- 深度学习实验-3d医学图像分割
桶的奇妙冒险
深度学习3d人工智能
实验四基于nnU-Net模型的3D医学图像分割实验一、实验介绍腹部多器官分割一直是医学图像分析领域最活跃的研究领域之一,其作为一项基础技术,在支持疾病诊断,治疗规划等计算机辅助技术发挥着重要作用。近年来,基于深度学习的方法在该领域中获得了巨大成功。本实验数据集为多模态腹部分割数据集(AMOS),一个大规模,多样性的,收集自真实临床场景下的腹部多器官分割基准数据。本实验在百度飞桨平台上采用nnU-N
- 论文解读- nnU-Net: Self-adapting Framework for U-Net-Based Medical Image Segmentation
Tina姐吖
本篇主要解读论文"nnU-Net:Self-adaptingFrameworkforU-Net-BasedMedicalImageSegmentation"==nnU-Net:基于U-Net的自适应医学图像分割框架。实现见本专栏下其他博文。直达链接nnU-Net如何安装--傻瓜式安装教程nnU-Net实战一使用预训练nnU-Net模型进行推理教你用4行命令轻松使用nnUNet训练自己的医学图像分割
- 在Windows上实现nnU-Net v2的环境配置
无聊的程序猿
深度学习python开发语言深度学习图像处理
nnU-Net早期被众人所熟知是有一年参加了医学图像分割领域的十项全能比赛(MSD)并获得了冠军,接着该团队在最近又推出了nnUNetv2,使得功能更强大,代码的集成化更好。需要的配置要求和相关环境的配置使用最新版本的Python3.9或更高版本保证正常工作,而且使用pytorch的版本要高于1.12.0.最好使用GPU版本。然后首先使用conda创建一个虚拟环境,接着根据源代码提供的requir
- BraTS2021 + nnU-Net配置
MrTinTin
医学图像分割计算机视觉
nnUnet:https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNetBraTS2021:BRaTS2021Task1Dataset|Kaggleapex安装gitclonehttps://github.com/NVIDIA/apexcdapexpipinstall-v--no-cache-dir--global-option="--cpp_ext"--global-option="-
- nnU-Net团队新作MedNeXt:新一代医学图像分割之王,刷新多项榜单记录!
Amusi(CVer)
人工智能深度学习计算机视觉机器学习
点击下方卡片,关注“CVer”公众号AI/CV重磅干货,第一时间送达点击进入—>【医疗影像和Transformer】微信技术交流群转载自:CVHubTitle:MedNeXt:Transformer-drivenScalingofConvNetsforMedicalImageSegmentationPaper:https://arxiv.org/abs/2303.09975导读ConvNeXT是一
- 魔改nnU-Net夺冠!2021 BraTS 脑肿瘤分割竞赛第一名解决方案
Amusi(CVer)
卷积计算机视觉人工智能深度学习机器学习
点击下方卡片,关注“CVer”公众号AI/CV重磅干货,第一时间送达转载自:集智书童Extendingnn-UNetforbraintumorsegmentation论文:https://arxiv.org/abs/2112.04653代码(刚刚开源):https://github.com/rixez/Brats21_KAIST_MRI_Lab本文描述了基于nn-UNet试验了几种改进,包括使用更
- Example: inference with pretrained nnU-Net models
Cierlly
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Example:inferencewithpretrainednnU-NetmodelsThisisastep-by-stepexampleonhowtoruninferencewithpretrainednnU-NetmodelsontheProstatedatasetoftheMedicalSegemtnationDecathlon.InstallnnU-Netbyfollowingthein
- nnunet(八) Supplementary information
shchojj
segmentation
https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41592-020-01008-z/MediaObjects/41592_2020_1008_MOESM1_ESM.pdfSupplementaryinformation|nnU-Net:aself-configuringmethodfordeeplearning-basedbiome
- nnU-Net论文笔记
滴嘟滴嘟dzj
论文阅读人工智能
论文标题:nnU-Net:Self-adaptingFrameworkforU-Net-BasedMedicalImageSegmentation一种基于U-Net的医学图像分割自适应框架论文链接:arxiv摘要(abstract)提出当Unet处理新问题时需要有适应过程,四个方面:确切的架构,预处理,训练和推理。这些选择并不是相互独立的,会对模型性能产生重大的影响。Theadaptationof
- python图像分割 框架_nnU-Net是一个专为医学图像分割而设计的框架
weixin_39681161
python图像分割框架
nnU-NetIn3Dbiomedicalimagesegmentation,datasetpropertieslikeimagingmodality,imagesizes,voxelspacings,classratiosetcvarydrastically.Forexample,imagesintheLiverandLiverTumorSegmentationChallengedataseta
- 论文解析[5] nnU-Net: Breaking the Spell on Successful Medical Image Segmentation
默_silence
#论文阅读计算机视觉图像分割医学图像
发表年份:2019论文地址:https://arxiv.org/abs/1904.08128v1代码地址:https://github.com/MIC-DKFZ/nnunet文章目录摘要2方法2.1预处理2.2训练步骤2.3推论4讨论参考资料摘要提出了nnU-Net(no-new-Net),一个可以自动适应于任何数据集的框架。我们做了一个最先的尝试使必需的adaption过程自动化,例如预处理、精
- Ubuntu下使用nnUNet 训练自己的数据集(只管实现,不讲原理,通俗易懂)
℡ヾNothing-_哥
nnUNet医学图像分割ubuntu神经网络python深度学习
方便日后跑通nnUNet进行对比实验,写下本文。本文只管如何在自己的数据集上跑通nnUNet,不讲解原理,因为我也是参考别人博文来做的,详情可参看Tina的四篇博文一、什么是nnUNet?nnU-Net是由德国癌症研究中心、海德堡大学以及海德堡大学医院研究人员(FabianIsensee,JensPetersen,AndreKlein)提出来的一个自适应任何新数据集的医学影像分割框架,该框架能根据
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lryjy
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任务一:(论文)AutomatedDesignofDeepLearningMethodsforBiomedicalImageSegmentation//nnU-Net:aself-configuringmethodfordeeplearning-basedbiomedicalimagesegmentationFabian1.背景动机:简单来说医疗数据尤其是在3D医学图像领域,遇到图片质量、图片模态
- 【论文笔记 医疗影像分割—nnUNet】nnU-Net: Self-adapting Framework for U-Net-Based Medical Image Segmentation
Jy的炼丹炉
医疗影像分割论文笔记计算机视觉深度学习神经网络
文章目录1.Abstract2.网络架构2.1Unet优点(写论文参考)2.22DU-Net2.33DU-Net2.4U-NetCascade3.动态调整网络拓扑4.预处理4.1Crop—剪裁4.2Resampling—重采样4.3Normalization5.训练程序5.1损失函数5.2学习率—当某指标不再变化调整学习率5.3数据增广5.4PatchSampling6.推理7.后处理8.结果说明
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宁眸
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nnUnet肾脏肿瘤分割实战KiTS19ChallengeHomepagennunet项目官方地址MIC-DKFZ/nnUNet使用nnunet之前,建议先阅读两篇论文nnU-Net:Self-adaptingFrameworkforU-Net-BasedMedicalImageSegmentationnnU-Net:aself-configuringmethodfordeeplearning-b
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nnunet项目官方地址MIC-DKFZ/nnUNet(github.com)使用nnunet之前,建议先阅读两篇论文nnU-Net:Self-adaptingFrameworkforU-Net-BasedMedicalImageSegmentationnnU-Net:aself-configuringmethodfordeeplearning-basedbiomedicalimagesegmen
- nnU-Net: Self-Adapting Framework for U-Net-Based Medical Image Segmentation
薪升贷农名工
计算机视觉深度学习人工智能
GithubPDFAbstractU-net在2015年被提出来,到现在引用量已经1万大几了,真是厉害的很。目前在医学图像分割甚至在自然图像领域都应用广泛。但是U-net在针对不同任务的时候,它的网络结构,预处理,训练和推断可能都不同。这些选择不是相互独立的并且影响着最终的效果。作者提出了nnU-Net(nonew-Net,起名字就是这么潇洒,学着点),该网络是在2D和3DU-Net基础的一个鲁棒
- 不用写代码神器!教你用4行命令轻松使用nnUNet训练自己的医学图像分割模型
Tina姐
nnU-Net医学图像分割深度学习人工智能python图像分割新星计划
给定某个数据集,nnU-Net完全自动执行整个分割过程,包括数据预处理到模型配置、模型训练、后处理到集成的整个过程,而不需要人为干预。此外,训练好的模型还可以应用到测试集中进行推理。博主强烈建议:做医学图像分割的任何人,都必须要会使用nnU-Net理由2个:首先用nnU-Net测试一下。看一下该任务的大致效果,心里有个大致预测。第二,写论文的时候通常都要和nnU-Net对比,尤其是投英文期刊(SC
- nnU-Net实战一使用预训练nnU-Net模型进行推理
Tina姐
nnU-Net新星计划深度学习人工智能医学图像
nnU-Net到底怎么使用,好不好用,我们看一个实战例子本次实战项目为使用预训练nnU-Net模型进行推理数据集:医学分割十项全能的前列腺数据集(Prostate)本系列还有1论文解读-nnU-Net:Self-adaptingFrameworkforU-Net-BasedMedicalImageSegmentation(附实现教程)2nnU-Net如何安装–傻瓜式安装教程这是该系列第3篇✍️✍️
- nnU-Net 如何安装--傻瓜式安装教程
Tina姐
nnU-Net新星计划
这是nnU-Net系列第二篇–安装教程上一篇:nnU-Net介绍篇nnU-Net只在Linux上测试(ubuntu16、18和20;centOS,RHEL)。它也可以在其他操作系统上工作,但我们不能保证它会工作。因此,最好安装在Linux上文章目录安装nnU-Net的硬件条件快速的创建Ubuntu虚拟环境1安装venv模块2创建虚拟环境存放目录3创建虚拟环境4激活该环境5退出该环境安装nnunet
- nnU-Net论文解读
张.晶
论文解读
Outline写在前面nnU-NetAbstract摘要部分Introduction引言部分Methods方法部分NetworkarchitecturesPreprocessingTrainingProcedureInferencePostprocessingEnsemblingandSubmissionExperimentsandResults实验和结果部分Discussion讨论部分写在前面你
- nnU-Net: 破除魔咒,一个成功的医学图象分割技术
QuantMess
AI
nnU-Net:BreakingtheSpellonSuccessfulMedicalImageSegmentationnnU-Net:破除魔咒,一个成功的医学图象分割技术Author:FabianIsenseeetal.Abstract.由于数据集的多样性,语义分割现在是医学图像领域一个非常热门的子环节,大量的新方法每年都会出现。但是,这个野蛮生长的领域,正在日益变得令人捉摸不透。同时,很多新提
- nnU-Net: 基于U-Net医学图像分割技术的自适应框架
QuantMess
AI
**nnU-Net:基于U-Net医学图像分割技术的自适应框架**https://arxiv.org/pdf/1809.10486.pdf作者:FabianIsensee提要U-Net于2015年推出。凭借其简单直接的架构,它迅速发展成为医学图像分割中的常用基准。但是,U-Net缺乏对新问题的适应性,包括在精确架构,预处理,训练和推理方面等缺乏自由度。这些选择的结果彼此影响,严重拖累整体性能。本文
- nnU-Net医学影像分割论文,可自动调参,适应所有数据集
Mr.Jk.Zhang
源码:https://github.com/MIC-DKFZ/nnunet近日,一篇来自德国癌症研究中心、海德堡大学以及海德堡大学医院研究人员的名为nnU-Net的医学影像分割论文引起了广泛关注。该团队提出了一个可以自适应任何新数据集的医学影像分割框架,该框架能根据给定数据集的属性自动调整所有超参数,整个过程无需人工干预。仅仅依赖于朴素的U-Net结构和鲁棒的训练方案,nnU-Net在六个得到公认
- nnU-Net
purson2
文章地址:nnU-Net:BreakingtheSpellonSuccessfulMedicalImageSegmentation代码:code概述针对的问题:许多提出的语义分割方法未能在它们被证明的实验之外进行推广。贡献:作者提出了一个自动适应任何给定新数据集的框架。作者在本文中提出了no-new-Net(nnU-Net),一种包含自动适应新数据集的形式的分割方法。基于对数据集的自动分析,nnU
- 2019-05-10|nnU-Net 自适应数据集的医学影像分割
reallocing
《nnU-Net:BreakingtheSpellonSuccessfulMedicalImageSegmentation》总结在数据集的多样性的推动下,语义分割是医学图像分析中的一个流行子领域,每年都会提出大量的新方法。然而,这种日益增长的方法变得越来越难以理解。同时,许多提出的方法未能在它们被证明的实验之外进行推广,从而妨碍了在新数据集上开发分割算法的过程。在这里,我们提出了nnU-Net('
- ztree设置禁用节点
3213213333332132
JavaScriptztreejsonsetDisabledNodeAjax
ztree设置禁用节点的时候注意,当使用ajax后台请求数据,必须要设置为同步获取数据,否者会获取不到节点对象,导致设置禁用没有效果。
$(function(){
showTree();
setDisabledNode();
});
- JVM patch by Taobao
bookjovi
javaHotSpot
在网上无意中看到淘宝提交的hotspot patch,共四个,有意思,记录一下。
7050685:jsdbproc64.sh has a typo in the package name
7058036:FieldsAllocationStyle=2 does not work in 32-bit VM
7060619:C1 should respect inline and
- 将session存储到数据库中
dcj3sjt126com
sqlPHPsession
CREATE TABLE sessions (
id CHAR(32) NOT NULL,
data TEXT,
last_accessed TIMESTAMP NOT NULL,
PRIMARY KEY (id)
);
<?php
/**
* Created by PhpStorm.
* User: michaeldu
* Date
- Vector
171815164
vector
public Vector<CartProduct> delCart(Vector<CartProduct> cart, String id) {
for (int i = 0; i < cart.size(); i++) {
if (cart.get(i).getId().equals(id)) {
cart.remove(i);
- 各连接池配置参数比较
g21121
连接池
排版真心费劲,大家凑合看下吧,见谅~
Druid
DBCP
C3P0
Proxool
数据库用户名称 Username Username User
数据库密码 Password Password Password
驱动名
- [简单]mybatis insert语句添加动态字段
53873039oycg
mybatis
mysql数据库,id自增,配置如下:
<insert id="saveTestTb" useGeneratedKeys="true" keyProperty="id"
parameterType=&
- struts2拦截器配置
云端月影
struts2拦截器
struts2拦截器interceptor的三种配置方法
方法1. 普通配置法
<struts>
<package name="struts2" extends="struts-default">
&
- IE中页面不居中,火狐谷歌等正常
aijuans
IE中页面不居中
问题是首页在火狐、谷歌、所有IE中正常显示,列表页的页面在火狐谷歌中正常,在IE6、7、8中都不中,觉得可能那个地方设置的让IE系列都不认识,仔细查看后发现,列表页中没写HTML模板部分没有添加DTD定义,就是<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3
- String,int,Integer,char 几个类型常见转换
antonyup_2006
htmlsql.net
如何将字串 String 转换成整数 int?
int i = Integer.valueOf(my_str).intValue();
int i=Integer.parseInt(str);
如何将字串 String 转换成Integer ?
Integer integer=Integer.valueOf(str);
如何将整数 int 转换成字串 String ?
1.
- PL/SQL的游标类型
百合不是茶
显示游标(静态游标)隐式游标游标的更新和删除%rowtyperef游标(动态游标)
游标是oracle中的一个结果集,用于存放查询的结果;
PL/SQL中游标的声明;
1,声明游标
2,打开游标(默认是关闭的);
3,提取数据
4,关闭游标
注意的要点:游标必须声明在declare中,使用open打开游标,fetch取游标中的数据,close关闭游标
隐式游标:主要是对DML数据的操作隐
- JUnit4中@AfterClass @BeforeClass @after @before的区别对比
bijian1013
JUnit4单元测试
一.基础知识
JUnit4使用Java5中的注解(annotation),以下是JUnit4常用的几个annotation: @Before:初始化方法 对于每一个测试方法都要执行一次(注意与BeforeClass区别,后者是对于所有方法执行一次)@After:释放资源 对于每一个测试方法都要执行一次(注意与AfterClass区别,后者是对于所有方法执行一次
- 精通Oracle10编程SQL(12)开发包
bijian1013
oracle数据库plsql
/*
*开发包
*包用于逻辑组合相关的PL/SQL类型(例如TABLE类型和RECORD类型)、PL/SQL项(例如游标和游标变量)和PL/SQL子程序(例如过程和函数)
*/
--包用于逻辑组合相关的PL/SQL类型、项和子程序,它由包规范和包体两部分组成
--建立包规范:包规范实际是包与应用程序之间的接口,它用于定义包的公用组件,包括常量、变量、游标、过程和函数等
--在包规
- 【EhCache二】ehcache.xml配置详解
bit1129
ehcache.xml
在ehcache官网上找了多次,终于找到ehcache.xml配置元素和属性的含义说明文档了,这个文档包含在ehcache.xml的注释中!
ehcache.xml : http://ehcache.org/ehcache.xml
ehcache.xsd : http://ehcache.org/ehcache.xsd
ehcache配置文件的根元素是ehcahe
ehcac
- java.lang.ClassNotFoundException: org.springframework.web.context.ContextLoaderL
白糖_
javaeclipsespringtomcatWeb
今天学习spring+cxf的时候遇到一个问题:在web.xml中配置了spring的上下文监听器:
<listener>
<listener-class>org.springframework.web.context.ContextLoaderListener</listener-class>
</listener>
随后启动
- angular.element
boyitech
AngularJSAngularJS APIangular.element
angular.element
描述: 包裹着一部分DOM element或者是HTML字符串,把它作为一个jQuery元素来处理。(类似于jQuery的选择器啦) 如果jQuery被引入了,则angular.element就可以看作是jQuery选择器,选择的对象可以使用jQuery的函数;如果jQuery不可用,angular.e
- java-给定两个已排序序列,找出共同的元素。
bylijinnan
java
import java.util.ArrayList;
import java.util.Arrays;
import java.util.List;
public class CommonItemInTwoSortedArray {
/**
* 题目:给定两个已排序序列,找出共同的元素。
* 1.定义两个指针分别指向序列的开始。
* 如果指向的两个元素
- sftp 异常,有遇到的吗?求解
Chen.H
javajcraftauthjschjschexception
com.jcraft.jsch.JSchException: Auth cancel
at com.jcraft.jsch.Session.connect(Session.java:460)
at com.jcraft.jsch.Session.connect(Session.java:154)
at cn.vivame.util.ftp.SftpServerAccess.connec
- [生物智能与人工智能]神经元中的电化学结构代表什么?
comsci
人工智能
我这里做一个大胆的猜想,生物神经网络中的神经元中包含着一些化学和类似电路的结构,这些结构通常用来扮演类似我们在拓扑分析系统中的节点嵌入方程一样,使得我们的神经网络产生智能判断的能力,而这些嵌入到节点中的方程同时也扮演着"经验"的角色....
我们可以尝试一下...在某些神经
- 通过LAC和CID获取经纬度信息
dai_lm
laccid
方法1:
用浏览器打开http://www.minigps.net/cellsearch.html,然后输入lac和cid信息(mcc和mnc可以填0),如果数据正确就可以获得相应的经纬度
方法2:
发送HTTP请求到http://www.open-electronics.org/celltrack/cell.php?hex=0&lac=<lac>&cid=&
- JAVA的困难分析
datamachine
java
前段时间转了一篇SQL的文章(http://datamachine.iteye.com/blog/1971896),文章不复杂,但思想深刻,就顺便思考了一下java的不足,当砖头丢出来,希望引点和田玉。
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- 小学5年级英语单词背诵第二课
dcj3sjt126com
englishword
money 钱
paper 纸
speak 讲,说
tell 告诉
remember 记得,想起
knock 敲,击,打
question 问题
number 数字,号码
learn 学会,学习
street 街道
carry 搬运,携带
send 发送,邮寄,发射
must 必须
light 灯,光线,轻的
front
- linux下面没有tree命令
dcj3sjt126com
linux
centos p安装
yum -y install tree
mac os安装
brew install tree
首先来看tree的用法
tree 中文解释:tree
功能说明:以树状图列出目录的内容。
语 法:tree [-aACdDfFgilnNpqstux][-I <范本样式>][-P <范本样式
- Map迭代方式,Map迭代,Map循环
蕃薯耀
Map循环Map迭代Map迭代方式
Map迭代方式,Map迭代,Map循环
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蕃薯耀 2015年
- Spring Cache注解+Redis
hanqunfeng
spring
Spring3.1 Cache注解
依赖jar包:
<!-- redis -->
<dependency>
<groupId>org.springframework.data</groupId>
<artifactId>spring-data-redis</artifactId>
- Guava中针对集合的 filter和过滤功能
jackyrong
filter
在guava库中,自带了过滤器(filter)的功能,可以用来对collection 进行过滤,先看例子:
@Test
public void whenFilterWithIterables_thenFiltered() {
List<String> names = Lists.newArrayList("John"
- 学习编程那点事
lampcy
编程androidPHPhtml5
一年前的夏天,我还在纠结要不要改行,要不要去学php?能学到真本事吗?改行能成功吗?太多的问题,我终于不顾一切,下定决心,辞去了工作,来到传说中的帝都。老师给的乘车方式还算有效,很顺利的就到了学校,赶巧了,正好学校搬到了新校区。先安顿了下来,过了个轻松的周末,第一次到帝都,逛逛吧!
接下来的周一,是我噩梦的开始,学习内容对我这个零基础的人来说,除了勉强完成老师布置的作业外,我已经没有时间和精力去
- 架构师之流处理---------bytebuffer的mark,limit和flip
nannan408
ByteBuffer
1.前言。
如题,limit其实就是可以读取的字节长度的意思,flip是清空的意思,mark是标记的意思 。
2.例子.
例子代码:
String str = "helloWorld";
ByteBuffer buff = ByteBuffer.wrap(str.getBytes());
Sy
- org.apache.el.parser.ParseException: Encountered " ":" ": "" at line 1, column 1
Everyday都不同
$转义el表达式
最近在做Highcharts的过程中,在写js时,出现了以下异常:
严重: Servlet.service() for servlet jsp threw exception
org.apache.el.parser.ParseException: Encountered " ":" ": "" at line 1,
- 用Java实现发送邮件到163
tntxia
java实现
/*
在java版经常看到有人问如何用javamail发送邮件?如何接收邮件?如何访问多个文件夹等。问题零散,而历史的回复早已经淹没在问题的海洋之中。
本人之前所做过一个java项目,其中包含有WebMail功能,当初为用java实现而对javamail摸索了一段时间,总算有点收获。看到论坛中的经常有此方面的问题,因此把我的一些经验帖出来,希望对大家有些帮助。
此篇仅介绍用
- 探索实体类存在的真正意义
java小叶檀
POJO
一. 实体类简述
实体类其实就是俗称的POJO,这种类一般不实现特殊框架下的接口,在程序中仅作为数据容器用来持久化存储数据用的
POJO(Plain Old Java Objects)简单的Java对象
它的一般格式就是
public class A{
private String id;
public Str