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组学习之samtools软件[学习笔记通俗易懂版]
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组学习之samtools软件[学习笔记通俗易懂版]date:2023.07.25recorder:CYH-BI特别注意(声明):本文为我自己学习的学习记录,没有任何权威,只能仅供初学者提供思路与参考
CYH-BI
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2023-10-25 12:07
转录组学习
学习
笔记
linux
学习方法
2021-09-30-day6-重点是
主要参考百迈客医学公众号的文章“SRA数据下载的几种常见方法”和生信星球公众号的文章“生信小白第19天--
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组实战(一)”。
重点是
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2023-10-25 11:44
2021-08-05 Omics Playground在线
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组和蛋白质组数据分析工具
网站链接OmicsPlayground是一个免费的生信分析平台,可以用于组学数据的可视化、分析和挖掘。适用于没有任何计算基础的生物小白,界面友好、图形可视化,没有任何编程经验的人都能用。参考文献:MurodzhonAkhmedov,AxelMartinelli,RogerGeiger,IvoKwee.OmicsPlayground:acomprehensiveself-serviceplatfor
iColors
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2023-10-25 11:00
上海见 | 易基因科技与您相约2023年中国微生物学会学术年会
图片来源:中国微生物学会公众号易基因科技受邀参加会议,将携原核三代甲基化、原核
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组、宏病毒组、细菌ChIP-s
易基因科技
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2023-10-25 10:03
生物学
生物信息学
经验分享
科技
易基因:WGBS等揭示植物基因体动态DNA甲基化与基因表达可塑性相关|Genome Biol
尽管DNA甲基化在转座子和重复DNA沉默中的作用已得到很好的表征,但基因体甲基化与
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抑制无关,其生物学重要性尚不清楚。
易基因科技
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2023-10-25 10:33
高分文章
生物学
生物信息学
数据挖掘
电泳迁移率变动(EMSA)实验原理
基于DNA-蛋白质或RNA-蛋白质复合体在聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)中有不同迁移率的原理,当
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因子与特异的DNA或RNA结合后,其在PAGE中的迁移率将小于未结合核蛋白
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因子的DNA
今日之森
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2023-10-25 05:19
本周最新文献速递20220320
Geneticassociationsatregulatoryphenotypesimprovefine-mappingofcausalvariantsfor12immune-mediateddiseases不想看英文题目:
调控
元件相关表型的遗传关联有助于
橙子牛奶糖
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2023-10-24 22:51
基于ESP8266-WiFi和Android的空
调控
制系统
基于ESP8266-WiFi和Android的空
调控
制系统一、实验目标通过ESP8266-WiFi芯片、红外线发射器、DHT11温度传感器与Android客户端实现空调的远程控制(空调开关、温度调节、风速调节
qq_42128826
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2023-10-24 21:16
智能家居
android
java
2018-11-26基础知识考点:失业类型
基础知识考点:失业类型宏观
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的其中一个目标是增加就业,这是经济学考试中比较重要的一部分,通常用失业率来衡量一个国家就业状况,故要了解就业就要了解失业,今天就失业类型向大家介绍。
白山华图
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2023-10-24 12:51
对潇潇暮雨洒江天
雨是万物的
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师,但风雨多是潇潇,昼雨与夜雨,奏下了古筝曲的《春江花月夜》,这一曲紧攥着万物的灵气,可是细听之后,在万物的《春江花月夜》中,
江南呀
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2023-10-24 08:06
跟着NatureMetabolism学作图:R语言ggplot2
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组差异表达火山图
论文Independentphenotypicplasticityaxesdefinedistinctobesitysub-typeshttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00629-2#Sec15s42255-022-00629-2.pdf论文中没有公开代码,但是所有作图数据都公开了,我们可以试着用论文中提供的数据模仿论文中的图今天的推文重复一下论
凉亭下
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2023-10-24 06:42
r语言
开发语言
云原生架构及演进
本文是由AIOps社区举办的《云原生架构演进》meetup
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而来,嘉宾张晋涛,ApacheAPISIXPMCKubernetesingress-nginxreviewer,containerd/Docker
云智慧AIOps社区
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2023-10-24 06:42
IT
云原生
架构
景联文科技:针对敏感数据的安全
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服务,护航信息安全
针对数据的安全
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服务,主要是为了确保数据在
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过程中的安全性和隐私保护。这些服务通常会采用一系列严格的安全措施,如数据加密、访问控制、数据脱敏等,以确保敏感数据不会被泄露或滥用。
景联文科技
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2023-10-24 06:10
科技
安全
RT-PCR,QRT-PCR,real-timePCR之间的区别
RT-PCR:反
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baiPCR(reversetranscription-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。
斗战胜佛oh
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2023-10-24 05:04
你信吗?路痴和loser 仅一线之隔
有人对此进行过研究,比如说《男人的大脑很那个》的作者,曾经就写道,男性大脑中的顶叶皮层和杏仁核要大于女性,这些区域实现部分方向感
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的功能,也就意味着男性更认路,遇到紧急情况能够快速的选择跑路。
度千寒
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2023-10-24 04:59
《破解高效学习的密码》读书笔记2
第一章元认知高效学习五维
调控
技术元认知是什么?是指对认知的认知。具体地说,是关于个人认知过程的知识和调节认知过程的能力。(摘自《记忆心理学》第三版)是指对思考进行的思考,是儿童需要学习的一个进程。
依然如水
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2023-10-24 00:31
百分百装修网告诉你中小型的装修公司和施工队该如何发展
催火了一个有一个的跟房地产有关的行业,暂且不说这几年的房产中介有多火热,光装修这一个行业,就给多少人带来了财富,水电工、木工、油漆工、壁纸、家具建材等等,还催生了一批又一批的装修公司,但随着政府对房地产行业的
调控
zp_b896
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2023-10-23 18:50
pyscenic的结果不可重复
一、pyscenic的结果不可重复最近在运行pyscenic的结果的时候发现了两次相同参数相同数据的结果存在不一致,回溯发现scenic的第一步GRN的结果已经出现了差异,
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因子和目标基因之间的importance
纷纷不可诉
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2023-10-23 15:50
无央,原来是古汉语!
下面
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几处古文中的出处:《吕氏春秋·知化》:“今释越而伐齐,譬之犹惧虎而刺猏,虽胜之,其后患无央。”汉霍去病《琴歌》:“国家安寧,乐无央兮。”
魚十三
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2023-10-23 14:23
发文很难吗?你只需要一个逆向思维:肿瘤TF预后
今天小编给大家带来不一样的TF肿瘤预后分析,文章发表于今年2月份FrontiersinOncology(IF:4.1)杂志,这是一篇干湿结合的关于胃癌
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因子
调控
影响预后的文章,实验做法简单明了,感兴趣的小伙伴可以扫码哦
概普生信
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2023-10-23 10:17
【听书笔记】父母的语言
4.学习双语,孩子的自我
调控
能力会更好,底层逻辑也会更好。5.传递文化规范,少用指令性语言,耐心解释规则,帮助孩子建立逻辑和推理能力。
超凡蘑菇
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2023-10-23 09:50
使用rna-seq定量软件salmon运行index步骤遇到的一个问题(计算集群slurm)
building.html#installationgithub主页https://github.com/COMBINE-lab/salmon我最开始是直接使用conda安装的v1.4首先第一步是对参考
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组进行索引
凉亭下
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2023-10-23 08:34
开发语言
时间序列的单细胞
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组数据分析
——恩格斯单细胞
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组数据分析在阐述多细胞生物发育与疾病进程方面已经开发了多种新的方法,如比较有名的轨迹推断(TI,trajectoryinference)。
周运来就是我
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2023-10-23 08:12
单细胞36计之31---RPKM、FPKM、TPM
简写RPKM:ReadsPerKilobaseofexonmodelperMillionmappedreads(每千个碱基的
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每百万映射读取的reads)FPKM:FragmentsPerKilobaseofexonmodelperMi
Seurat_Satija
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2023-10-23 07:33
「文献06」植入前胚胎的染色质可及性和
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组图谱
日期:2019年2月9日——2019-Week6分类:「思路,方法」题目:Anintegratedchromatinaccessibilityandtranscriptomelandscapeofhumanpre-implantationembryosDOI:https://www.nature.com/articles/s41467-018-08244-0.pdf杂志:NatureCommuni
六六_ryx
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2023-10-23 05:28
学习小组Day7——林瑶
一代测序(Sanger测序):利用双脱氧核苷酸ddNTP去摸索DNA分子二代测序构建DNA文库上样桥式PCR测序名词结构化基因组学(核酸序列分析)
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组学(基因表达分析)蛋白质组学代谢组学Day7.png
瑶_4ff9
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2023-10-23 05:18
陈晨的3月10日晚安日记
除了跑步上身体的变化外,还有生物钟的
调控
,每天在五点半左右就会自动醒来,不过还会赖
狂奔的夏威夷果
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2023-10-23 03:19
非经典开放阅读框的翻译
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黏膜免疫
Thetranslationofnon-canonicalopenreadingframescontrolsmucosalimmunity题目:非经典开放阅读框的翻译
调控
黏膜免疫作者及单位:RuaidhríJackson
猫姐Lily
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2023-10-23 01:49
阿育吠陀6
调控
能量消耗水平。年纪增大,甲状腺一般自动控制代谢降低,以延长寿命,但,会因此导致肥胖。年轻时,甲状腺型的人,都不容易胖,行动速度超过大脑思考!
微醺的风
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2023-10-23 01:50
文献翻译--
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因子对可变剪接
调控
网络的多层控制
利用这个系统,我们确定了数百个与不同
调控
层相关的因子,这些
调控
层积极或消极地控制
ECHO1216
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2023-10-22 22:37
智慧公厕系列产品:为您提供更便捷、更卫生的厕所体验
这些产品涵盖了从厕位监测到环境
调控
,从安全防范到能耗监测的各个方面,为用户提供了一个更加方便、舒适、卫生的厕所环境。
中期科技ZONTREE
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2023-10-22 19:30
物联网
智慧公厕
智慧厕所
中期科技
MIT 生物信息课程
youtube链接RegulatoryGenomics(Lecture07):这门课程介绍了基因
调控
的概念,涉及到基因的开启和关闭。这是生物信息学中的一个核心概念,对于理解整个生物网络至关重要。
丸丸丸子w
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2023-10-22 19:02
生物信息
生物信息
日进六功第50天
把握要点(自我状态
调控
,建关系,黄金三问,目标,快速切入,先跟后带,共情,同频共振,稳稳地托住和抱持),继续修炼自生力,学习力!
腾飞爱自己
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2023-10-22 18:49
#今天你吃上猪肉了吗#1000万公斤!国家存的猪肉即将投放!肉从何来,存了多久?这些知识你要知道
这些知识你要知道根据《中央储备肉管理办法》,储备肉是指国家用于应对重大自然灾害、公共卫生事件、动物疫情或者其他突发事件引发市场异常波动和市场
调控
而储备的肉类产品,包括储备活畜(含活猪、活牛、活羊,下同)
翰塍百科
·
2023-10-22 16:23
2022-06-03 关于异法方宜论的随笔
而饮食习惯决定了肠道菌群,肠道菌群又
调控
了免疫系统,免疫系统又决定了人体抵抗力以及疾病情况。(人只有通过学习与分析思考才能去伪存真。我花时间和精力去学习并整理记录分享,您的打赏对我将是莫大的鼓励。
三月小小草
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2023-10-22 13:26
临床咨询心理学家(三)
记录信息:以书面、电子形式输入、
转录
、记录、存储或维护信息。向他人解释信息含义:翻译或解释信息的含义,以及该如何使用它们。详细工作活动通过观察、访谈或调查,从人们那里收
大智的自我养成手册
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2023-10-22 07:34
2018-08-16什么是人的成长
是更加努力地学习,从要别人监督到不用别人的督促也能坚持学习,说明你有足够的自制力;是遇事冷静,能独自面对一些事,就算是伤心的事情能自我消化,说明你有能力
调控
自己的情绪;是形成了自己的价值观,有自己对人生
一枚_铜钱
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2023-10-22 06:22
资本寒冬并未到来 创业时代正是当下
图片发自App随着国家部门发力,央行大力
调控
房价,消费内需大幅拉动,资本即将又有一个流向
零度空间传媒
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2023-10-22 06:52
GFAP---Gene family模块
区别点在于,该模块所针对是非
转录
因子且在植物中较为常见的基因家族,比如LRR,ABC家族等,至于我为什么知道这些家族是常见的,我估计应该不会告诉你我是翻阅了近500篇家族分析文章总结来的吧~秀一下界面吧稍微补充一个功能
许东
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2023-10-22 05:17
本周最新文献速递20210516
20210516一文献题目:Landscapeofallele-specifictranscriptionfactorbindinginthehumangenome不想看英文题目:人类基因组中等位基因特异性
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因子结合图谱杂志和影响因子
橙子牛奶糖
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2023-10-22 04:20
2018-05-21
于大多数人而言,关心猪肉价格的涨跌、衣服材质的好坏、鸡鸭猫狗的作息这些接地气的事务要比了解宏观政策的变动、金融经济的
调控
、文化传统的传承这些大命题实惠且容易得多。
墨須有
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2023-10-22 04:12
目前数字货币行业的现状,以及身为产品经理应该怎么看待这个行业?
怎么去获取更多的用户需求,是开发出更多产品的关键;传统的期货市场,基金市场,证券市场所产生的金融衍生品,都能在这个行业找到对应的模式;数字货币行业是一个泛监管的行业,传统的证券市场,有证监会监管,他们有着国家宏观经济的
调控
阿日库勒其
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2023-10-22 03:49
【RNA structures】RNA
转录
的重构和前沿测序技术
文章目录RNA
转录
重建1先简单介绍一下测序相关技术2MaptoGenomeMethods2.1Step1Mappingreadstothegenome2.2Step2Dealwithsplicedreads2.3Step3Resolveindividualtranscriptsandtheirexpressionlevels3Align-de-novoapproaches3.1Step1
丸丸丸子w
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2023-10-21 22:02
生物信息
RNA
RNA测序
生物信息
RNA_seq生物分析学习--RNA-seq介绍
目录第一课课程介绍第二课RNAseq技术第三课RNAseq发展历史第四课关于基因的概念第一课课程介绍RNAseq捕获了细胞某一状态下所有的
转录
信息DNA是静态信息、RNA是动态信息,是某一时刻DNA表达谱的快照课程大纲
Drone_xjw
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2023-10-21 20:42
生物信息学
机器学习
其他
智慧公厕:探索未来城市环境卫生设施建设新标杆
现代智慧公厕的功能异常丰富,从厕位监测到多媒体信息交互,从自动化清洁到环境
调控
,每一项功能都为公厕的使用者提供了独特的体验和便利。那么,智慧公厕最实用、最便捷的功能有哪些?
中期科技ZONTREE
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2023-10-21 19:44
智慧公厕
智慧厕所
中期科技
智慧城市
2021-12-31
前沿分子生物学技术撰文:风不止步IF=49.962推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:人们对肿瘤克隆在组织内是如何组织的,以及癌症的发展在多大程度上是由克隆特异性遗传畸变或环境线索驱动的仍然知之甚少,依然需要有新的方法来整合基因组、
转录
组和空间的规模测量
图灵基因
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2023-10-21 17:17
2022-04-02
收录于话题#前沿生物大数据分析撰文:骄阳似我IF:31.743推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:作者及其研究团队使用高通量单细胞基因组分析方法来描述原发性胶质母细胞瘤以及匹配的患者来源的外植体和胶质球细胞系的遗传和
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组异质性
图灵基因
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2023-10-21 16:12
2019文献汇总 | 单细胞与病毒感染
我的单细胞测序project主要是做炎症相关的单细胞
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分析,在检索paper的过程中,发现有关单细胞测序和病毒相关的文献是很少的,大致统计一下也不过十几篇,追根究底可能有两个方面的原因:(1)我们做感染的还是很穷哒
生信宝典
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2023-10-21 09:32
走进孩子的情绪世界
情商:指的是个体监控自己及他人的情绪和情感,恰当地表达情绪,以及适应性地
调控
情绪的能力。情绪识别:是指我们区分特定的情绪,并且可以用不同的方式标记不同情绪的能力。
妞妞橙
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2023-10-20 23:23
中医理论-气机
解读气有运动的特性,气以其运行不息而激发和
调控
机体的新陈代谢,推动人体的生命进程。气的运动止息,机体新陈代谢的气化过程因而停止,则标志着生命过程的
差时间
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