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Alphafold
比
AlphaFold
2快10倍!国产开源项目加速蛋白质预测,超长序列22分钟就搞定
22分钟推理出长达4K+的超长蛋白质序列,1分15秒搞定将近2K长的序列预测。这是国产开源项目的最新战绩!最近,由Colossal-AI团队(https://github.com/hpcaitech/ColossalAI)联合百图生科的蛋白质预测模型xTrimoMultimer,正式免费开源。它在支持蛋白质单体(Monomer)和复合物(Multimer)的同时,还能大幅提升蛋白质预测速度。面对2
QbitAl
·
2022-08-25 07:46
大数据
机器学习
人工智能
深度学习
java
JuiceFS 在多云存储架构中的应用 | 深势科技分享
2020年末,谷歌旗下DeepMind研发的AI程序
AlphaFold
2在国际蛋白质结构预测竞赛上取得惊人的准确度,使得“AI预测蛋白质结构”这一领域受到了空前的关注。
微服务商城技术分享
·
2022-08-19 07:10
架构
科技
人工智能
ESMFold:
AlphaFold
2之后蛋白质结构预测的新突破
刚刚,MetaAI蛋白质团队负责人AlexanderRives在推特上宣布最新成果ESMFold,可从蛋白质的单序列中进行高精度端到端原子水平结构预测,推理速度超过
AlphaFold
。
weixin_4528312
·
2022-07-24 15:38
最新科技
人工智能
深度学习
蛋白质结构预测
AlphaFold
ESMFold
训练精度媲美
AlphaFold
2、速度翻倍,飞桨螺旋桨HelixFold训练和推理代码全面开源...
杂志上发表了题为"HighlyaccurateproteinstructurepredictionwithAlphaFold"的文章,系统介绍了一种端到端的从蛋白质序列预测蛋白质三维结构的神经网络算法—
AlphaFold
2
飞桨PaddlePaddle
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2022-07-19 19:48
算法
大数据
机器学习
人工智能
深度学习
AI 企业多云存储架构实践 | 深势科技分享
2020年末,谷歌旗下DeepMind研发的AI程序
AlphaFold
2在国际蛋白质结构预测竞赛上取得惊人的准确度,使得“AI预测蛋白质结构”这一领域受到了空前的关注。
JuiceFS
·
2022-07-06 13:00
AI 企业多云存储架构实践 | 深势科技分享
2020年末,谷歌旗下DeepMind研发的AI程序
AlphaFold
2在国际蛋白质结构预测竞赛上取得惊人的准确度,使得“AI预测蛋白质结构”这一领域受到了空前的关注。
·
2022-07-06 12:46
机器学习深度学习云存储文件系统
全球生命科学领域正面临转型,AI+生命科学元年正在开启
届国际蛋白质结构预测竞赛)蛋白质测试集的企业内测中,获得82.7/100的成绩(TM-Score),已经超过来自华盛顿大学的生物学家DavidBaker团队研发的RoseTTAFold81.3/100的成绩,仅次于
AlphaFold
2
科技全景
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2022-07-06 07:02
人工智能
机器学习
深度学习
吴恩达:这些 AI 大事件让我无法忘怀...
编程资源领取大佬们推荐的学习资料作者|吴恩达编译|陈大鑫、贝爽编辑|青暮转自|AI科技评论日前,吴恩达在圣诞节之际回顾了2020年AI的一些重大事件,包括AI应对新冠疫情、数据集存在种族偏见、对抗虚假信息算法、
AlphaFold
code小生_
·
2022-06-01 16:55
大数据
编程语言
机器学习
人工智能
深度学习
对标GPT-3、
AlphaFold
,智源研究院发布超大规模智能模型系统“悟道1.0”
出品|AI科技大本营(ID:rgznai100)3月20日,北京智源人工智能研究院发布我国首个超大规模智能模型系统“悟道1.0”。“悟道1.0”由智源研究院学术副院长、清华大学唐杰教授领衔,带领来自北京大学、清华大学、中国人民大学、中国科学院等单位的100余位AI科学家团队联合攻关,取得了多项国际领先的AI技术突破,形成超大规模智能模型训练技术体系,训练出包括中文、多模态、认知、蛋白质预测在内的系
AI科技大本营
·
2022-05-31 14:11
人工智能
人脸识别
大数据
java
编程语言
【Paper Reading】自注意力机制以及在
Alphafold
2中的应用
文章目录
Alphafold
2做了一件什么事Model从Self-Attention机制到Transformer模型Attention机制Attention机制的计算Self-Attention自注意力机制
takedachia
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2022-04-10 00:22
论文阅读笔记
深度学习
人工智能
机器学习
与吴恩达创办Coursera后,她一头扎进数字生物学
2020年年底,在国际蛋白质结构预测赛中,DeepMind公司研发的
AlphaFold
2摘得桂冠,并破解了蛋白质折叠这个困扰人类50年的难题,轰动一时,新药研发也成为热点话题。
OneFlow深度学习框架
·
2022-04-02 09:06
业界观点
大数据
python
机器学习
人工智能
alphafold
与吴恩达创办Coursera后,她一头扎进数字生物学
2020年年底,在国际蛋白质结构预测赛中,DeepMind公司研发的
AlphaFold
2摘得桂冠,并破解了蛋白质折叠这个困扰人类50年的难题,轰动一时,新药研发也成为热点话题。
·
2022-03-31 11:36
alphafold
2 蛋白三级结构预测
nature原文安装及具体使用见主页要注意GPU的配比问题,例如在我们的服务器上使用:freen|grep-E'Partition|----|gpu'查看可用的GPU以及每个GPU的限制。我们服务器上已经安装了该软件,所以直接调用module,需要自己准备包含蛋白氨基酸序列的protein.fa#!/bin/bash#SBATCH--time=8:00:00#SBATCH--partition=g
落寞的橙子
·
2022-03-22 04:20
抢工程师的饭碗?业内人士这样评价AlphaCode | 今夜科技谈
自从AlphaGo在围棋领域名声大噪之后,它的兄弟
AlphaFold
在药物研发领域又刮起了一阵大旋风。现在,AlphaCode来搅动编程行业了。
OneFlow深度学习框架
·
2022-03-09 09:13
人工智能
编程语言
python
大数据
机器学习
昇思MindSpore再突破:蛋白质结构预测训练推理全流程开源,助力生物医药发展
近日,昇思MindSpore与昌平实验室、北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)和化学与分子工程学院、深圳湾实验室高毅勤教授课题组及鹏城实验室陈杰团队基于全场景AI框架昇思MindSpore实现
AlphaFold
2
·
2022-03-04 22:35
代码规范
AI+Science:基于飞桨的
AlphaFold
2,带你入门蛋白质结构预测
1958年F.H.C.克里克提出了生物学中重要的中心法则,DNA->RNA->蛋白质,中心法则说明,DNA可以转录形成RNA,RNA再翻译成一个个氨基酸,最后组合形成蛋白质。通过中心法则不难看出,如果把DNA比喻为进行工业生产的设计蓝图,那么蛋白质就像实现这个蓝图的工具,所以说蛋白质是一切生命活动的基础,它几乎参与了所有的生物学过程,如遗传、发育、繁殖等等。对蛋白质进行深入地研究,能让我们从更深层
·
2022-02-09 19:25
人工智能
【生物学软件】PyMol的初级使用之安装篇
同时,
Alphafold
2的出现,降低了我们接触结构生物学的门槛。而结构生物学的原始数据是原子位点在三维空间上的坐标,这对于人类这个视觉动物是很不方便的,在这种情况下,PyMol就应运而生。
巩翔宇Ibrahimovic
·
2022-01-31 18:35
2022-01-30 从比较的眼光看
AlphaFold
2的架构创新 // A Comparative View on What's New in
AlphaFold
2
由于工作比较忙的原因,最近没有太跟进蛋白质折叠领域的更新.临近过年有一点时间可以拿出来用,所以就查了一下
AlphaFold
2的原理.遗憾的是无论在知乎,微信还是上都没有看到对于模型架构之美的阐述,更有少数声音认为
shouldsee
·
2022-01-30 12:32
AlphaFold
和RoseTTAFold双剑合璧,成功预测蛋白质复合体结构,北大校友领衔登上Science...
鱼羊发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAIAlphaFold和RoseTTAFold等AI的横空出世,可以说打开了蛋白质预测新世界的大门。而现在,依靠这俩AI模型的“组合拳”,科学家们又有了新的突破:首次确定了超过100种“疑似”全新蛋白质复合体,并为700多种此前结构未知蛋白质复合体提供了3D结构预测。也就是说,现在,AI现在不仅能预测蛋白质单体,还能成功预测蛋白质之间的相互作用了。研究人员兴
QbitAl
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2021-11-19 13:49
人工智能
机器学习
大数据
深度学习
算法
AlphaFold
非docker安装
系统:Centos7,6;Ubuntu皆可环境:GCC版本建议大于4.9安装好anaconda或miniconda1.创建conda虚拟环境condacreate--nalphafold2.进入刚刚创建的虚拟环境condaactivatealphafold3.安装依赖软件库3.1安装python3.8.0(必须安装python3.8版本)condainstall-canaconda-cconda-
李狗蛋负我
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2021-08-31 14:39
使用
alphafold
2探索Covid19-Δ毒株新药作用靶点的研究
写这篇帖子是为了将最新开发的
alphafold
2和Covid19-delta毒株的药物研发结合起来,看一看最新的人工智能技术可以怎样辅助药物研发。
Charles_ye
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2021-08-11 00:48
DeepMind推出
AlphaFold
,挑战“蛋白质折叠问题”
12月初,DeepMind研发的
AlphaFold
在“蛋白质结构预测比赛”CASP中夺冠,战胜了其他97个算法。
甲子光年
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2021-06-13 03:55
AI巅峰
AlphaFold
2:四大顶级专家说(上篇)
AlphaFold
2的胜利就像是一场接力赛,往往是跑到最后一棒的人会有更多的高光时刻。但是,我们依然要记住为这门学科贡献智慧的人。
l7H9JA4
·
2021-01-24 12:26
算法
神经网络
大数据
编程语言
机器学习
AI巅峰
AlphaFold
2:四大顶级专家说(下篇)
AlphaFold
2的胜利就像是一场接力赛,往往是跑到最后一棒的人会有更多的高光时刻。但是,我们依然要记住为这门学科前赴后继的人。
l7H9JA4
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2021-01-24 12:26
算法
大数据
编程语言
机器学习
人工智能
年终收藏!吴恩达盘点2020年度AI热门事件
昨日,吴恩达在圣诞节之际回顾了2020年AI的一些重大发展,包括AI应对新冠疫情、数据集存在种族偏见、对抗虚假信息算法、
AlphaFold
预测蛋白质三维结构、1750亿参数的GPT-3出现等等。
喜欢打酱油的老鸟
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2020-12-31 20:36
人工智能
智源研究院发布 2020 年世界十大 AI 进展
譬如5月份出现的GPT-3,让人们突然看到了通用人工智能的希望;再如12月初
AlphaFold
2的出道,让人惊叹“它将改变一切”,人们意识到AI正在以及将要颠覆传统学科。
BAAIBeijing
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2020-12-31 19:00
神经网络
算法
大数据
机器学习
人工智能
2020-12-06
这个算法名为“
AlphaFold
”,由DeepMi
TOM_5462
·
2020-12-06 18:35
【独家解读】Nature论文
AlphaFold
:AI推动科学发现
人工智能前沿讲习编译原标题:
AlphaFold
:UsingAIforscientificdiscovery作者:AndrewSenior,JohnJumper,DemisH
人工智能前沿讲习
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2020-12-03 17:38
神经网络
大数据
机器学习
人工智能
深度学习
「它将改变一切」,DeepMind AI解决生物学50年来重大挑战,破解蛋白质分子折叠问题
本周Google旗下人工智能企业DeepMind发布了最新
AlphaFold
成果,这是全球AI界无比振奋的重大科研突破。
李开复
·
2020-12-02 00:00
「它将改变一切」,DeepMind AI解决生物学50年来重大挑战,破解蛋白质分子折叠问题
本周Google旗下人工智能企业DeepMind发布了最新
AlphaFold
成果,这是全球AI界无比振奋的重大科研突破。
李开复
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2020-12-02 00:00
哈佛医学院研究员解读DeepMind大突破
AlphaFold
:有进步,但未解决根本问题
乾明发自凹非寺量子位报道|公众号QbitAI前不久,DeepMind放出大招
AlphaFold
。在“蛋白质结构预测奥运会”CASP13比赛中,力压其他参赛者。
量子位
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2020-07-09 02:47
DeepMind研制出可准确预测蛋白质结构的
AlphaFold
谷歌旗下公司DeepMind最新研制出的人工高智能系统
AlphaFold
在蛋白质结构预测技术评估试验CASP(CriticalAssessmentofStructurePrediction)以58%的准确率获得冠军
人工智能快报
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2020-07-07 08:54
AlphaGo姐妹篇
AlphaFold
在AlphaGo成功之后,我以为DeepMind的下一步动作是进军游戏产业,制作一个能打败所有顶尖游戏选手的程序,毕竟这个能做出来也很拉风。但是,没想到他下一步的动作是AplhaFold,用来预测蛋白质的三维结构,运用人工智能技术来助力科学发现。在CommunityWideExperimentontheCriticalAssessmentofTechniquesforProteinStructur
宁悦
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2020-07-07 06:14
机器学习
AlphaGo“兄弟”
AlphaFold
出世,DeepMind再创记录
据《卫报》报道,DeepMind花了两年的时间做出来的“新生儿”
AlphaFold
这次在98名参赛者中排名第一,它获得了预测43种蛋白中的25种蛋
AI科技大本营
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2020-07-07 06:41
AlphaGo之后,DeepMind重磅推出
AlphaFold
:基因序列预测蛋白质结构
如今,该公司已将人工智能技术应用到最具挑战性的科学研究问题中,其刚刚推出的
AlphaFold
可以仅根据基因「代码」预测生成蛋白质的3D形状。
人工智能学家
·
2020-07-07 04:45
DeepMind开源
AlphaFold
,蛋白质预测模型登上《Nature》
2020-01-1916:09导语:CNN+Rosetta雷锋网(公众号:雷锋网)报道:还记得
AlphaFold
成名的那一战么?
喜欢打酱油的老鸟
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2020-07-06 19:06
人工智能
AI对抗冠状病毒爆发的11种方式
让我们看一下如何使用AI来控制最新爆发:1.DeepMind使用其
AlphaFold
系统DeepMind宣布,他们将发布几种蛋
qq2648008726
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2020-06-27 03:22
DrugAI
《评人工智能如何走向新阶段》后记(再续7)
由AI科技大本营下载自视觉中国66.谷歌近来研发用于基因科学的人工智能
AlphaFold
,根据基因序列预测生命基本分子一蛋白质的三维结构(
AlphaFold
与下国际围棋的AlphaGo似孪生兄弟),这是用来预测蛋白质折叠结构的能力或设计新的蛋白质
AI科技大本营
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2020-06-20 20:57
评人工智能如何走向新阶段?
未来已来!从今天起,人工智能+基因科学不再是科幻小说
谷歌宣布:谷歌最新人工智能
AlphaFold
,在一项极其困难的任务中击败了所有对手,成功根据基因序列预测了生命基本分子——蛋白质的三维结构。
天和汇和羲医疗
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2020-02-10 02:03
2019,AlphaGo Zero又上《Science》封面!谷歌的人工智能又干翻人类了!
从2016年AlphaGo论文发表在《自然》上,到今天AlphaZero登上《科学》,Alpha家族除了最新出炉的
AlphaFold
之外,AlphaGo、AlphaGoZero和AlphaZero已经全部在顶级期刊
数据服务
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2019-12-23 13:49
谷歌宣布:上帝的密码防线逐渐崩溃
谷歌宣布:谷歌最新人工智能
AlphaFold
,在一项极其困难的任务中击败了所有对手,成功根据基因序列预测了生命基本分子——蛋白质的三维结构。
李财有道plus
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2019-10-03 15:27
我的生信之路--linux安装和基本配置
谷歌的
alphafold
已经揭示了蛋白质的折叠密码,被称之为解密了上帝的最后一层面纱。从DNA序列,到RNA序列,到密码子的发现和蛋白质结构的解析。生命科学领域里,人工智能和计算机科学的应用不断加强。
王朕朕
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2019-06-27 16:13
谷歌宣布:上帝的密码防线逐渐崩溃!世界为之震惊!
前不久,谷歌宣布:谷歌最新人工智能
AlphaFold
,在一项极其困难的任务中击败了所有对手,成功根据基因序列预测了生命基本分子——蛋白质的三维结构。
Me极客
·
2019-05-20 10:58
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