第三代测序第13页

Seurat24节气之10夏至---整合方法merge()与IntegrateData()

随着单细胞测序技术的成熟，越来越多的研究者选择应用该技术来阐释手上的生物学问题。同时单细胞也不再是单样本单物种单器官的技术，往往会用到多样本整合分析的技术，这方面Seurat团队是最值得关注的。

Seurat_·2023-12-01 12:48

2022-04-28

day7测序技术知识——罗wb测序技术原理及平台.png测序技术原理及常用数据格式简介（*****）https://mp.weixin.qq.com/s/zPa2G5gzl-sTFAi-qAzbvA各测序技术的参数及特点微信图片

婉_870f·2023-12-01 12:03

基因组浏览器使用 (EPGG)

基因组浏览器是高通量测序分析的一个重要的可视化工具。

生信宝典·2023-12-01 11:53

2022-02-18

是一代又一代人的牺牲与奉献，富一代都是一路吃屎过来，第二代就能舒适的日子，二代再拚一把，第三代就拿到进入上流社会的门票。中间有一代摆烂耍废，下一代就又要重新来过，吃一次又一次的屎。

乡召·2023-12-01 07:53

植物发育过程中，如何驱动共生微生物组的动态变化？

期刊《Microbiome》影响因子14.65近期，派森诺与中国科学院生态环境研究中心、中国科学院大学合作，又双叒在《Microbiome》发表论文，通过扩增子测序和宏基因组测序等方法，研究了植物发育过程中微生物群落与气候

felix108·2023-12-01 07:01

Tools:aspera上传数据到SRA数据库

注意：第6步，文件名，测序是R1和R2这种，把R1和R2放在同一行，最后面一栏filename，filename2分别填写R1和R2的完整文件名。上传数据到数据库。选择

wo_monic·2023-11-30 22:17

曹操

东汉政权的建立成功延续了大汉皇朝的寿命，中央集权得到了进一步的加强，皇帝的权威也发展到了新的高度，可是却帅不过三代，从第三代皇帝开始，皇帝就死的早，这就悲剧了，真个朝廷就留下了年轻的皇后和幼小的皇帝，于是乎

薛义之Harry·2023-11-30 19:41

启示录四帝国

关于死亡教廷的起源还要追溯到第三代虫群诞生伊始，虫群所征服的第一个星球上。在虫群的利爪彻底洗刷尽这个星球之后，残余的原住民被虫群同化，在虫群高层借助一个遗弃的科技遗迹之后。

问号鱼m·2023-11-30 19:31

寒听雪落·2023-11-30 17:14

1178、好日子

表弟一家，他的父亲兄弟姐妹多个，又都是子女也成家立业了，这是第三代的大喜之日；伯母也是人缘极好，老姐妹较多；表弟朋友也多，所以这婚礼人多、热闹，这样的大喜事，亲朋好友齐聚一堂，在吴江宾馆，真可谓喜气洋洋

天使小鱼儿·2023-11-30 17:58

学习小组Day7笔记—白兔儿溜溜

测序知识基因测序技术的发展历史一、二、三代测序基因测序技术.png二代测序大体流程现在的测序平台基本都是illumina公司出品的。

白兔儿溜溜·2023-11-30 15:24

在微型计算机中应用最普遍的数字编码是,计算机基础知识理论复习题及答案

基础知识复习题及答案一、选择题1.第三代计算机所使用的电子器件是()。A)晶体管B)电子管C)中小规模集成电路D)大规模和超大规模集成电路2.微型计算机中使用的关系数据库，就应用领域而言是属于()。

铃木大宝·2023-11-30 15:05

【现学现卖】宏基因组数据与深度学习

现在测序技术发展快速，序列数据越来越多，NCBI中SequenceReadArchive(SRA)数据库中的reads成倍地增长。

乔伊nikkie·2023-11-30 13:34

python_并发编程

2、操作系统历史1）第一代计算机（1940~1955）：真空管和穿孔卡片（无操作系统）2）第二代计算机(1955~1965)：晶体管和批处理系统3）第三代计算机(1965~1980)：集成电路芯片和多道程序设计

Oayia·2023-11-30 11:02

甲基化-全基因组甲基化测序WGBS & RRBS

回顾表观基因组中5mC(DNA甲基化)概述：在甲基转移酶的作用下，DNA序列中的胞嘧啶(C)5`碳位结合一个甲基基团形成5`-甲基胞嘧啶的现象。DNA甲基化检测技术包括：基于Bisulfite转化的检测技术、基于限制性内切酶的检测技术、基于免疫共沉淀的检测技术。基于Bisulfite转化的检测技术通过亚硫酸氢盐将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U，进行PCR扩增后变成T，而有甲基化修饰的C碱基则

b2ad98a9e7bd·2023-11-30 08:43

隐马尔可夫模型笔记

1.定义隐马尔可夫模型是关于时序的概率模型，描述由一个隐藏的马尔可夫链随机生成不可观测的状态序列，再由各个状态随机生成一个观测而产生观测序列的过程。

MusicDancing·2023-11-30 03:50

跟着Cell学单细胞转录组分析(三):单细胞转录组数据质控（QC）及合并去除批次效应

KS科研分享与服务·2023-11-30 02:34

单细胞测序文献解读-拟南芥根系单细胞测序揭示根系细胞发育轨迹

单细胞转录组测序作为区别于传统Bulk-RNA测序的新兴技术，更好的解决了传统研究中存在的细胞异质性问题，为细胞类型鉴定及新细胞类型发现、细胞发育轨迹和功能分析等提供了良好的解决方案，已广泛应用于人类和动物研究

felix108·2023-11-29 23:18

学习小组Day7笔记--阿星

学习小组Day7测序和组学思维导图.png测序和组学1.测序重点关注三代测序的原理和优缺点2.组学初步了解基因组学和转录组学的意义和应用场景3.七天总结这七天用最快的方法入门和学习了生信的核心内容。

阿星爱小羊·2023-11-29 23:51

转录组测序学习第二弹

安装软件前面已经安装好了conda，那么我们现在需要安装我们后续需要用到的软件1.先进入我们前面建立的虚拟环境中condaactivatemy_env2.安装软件condainstall-ysra-toolscondainstall-ytrimmomaticcondainstall-ycutadaptmultiqccondainstall-ytrim-galorecondainstall-ysta

长腿猴子请来的救兵·2023-11-29 18:50

2020转录组RNA-SEQ上游分析

conda使用清华源下载sh脚本并安装设置镜像源conda环境创建激活和退出环境conda安装软件质量评估@fastQCfastq格式FsatQC软件multiqc综合所有qc结果解读单一碱基占比单碱基测序质量在

super_qun·2023-11-29 18:20

不用linux转录组数据分析,无参考基因组的转录组测序分析流程

下边上干货.1.分析流程：2.分析步骤2.1数据预处理，质控过程，与有参考的转录组分析一致2.2UniGene拼接目的：将预处理后reads进行拼接，得到拼接结果。原理：应用deBruijngraphpath算法对reads进行denovo拼接；对上一步的拼接结果，再用HamiltonPath算法拼接。结果：UniGene序列，UniGene统计信息，序列长度分布图2.3数据库注释目的：对拼接得到

师敬超·2023-11-29 18:49

转录组学习第5弹-比对参考基因组

比对参考基因组在构建文库的过程中需要将DNA片段化，因此测序得到的序列只是基因组的部分序列。

长腿猴子请来的救兵·2023-11-29 18:12

三星Galaxy Z Fold2 5G将在国行发布会公布

三星GalaxyZFold25G是三星第三代折叠屏手机，该机配备更大的外部屏幕和内部主屏幕。其中，外部屏幕采用了6.2英寸全视开孔屏设计，在闭合状态下，亦能查看电子邮件、查找定位、观看视频内容等。

磕就完事儿·2023-11-29 08:09

可验证随机函数（VRF）

文章目录一、背景以及场景共识发展第一代POW“以力取胜”第二代POS/DPOS“民主投票”第三代VRF“运气抽签”二、可验证随机函数（VRF）快速开始1.VRF是什么?

西京刀客·2023-11-29 00:27

太火爆被催更！康辉现身央视综艺节目在线教学，纠正发音

提起康辉，我们最先想到的是就是“三观”端正，“五官”端庄，不仅有一张标准的“国”字脸，还具有扎实的播音基本功底和敬业精神，他刚亮相《新闻联播》时就被认为是“央视迎来了第三代主持人”。

童说家·2023-11-28 19:20

计算不同组别间差异甲基化位点和区域的R包—DSS

DSS(DispersionShrinkageforSequencingdata)，为基于高通量测序数据的差异分析而设计的Bioconductor包。

黄晶_id·2023-11-28 16:39

Java中的日期类整理

文章目录第一代日期Date类第二代日期Calendar类第三代日期LocalDateTime类4.Instant类时间戳第一代日期Date类jdk1.0引入1.第一代日期类包含两个构造器，Date()和

Mr YiRan·2023-11-28 11:38

bioinfo100-第13题-从双序列比对开始学起

经过我们之前的12个问题，我们对Illumina测序的原理，测序的储存模式，测序数据的质控已经有了一个比较清楚的认识。那么我们今天就开始用接下来的若干次提问来学习与比对有关的知识。

RachaelRiggs·2023-11-28 04:12

058-第三代软件开发-文件Model

第三代软件开发-文件Model文章目录第三代软件开发-文件Model项目介绍文件Model关键字：Qt、Qml、关键字3、关键字4、关键字5项目介绍欢迎来到我们的QML&C++项目！

DreamLife.·2023-11-27 22:10

2018-03-10

想不起上一次和爸爸妈妈一起逛解放碑是什么时候了，记忆里还留存着小时候每到放暑假一家人在八一路摇着扇子吃火锅，坐渡轮去江北，乘大扶梯上上下下…现在，当年的爸爸妈妈已经白发苍苍，当年的两个小女孩也慢慢步入中年，第三代也茁壮成长起来

笔尖的呢喃·2023-11-27 22:17

056-第三代软件开发-软件打包

第三代软件开发-软件打包文章目录第三代软件开发-软件打包项目介绍软件打包1下载linuxdepoyqt工具2安装linuxdepoyqt3qmake配置4打包程序总结关键字：Qt、Qml、linuxdeployqt

DreamLife.·2023-11-27 18:38

059-第三代软件开发-巧用工控板LED指示灯引脚

第三代软件开发-巧用工控板LED指示灯引脚文章目录第三代软件开发-巧用工控板LED指示灯引脚项目介绍巧用工控板LED指示灯引脚第一种方式第二种方式总结关键字：Qt、Qml、Power、继电器、IO项目介绍欢迎来到我们的

DreamLife.·2023-11-27 18:38

HMM基础

三、HMM的3个问题（一）概率计算／评估------likelihood给定模型参数以及观测序列，求当前模型参数下生成给定观测序列的概率。图3.1likelihood问题1、穷举法图3.2穷举法2

cherryleechen·2023-11-27 16:06

R语言实现OTU表的抽平分析

相信大家平常在16sRNA测序后，一般都会对测序数据划分后生成的OTU表进行抽平，保证保证样本测序序列的均一性。那么今天就来讲一下如何使用R语言来实现对OTU表的抽平分析。1抽平是什么？

fafu生信小蘑菇·2023-11-27 13:03

腾讯云服务器芯片,腾讯云星星海重磅发布首款自研GPU服务器占据业界几宗“最”...

12月20日，在腾讯2020TechoPark开发者大会“下一代软硬一体化的云计算基础设施”分论坛上，腾讯云重磅发布星星海首款自研GPU服务器和星星海新一代自研双路服务器，后者也是国内首款搭载即将发布的第三代英特尔至强可扩展处理器

RYAN槐宏武·2023-11-27 11:17

腾讯的星星海服务器芯片,腾讯云星星海重磅发布两款自研新品打造软硬一体云计算基础设施...

12月20日，在腾讯2020TechoPark开发者大会“下一代软硬一体化的云计算基础设施”分论坛上，腾讯云重磅发布星星海首款自研GPU服务器和星星海新一代自研双路服务器，后者也是国内首款搭载即将发布的第三代英特尔至强可扩展处理器

涂妞妞·2023-11-27 11:17

机器人分类

从发展阶段分类：1第一代机器人2第二代机器人3第三代机器人：智能型机器人。生于90年代。

纳米机器人geniusNMRobot·2023-11-27 10:12

057-第三代软件开发-文件监视器

第三代软件开发-文件监视器文章目录第三代软件开发-文件监视器项目介绍文件监视器实现原理关于QFileSystemWatcher实现代码关键字：Qt、Qml、关键字3、关键字4、关键字5项目介绍欢迎来到我们的

DreamLife.·2023-11-27 09:41

混合（Pooling）样本测序研究

1.混合测序基础测序成本虽然下降了，但对于植物育种应用研究来说还是很高，动不动就上百群体，小小植物个体价值又低，测完了很可能后面就用不到了。这时，混合样本测序是一种省钱的好办法。

生物信息与育种·2023-11-26 19:46

python检测序列中的元素是否满足严格升序关系

方法1deflessThan1(seq):forindex,valueinenumerate(seq[:-1]):ifvalue>=seq[index+1]:returnFalsereturnTrue方法2deflessThan2(seq):func=lambdax,y:x

el psy congroo·2023-11-26 07:02

这篇11分文章还留了个宝藏给你

11.878)的一篇文章，“Anatlasoftheaginglungmappedbysinglecelltranscriptomicsanddeeptissueproteomics”，本文通过联合单细胞转录组测序技术和蛋白质谱去分析了衰老对小鼠肺组织细胞活性的影响

科研菌·2023-11-26 06:41

基因组在动物的实际应用综述

•也可能会出现从基因型微阵列到测序的转变。摘要许多牲畜物种的高维基因组信息的获取正在加速。这不仅得益于基因分型成本的持续降低，而且还得益于利用基

Hello育种·2023-11-26 05:17

qRT-PCR相对定量计算详解qPCR相对定量计算方式——2^-(∆∆Ct) deta t

做完转录组分析之后，一般都要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。

生信小博士·2023-11-25 15:01

云计算领域的第三代浪潮！

根据IDC不久前公布的数据，2023年上半年中国公有云服务整体市场规模(IaaS/PaaS/SaaS)为190.1亿美元，阿里云IaaS、PaaS市场份额分别为29.9%和27.9%，都远超第二名，是无可置疑的行业领头羊。随着人工智能（AI）大模型技术的迅速发展，智能化时代正在开启，AI将成为各行各业的新型生产力，并对算力提出更高要求。从底层算力到AI平台再到模型服务，阿里巴巴加大研发投入，推动阿

传知摩尔狮·2023-11-25 13:44

LoRDEC 利用二代数据纠错PacBio 数据

LoRDEC是一个利用二代测序短序列reads矫正三代测序长reads的工具，利用准确度高的NGS数据构建deBruijnGraph（DBG）对三代长Reads进行纠错，适用于PacBio和Oxford

迎着阳光走·2023-11-25 11:18

生信课程笔记12-负二项分布与测序

随机变量随机试验的样本空间为Ω，如果对于每一个样本点ω∈Ω，有一个实数X(ω)与之对应，这样得到一个定义在Ω上的单值函数X=X(ω)，则称X(ω)为随机变量，简记为X。也就是说，随机变量X是一个从Ω到实数域R的函数，它的定义域为Ω，它的值域X(Ω)为R或R的一个子集。通常用X,Y,Z表示随机变量，用x,y,z表示随机变量的取值。引入随机变量是为了将随机试验数量化，便于对其规律性进行研究。例如，随机

果蝇饲养员的生信笔记·2023-11-25 10:06

NC：樊嘉/杨欣荣合作团队等报道单细胞测序解析肝癌循环肿瘤细胞的时空异质性和免疫逃逸新机制

2021年07月02日，Naturecommunications在线发表了复旦大学（中山医院）肝癌研究所樊嘉院士、杨欣荣教授团队与深圳华大生命科学研究院合作的最新成果DissectingspatialheterogeneityandtheimmuneevasionmechanismofCTCsbysingle-cellRNA-seqinhepatocellularcarcinoma。论文通过单细胞

尐尐呅·2023-11-25 07:54

群体结构分析 | Pophelper 的“平替版”

基于重测序数据的群体结构分析，很多时候，我们会用一款软件，即Admixture（替代传统的Structure，后者太慢了）。输出的结果可视化，才能方便下游分析。

生信石头·2023-11-25 07:46

VirtualBox 中练习安装linux系统centos7

，只要下载好vbox软件，双击运行一直下一步就安装好了：下载地址：https://www.virtualbox.org/wiki/Downloads2.2下载centos7系统iso文件：海量的高通量测序数据

组学大讲堂·2023-11-25 04:45

推荐频道

第三代测序