《学习小组Day3笔记--于多多》

conda安装

  1. 进入biosoft目录
    cd ~/biosoft
  2. 下载miniconda
    谷歌搜索“miniconda 清华”(是清华的conda镜像网站,
    https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/)
    uname -a(查看服务器是多少位)按需下载
    wget 下载链接(下载)
    3.安装
    bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
    微信图片_20200226222341.png
  3. 激活conda
    source ~/.bashrc
  4. 添加镜像

使用清华镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

  1. conda list 查看当前所有软件列表
  2. conda search fastqc 搜索软件
  3. conda install fastqc -y (加上-y是自动安装)
  4. conda remove fastqc -y 卸载软件

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