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Linux
QTL
3.
QTL
定位:Rqtl —— Multiple-
QTL
analyses
在进行单
QTL
和双
QTL
基因组扫描后,最好将确定的位点合并成一个联合模型,然后进一步探讨
QTL
的可能性。在此工作中,我们使用由makeqtl()创建的
QTL
对象,利用fitqtl()拟合多
qtl
模型。
Wei_Sun
·
2024-02-20 09:54
2.
QTL
定位:Rqtl —— Two-
QTL
scans
在上篇帖子中介绍了如何用
qtl
这个R包进行单
QTL
定位,但有很多复杂性状都是由多位点共同控制的。
Wei_Sun
·
2024-02-05 14:53
QTL
定位:MapQTL6
MapQTL是一款用于分析二倍体物种实验群体中数量性状位点(
QTL
)的Windows计算机程序,对于用户比较友好,更加便于使用。
Wei_Sun
·
2024-01-28 17:11
qt元对象以及
QTL
容器讲解
1、Qt的元对象系统Qt的元对象提供对象间通信的信号和槽机制、运行时类型信息和动态属性系统。QTRTTI运行时类型识别技术(运行时类型信息)除了C++为我们提供的两种RTTI运算符(dynamic_cast和typeid)外,qt也为我们提供了两种运行时类型识别机制:(1)qobject_cast(2)Qobject::inherits()QT对象间的交流(槽函数)QObject::connect
90岁编程之路
·
2024-01-19 07:48
Qt
QWidget
数据库
qt
2022-12-06
重测序SNP分析------二代测序数据检测;SNPcalling;SNP过滤;遗传多样性分析;PCA分析;群体遗传结构分析;系统进化分析;
QTL
连锁不平衡分析;GWAS全基因组关联分析(关键基因挖掘)
王钦_ce33
·
2024-01-08 16:01
遗传图谱构建及
QTL
定位的基础知识点
今天,小编简单讲解一下遗传图谱构建及
QTL
定位的一些基本知识点。质量性状:指能观察但不能测量的性状,同一种性状的不同表现型之间不存在连续性的数量变化,而呈现质的中断性变化。多由一对或少数几对基因控制。
组学大讲堂
·
2024-01-04 16:46
QList、QVector、QMap、QHash安全删除(指定删除、遍历删除、快速删除)
Q各种容易结构介绍:除了QVarLengthArray,所有
QTL
数据都存放在堆空间,支持隐式共享。
东方忘忧
·
2023-12-30 19:33
QT
哈希算法
算法
数据结构
不会做
QTL
分析,也能轻松找sQTL、eQTL、meQTL | 癌症研究数据库推荐
科研萌新不会做
QTL
分析,如何找eQTL、meQTL、sQTL?给大家推荐3个非常好用的癌症研究数据库套装:Panc
尐尐呅
·
2023-12-06 14:28
QBuffer 用法理解
QBuffer为
Qtl
里面的缓冲区类缓冲区的本质就是一段连续的存储空间在Qt中QBuffer可以看为一个特殊的IO设备文件辅助类(QDataStream,QTextStream)可以直接作用于缓冲区类QBuffer
badogyang
·
2023-12-01 15:32
学习笔记
Qt
2019-02-23
QTL
(转自知乎)
一、
QTL
定位的基本思想
QTL
全称是QuantitativeTraitLoci。顾名思义就是基因组上的一些位点,对一些特定
守望_0bf7
·
2023-11-20 16:58
QTL
定位:Rqtl2输入文件
0.功能概述Rqtl2所有功能的简单描述在以下链接:https://kbroman.org/
qtl
2/pages/rqtl2_functions.html主要包括:DataimportDatasubsettingCombiningdataGenotypereconstructionGenotyp
Wei_Sun
·
2023-11-20 11:04
基因组重测序与转录组联合分析简介
通过基因组重测序中的全基因组关联分析(GWAS)、数量性状基因座(
QTL
)等方式可以挖掘到重要性状的关键候选基因。
花生学生信
·
2023-11-19 20:29
[转]QVector与QByteArray——Qt的写时复制(copy on write)技术
老实说,“隐式共享,引用计数,写时复制”也是老调重弹的话题了,不过也是
QTL
与STL最大的区别之一,这篇博文不详谈“写时复制”技术的细节,那个有不少文章介
weixin_33825683
·
2023-11-17 09:33
c/c++
再谈QVector与QByteArray——Qt的写时复制(copy on write)技术
老实说,“隐式共享,引用计数,写时复制”也是老调重弹的话题了,不过也是
QTL
与STL最大的区别之一,这篇博文不详谈“写时复制”技术的细节,那个有不少文章介
Cloud_Castle
·
2023-11-17 09:02
Qt杂七杂八
设计原则
结构与模式
QByteRef
QStringRef
写时复制
qt
QVector
利用melendy插入参考文献_Q基因的转座子插入突变导致去驯化过程中普通小麦重获脆穗性...
四川农业大学小麦研究所从上世纪90年代开始陆续在西藏半野生小麦中鉴定到3个控制脆穗性状的主效
QTL
,分别位于2DL、3DS和5AL(Chenetal.1998;Jiangetal.
weixin_39611769
·
2023-11-09 11:00
利用melendy插入参考文献
【动植物研究动态】20220605文献解读
NaturalallelicvariationofGmST05controllingseedsizeandqualityinsoybean该研究通过对1800多份大豆种质资源籽粒厚度性状的全基因组关联分析,在5号染色体上鉴定到了一个与粒厚相关的稳定信号区间,并且该区间与已报道的多个产量、油含量和蛋白含量候选
QTL
生物信息与育种
·
2023-11-06 10:05
Qt中英文切换(涉及多种场景)
首先把代码中除.ui文件外的所有中文使用tr()括起来,使
QtL
东方忘忧
·
2023-11-04 01:29
QT
qt
ui
开发语言
Cell—Engineering Quantitative Trait Variation for Crop Improvement by Genome Editing
结果(上):使用CRISPR/Cas9突变顺式作用元件(CRE)重新创建果实形状的
QTL
番茄驯化的主要特征是在果实大小方向上的显著增加。
种地书生
·
2023-11-02 04:36
QT QVector
> qSort 排序
#include//这个是用于QTQVector容器的纯C++用的是#include#include所以QT里面的叫法也不一样,C++叫STL,而QT叫
QTL
现在直接讲QT一个排序实例吧:头文件(.h)
小K小Q
·
2023-10-12 06:14
QT学习之路
QT
QVector
排序
R/
qtl
,遗传图校正距离
library(ggplot2)library(ggpubr)library(
qtl
)f210thelim10even10for(iinodd){axis(side=2,at=chrpos[i],labels
93830eddc2a4
·
2023-10-03 14:25
各种UI库使用总结
性能性能上关注了一下CPU占用率上,在Hi3536C上测试了一下,使用
QTl
hi_LeTian
·
2023-09-11 00:49
ui
全基因组关联分析GWAS结果批量整理方法
GWAS结果批量整理今天分享一个算法,主要是利用R语言对GWAS分析得到的结果进行批量整理,适用于批量筛选关键SNP位点与对应的基因或
QTL
,尤其是多个表型多个材料的批量分析。
生信分析笔记
·
2023-09-01 10:05
后端
正向遗传学和反向遗传学
数量性状基因座(
QTL
)图谱和关联定位等遗传作图方法也是。反向遗
一抹_暖光
·
2023-08-26 19:18
2020-11-02-遗传图谱的基本知识点
遗传图谱构建及
QTL
定位的基础知识点基因定位最有效且最常用的方法就是构建遗传连锁图谱进行基因定位,该方法对于数量性状和质量性状的基因定位都适用。
麦冬花儿
·
2023-08-25 00:30
Qt&C++ 技术分析4 - 流、d-pointer隐式共享以及容器迭代器
中的流文件系统与底层文件操作文件系统类QFileQTextStreamQDataStreamQLocale隐式共享与d-pointer隐式共享d-pointer在隐式共享中的应用二进制代码兼容d-pointer模式实现Qt容器及迭代器
QTL
知奕奕
·
2023-08-04 16:35
#
QT
qt
c++
开发语言
Matrix eQTL分析
目前针对
QTL
分析有很多软件,比如Plink、Merlin、R/
qtl
、FastMap等等,今天给大家分享一下如何使用MatrixeQTL进行分析。首先我们先了解一下什么是eQTL以及eQTL的分类。
杨博士聊生信
·
2023-07-16 23:15
JAVA的jdk1.8中文文档
百度网盘自取:链接:https://pan.baidu.com/s/1tIYmOEoWbWqkB8
QTL
8R-EA?pwd=wybd提取码:wybd
沐阳gg
·
2023-06-16 21:26
java
java
凌恩全新育种分析流程!助力种质资源高分文章发表!
凌恩生物基于农业动植物自然群体、分离群体、种质资源等,结合表型性状,全基因组关联(GWAS)以及
QTL
定位关键农艺性状候选基因,开展农作物功能SN
SHANGHAILINGEN
·
2023-06-15 13:23
测序
组学
测序
组学
使用ALLMAPS进行辅助组装得到准染色体水平基因组
一个物种可能会有多个遗传图谱,可以是不同项目中的不同定位群体结果,可以是不同软件如R/
QTL
,MSTMAP和JOINMAP的分析结果。遗传图谱会因重组率,偏分离
xuzhougeng
·
2023-04-20 17:14
java 持久化类_[Java教程]持久化类(状态介绍)
持久化类(状态介绍)02018-09-1512:00:31叙:之前介绍了持久化、持久化类的相关信息,关于持久化类只讲了相关编写规则等(文章地址:https://www.cnblogs.com/Email-
qtl
777777
XU美伢
·
2023-04-10 10:19
java
持久化类
2021-01-27林木全基因组关联分析(GWAS)研究进展与展望
2、但由于林木家系作图大多基于F1,F2或BC1等低世代杂交群体,遗传变异丰富度较低和染色体重组事件有限,导致
QTL
作图分辨率低且其遗传效应
麦冬花儿
·
2023-04-03 16:10
BSA专题2—缩小定位区间和后续验证怎么做?
导语:又是一周打工人的开局,小编又来啦,来兑现上一专题说的BSA定位后的缩小候选区间&相关实验内容整理哟~缩小候选区间的方法总结如下:☑与遗传图谱结果相结合,基于表型数据,进行
QTL
定位,与BSA结果相结合
felix108
·
2023-03-20 15:28
水稻耐淹
QTL
Sub1的奇幻之旅:从地方品种到现代栽培种
水稻是一种重要的粮食作物。在世界范围内,一半以上的人口都以水稻作为主粮。亚洲是水稻主要的生产地和消费地,约90%的水稻产量和消费都集中在亚洲国家【1】。在南亚和东南亚,由于当地特殊的气候,水稻容易受季风洪水的影响,导致稻苗被部分或完全淹没,对水稻的生产造成极严重的影响。据报道,在世界范围内,约有2200万公顷的低地水田易遭受洪灾,影响全球18%的水稻产量【2】。仅在孟加拉国和印度,每年雨季就有约1
曹务强
·
2023-03-19 07:46
BSA专题2—缩小定位区间和后续验证怎么做?
导语:又是一周打工人的开局,小编又来啦,来兑现上一专题说的BSA定位后的缩小候选区间&相关实验内容整理哟~缩小候选区间的方法总结如下:☑与遗传图谱结果相结合,基于表型数据,进行
QTL
定位,与BSA结果相结合
felix108
·
2023-03-08 23:47
全基因组关联分析流程
AnewregulatorofseedsizecontrolinArabidopsisidentifiedbyagenome-wideassociationstudy做的是拟南芥191个自交系的籽粒大小的全基因组关联分析,并且对其中一个显著的
qtl
1yon
·
2023-02-18 08:13
连锁定位(Linkage Mapping)与关联定位(Association Mapping)
本文主要介绍了育种领域早期(2001年以前)定位
QTL
(quantitativetraitloci,数量性状基因座)所使用的方法及分子标记。
浓香鸭腿面
·
2023-01-11 17:53
玉米基因组
学习
玉米关联群体:NAM(Nested Association Mapping)群体简介(Edward S. Buckler,2009)
本文内容主要摘自下面3篇文章:第一篇介绍了NAM群体的构建及玉米基因组的重组特征;第二篇介绍了计算机模拟下NAM群体挖掘
QTL
的效力;第三篇介绍了NAM群体的应用,使用NAM群体挖掘与花期相关的
QTL
及特征
浓香鸭腿面
·
2023-01-11 17:49
玉米基因组
其他
QTL
上位性分析:QTLNetwork2.0
官网:http://ibi.zju.edu.cn/index.html/BCL/software/qtlnetwork/download.htmlQTLNetwork是一款用于
QTL
上位性分析,以及
QTL
Wei_Sun
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2023-01-05 19:56
adb monkey命令基本用法
adbshellmonkey-pcom.tencent.qt.
qtl
-s23--throttle2000--ignore-crashes--ignore-timeouts-v-v-v10000>D:/log.txt2
梦见886
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2022-09-05 11:19
APP测试
pip
python
android
1.
QTL
定位:Rqtl—— Single-
QTL
analysis
R/
qtl
是一个可扩展的、交互的、用于
QTL
定位的R包,集数据分析和绘图于一体。特点是使复杂的
QTL
定位方法被广泛使用,使用户专注于建模而不是计算。
Wei_Sun
·
2022-07-09 15:34
GPOPSIM软件使用
Fortran90输入文件一个TXT文本文件,Fortran语言风格para.txt参数设置整体参数设置分类参数Overall群体结构,染色体长度,染色体数目Marker每个染色体上的标记数,标记的分布,标记和
QTL
日记本的琉璃
·
2022-03-29 18:56
2022-03-03 snp gff提取注释信息
,b,"=");if(++c[b[1]]==1)printb[1]}}'XXX.gffawk-F"\t"'{print$9}'XXX.gff|cat-n|less下面使用awk进行注释信息提取(以提取
QTL
_ID
白告2333
·
2022-03-03 16:39
QTLseqr包实战
偶然发现有个R包可以做相关的
QTL
分析。拿来试试。
MrLong_0220
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2022-02-19 10:14
常用作图群体简介
我们平常做
QTL
或者GWAS时候总会接触到各种作图群体。今天就简单介绍以下常用的作图群体类型、构建方法及特点。
正踪大米饭儿
·
2022-02-05 11:57
Fine mapping定位
QTL
作物遗传育种需要发掘对农艺性状有重要贡献的
QTL
。某一重要农艺性状往往是由多个
QTL
调控。对这些
QTL
进行精细定位找出对应的基因对作物的改良具有重要意义。
陈牛牛
·
2022-01-03 20:51
get-pip.py 源文件
链接:https://pan.baidu.com/s/1Zq3sTssBIe1UocbMWE4XXA密码:
qtl
5
国家一级蹦迪运动员
·
2021-06-25 08:17
安装使用
QTL
-seqr
QTL
-seqr是一个R包。
wo_monic
·
2021-06-24 13:45
eQTL
1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html首先
QTL
是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL
又是一只小菜鸟
·
2021-06-20 16:02
R/
qtl
包的
QTL
学习
我所有的内容的都是基于会安装R包的基础,假设你已经安装了
qtl
,当开始一项新的项目时。首先,清空rstudio里面的各种变量,我个人习惯是清空的。rm(list=ls())。
MrLong_0220
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2021-06-09 22:37
2021-03-31小麦
QTL
数据库使用
小麦
QTL
数据库地址:http://wheatqtldb.net/1.数据库简介wheatQTLdb是专门用于小麦研究的
QTL
数据库,它包含区间作图鉴定以及GWAS鉴定
QTL
,同时也含有metaQTL、
bcl_hx
·
2021-03-31 20:51
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