GOCI数据下载

2019-12-22 Day10-14-学习 TCGA数据库单基因文章套路

IF4.5分左右套路：TCGA数据下载，选择想要研究的基因，然后对基因ID进行转换，提取矩阵中基因表达量，然后做差异表达分析-散点图-疾病和正常或肿瘤与癌旁比较，配对的差异分析-肿瘤与癌旁，然后对TCGA
卅衣·2021-04-28 20:58

170110-罗辑思维春节前最后一次周例会

得到周例会脱不花公布运营数据下载安装用户数：450万日活用户数：45万春节附近的产品安排：年底不断电，持续和大家一起学习《卓老板聊科技》的作者卓克，上线一个节目《今年》讲给小朋友听历史上的今天VOVO搞活动
勇哥在进化·2021-04-28 11:00

「r<-包」UCSCXenaTools v1.2.7

GDC数据下载问题的修复详情见ht
王诗翔·2021-04-28 00:22

ELMAN神经网络及其matlab代码实现讲解

代码4.ELMAN程序运行结果4.1各层的神经元个数的确定过程4.2预测值和真实值的误差计算（SSE、MAE、MSE、RMSE、MAPE）4.3Elman网络预测的分析图像5.小结6.MATLAB代码与数据下载地址
wishes61·2021-04-26 18:47

入门5：使用太乐地图服务快速搭建离线地图应用

下载：太乐地图下载器太乐地图下载器是一款集地图类数据下载（谷歌/百度/天地图/海图/专题图/E都市等）、矢量类数据下载（高程/DEM/等高线/三维地形、兴趣点POI、建筑轮廓、路网/水系/绿地等），地图服务发布
太乐地图·2021-04-25 16:10

自然语言处理简单应用---预测文章获得的赞同数量

数据下载地址：https://github.com/arnauddri/hn数据集中存储了从HackerNews上爬取的内容，我们的目的是通过对每篇文章的headline进行分析，预测文章获得的赞同数量
来个芒果·2021-04-24 16:38

Landsat数据下载的那些坑

1网址目前，Landsat数据下载地址处于新老交替中，主要有三个网址可以下载：老版本glovis的为：http://glovis.usgs.gov/，需要装Java，动不动就死给你看，选择数据费劲。
JimRunner·2021-04-23 07:09

异朽阁作品使用说明动图合集

目录小婵简介小婵_00功能简介.gif调试04.调试-申请模拟账户.gif03.调试-数据下载.gif05.调试-填写注册信息.gif06.调试-绑定多个账号.gif小婵_错误自检.gif使用小婵_01
killnight·2021-04-22 12:49

NCBI-SRA数据下载的3种方法

SRA数据库，为SequenceReadArchive的缩写。主要存储高通量测序的原始数据，来自四个测序平台，分别为：Roche_LS454，Illumina，ABI_SOLID和HELICOS。从事生物信息分析的老师和同学一般都会接触SRA数据，下载SRA数据的方法也有很多，这里来简单总结一下。方法一：SRATookit下载SRATookit是NCBI提供的下载软件，我们需要下载安装，下载地址：
组学大讲堂·2021-04-22 01:21

R语言配色方案02-RcolorBrewer包

语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr-专为学术绘图而生（二）ggstatsplot-专为学术绘图而生(一)生存曲线R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵
医科研·2021-04-21 11:43

R语言ggboxplot-一文掌握箱线图绘制所有细节

语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr-专为学术绘图而生（二）ggstatsplot-专为学术绘图而生(一)生存曲线R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵
医科研·2021-04-19 21:40

SRA数据下载

http://zhaohuanan.cc/2020/04/15/11.bioinfo/bioinfo-SRA%E6%95%B0%E6%8D%AE%E4%B8%8B%E8%BD%BD/应用场景：如果自己没有测序数据，比如Pacbio数据，nanopore数据等，想要测试一些软件，或者想重复文章的内容，就需要从SRA数据库下载数据。SRA数据库介绍https://www.ncbi.nlm.nih.go
RachaelRiggs·2021-04-19 20:14

R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵

解决一个探针对应多个基因的问题GEO数据下载-GEOquery安装GEOquery包options(stringsAsFactors=F)##避免将character转换为因子if(!
医科研·2021-04-19 11:18

TCGA学习04：建模预测-lasso回归

TCGA学习01：数据下载与整理-TCGA学习02：差异分析-TCGA学习03：生存分析-TCGA学习04：建模预测-cox回归-TCGA学习04：建模预测-lasso回归-TCGA学习04：建模预测-
小贝学生信·2021-04-19 09:23

植物RNA-seq (Salmon)从软件安装到下游分析(纯Mac) 4.8更完

写在前面：整个流程是首次从软件安装-数据下载-上游分析-下游分析。代码没毛病，奇怪的是salmon比对后，mapping～15%（不正常），一般来说期望mapping应该是70-90%。
dandanwu90·2021-04-19 07:07

GDCRNATools的安装与使用---TCGA数据下载与分析工具

GDCRNATools是一个R软件包，用于下载，组织和综合分析GDC中的lncRNA，mRNA和miRNA数据介绍TheGenomicDataCommons(GDC，基因组数据库)保存有美国国家癌症研究所（NCI）计划的标准化基因组，临床和生物样本数据，包括癌症基因组图谱（TCGA）和产生有效治疗的治疗性应用研究（TARGET），它也接受高质量的数据集和来自非NCI支持的癌症研究计划，例如来自Fo
养猪场小老板·2021-04-18 23:43

R语言GEO数据挖掘03-limma分析差异基因

limma分析差异基因在经过了前两期中的数据下载，数据基本处理之后，解决了一个探针对应多个基因数的以及多个探针对应一个基因求平均值，在此基础上运用limma包分析差异基因除此以外，包括绘制火山图，热图，
医科研·2021-04-18 16:10

ggpubr-专为学术绘图而生（二）

作者：白介素2相关阅读：ggpubr-专为学术绘图而生（二）ggstatsplot-专为学术绘图而生(一)R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01生存曲线R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵
医科研·2021-04-18 05:27

TCGA视频第三章---GDC下载及数据整理

from=search&seid=17709076368945641839特此致谢：生信技能树关于数据下载，其实有好多种方法，有firhose,有XENA，甚至还有专门的R语言包比如TCGAbiolinks
寥廓江天万里霜·2021-04-17 18:57

细菌全基因组测序数据构建SNP系统发育树

整个数据处理过程包括如下步骤：数据下载及转化：包括NCBI下载sra数据以及候选的参考基因组数据；数据预处理参考基因组选择callSNP
涤生生·2021-04-17 17:14

R语言绘制地图实例讲解

SHEEP_ROH")png("12.png",width=7000,height=5500,pointsize=170)par(mai=c(12,12,12,12),mgp=c(2.1,0.5,0))#地图数据下载
·2021-04-17 14:25

疫情监控脚本：实时追踪全国各地疫情地图

疫情情况实时监控完整代码0.结果演示1.获取实时数据2.可视化疫情数据拆解项目1.实时疫情数据来源省市数据定位省市数据下载省市数据解析2.可视化数据图表创建疫情地图新增趋势图确诊趋势图死亡趋势图分布图完整代码整个项目分成俩部分
Debroon·2021-04-16 19:19

scrapy框架

一、简介高性能的持久化存储，异步的数据下载，高性能的数据解析，分布式依赖：pipinstallscrapy二、基本使用创建工程：scrapystartprojectProjectName进入到工程目录中
ch_atu·2021-04-16 14:53

R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断

语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr-专为学术绘图而生（二）ggstatsplot-专为学术绘图而生(一)生存曲线R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵
医科研·2021-04-14 21:01

LSTM进行时间序列预测

LSTM进行时间序列预测示例数据下载点击此处目标：预测国际航班未来1个月的乘客数数据如图所示image.pngimportnumpyimportmatplotlib.pyplotaspltfrompandasimportread_csvimportmathfromkeras.modelsimportSequentialfromkeras.layersimportDensefromkeras.lay
逍遥_yjz·2021-04-13 20:55

Xena开启TCGA数据之旅

之前自己的课题一直不顺，TCGA的学习也就拖着，最近放假了终于可以重新跟着Jimmy大神学习公共数据库挖掘了（不过在家效率是真的低QAQ）step1:数据下载及差异分析第一步数据下载就很麻烦，因为下载方式太多了
张张只想发1_3分·2021-04-13 17:10

SRA数据下载

追加评论：sratoolkit真垃圾！！！！！不要用了。不推荐，完全不推荐！！！！最近开始了参与另外一个方向，所以需要学习新东西啦。下载sratoolkit工具，用于从NCBI下载数据。第一次下载了最新版本（sratoolkit.2.10.9-centos_linux64），但是运行的时候报错：./fastq-dump:/lib64/libc.so.6:version`GLIBC_2.14'not
谢京合·2021-04-13 17:11

WGCNA

加权基因共表达网络分析(WGCNA,Weightedcorrelationnetworkanalysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法，可以用来鉴定高度协同变化的基因集,image.png测试数据下载地址
生信编程日常·2021-03-30 14:41

转录组分析——一、工作目录搭建及SRA文件下载

mkdirrnacdrnamkdirbiosoftdatabasepiplineprojectproject_backup一句命令同时创建多个同级别文件夹，规律存放，方便溯源几个文件的作用分别为“软件安装，数据库存放，流程搭建目录，项目分析，数据备份”二、数据下载流程
A西方不亮东方亮·2021-03-29 10:07

Pytorch训练表情识别之笑脸识别

Pytorch训练表情识别之笑脸识别一、数据下载首先是数据下载，话不多说，直接上百度云链接，这是一个只有笑脸和无表情的数据集：链接：https://pan.baidu.com/s/11K1C6nYfa9bbnsIWsvRGKg
机器视觉之眼·2021-03-22 17:03

使用xgboost多分类模型识别手写数字

使用xgboost多分类模型识别手写数字数据下载牛客网的手写数字识别当然啦！在许多网站上都有着类似的数据。
追风少年1899·2021-03-10 23:05

最新最全论文合集——基于3D点云的深度学习

系统2006年上线，吸引了全球220个国家/地区1000多万独立IP访问，数据下载量230万次，年度访问量超过1100万，成为学术搜索和社会网络挖掘研究的重要数
AMiner科技·2021-03-09 15:19

python爬虫实战之旅（ 第九章：scrapy框架（上））

scrapy的功能：高性能的持久化存储；异步的数据下载；高性能的数据解析，分布式。1.2scrapy环境的安装：pipinstallscrapy1.3scrapy的基本使用：1
KQ.·2021-03-08 17:21

Encode数据下载很慢怎么办？

最近我要下200个ChIP-seq的数据，在下载的过程中发现，有的数据下载非常的慢！就像下面这种，我排除了大型机网络的问题，那么我应该咋办。。。？
liu_ll·2021-03-06 17:44

vs2017配置LAStools+测试代码

之前已经配置好pcl（vs2017配置pcl），可以单独配置LAStools，也可以在原有pcl属性表的基础上继续配置目录1相关数据下载2LAStools配置步骤3测试代码1相关数据下载配置所需要的LAStools
借我十斤肉·2021-03-04 13:03

pytorch 猫狗分类

数据下载地址：(1)https://www.kaggle.com/c/dogs-vs-cats-redux-kernels-edition/data(2)https://pan.baidu.com
Lucky_Ape·2021-02-25 02:30

使用插件轻松获取jenkins构建数据

使用插件获取Build数据下载插件https://github.com/jenkinsci/...下载这个插件，cd到下载目录下，编译插件，使用：mvninstall或者mvnpackage命令。
·2021-02-23 15:15

TCGA数据挖掘入门---数据下载工具gdc-client的环境变量配置

使用gdc-client下载数据为方便起见，需要对gdc-client环境变量的配置。首先需要下载官方下载工具「gdc-client」：链接地址：gdc-client下载工具，根据自己系统进行下载即可。我的是win10image.png工具下载完之后不需要安装就可以直接使用，但是下载数据是在命令行中进行的，为了方便需要把安装工具配置到系统中的「环境变量」下载工具的「环境变量」配置第一步，找到工具所
Seurat_Satija·2021-02-23 11:45

Day-1 xiaode

生信学习笔记—byxiaode数据下载与整理image.pnglinux系统简介基本命名规则image.png文件夹与文件管理命令image.png常见参数image.pnglinux操作流程准备工作：
1c9f38e0bb6b·2021-02-23 00:23

全球人工智能技术创新大赛 - 布匹疵点智能识别参赛笔记（win10采坑不断版本）

目录1.代码参考2.环境安装3.docker预备知识4.过程详述4.1数据下载和预处理4.2.训练模型4.3docker上传到阿里docker仓5.结果预览ref：1.代码参考参考的baseline-yolov5
熊猫小妖·2021-02-22 00:30

ElasticSearch查询（一）

1.准备测试数据，将数据下载到本地:https://github.com/elastic/el...数据结构:{"account_number":0,"balance":16623,"firstname
·2021-02-20 22:07

TCGA数据下载与整理GDC tool

author:"Hannisal"date:"2020/10/4"【TCGA数据库简介】TCGA是美国国家癌症研究所(NationalCancerInstitute)和美国人类基因组研究所(NationalHumanGenomeResearchInstitute)共同监督的一个项目，旨在应用高通量的基因组分析技术，以帮助人们对癌症有个更好的认知，从而提高对于癌症的预防、诊断和治疗能力。TCGA第一
Hannisal·2021-02-08 16:30

问题1--如何将Elasticsearch中千万数据保存到本地文件

问题:工作中,需要将Elasticsearch中几千万的数据下载到本地磁盘中,1.先借助游标,将所有结果数据存储到内存中2.然后将内存中结果数据写入到磁盘,也就是文件中3.因为几千万条数据过大,所以我们在处理的时候就需要先将缓存在内存中的数据写入到磁盘中
鬼古神月·2021-02-05 18:23

Python 量化分析——基本面选股模型

本文源码及数据下载：点击这，谢谢支持一环境准备1-Anaconda安装参考：https://ww
FreoStudio·2021-02-05 13:13

2021年美国大学生数学建模竞赛E题思路分析

文章目录下载链接原文翻译思路分析数据下载下载链接2021美赛题目下载：链接：https://pan.baidu.com/s/1yFdg3vBMS4MY7CnQ3PMG9Q提取码：6666原文翻译2021
不想赖床·2021-02-04 20:48

2021年美国大学生数学建模竞赛B题思路分析

文章目录下载链接原文翻译思路分析数据下载下载链接2021美赛题目下载：链接：https://pan.baidu.com/s/1yFdg3vBMS4MY7CnQ3PMG9Q提取码：6666原文翻译2021
不想赖床·2021-02-04 20:50

如何将TCGA文件ID（UUID）转换为TCGA 样本ID（Barcode)

我遇到的问题：从TCGAGDC把表达谱的数据下载到服务器后，发现表达矩阵有两列，一列是ENSG号，一列是表达值，而文件名为一串数字，虽然在manifest文件里可以找到每个文件名所对应的TCGAUUID
生信摆渡·2021-02-01 16:30

李宏毅机器学习的数据下载解决方法——如何避开使用!gdown

文章目录作业一：作业二：作业三：本文章纯属小白的懒人做法，纯粹是通过找规律解决的，如有问题还请指正！如果需要第3次作业的数据，就在下载的搜索框中输入"李宏毅2020春季作业hw3的所需数据"即可找到对应的资源。针对“李宏毅机器学习2020春季作业三hw3”的数据不会用!gdown进行下载的问题，自己找到一些解决办法，希望对大家有所帮助。———————————————————————————————
Nefu_lyh·2021-01-28 21:07

转录组 Day 1 背景介绍，测序原理，工作准备，数据下载

root用户的命令行以#开头目录文件命名：由字母，下划线，数字组成，不要以数字开头，不要使用特殊符号下划线命名法：project_backup峰驼法：projectBackup3.数据下载Aim：airway
Tina_e4a6·2021-01-28 11:34

全球海温数据NOAA Extended Reconstructed Sea Surface Temperature (SST) V5的时间解释

全球海温数据下载美赛的2020-A是一道关于海洋温度的题，由于海洋温度数据的封装格式是nc格式，所以excel处理不了，得用代码处理，本来以为挺简单的事情，结果，光看懂数据就花了一天的时间，哭了，网上资源层次不齐
写代码的资资·2021-01-26 23:33
上一页 24 25 26 27 28 29 30 31 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他