单细胞聚类第22页

2022-02-23

48-12#①在做T-SEN聚类时，报错报错信息②然后上CSDN搜索有人遇到过类似问题，并由详细解答[R语言完成t-SNE分析和画图](R语言完成t-SNE分析和画图_小洁忘了怎么分身的博客-CSDN博客

生信小萌神·2023-12-03 22:24

学习笔记7——数据库基础知识以及mysql的查询语句

数据库三个概念区分DB：数据库，存储数据的仓库，有组织的数据容器DBMS:数据库管理系统SQL：几乎所有的DBMS都支持的语言对数据库的大致了解过程MySQL详细学习教程（建议收藏）-CSDN博客聚集索引（聚类索引

热烈小狗·2023-12-03 19:59

Arxiv网络科学论文摘要21篇(2020-10-15)

众包音乐知识管理中的专业知识和动态：以Genius平台为例;交通干预重塑纽约通勤：评估共享出行和曼哈顿拥堵附加费影响的概率模拟框架;语言网络：一种实用的方法;TriNE：三元异构网络的网络表示学习;细化相似性矩阵以准确聚类属性网络

ComplexLY·2023-12-03 18:10

深度学习 -- 卷积神经网络

1、卷积神经网络的结构大卫·休伯尔(DavidHunterHubel)等人研究发现，猫的视皮层上存在简单细胞(simplecell)和复杂细胞(complexcell)，简单细胞会对感受野中特定朝向的线段做出反应

想做后端的前端·2023-12-03 17:14

15、分层聚类（与kmeans对比）以及连通性、

一、分层聚类1具体介绍image.png生成结构化的层次分层聚类--又叫系统聚类法具体的做法：1.开始吧每个样品作为一类2.然后把嘴靠近的样品（即距离最小的群品）首先聚为小类3.再将已聚合的小类按其类间距离再合并

羽天驿·2023-12-03 16:01

植物王国的“觉醒”者——蕨

在植物进化的过程中，先后有了菌类藻类，有了苔藓，从单细胞到单细胞群到多细胞，都是一个个进化的过程，而在这一个个过程当中，还没有一个植物是可以站立起来的，蕨类是第1个。

R琳茜·2023-12-03 15:41

学习计划

学习标准-理解公式，会推导公式3、pandas、numpy，scipy学习4、a-算法理论:简单线性回归，多元线性回归，回归里面的梯度下降方法b-分类算法:逻辑回归，决策树，支持向量机c-聚类算法:kmeans

黏小莲·2023-12-03 15:21

2022-09-05

09-0510:21发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制撰文：榴莲不酥IF=38.272推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本文系统地比较了癌症基因组图谱（TCGA）肿瘤样本和小鼠器官形成细胞图谱（MOCA）单细胞数据

图灵基因·2023-12-03 14:15

03、K-means聚类实现步骤与基于K-means聚类的图像压缩（2）

03、K-means聚类实现步骤与基于K-means聚类的图像压缩（2）工程下载：K-means聚类实现步骤与基于K-means聚类的图像压缩其他：03、K-means聚类实现步骤与基于K-means聚类的图像压缩

怡步晓心l·2023-12-03 11:45

空间转录组第十讲：空转的细胞分化（拟时序分析）该怎么玩

对于单细胞的数据做拟时序分析基本的流程是挑选一些感兴趣并且可能有分化关系的亚群，然后来分析它们

邓老师呦·2023-12-03 11:40

讲解机器学习中的 K-均值聚类算法及其优缺点。

K-均值聚类（K-meansclustering）是一种无监督学习算法，用于将相似的数据点分成多个组（簇），从而减少数据的复杂性。

微语早读·2023-12-03 11:28

数据分析简单项目总结

基于BERT模型的群众问政留言之城乡建设热点大数据分析基于Python爬取了1500条阳光热线中关于城乡建设的留言，通过BERT预训练语言模型提取文本的语义向量特征，利用临近传播算法对语义向量特征进行聚类得到

孩纸D·2023-12-03 09:00

基于相关性的四种机器学习聚类方法

在这篇文章中，基于20家公司的股票价格时间序列数据。根据股票价格之间的相关性，看一下对这些公司进行分类的四种不同方式。苹果（AAPL），亚马逊（AMZN），Facebook（META），特斯拉（TSLA），Alphabet（谷歌）（GOOGL），壳牌（SHEL），Suncor能源（SU），埃克森美孚公司（XOM），Lululemon（LULU），沃尔玛（WMT），Carters（CRI）、Chil

Python数据挖掘·2023-12-03 09:24

【100天精通Python】Day73：python机器学习入门算法详解与代码示例

LogisticRegression）：1.3决策树（DecisionTree）：1.4支持向量机（SupportVectorMachine）：1.5随机森林（RandomForest）：2.无监督学习算法：2.1聚类算法

LeapMay·2023-12-03 08:19

deepTools 的使用（二）

上校的猫·2023-12-03 08:34

基于2D激光雷达匹配的充电桩位姿检测

原理1.激光雷达滤波，滤除太远的雷达数据，并降采样2.对雷达数据进行分割聚类出candidates3.通过策略，过滤掉大部分不符合的candidates4.对candidates与充电桩模板数据进行PCA

AIMercs·2023-12-03 05:04

面向超大规模数据的自适应谱聚类算法

摘要:针对超大规模数据聚类过程中人为设定邻域参数及计算量庞大等问题，提出了一种基于近似自然近邻的自适应超大规模谱聚类算法(approximatenaturalnearestneighborbasedself-adaptiveultra-scalablespectralclusteringalgorithm

罗伯特之技术屋·2023-12-03 03:28

2018-11-09

能量泵满的时刻1.针对老师讲述的聚类分析能够比较快的理解并且联想到具体的应用。2.讨论问题的时候能够追根溯源，有意识的回答根本性的问题。

窝边的豆豆·2023-12-03 02:50

模糊C均值（Fuzzy C-means，FCM）聚类的python程序代码的逐行解释，看完你也会写！！

文章目录前言一、本文的原始代码二、代码的逐行详细解释总结前言接上一篇博客，详细解释FCM聚类的程序代码！！

小桥流水---人工智能·2023-12-03 00:11

模糊C均值（Fuzzy C-means，FCM）聚类的可运行的python程序代码，复制即可用！！切记需要安装库 scikit-fuzzy

文章目录前言一、安装库scikit-fuzzy二、具体程序代码（复制可运行）三、结果展示总结前言模糊C均值（FuzzyC-means，FCM）聚类是一种软聚类方法，它允许数据点属于多个聚类，每个数据点对所有聚类的隶属度都不同

小桥流水---人工智能·2023-12-03 00:10

SAS聚类分析介绍

1聚类分析介绍1.1基本概念聚类就是一种寻找数据之间一种内在结构的技术。聚类把全体数据实例组织成一些相似组，而这些相似组被称作聚类。处于相同聚类中的数据实例彼此相同，处于不同聚类中的实例彼此不同。

TwcatL_tree·2023-12-02 21:23

DBSCAN聚类算法——机器学习(附代码和图解)

一、前言DBSCAN（Density-BasedSpatialClusteringofApplicationswithNoise，具有噪声的基于密度的聚类方法）是一种基于密度的空间聚类算法。

XF鸭·2023-12-02 21:49

对比学习与聚类的研究

1.关于聚类的一些基本介绍，请参考这里阅读；https://www.cnblogs.com/kailugaji/p/11640006.htmlhttps://kailugaji.github.io/1.1SupportingClusteringwithContrastiveLearninghttps

mingqian_chu·2023-12-02 20:05

2022-06-17

NatBiotech|AI视觉结合蛋白质组学定义单细胞特性和异质性原创图灵基因图灵基因2022-06-1708:05发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术尽管基于成像和质谱的空间蛋白质组学方法取得了进展

图灵基因·2023-12-02 20:59

生命演化中关于生育、繁殖的演化轨迹

二、被历史抛弃的长生者，分裂繁殖的痛苦到大分子以及单细胞时代

8戏语8·2023-12-02 19:56

datawhale开源项目：动手学大模型应用开发第二三次打卡调用大模型API大模型开发流程及架构

一、基本概念1.PromptPrompt最初是NLP（自然语言处理）研究者为下游任务设计出来的一种任务专属的输入模板，类似于一种任务（例如：分类，聚类等）会对应一种Prompt。

soulermax·2023-12-02 18:33

2023-11-28-直播单细胞图表美化-seurat数据结构 featureplot dotplot vlnplot

单细胞常见的可视化方式有DimPlot，FeaturePlot，DotPlot，VlnPlot和DoHeatmap几种，Seurat中均可以很简单的实现，但是文献中的图大多会精美很多。

生信小博士·2023-12-02 17:19

RNAvelocity系列教程1：RNA速率简介及scVelo安装

(Nature,2018)引入了RNA速率的概念，利用新转录的未剪接的前体mRNA和成熟的剪接mRNA可以在常见的单细胞RNA-seq流程中区分的事实，可以恢复定向动态信息，前者可通过内含子的存在检测。

Seurat_Satija·2023-12-02 17:11

【02误区解读】知识图谱与文献计量你一定做错了~多维尺度图

聚类主题是如何划分的？哪张图最合理？

文献计量·2023-12-02 14:28

KDE指导聚类分析（一）噪声问题

作者在看文献[1]盛魁,马健.基于核密度估计的物联网聚类分析模型[J].控制工程,2018,25(06):1098-1102.DOI:10.14107/j.cnki.kzgc.170739.时发现了这句话

Joy T·2023-12-02 12:27

FlowJo软件的简单介绍掌控流式细胞分析的科技巨匠 FlowJo10

数据分析：FlowJo10提供了多种强大的数据分析工具，如聚类分析、差异分析、细胞周期分析等，可以帮助用户深入挖掘流式细胞数据中的信息。可视化与图形生成：FlowJo10具有强大的可视

Someone_sky·2023-12-02 11:11

机器学习实战 ——《跟着迪哥学Python数据分析与机器学习实战》（2）

机器学习实战——《跟着迪哥学Python数据分析与机器学习实战》（2）七、贝叶斯算法7.1新闻分类任务实战7.1.1结巴分词7.1.2词云表示工具包wordcloud7.1.3TF-IDF特征八、聚类算法

躬身入世，以生证道·2023-12-02 09:47

【代码】基于麻雀搜索优化Kmeans图像分割算法

程序名称：基于麻雀搜索优化Kmeans图像分割算法实现平台：matlab代码简介：首先使用麻雀搜索优化算法来确定K-means算法的初始质心位置，然后进行传统的K-means聚类。

玉子（代码分享版）·2023-12-02 09:56

使用K-means把人群分类

1.前言K-mean是无监督的聚类算法算法分类：2.实现步骤1.数据加工：把数据转为全数字（比如性别男女，转换为0和1）2.模型训练fit3.预测3.代码原数据类似这样(source：http:img-blog.csdnimg.cn

hzp666·2023-12-02 09:47

跟着Cell学单细胞转录组分析(十四):细胞比例柱状图---连线堆叠柱状图

之前做单细胞比例图的时候做过堆叠柱状图，（跟着Cell学单细胞转录组分析(六):细胞比例计算及可视化），看那篇Cell文章封面也给我一个启发，我们做的柱状图每个样本是一个单独的柱子，如果有很多细胞类型，

KS科研分享与服务·2023-12-02 06:44

geemap学习笔记018：非监督分类

前言非监督分类是遥感影像中非常常用的一种分类方式，下图是EarthEngine中常用的聚类方法，本节就以landsat8数据为例，采用ee.Clusterer.wekaKMeans()方法进行聚类分类。

静观云起·2023-12-02 04:37

点云凹凸缺陷检测最高层点云点云聚类

文章目录0.数据说明1.凹凸缺陷基本内容2.详细检测思路结果：0.数据说明如上图所示，需要检测的内容为红色框内标出的缺陷部分。简单示例如下红色线条。但是，由于噪声的影响，点云的平面度并不好，且横梁边缘处存在连接，如下：基于上述问题，首先需要获取有效点云（最上层横梁点云），之后在进行凹凸缺陷检测。1.凹凸缺陷基本内容进行3D点云凹凸缺陷检测在许多应用中具有重要的意义，以下是一些常见的原因：

IVisionNode·2023-12-02 03:29

讲解机器学习中的 K-均值聚类算法及其优缺点

K-均值聚类算法是一种常用于聚类分析的无监督学习算法。其基本思想是将数据集分成K个不同的簇，使得同一个簇内的数据点之间的距离尽可能小，不同簇之间的距离尽可能大。

小筱在线·2023-12-02 03:22

数据分析课程设计(数学建模+数据分析+数据可视化)——利用Python开发语言实现以及常见数据分析库的使用

目录数据分析报告——基于贫困生餐厅消费信息的分类与预测一、数据分析背景以及目标二、分析方法与过程数据探索性与预处理合并文件并检查缺失值2.计算文件的当中的值消费指数的描述性分析首先对数据进行标准化处理聚类模型的评价聚类模型的结果关联利用决策树模型进行预测决策数模型的数据处理决策树模型的参数设置模型参数如下表

Tech行者·2023-12-02 02:36

基于聚类模型的异常值仿真——MathorcupD题航空QAR数据分析实践

思考再三，笔者在本题中所使用的方法为聚类分析筛选异常值点。计算软件为Python。感觉做法还是存在很多问题，模型还是有很多漏洞。望读者大佬们提出建议，共同进步。

Dave-Yang·2023-12-02 02:02

一文掌握seurat的umap新姿势，定制你的UMAP图

大家好，欢迎来到单细胞图片美化专辑！本文ump图，大致有四种中，欢迎个性化定制。

生信小博士·2023-12-01 23:07

【深度学习】KMeans中自动K值的确认方法

1前言聚类常用于数据探索或挖掘前期，在没有做先验经验的背景下做的探索性分析，也适用于样本量较大情况下的数据预处理等方面工作。

TwcatL_tree·2023-12-01 23:23

【机器学习】聚类（二）：原型聚类：LVQ聚类（学习向量量化）

文章目录一、实验介绍1.算法流程2.算法解释3.算法特点4.应用场景5.注意事项二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍三、实验内容0.导入必要的库1.LVQ类a.构造函数b.闵可夫斯基距离c.LVQ聚类过程

QomolangmaH·2023-12-01 23:19

MAGIC||利用流形学习还原单细胞的基因表达

单细胞转录组测序数据由于测序技术的问题，常常难以捕获到低表达的基因，从而出现大量的零值，这些零值通常被称为“dropout”。

生信编程日常·2023-12-01 21:15

生信小白开始接活——文本处理（二）

上篇处理了最简单的单细胞公共数据，即1个样本对应1个矩阵文件（tsv），读取统计就行了，但是GEO公共数据库中还存在如下的情况：例如GSE178318，15个样本的信息全部混在一块了，针对这种情况，我们怎么统计指定样本的线粒体基因分布

璇而微珏·2023-12-01 16:59

回答关于模糊C均值聚类（FCM）的一些问题！FCM停止迭代的条件是什么，FCM中的隶属度起什么作用？

文章目录一、模糊C均值聚类（FCM）中的隶属度是起什么作用二、FCM停止迭代的条件是什么一、模糊C均值聚类（FCM）中的隶属度是起什么作用表示样本点对各个聚类中心的隶属程度。

小桥流水---人工智能·2023-12-01 13:36

什么是软阈值，硬阈值，软聚类，硬聚类！！软和硬指的是什么呢？详细解释看这里！！！

文章目录一、软阈值和硬阈值的基本概念和区别二、软聚类和硬聚类的详细概念和区别一、软阈值和硬阈值的基本概念和区别在我所研究的领域中，经常出现小波降噪，就拿小波降噪举例子吧！！

小桥流水---人工智能·2023-12-01 13:31

带你解锁高分单细胞发文骚操作！

说在前面我们都知道在科研论文中有两大类：一类是研究型论文；另一类是综述型论文。其中，前者主要是以研究为主的行文思路，根据研究发现的不同发表在不同级别的杂志上；而后者多是本身没有新的研究发现，主要是对前人的研究结果进行评价综述。然而，这两种分类都是针对以实验为主论文分类，那么这两年生信为主的文章发文量逐年增加，是否也有这样的分类呢？Immugent今天就来解读特别的一类生信文章，姑且把它称为“生信综

生信宝库·2023-12-01 12:20

Seurat24节气之10夏至---整合方法merge()与IntegrateData()

随着单细胞测序技术的成熟，越来越多的研究者选择应用该技术来阐释手上的生物学问题。同时单细胞也不再是单样本单物种单器官的技术，往往会用到多样本整合分析的技术，这方面Seurat团队是最值得关注的。

Seurat_·2023-12-01 12:48

聚类分析例题（多元统计分析期末复习）

例一动态聚类，K-means法，随机选取凝聚点（题目直接给出）已知5个样品的观测值为：1，4，5，7，11。

倒杯Whisky·2023-12-01 11:34

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