-21 07:25
多基因风险评分分析(Polygenic risk score)
计算公式如下:image.pngn:纳入的
SNP
的数量;Xi:SNPI的基因型(0,1,2)Wi:GWAS发现的
SNP
的权重,其中:连续型变量的表型用Effectsize表示,beta值分类变量的表型用
Richard_Zhou
·
2019-12-19 18:26
SnpEff使用方法
SnpEff使用方法SnpEff软件通过基因组结构注释数据(GTF文件),对VCF文件中的
SNP
/InDel信息进行注释,即主要解释了
SNP
/InDel是否能够对编码蛋白基因造成影响。
LiuYueRR
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2019-12-19 14:34
关于遗传参数评估的培训通知
ASReml可对数量性状、阈值性状、分类性状、
SNP
标记等多个性状进行分析,并可实现固定效应、随机效应值的预测以及显著性检验、遗传参数的估计、全
育种数据分析之放飞自我
·
2019-12-19 12:07
SNP
calling 几张图
image.pngimage.pngimage.pngimage.pngGraphicalrepresentationofallelicheterogeneityatalocuswithcommonandlowfrequency/rarevariantassociationswithacomplextrait.Turquoisebarsrepresenttrait-relatedvariantsc
Y大宽
·
2019-12-19 06:32
使用plink进行连锁不平衡分析
map文件主要保存
SNP
位点的名称和位置信息,内容如下1
snp
1011
snp
202共4列,每一行代表一个
SNP
位点,第一列代表
SNP
位点所在染色体的名字,第二列代表
SNP
位点的ID,通常是rs编号,也可以是自定义
生信修炼手册
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2019-12-17 15:41
计科菜鸟玩生信(二)——基本概念的学习
1.单核苷酸多态性(
SNP
)人与人之间一个碱基的差异,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列的多态性。属于第三代遗传标记,广泛的分布在染色体上。
小颜同学Shiny
·
2019-12-15 23:00
SNP
& Coffee
1.
SNP
与表型差异
SNP
(单核苷酸多态性;SingleNucleotidePolymorphisms)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。
酸黄瓜的公众号
·
2019-12-15 15:41
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