单细胞聚类第20页

用通俗易懂的方式讲解：关键词提取方法总结及实现

文章目录一、关键词提取概述二、TF-IDF关键词提取算法及实现三、TextRank关键词提取算法实现四、LDA主题模型关键词提取算法及实现五、Word2Vec词聚类的关键词提取算法及实现六、信息增益关键词提取算法及实现七

深度学习算法与自然语言处理·2023-12-17 02:07

模糊C均值聚类（Fuzzy C-means）算法（FCM）

https://github.com/helloWorldchn/MachineLearning一、FCM算法简介1、模糊集理论L.A.Zadeh在1965年最早提出模糊集理论，在该理论中，针对传统的硬聚类算法其隶属度值非

helloWorldZMY·2023-12-17 02:06

NBIS系列单细胞转录组数据分析实战（七）：空间转录组分析

第七节：空间转录组分析在本节教程中，我们将学习空间转录组的一些分析方法。10XVisium平台的空间转录组数据在许多方面是类似于scRNA-seq数据的，它包含5-20个细胞而不是单个细胞的UMI计数，但仍然与scRNA-seq相同，数据非常的稀疏，同时还具有相关组织中空间位置的附加信息。在这里，我们将使用小鼠大脑(Sagittal)的两个Visium空间转录组数据集进行实战练习。首先，以类似于s

夕颜00·2023-12-17 01:04

Hi-C辅助组装问题盘点

angelicaHi-C辅助组装技术是通过捕获染色体DNA的交互关系，根据染色体内部互作频率显著高于染色体间互作频率，同时，在同一条染色体上互作频率随着互作距离的增加而减少的原理，将Contig或者Scaffold聚类到组群

生信阿拉丁·2023-12-17 00:17

PySCENIC（三）：pyscenic单细胞转录因子分析可视化

KS科研分享与服务·2023-12-17 00:23

安装SingleR之前，先看看它的数据库里有没有你要的细胞

singleR这个R包，还有它配套的celldex数据库，安装真的好麻烦啊为了安装它，把我的的R升到了最新版，结果更新又很麻烦……好不容易安上了这个包，发现自动注释出来的结果跟我聚类出来的图一对比，不能说是一模一样吧

小鱼同学的踩坑记录·2023-12-16 22:28

聚类算法模型的概念、评估及应用

聚类是一种无监督学习方法，其目标是将数据集中的样本分成不同的组别，使得同一组内的样本相似度较高，而不同组之间的样本相似度较低。聚类算法模型通常通过计算样本之间的相似度或距离来实现这一目标。

rubyw·2023-12-16 19:09

我的数据仓库与数据挖掘期末大作业重置版

JupyterNotebook的预设定调整MatPlotLib和Pandas的输出设置任务1：预测问题数据的保存和读取数据的分析和预处理模型的选择和构建线性回归一元多项式回归拟合预测拟合优度的评估任务2：聚类分析问题数据的保存和读取数据的分析和预处理聚类的实现聚类结果有效性评估任务

BOXonline1396529·2023-12-16 17:05

Linux/Mac/Windows的Rstudio安装Python模块总报错，怎么破？

cran.r-project.org/web/packages/reticulate/vignettes/python_packages.html这里写了不需要管理员权限的方法，基于管理员权限的可以看一下：单细胞

刘小泽·2023-12-16 17:03

传单记录

记录儿子传染性单细胞核增多，EB病毒感染的过程。8月20日之前一周，小宝每天流鼻涕，体温在38°以下，没别的什么症状。去社康拿了点感冒药。吃了几天，没什么效果。

小神魔之塔·2023-12-16 16:14

玩转大数据15：常用的分类算法和聚类算法

前言分类算法和聚类算法是数据挖掘和机器学习中的两种常见方法。它们的主要区别在于处理数据的方式和目标。分类算法是在已知类别标签的数据集上训练的，用于预测新的数据点的类别。

沛沛老爹·2023-12-16 16:30

Cell | 单细胞测序描绘骨髓间质完整的细胞类群(转载)

Cell|单细胞测序描绘骨髓间质完整的细胞类群原创：章台柳BioArt今天撰文|章台柳责编|兮间质存在于每个器官，对器官的发育、稳态维持及修复都非常重要，但对其定义一直都不清晰。

天涯清水·2023-12-16 15:45

算法工程师-机器学习面试题总结(7)

7.如何评估聚类效果？8.k-means的超参数类的个数k值如何选取？9.k-means有哪些优缺点？是否有了解过改进的模型，举例说明？10.除了k-means聚类算法之外，

学术菜鸟小晨·2023-12-16 14:31

2020-12-24 文献阅读

技术手段：使用新技术Patch-seq，同时结合膜片箝技术，生物素标记和单细胞转录组手段来检测了超过1300个成年小鼠初级运动皮层。科学发现：新皮层的神经元类型在转录组水平和电生理特征上并非离散的

Zane_bio·2023-12-16 12:47

人工智能增强的全流程测试在需求理解分析阶段和单元测试阶段的提效手段

(2)使用机器学习和数据挖掘技术，对需求文档进行自动分类、聚类、过滤等处理，提高需求分析的效率和准确性。(3)引入知识图谱，将需求信息进行链接和整合，辅助需求分析人员更好地理解需求与相关信息

超级大超越·2023-12-16 11:08

Seurat Weekly NO.17 || 一个R包的CNS之路

seurat发展历史，cns之路在单细胞数据分析中，特别是对初学者来说，Seurat是一个教科书级别的工具。

周运来就是我·2023-12-16 10:16

[源码和文档分享]python数据分析（6）——挖掘建模（1）分类与预测

经过数据探索与数据预处理，得到了可以直接建模的数据.根据挖掘目标与数据形式可以建立分类与预测、聚类分析、关联规则、时序模式和偏差检测等模型。

ggdd5151·2023-12-16 09:29

机器学习（二）机器学习基本概念

无监督学习常见的有聚类和关联规则。监督学习，这种情况下统计学习的方法可以概括如下：从给定的训练数据出发，假设数据是独立同分布产生的；并且假设要学习的模型属于某个函数的集合，称为假设空

archted·2023-12-16 08:22

诺禾单细胞测序助力杨树茎干组织的单细胞转录组图谱绘制

2021年11月22日，诺禾致源单细胞客户在GenomeBiology（IF=13.583）上发表了题为“Transcriptionallandscapeofhighlylignifiedpoplarstemsatsingle-cellresolution

诺禾致源·2023-12-16 05:53

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十三讲-相关分析（含Matlab代码）

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十三讲-相关分析（含Matlab代码）基本概念典型相关分析综合评价模型对应分析因子分析聚类分析习题10.41.题目要求2.解题过程3.程序习题10.51.题目要求

zhushatong·2023-12-16 05:53

104基于matlab的人工蜂群数据聚类算法ABCO-K-均值

基于matlab的人工蜂群数据聚类算法ABCO-K-均值。该代码提供了比K-均值算法更准确的结果。

顶呱呱程序·2023-12-16 02:43

扩展学习|商务智能与社会计算

这些方法通过对数据进行分类、回归、聚类、关

封印师请假去地球钓鱼·2023-12-16 02:44

Course3-Week1-无监督学习

Course3-Week1-无监督学习文章目录Course3-Week1-无监督学习1.欢迎1.1Course3简介1.2数学符号约定2.K-means算法2.1K-means算法的步骤2.2代价函数2.3选择聚类数量

虎慕·2023-12-16 01:44

Altair推出 Altair RapidMiner 2023 平台，提供生成式 AI 功能

Altair推出AltairRapidMiner2023平台，提供生成式AI功能更新包括自动聚类、扩展SAS、Python和R编程功能等近日，Altair（纳斯达克股票代码：ALTR）近日宣布其数据分析和

Altair澳汰尔·2023-12-16 00:55

【scikit-learn基础】--『数据加载』之样本生成器

1.分类聚类数据样本分类和聚类是机器学习中使用频率最高的算法，创建各种相关的样本数据，能够帮助我们更好的试验算

液态不合群·2023-12-15 22:45

Science | 张锋实验室：聚类算法揭示188种新型CRISPR系统

微生物序列数据库包含大量有关酶和其他可用于生物技术的分子的信息。但近年来，这些数据库已经变得非常庞大，以至于很难有效地搜索到感兴趣的酶。2023年11月23日，博德研究所张锋及美国国立卫生研究院EugeneV.Koonin共同通讯在Science在线发表题为“UncoveringthefunctionaldiversityofrareCRISPR-Cassystemswithdeepterasca

weixin_4528312·2023-12-15 22:10

kmeans设置中心_Spark分布式机器学习源码分析：Kmeans族聚类

Spark是一个极为优秀的大数据框架，在大数据批处理上基本无人能敌，流处理上也有一席之地，机器学习则是当前正火热AI人工智能的驱动引擎，在大数据场景下如何发挥AI技术成为优秀的大数据挖掘工程师必备技能。本文采用的组件版本为：Ubuntu19.10、Jdk1.8.0_241、Scala2.11.12、Hadoop3.2.1、Spark2.4.5，老规矩先开启一系列Hadoop、Spark服务与Spa

weixin_39699121·2023-12-15 19:27

MATLAB中的模糊C均值聚类在医学图像分割中的应用

模糊C均值（FCM）是一种常用于图像分割的无监督聚类算法。与传统的C均值聚类方法不同，FCM考虑了每个像素点对各个聚类的隶属度，从而使分割结果更加精确和鲁棒。

m0_57781768·2023-12-15 17:16

matlab kmeans图像聚类例子

%*******************************读取图像数据********************************clearcloseallclcx=imread('fig.png');%读入一幅图像，得到图像数据xwhosx%查看矩阵x的大小和类型y=double(x(:));%将图像数据x按列拉长成一个长向量%*************************调用km

satadriver·2023-12-15 16:11

基于k-均值聚类的图像分割

参考链接：https://blog.csdn.net/LucasXu01/article/details/90764759?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2defaultbaidujs_baidulandingword~default-0-90764759-blog-125619862.235v39pc_relevant_3m_s

satadriver·2023-12-15 16:11

Qt OpenCV 学习（六）：kmeans聚类算法实现背景替换

1.mainwindow.h#ifndefMAINWINDOW_H#defineMAINWINDOW_H#include#include#include#include#include#include#includeusingnamespacecv;usingnamespacestd;QT_BEGIN_NAMESPACEnamespaceUi{classMainWindow;}QT_END_NAM

Robot_Yue·2023-12-15 14:40

机器学习密度聚类

10.4密度聚类密度聚类则是基于密度的聚类，它从样本分布的角度来考察样本之间的可连接性，并基于可连接性（密度可达）不断拓展疆域（类簇）。

黄粱梦醒·2023-12-15 13:48

重新认识我们的大脑

但在数十亿年前，远古的海洋中出现了一些“复制子”，在进化的力量下，它们逐渐成为单细胞生物，接着又演化为动物、植物和微生物等，之后动物这条分支进化成各种原始鱼类，遍布大海。

东山东复东·2023-12-15 13:30

聚类笔记：聚类算法评估指标

1内部评估方法当一个聚类结果是基于数据聚类自身进行评估的，这一类叫做内部评估方法。如果某个聚类算法聚类的结果是类间相似性低，类内相似性高，那么内部评估方法会给予较高的分数评价。

UQI-LIUWJ·2023-12-15 12:16

朝向阳光的“孩子”——藻类

而有机物质又在小到基本没有的概率之中，成为了真正的生命，也就是最开始的单细胞古菌，古菌后来又

兰海粟·2023-12-15 11:30

Python数据分析与机器学习34-DBSCAN实例

image.pngname啤酒的名称calories啤酒的卡路里sodium纳元素含量alcohol酒精含量cost价格二.使用DBSCAN进行聚类代码:importpandasaspdfromsklearn.clusterimportDBSCANfrompandas.plottingimportscatter_matrixim

只是甲·2023-12-15 09:59

肿瘤单细胞的背景介绍

传统的分析方法难以全面系统的分析肿瘤的生态体系，而单细胞测序技术作为一种强而有力的手段，能为我们精确到各种亚类细胞层面剖析肿瘤。

黄佳佳_·2023-12-15 09:03

「NLP主题分析」LDA隐含狄利克雷分布（Latent Dirichlet Allocation）

是基于贝叶斯思想的无监督的聚类算法，广泛用于文本聚类，文本分析，文本关键词等场景。

Reese小朋友·2023-12-15 09:17

保姆级 Keras 实现 YOLO v3 二

保姆级Keras实现YOLOv3二一.数据准备二.从xml或者json文件中读出标注信息三.K-Means计算anchorbox聚类尺寸读出所有标注框尺寸K-Means聚类四.代码下载上一篇文章中,我们完成了

Mr-MegRob·2023-12-15 08:32

Week8

第8周十三、聚类(Clustering)13.1无监督学习：简介参考视频:13-1-UnsupervisedLearning_Introduction(3min).mkv在这个视频中，我将开始介绍聚类算法

kidling_G·2023-12-15 06:57

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十二讲-因子分析、判别分析（含Matlab代码）

程序4.结果习题10.6（1）1.题目要求2.解题过程——对应分析3.程序4.结果习题10.6（2）1.题目要求2.解题过程——R型因子分析3.程序4.结果习题10.6（3）1.题目要求2.解题过程——聚类分析

zhushatong·2023-12-15 03:00

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十一讲-因子分析、聚类与主成分（含Matlab代码）

【数学建模】《实战数学建模：例题与讲解》第十一讲-因子分析、聚类与主成分（含Matlab代码）基本概念聚类分析Q型聚类分析R型聚类分析主成分分析因子分析习题10.11.题目要求2.解题过程3.程序4.结果习题

zhushatong·2023-12-15 03:59

自编码器 AutoEncoder

自动编码器在图像重构、聚类、降维、自然语言翻译等方面应用广泛。1.数据表示数据表示（DataRepresentation）是使用另一种

uodgnez·2023-12-15 00:23

机器学习-聚类问题

前言聚类算法又叫做”无监督分类“，目标是通过对无标记训练样本来揭示数据的内在性质及规律，为进一步的数据分析提供基础。

懒猫gg·2023-12-14 23:11

数学建模算法

算法部分1.评价类模型2.TOPSIS3.线性规划4.聚类分析5.预测模型6.拉伊达准则(对异常值进行剔除)7.数据拟合8.图论代码练习1.模拟圆周率2.斐波那契数列3.四只鸭子落在一个圆中概率4.方程

`流年づ·2023-12-14 23:02

异常检测 | MATLAB实现基于支持向量机和孤立森林的数据异常检测(结合t-SNE降维和DBSCAN聚类)

异常检测|MATLAB实现基于支持向量机和孤立森林的数据异常检测(结合t-SNE降维和DBSCAN聚类)目录异常检测|MATLAB实现基于支持向量机和孤立森林的数据异常检测(结合t-SNE降维和DBSCAN

机器学习之心·2023-12-14 23:15

机器学习---微博聚类案例

1、微博聚类分析要实现广告的精准投放，需要使用聚类找出兴趣一致的用户群体，这样就需要对用户进行聚类找出行为一致的用户，当对所有用户完成聚类之后，再使用关键词分析找出每个聚类群体中的用户的讨论主题，如果主题符合广告内容或者和广告内容相关

30岁老阿姨·2023-12-14 22:40

聚类算法的性能度量

聚类算法的性能度量聚类算法就是根据数据中样本与样本之间的距离或相似度，将样本划分为若干组／类／簇，其划分的原则：簇内样本相似、簇间样本不相似，聚类的结果是产生一个簇的集合。

Gowi_fly·2023-12-14 22:04

论文粗读“Multi-view clustering via deep concept factorization”

etal.Multi-viewclusteringviadeepconceptfactorization[J].Knowledge-BasedSystems,2021,217:106807.摘要翻译最近的研究表明，矩阵分解技术在多视图聚类

掉了西红柿皮_Kee·2023-12-14 20:24

利用ggplot绘制密度散点图（同时附带spearman的R和P值）

写在前面今天在看一篇单细胞文章的时候，看到一个挺精致的图形，如下图所示：密度散点图，我称之为“密度散点图”，因为它像我们平时看到的散点图类似，就是又加上了密度属性。

Kevin_Hhui·2023-12-14 15:49

推荐频道

单细胞聚类