Geometric 第6页

OSError:libcusparse.so.10.0:cannot open shared object file:No such file or directory

跑图神经网络需要用到torch_geometric，但是在用的出现上述错误，特记录解决过程。

XXin_YYYYYY·2022-12-25 10:23

cuda 9.0 安装torch 0.4_PyTorch geometric 安装中libcusparse.so.10 error的解决策略

准备工作（自己的电脑）：OS:Ubuntu16.04Pythonversion:3.6PyTorchversion:1.6.0CUDAversion:10.1安装流程（pip）：首先确保PyTorch1.4.0及以上版本$python-c"importtorch;print(torch.__version__)">>>1.6.02.查询GPU版PyTorch的CUDA版本$python-c"imp

weixin_39614831·2022-12-25 10:52

【最快解决方案】安装torch-geometric报错 libcusparse.so.11: cannot open shared object file: No such file or dir

安装torch-geometric和安装torch-sparse（官网安装说明：PyGDocumentation—pytorch_geometric2.0.5documentation）后，导入torch-sparse

文森@Vincent·2022-12-25 10:47

图卷积神经网络（GCN）论文笔记与Geometric源码解释

文章目录引言理论推导通俗理解GCN谱图卷积的一阶近似——GCN逐层线性模型半监督节点分类4GeometricGCNConv源码【参考文献】：1.SEMI-SUPERVISEDCLASSIFICATIONWITHGRAPHCONVOLUTIONALNETWORKS引言主要解决问题图半监督分类问题，如引用网络。一般解决方案及缺点图半监督学习问题，使用基于图的显示正则化平滑标签信息，如在损失函数中使用图

十里清风·2022-12-24 17:18

安装torch-geometric

首先要明白一件事，torch-geometric与torch，gpu之间存在着很强的依赖关系，同时，torch-geometric还需要c++的编译环境第一步，下载visualstudio2019vs2019

知福致福·2022-12-23 11:07

PyG自定义数据集学习笔记（持续更新

文章目录1前言1.1torch_geometric.data.Data1.2torch_geometric.datasets自带的数据集1.3自定义数据集基于Data创建数据集的参数2继承InMemoryDataset

来包番茄沙司·2022-12-23 10:13

如何安装torch_geometric？

torch_geometric安装官网：https://pytorch-geometric.readthedocs.io/en/latest/notes/installation.html1.查看CUDA

知行合一and至于至善·2022-12-22 17:12

【未解决】根据torch版本和cuda版本等来配置安装 torch_geometric工具包 Try using the full path with constructor syntax.

目录一、问题来源二、问题解决一、问题来源之前安装的torch_geometric，是可以安装成功，但是跑代码时报错，截图如下，（之前的安装步骤：点我就好）内容即：FileNotFoundError:Couldnotfindmodule

追光者♂·2022-12-22 17:09

anaconda下安装torch_geometric

官方文档安装的时候出了很多错误，最后还是按照官网文档才安装好了文章目录pytorch的版本CUDA的版本安装包pytorch的版本确定pytorch的版本，最低1.4.0python-c"importtorch;print(torch.__version__)">>>1.8.0CUDA的版本确定cuda的版本python-c"importtorch;print(torch.version.cuda

F_aF_a·2022-12-22 15:26

torch-geometric(PYG) 环境配置

一、引言PyTorchGeometric，简称Pyg。Pyg库包含易用的小批量加载器（mini-batchloader）、多GPU支持、大量常见基准数据集和有用的变换，适用于任意图像、三维网格（3Dmesh）和点云。基于PyTorch构建，用于处理不规则结构化输入数据（如图、点云、流形）。除了一般的图形数据结构和处理方法外，它还包含从关系学习到3D数据处理等领域中最新发布的多种方法。通过利用稀疏G

推荐算法研究僧·2022-12-21 19:04

Pytorch geometric 打乱数据集的另一种方法，如 TUDataset 等等（非原Pytorch）

Pytorchgeometric打乱数据集的另一种方法，如TUDataset等等（非原Pytorch）perm=torch.randperm(len(dataset))dataset=dataset[perm]

HuanCaoO·2022-12-21 12:31

【机器学习】中国人民大学高瓴机器学习Lab1图序列自回归模型实验记录

图序列自回归模型实验记录文章目录高瓴人工智能学院大二下机器学习Lab1图序列自回归模型实验记录工具：Pycharm/JupyterNotebook环境：Anaconda(要用到conda环境安装Pytorch和Pytorch-geometric

Isabella...伊莎贝拉·2022-12-21 09:05

从零开始学习图神经网络 - Data类和Datasets的基本使用

Data类——PyG中图的表示及其使用torch_geometric.data.DataPyG-01数据预处理-torch_geometric.data.Data#Data类的构造函数classData

兀坐晴窗独饮茶·2022-12-19 13:24

【OSError: libcublas.so.11: cannot open shared object file: No such file or directory】

OSError:libcublas.so.11:cannotopensharedobjectfile:Nosuchfileordirectory安装torch_geometric的时候，要提前安装四个插件

weixin_45473154·2022-12-16 16:09

利用torch_geometric运行gcn

pytorch出了图计算的工具torch_geometric后，gcn的实现就简单了，直接封装好了首先需要安装torch_geometric$pipinstall--no-indextorch-scatter-fhttps

喝粥也会胖的唐僧·2022-12-16 09:36

【实战】疾病-基因与图神经网络和图自动编码器的相互作用

在pytorch_geometric中，可以使用一行代码构建GCN层：fromt

battle不停息·2022-12-15 21:56

2022-ICML-EquiBind: Geometric Deep Learning for Drug Binding Structure Prediction

2022-ICML-EquiBind:GeometricDeepLearningforDrugBindingStructurePredictionPaper:https://arxiv.org/pdf/2202.05146Code:https://github.com/HannesStark/EquiBind麻省理工学院的研究人员用EquiBind挑战这一范式，这是一种SE(3)等变几何深度学习模

发呆的比目鱼·2022-12-15 15:50

pytorch中的稀疏矩阵 2021-09-07

pytorch的系数矩阵结构包括：torch_sparse.tensor.SparseTensor:该结构非pytorch官方给出的数据结构，在torch_geometric等包中使用。

Henry Fox·2022-12-15 14:12

关于scatter_add函数的用法

关于scatter_add函数的用法两种scatter函数的关系torch_scattertorch_scatter是pytorch_geometric作者基于pytorch做的smallextensionlibraryofhighlyoptimizedsparseupdate

彭π·2022-12-15 12:25

【Torch_scatter API】关于scatter_add函数的用法

关于scatter_add函数的用法两种scatter函数的关系torch_scattertorch_scatter是pytorch_geometric作者基于pytorch做的smallextensionlibraryofhighlyoptimizedsparseupdate

devil_son1234·2022-12-15 12:20

ModuleNotFoundError: No module named ‘torch_geometric‘

问题：ModuleNotFoundError:Nomodulenamed'torch_geometric'显示如下：注意：1不能简单的直接pipinstalltorch_geometric或者condainstalltorch_geometric2

糖尛果·2022-12-13 13:40

深度学习基础----GAE和VGAE

就看这一个就行了：PytorchGeometricTutorial配合PyG的文档食用：torch_geometric.nn—pytorch_geometricdocumentation只有一个地方不理解

无意识积累中·2022-12-11 14:52

PyG初探（一）

今天主要安装了一下torch-geometric，本来之前以为直接pipinstall就完事了，结果使用时发现了很多报错，主要报错有1：undefinedsymbol:_ZN3c105ErrorC1ENS

Hills＇·2022-12-11 10:28

复现KM3D:Monocular 3D Detection with Geometric Constraints Embedding and Semi-supervised Training

复现KM3D:Monocular3DDetectionwithGeometricConstraintsEmbeddingandSemi-supervisedTraining时间：2022年5月27日1.下载官方代码到github中，搜索KM3D找到官方代码，下载。网址如下：https://github.com/Banconxuan/RTM3D2.安装环境（install）查看install.md，

beneficial·2022-12-09 09:03

ubuntu安装pytorch_geometric

我首先是在base环境中安装的base环境如下首先不要直接安装torch-scatter,会出错，正确做法是，首先安装torchpip3installtorchtorchvisiontorchaudio--extra-index-urlhttps://download.pytorch.org/whl/cpu成功安装torch后如图然后输入pipinstalltorch-scatter但是出现以下错

qq_45759229·2022-12-09 04:16

GNN学习笔记（二）：PyG数据集加载与处理

参照官方文档学习：1图的构建构建一个三个节点，四条边的图（有两条无向边，用四条有向边表示）importtorchfromtorch_geometric.dataimportData#data.edge_index

花锄·2022-12-08 19:25

yelp数据集_pyg学习04：数据集创建

引言在pyg的torch_geometric.datasets的包中，已经包含许多常见的数据集，但是针对的自己的需求去构建或者引用其他的一些数据集的时候，我们需要在pyg提供的函数的基础上进行数据的规范化

weixin_39793105·2022-12-08 19:55

PyG教程(4)：自定义数据集

PyG中提供了两个数据集抽象类：torch_geometric.data.Dataset：用于构建大型数据集（非内存数据集）；torch_geometric.data.InMemoryDataset：用于构建内存数据集

斯曦巍峨·2022-12-08 19:24

PyG学习 - Dataset, DataLoader, Tranforms

通过索引可以访问每一个数据:fromtorch_geometric.datasetsimpor

无脑敲代码，bug漫天飞·2022-12-08 19:23

【PyG】创建自己的数据集-图神经网络

对于数据集的创建涉及到两个类，torch_geometric.data.Dataset和torch_geometric.data.InMemoryDataset，其中第二个是第一个的子类，如果希望全部数据都在内存里则需要使用第二个类

c橘子·2022-12-08 19:23

PyG框架构建GCN、GAT、GraphSAGE模型

获取Cora数据集，查看训练、测试、验证集比例fromtorch_geometric.datasetsimportPlanetoid#'''#下载报错，将所有data文件下载到本地#https://github.com

调包调参侠·2022-12-08 19:22

【无标题】Torch_geometric安装教程，问题汇总详解。

首先，在核心上，Torch_geometric的安装方法几乎和pytorch一样，甚至他们的官网界面都很像。

mougeiwala·2022-12-08 16:53

论文速读:Deep Anomaly Detection Using Geometric Transformations [2018 NPIS]

本篇是近期在classification-based在anomalydetection上有重大突破，想法也很简单，即dataaugmentation运用。是通过geometrictransformation将one-class的normaldata转成multi-class,用标准的crossentropy训练分类器，进行分类取得的结果就很惊艳。整体可分成三部分：1.CreatingtheSelf

攻城争先登·2022-12-08 13:43

在VScode中报错No module named ‘torch_geometric‘

__version__查看torch版本，就会出现版本号然后打开这个链接https://pytorch-geometric.com/whl/，选择你的torch版本点进去。

卷积怎么卷的·2022-12-08 00:19

解决报错ImportError: unique_cuda.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so: undefined symbol: _ZN6caffe28T

最近在调试有关pytorch-geometric包的代码的时候遇到了这个错误，具体报错如下所示：ImportError:/home/amax/.conda/envs/SGE/lib/python3.7/

雨•人·2022-12-07 17:30

torch_geometric torch_scatter 安装记录

安装torch的时候，如果显卡是RTX3090，对应的cuda版本应该是11.0及以上版本，例如torch1.7.1+cu110。第一次安装torch_geometrictorch_scatter时候，遇到报错OSError:libtorch_cuda_cu.so:cannotopensharedobjectfile:Nosuchfileordirectory。问题应该是cuda版本不匹配问题，两

qq_41854611·2022-12-07 17:20

OpenCV库的学习笔记（四）Geometric Transformations of Images

目标学习对图像应用不同的几何变换，如平移、旋转、仿射变换等；你会看到这些功能：cv.getPerspectiveTransform。转换OpenCV提供了两个转换函数，cv.warpAffine和cv.warpPerspective，您可以使用它们执行各种转换。cv.warpAffine采用2x3变换矩阵，而cv.warpPerspective采用3x3变换矩阵作为输入。缩放缩放只是调整图像的大小

郭铁拳·2022-12-06 22:51

GNN学习笔记（一）：PyTorch Geometric 环境搭建（win10_CPU_jupyter/ Linux_GPU_VSCode远程）

1创建python虚拟环境condacreate-nenvpython=3.8condainfo--envscondaactivateenv2安装pytorch官方文档：PyTorch清华源：-ihttps://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simplesome-packagepip3installtorchtorchvisiontorchaudio-ihttps://pyp

花锄·2022-12-06 12:50

解决PyG (PyTorch Geometric)库安装以及import时sklearn报错等问题

解决PyG(PyTorchGeometric)库安装以及import时sklearn报错等问题2021-3-26ByJunwuChenatCASIPE,Beijing1.安装pytorch由于我们组服务器的linux系统版本太老，glibc版本低于2.17且没有root权限，所以我通过conda的方法安装pytorch（安装PyG前需要先安装torch）。conda安装pytorch的方法可以见我

ccjjww25·2022-12-06 08:41

《Fast graph representation learning with PyTorch Geometric》阅读笔记【PyG-paper】

这篇文章是PyG的官方paper，里面提供了很多有价值的信息，在这里进行一下汇总和思考。FeyM,LenssenJE.FastgraphrepresentationlearningwithPyTorchGeometric[J].arXivpreprintarXiv:1903.02428,2019.PyG主要是利用消息传递框架的思想来「提供API接口」以及「实现高GPU吞吐量」（加速）的。图数据结构

智慧的旋风·2022-12-06 06:32

PyTorch & PyTorch Geometric图神经网络(GNN)实战

7673502_839610173.shtmlhttp://www.jintiankansha.me/t/OsNpfQP895PyG:https://github.com/rusty1s/pytorch_geometric

法相·2022-12-06 06:32

图神经网络库(PyTorch geometric:PYG)安装

一、PYG简介PyTorchGeometric是Pytorch的图深度学习扩展库。PYG包含已公开发表的论文中关于在图和非规则结构上进行深度学习的各种方法。此外，它还包括一个易于使用的小型批处理加载器、大量通用基准数据集和有用的转换，用于学习任意图以及3D网格或点云。更多信息，可参考官方文档。二、使用Anaconda安装pytorch1、安装Anaconda在Anaconda官网下载安装包后直接安

很爱吃土豆·2022-12-06 06:58

PyG (PyTorch Geometric) Dropbox系图数据集无法下载的解决方案（AMiner, DBLP, IMDB, LastFM）（持续更新ing...）

诸神缄默不语-个人CSDN博文目录本文主要关注PyG官方提供的数据集中，因为数据下载源是Dropbox，所以不能直接下载的解决方案。由于CSDN无法直接显示百度网盘链接，因此放到了GitHub上：PolarisRisingWar/HGNN_Collection:ACollectionforHGNN(HeterogenousGraphNeuralNetwork),includingdatasets,

诸神缄默不语·2022-12-06 06:25

PyG (PyTorch Geometric) 异质图神经网络HGNN

诸神缄默不语-个人CSDN博文目录PyTorchGeometric(PyG)包文档与官方代码示例学习笔记（持续更新ing…）本文介绍使用PyG实现异质图神经网络（HGNN）的相关操作。本文主要参考PyG文档异质图部分：HeterogeneousGraphLearning—pytorch_geometricdocumentation相关官方代码示例：https://github.com/pyg-te

诸神缄默不语·2022-12-06 06:52

第十八课.Pytorch-geometric入门(三)

目录异构图学习heterogeneousgraphlearning示例图创建异构图异构图的转换创建异构GNNAutomaticallyConvertingGNNModels（示例）补充内容：同构图下的GATConvUsingtheHeterogenousConvolutionWrapper（示例）DeployExistingHeterogenousOperators（示例）异构图采样器Hetero

tzc_fly·2022-12-05 18:15

[论文翻译]A Global Geometric Framework for Nonlinear Dimensionality Reduction

论文题目：AGlobalGeometricFrameworkforNonlinearDimensionalityReduction论文来源:Science290,2319(2000);AGlobalGeometricFrameworkforNonlinearDimensionalityReduction非线性降维的全局几何框架JoshuaB.Tenenbaum,1*VindeSilva,2John

大数据机器学习实验室·2022-12-05 17:06

【论文翻译】A Global Geometric Framework for Nonlinear Dimensionality Reduction

论文题目：AGlobalGeometricFrameworkforNonlinearDimensionalityReduction论文来源：Science290,2319(2000);AGlobalGeometricFrameworkforNonlinearDimensionalityReductionJoshuaB.Tenenbaum,1*VindeSilva,2JohnC.Langford3A