单细胞聚类

【人工智能Ⅰ】实验8：DBSCAN聚类实验

实验8DBSCAN聚类实验一、实验目的学习DBSCAN算法基本原理，掌握算法针对不同形式数据如何进行模型输入，并结合可视化工具对最终聚类结果开展分析。
MorleyOlsen·2023-12-14 13:56

Geneformer：计算生物学的大模型革新

Geneformer基于约3000万个单细胞转录组的大规模语料库进行预训练，旨在网络生物学数据有限的情况下实现上下文特异性预测。
努力犯错·2023-12-14 13:11

【机器学习】聚类（三）：原型聚类：高斯混合聚类

全局调试变量2.调试函数3.高斯密度函数（phi）4.E步（getExpectation）5.M步（maximize）6.数据缩放函数7.初始化参数8.GMMEM算法函数9.主函数四、代码整合  高斯混合聚类是一种基于概率模型的聚类方法
QomolangmaH·2023-12-06 22:12

Hepatology（IF 17.425）| 明尼苏达大学Revelo教授团队通过单细胞转录组揭示肠道菌群加重脂肪肝的潜在机制

非酒精性脂肪肝（NASH）正迅速成为肝移植和肝衰竭的首要原因。肝炎是NASH的关键特征，但参与这一过程的免疫通路尚未充分阐明。B细胞是适应性免疫系统的细胞，是免疫反应的关键调节剂。然而，B细胞在NASH发病机制中的作用以及导致它们在肝脏中激活的潜在机制尚不清楚。美国明尼苏达大学XavierRevelo教授等研究团队在Hepatology（IF17.425）上发表了一项题为“Microbiota‐d
中科新生命·2023-12-06 21:09

单细胞个性化细胞注释

关于单细胞中级的课程内容，前面已经有了三次直播。
生信小博士·2023-12-06 19:20

AGNES层次聚类

要求：(1)采用层次聚类的聚集算法进行聚类，k=2。(2)距离计算采用欧几里得距离。(3)簇之间的距离采用单链接方式度量。 
微笑伴你而行·2023-12-06 19:17

相似背景搜索相关技术专利总结

CN110569878A一种基于卷积神经网络的照片背景相似度聚类方法及计算机-上海汇付数据服务有限公司2019思路对原始图像预处理以校正原始图像中的识别目标的方向前景图像特征与背景图像特征进行实例分割，
uncle_ll·2023-12-06 14:27

【人工智能Ⅰ】实验7：K-means聚类实验

实验7K-means聚类实验一、实验目的学习K-means算法基本原理，实现Iris数据聚类。二、实验内容应用K-means算法对iris数据集进行聚类。
MorleyOlsen·2023-12-06 14:56

机器学习---使用 EM 算法来进行高斯混合模型的聚类

1.指定k个高斯分布參数导包importmathimportcopyimportnumpyasnpimportmatplotlib.pyplotaspltisdebug=False全局变量isdebug可以用来控制是否打印调试信息。当isdebug为True时，代码中的一些调试信息将被打印出来，方便进行调试。初始化：defini_data(Sigma,Mu1,Mu2,k,N):globalXglo
三月七꧁ ꧂·2023-12-06 11:48

讲解机器学习中的 K-均值聚类算法及其优缺点

K-均值聚类（K-meansclustering）是一种无监督学习算法，常用于数据聚类和图像分割。该算法将数据集划分为K个不同的类别，使得每个数据点属于离其最近的质心（centroid）所对应的类别。
跃跃欲试-迪之·2023-12-06 11:47

机器学习实验一：线性回归

系列文章目录机器学习实验一：线性回归机器学习实验二：决策树模型机器学习实验三：支持向量机模型机器学习实验四：贝叶斯分类器机器学习实验五：集成学习机器学习实验六：聚类文章目录系列文章目录一、实验目的二、实验原理
Magic171·2023-12-06 11:14

Data Mining数据挖掘(一)——Clustering聚类

1.IntroductionWearedrowningindata,butstarvingforknowledge.(JohnNaisbitt,1982)Dataminingdrawsideasfrommachinelearning,statistics,anddatabasesystems.MethodsDescriptivemethods=unsupervisedPredictivemetho
大白要努力啊·2023-12-06 07:53

机器学习实验四：贝叶斯分类器

系列文章目录机器学习实验一：线性回归机器学习实验二：决策树模型机器学习实验三：支持向量机模型机器学习实验四：贝叶斯分类器机器学习实验五：集成学习机器学习实验六：聚类文章目录系列文章目录一、实验目的二、实验原理三
Magic171·2023-12-06 07:51

机器学习实验二：决策树模型

系列文章目录机器学习实验一：线性回归机器学习实验二：决策树模型机器学习实验三：支持向量机模型机器学习实验四：贝叶斯分类器机器学习实验五：集成学习机器学习实验六：聚类文章目录系列文章目录一、实验目的二、实验原理三
Magic171·2023-12-06 07:50

机器学习实验三：支持向量机模型

系列文章目录机器学习实验一：线性回归机器学习实验二：决策树模型机器学习实验三：支持向量机模型机器学习实验四：贝叶斯分类器机器学习实验五：集成学习机器学习实验六：聚类文章目录系列文章目录一、实验目的二、实验原理三
Magic171·2023-12-06 07:20

第一章 绪论

“聚类”即将训练集中的西瓜分为
lammmya·2023-12-06 06:21

肘部法则求kmeans聚类最佳分类数K

原文链接：https://blog.csdn.net/hutao1101175783/article/details/77417186K-Means算法是一个重复移动类中心点的过程，把类的中心点，也称重心（centroids），移动到其包含成员的平均位置，然后重新划分其内部成员。是算法计算出的超参数，表示类的数量；K-Means可以自动分配样本到不同的类，但是不能决定究竟要分几个类。K-Means
Xiacedar·2023-12-06 04:36

K-means聚类最优k值的选取

公众号系统之神与我同在最近做了一个数据挖掘的项目，挖掘过程中用到了K-means聚类方法，但是由于根据行业经验确定的聚类数过多并且并不一定是我们获取到数据的真实聚类数，所以，我们希望能从数据自身出发去确定真实的聚类数
Necther·2023-12-06 04:35

kmeans聚类目的干什么的_零基础学习Kmeans聚类算法的原理与实现过程

内容导入：聚类是无监督学习的典型例子，聚类也能为企业运营中也发挥者巨大的作用，比如我们可以利用聚类对目标用户进行群体分类，把目标群体划分成几个具有明显特征区别的细分群体，从而可以在运营活动中为这些细分群体采取精细化
weixin_39898248·2023-12-06 04:35

肘方法确定聚类数k_肘方法确定KMeans聚类的最佳K值

当Kmeans聚类的K没有指定时，可以通过肘部法来估计聚类数量K_means参数的最优解是以成本函数最小化为目标，成本函数为各个类畸变程度之和，每个类的畸变程度等于该类重心与其内部成员位置距离的平方和但是平均畸变程度会随着
几处笙歌·2023-12-06 04:05

聚类k值确定--肘部法则

当k小于真实聚类数时，由于k的增大会大幅增加每个簇的聚合程度，故SSE的下降幅度会很大，而当k到达真实聚
kalani呀·2023-12-06 04:34

机器学习——Kmeans聚类算法

目录简介手肘法手肘法核心思想轮廓系数代码举例1代码举例2实例简介K均值聚类算法是先随机选取K个对象作为初始的聚类中心。
bw876720687·2023-12-06 04:33

使用肘部法则选择KMeans聚类中的k值

在这篇文章中，我们将讨论如何选择最好的k（聚类数）的k-Means聚类算法。肘部法则简介任何无监督算法的基本步骤是确定数据可以被聚类到的聚类的最佳数量。因为我们在无监督学习中没有任何预定义数量的聚类。
python收藏家·2023-12-06 04:32

神奇的小球藻（功效篇）

来源：《绿藻食疗网》之前跟大家介绍了有“营养之王”和“排毒圣品”的单细胞植物—小球藻，或许有人会问小球藻真的有这么神奇吗？
jocelyn_wing·2023-12-06 02:56

结合 DBSCAN 示例代码介绍 DBSCAN

的科研之旅第一周——科研工具学习及论文阅读收获-CSDN博客DBSCAN介绍DBSCAN（Density-BasedSpatialClusteringofApplicationswithNoise）是一种基于密度的聚类算法
Joy T·2023-12-06 01:08

【聚类】K-modes和K-prototypes——适合离散数据的聚类方法

分析：思路是使用聚类的方式，每个簇选一个样本。观察数据，都为类别特征，常用的kmeans聚类方法，会使用欧式距离，计算两个样本之间的距离，来判断该样本是否数据该簇。
凝眸伏笔·2023-12-06 00:04

信息编码策略

组织信息的方法可分为两大类：1.聚类组织法2.概括组织法材料内容不同，其特点不同。
太阳女神_2841·2023-12-05 19:44

清空不同Resolution分群走向的历史信息

单细胞系列教程目录索引,持续更新...在对大类注释好的数据集进行亚群提取后，往往需要重新对子集进行聚类分群，但在使用下述代码对新子集进行不同粒度分群走向时绘图会混入meta.data中原始大类数据集的粒度分群走向信息
科研小徐·2023-12-05 17:38

spark mllib和spark ml机器学习基础知识

(cnblogs.com)参考spark机器学习简介机械学习是一门人工智能的科学，用于研究人工智能，强调算法，经验，性能开发者任务：spark基础+了解机器学习原理+相关参数含义millib：分类回归聚类协同过滤降维特征化
厨 神·2023-12-05 16:50

python基因差异分析_差异表达基因的分析（2）

专题一给出了聚类分析的示例，本专题主要谈在表达谱芯片分析中如何利用Bioconductor鉴定差异表达基因。鉴定差异表达基因是表达谱芯片分析pipeline中必须的分析步骤。
weixin_39633113·2023-12-05 10:45

Open3D库进行点云的DBSCAN密度聚类和可视化 c++ 代码

使用Open3D库进行点云的DBSCAN密度聚类和可视化。引入必要的头文件和命名空间：main函数：读取点云数据文件到cloud对象。如果读取失败，则输出警告信息并返回。输出点云中的点数。
点云-激光雷达-Slam-三维牙齿·2023-12-05 06:34

人工智能算法

典型算法：监督学习：线性回归、决策树、支持向量机（SVM）、神经网络无监督学习：K均值聚类、层次聚类、主成分分析（PCA）强化学习：Q-learning、深度强化学习（如深度Q网络）代码示例（Python
不爱吃香菇的干饭少年·2023-12-05 06:16

单细胞分析（三）——细胞分群单独展示

使用降维分析图展示marker基因大部分单细胞分析，以及seuratpackage这个包给出的示例，也都是某一marker基因在降维分析之后得到位置的表现。
生信小鹏·2023-12-05 05:57

k中心点聚类算法伪代码_第十三篇：K-Means 聚类算法原理分析与代码实现

从经典的聚类问题展开讨论。所谓聚类，就是事先并不知道具体分类方案的分类(允许知道分类个数)。本文将介绍一个最为经典的聚类算法-K-Means聚类算法以及它的两种实现。
杨姓美少年·2023-12-05 05:03

十五、机器学习进阶知识：K-Means聚类算法

文章目录1、聚类概述2、K-Means聚类算法原理3、K-Means聚类实现3.1基于SKlearn实现K-Means聚类3.2自编写方式实现K-Means聚类4、算法不足与解决思路4.1存在的问题4.2
七层楼的疯子·2023-12-05 05:25

互联网技术 淘汰着传统行业 也淘汰着人民的幸福

就像海洋，鲸鱼能活，小鱼小虾甚至海藻单细胞生物也能活，这才叫良好生态，不能只让鲸鱼活下去，而把小生物都淘汰掉。一个社会，大资本大企业应该干什么？难道是要倾尽它们的力量与小民争利吗？
小绿逗·2023-12-05 03:03

2019-01-21 k均值聚类算法

K均值(K-means)算法是现在最为广泛使用的聚类方法，它将有未加标签的数据自动地分成有紧密关系的子集或是簇。K均值是一个迭代方法，它要做两件事情：第一个是簇分配，第二个是移动聚类中心。
奈何qiao·2023-12-05 03:32

商业智能领域中零售分析的妙用

BI是一种是一种运用了数据仓库、在线分析和数据挖掘技术来处理和分析数据的技术，其工作原理主要是通过对数据进行抽取、清洗、聚类、挖掘、预测等处理来产生可透析的各种展示数据。
彼岸發·2023-12-05 01:48

论文阅读“Dissimilarity Mixture Autoencoder for Deep Clustering”

GonzálezFA.DissimilarityMixtureAutoencoderforDeepClustering[J].arXivpreprintarXiv:2006.08177,2020.摘要翻译差异混合自编码(DMAE)是一种基于特征聚类的神经网络模型
掉了西红柿皮_Kee·2023-12-04 22:01

K-Means 算法详解

K-Means算法详解K-Means是一种流行的聚类算法，用于将数据划分为预定数量的簇（clusters）。
h52013141·2023-12-04 20:49

K-Means聚类算法学习

1.K-Means算法介绍K-Means作为聚类算法中的典型代表，比较容易实现。聚类算法又叫做“无监督分类”，其目的是将数据划分成有意义或有用的组（或簇）。
名字真的难想·2023-12-04 19:51

【单细胞】scRNA-seq VS snRNA-seq

题记：因为我们在准备烟草某些部位单细胞样品的时候，质量和活性总是比较低，所以对于比较难制备的样品，有的人推荐我们尝试一下snRNA-seq。就去了解了一下snRNA-seq。
jjjscuedu·2023-12-04 19:44

Analysis of single cell RNA-seq data 学习笔记(六)

这一节，我们介绍一下单细胞生物学分析的内容PCA#加载包library(pcaMethods)library(pcaReduce)library(SC3)library(scater)library(SingleCellExperiment
小潤澤·2023-12-04 18:04

单细胞marker基因可视化的补充---密度图与等高线图

单细胞系列已经说了很多关于基因可视化的方法了。
KS科研分享与服务·2023-12-04 15:59

维基百科文章爬虫和聚类：高级聚类和可视化

在我的上一篇文章中，KMeans聚类应用于一组大约300篇维基百科文章。如果没有任何预期的标签，则只能通过检查哪些文章被分组在一起以及哪个单词最常出现来接近聚类结果。
无水先生·2023-12-04 12:20

python核心编程之实现Kmeans聚类算法

这篇文章主要为大家详细介绍了Python实现Kmeans聚类算法，具有一定的参考价值，感兴趣的小伙伴们可以参考一下关于聚类聚类算法是这样的一种算法：给定样本数据Sample，要求将样本Sample中相似的数据聚到一类
haoxun03·2023-12-04 09:27

tfidf和word2vec构建文本词向量并做文本聚类

一、相关方法原理1、tfidftfidf算法是一种用于文本挖掘、特征词提取等领域的因子加权技术，其原理是某一词语的重要性随着该词在文件中出现的频率增加，同时随着该词在语料库中出现的频率成反比下降，即可以根据字词的在文本中出现的次数和在整个语料中出现的文档频率，来计算一个字词在整个语料中的重要程度，并过滤掉一些常见的却无关紧要本的词语，同时保留影响整个文本的重要字词。TF（TermFrequency
饕餮&化骨龙·2023-12-04 05:33

《西瓜书》-9.聚类

9.聚类9.1.聚类任务聚类是一种经典的无监督学习方法，无监督学习的目标是通过对无标记训练样本的学习，发掘和揭示数据集本身潜在的结构与规律，即不依赖于训练数据集的类标记信息。
ruoqi23·2023-12-04 04:15

栅格数据的空间分析——多元分析

1.ISO聚类：ISO（InteractiveSelf-organization）聚类，即迭代式自组织聚类方法，是最常用的非监督分类算法。
进击的码农设计师·2023-12-04 02:44

质谱流式细胞技术简介

中文名：质谱流式细胞技术外文名：MassCytometry技术：流式技术区别：标签系统的不同技术优势：通道数量增加到上百个基本概念：质谱流式细胞技术（MassCytometry）是利用质谱原理对单细胞进行多参数检测的流式技术
Seurat_Satija·2023-12-04 01:27
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