RNA剪接第11页

转录组分析Day1笔记--xiaofan1991

实验设计主要注意以下三个方面的内容:RNA提取方案测序深度或文库大小重复的次数 RNA提取方案主要是去除rRNA，保留我们感兴趣的mRNA。

xiaofan1991·2023-09-28 08:55

日更第十天

整天风风火火，今天换垫料，提蛋白，提RNA测蛋白浓度，细胞传代。明天任务，基因鉴定，转化，测尿素氮，配western的胶，测RNA浓度。这周六日跑出来mate1

Lucky_笑·2023-09-28 06:22

国自然研究热点-RNA甲基化研究指南

m6ARNA甲基化是RNA最关键的内部修饰之一，是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。

诺禾致源·2023-09-28 04:39

scmap:单细胞RNA-seq数据跨数据集的投影

随着越来越多的scRNA-seq数据集可用，对它们进行比较是关键。主要的应用程序是比较不同实验室收集的具有相似生物学来源的数据集，以确保注释和分析是一致的。此外，随着大量的参考数据集，如人类细胞图谱(HCA)的出现，一个重要的应用将是将来自新样本(如来自疾病组织)的细胞投射到参考数据集上，以表征组成的差异，或检测新的细胞类型。scmap是一种将细胞从scRNA-seq实验投射到不同实验中识别的细胞

周运来就是我·2023-09-27 21:59

Molecular Cancer|CDK9抑制诱导表观遗传重编程，揭示了规避淋巴瘤耐药性的策略

细胞周期蛋白依赖性激酶（CDK）蛋白家族在细胞周期进程（如CDK1/2/4/6）和RNA转录（如CDK7/8/9/11）的调控中起着不可或缺的作用。

爱基百客·2023-09-27 18:53

MC：RNA修饰万字综述

概普生信·2023-09-27 14:23

听书《与病对话：全科医生手记》

而病毒只是一团蛋白质裹着，几个RNA或者DNA，个头比细菌小很多。对抗病毒没有特

f13abc77b45e·2023-09-27 00:44

Python正则表达式之re.match()

我们在面对生物数据，比如序列信息（比如碱基序列、氨基酸序列等）的时候，会时常要问，这其中是否包含着且含有多少某种已知的模式，一段DNA中是否包含转录起始特征TATAbox、一段RNA中是否包含某种lncRNA

5cb608806559·2023-09-26 21:14

mixcr3.0 软件使用

支持部分和全长分析，并使用所有可用的RNA或DNA信息，包括V基因片段上游和J基因片段下游的序列。

11的雾·2023-09-26 14:56

PCR检测试剂——博迈伦

1.引物（primers）：引物是PCR检测试剂中的核心组成部分，它们是一对具有互补碱基序列的短链DNA或RNA片段。引物在PCR反应中起到识别特定DNA区域的作用，为DNA复制提供起始点。

博迈伦生物·2023-09-26 13:15

RNAseq教程(4.2)

IntroductiontoRNAsequencingInstallationReferenceGenomesAnnotationsIndexingRNA-seqDataPre-AlignmentQC2.Module2-RNA-seqAlignmentandVisualizationAdapterTrimAlignmentIGVAlignmentVisualizationAli

周小钊·2023-09-26 02:53

短视频矩阵系统，短视频矩阵源码技术

1、抖音开放平台申请账号，快手平台申请账号；阿里云混剪接口。2、系统总台支持OEM代理，可以按点数管理。3、代理功能。包括是否允许再次开二级代理、是否允许OEM等。

云罗互动yx898978·2023-09-25 22:31

JSTA：将空间转录组原始数据转换成单细胞水平空间表达谱的专用工具

基于RNA杂交的空间转录组方法提供了极高的RNA检测准确率。然而其需要使用图像分割算法将图像分割成细胞，将RNA检测转换为空间单细胞数据。

尐尐呅·2023-09-25 21:26

分享40个Python源代码总有一个是你想要的

分享40个Python源代码总有一个是你想要的源码下载链接：https://pan.baidu.com/s/1PNR3_RqVWLPzSBUVAo2rnA?

zdh13370188237·2023-09-25 15:52

代码分析 | 单细胞转录组质控详解

前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞

生信宝典·2023-09-25 08:00

SCENIC单细胞转录因子分析原理

2017年发表在NatureMethods杂志上的SCENIC算法，利用单细胞RNA-seq数据，同时进行基因调控网络重建和细胞状态鉴定，应用于肿瘤和小鼠大脑单细胞图谱数据，提出并证

Seurat_Satija·2023-09-25 08:51

非因解读| Reverse Phase Protein Array（RPPA）蛋白组学技术在外泌体分析中的应用

蛋白组学技术在外泌体分析中的应用外泌体（Exosome）是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡，也是细胞外囊泡（EV）的一种主要类型，直径大约40-160nm，具有脂质双层膜结构，能很好的保护其包被的物质，内含大量的核酸，包括DNA、RNA

FynnBio·2023-09-25 06:06

Nature Communications | 张阳课题组：端到端深度学习实现高精度RNA结构预测

RNA分子是基因转录的主要执行者，也是细胞运作的隐形功臣。它们在基因表达调控、支架构建以及催化活性等多个生命过程中都扮演着关键角色。

weixin_4528312·2023-09-25 02:13

柿子基因组测序与其性别决定系统的进化分析

生信石头·2023-09-24 21:08

RNA-seq的差异基因除了热图/火山图，你还可以如何展示？

差异基因展示方式除了热图、火山图，还有传说中的“瀑布图”（不确定是不是叫瀑布图，我感觉更像S型图），近两天我在浏览的时候发现了一篇好文，来自作者ZZZZZZ_XX的一篇：测序结果概览：基因表达量rank瀑布图，高密度表达相关性散点图，注释特定基因及errorbar的表达相关性散点图绘制，觉得里面有一张图很有意思，于是就想试试。所以就随便找了一个差异基因列表操练起来：NOTE:这里的代码和原作者并不

生信start_site·2023-09-24 09:18

疫情.怡情(之五百三十七)

而第三剂疫苗初步确定是使用RNA信使蛋白，即辉瑞和莫德纳疫苗。随着全球开始或计划为公民接种第三剂新冠疫苗的国家增多，世界卫生组织却发出不同声音：强烈反对富裕

飞扬的雪ing·2023-09-23 20:41

微生物测序该怎么选，16S or 宏基因组?

基本简介一、16SrRNA16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚基，16SrDNA就是编码该亚基的基因。细菌rRNA（核糖体RNA）按沉降系数分为3种，分别为5S、16S和23SrRNA。

唯问生物·2023-09-23 07:53

觉知 ——《拾起的宝藏》读后感

【原文剪接】：我们生活在这样的一个环境系统里，就难免被这些未平衡所影响，如果我们没有觉知，没有真正的醒来，心灵上也就容易沾上一些灰尘。使得我们没有原先的那么纯粹，没有原先那么自在。

晓兵论调·2023-09-23 00:07

一个逆天的small RNA-seq数据挖掘神器

大家好，我是白介素2同学，继续分享数据挖掘神器。随着高通量测序技术的不断发展完善，大批量的基因组数据积累在数据库中，这个大家都很清楚。近些年，越来越多的证据表明samllnon-codingRNA（sncRNAs)也发挥了很重要的调节作用。同样的，分析这些数据对物生物信息背景的研究人员而言存在诸多困难，这个时候我们就需要一款神器助攻了。先看看大概长啥样，简洁干净清爽的界面，名字就叫SPAR，不是那

医科研·2023-09-22 17:27

拟南芥长链非编码RNA(lncRNA)鉴定的一个简单小例子

链特异性文库数据对应的论文IdentificationandcharacterizationofnovellncRNAsinArabidopsisthaliana看了下投稿时间image.png3天，也太吓人了吧！！！期刊是BiochemicalandBiophysicalResearchCommunicationsBBRC印象里好像看过介绍这个期刊的文章，特点就是审稿快，4区，3年平均影响因子2

小明的数据分析笔记本·2023-09-22 05:25

宏病毒组学 | 人体肠道病毒组学

这些病毒以DNA病毒为主，伴有少数RNA病毒。噬菌体、真核病毒和植物源病毒与共生细菌和肠道屏障相互作用，促进肠道健康所必需的重要功能(图1)。

E_GENE·2023-09-22 01:44

CASP15比赛的新出的相关任务内容

在CASP15中，引入了四种新的预测类别：RNA结构、配体-蛋白复合物、低聚结构及其界面的准确性，以及备选构象的集合。本文列出了这些类别的技术规范，并描述了它们在CASP数据管理系统中

DrugPython·2023-09-21 23:49

RFect siRNA转染试剂

RFect可用来转染siRNA、antisenseRNA、microRNA等200bp以内的小分子RNA和DNA。

别踩我的菜·2023-09-21 22:26

2022-03-28

NatBiotech|RNA碱基编辑的临床前概念验证原创图灵基因图灵基因2022-03-2807:03收录于话题#前沿分子生物学技术WaveLifeSciences的研究人员已经发布了积极的临床前概念验证数据

图灵基因·2023-09-21 15:11

RT-PCR、QPCR、Real-time PCR、Real-time RT-PCR 你真的区分的开吗？

在RT-PCR中，一条RNA链被逆转录成为互补DNA，再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。那什么是qPCR、Real-time-PCR？其实Rea-time-PCR和

济南赛傲·2023-09-21 05:18

认知心理学

病毒是由一个核酸分子（DNA或RNA）与蛋白质构成的非细胞形态，是一种介于生命体及非生命体之间的有机物种。

黑色玫瑰d·2023-09-21 02:46

【陈巍学基因-3】small RNA-seq

MicroRNA参与许多的生命调节过程，是近十年来的一个研究重点。这次介绍：1.smallRNA建库测序方法2.smallRNA的生物信息学分析表达量差异分析聚类分析靶基因的GeneOntology分析(GO分析)靶基因的KEGGPathway分析3.血清、血浆microRNA测序意义样本准备视频时长11分钟，建议在Wifi条件下观看：视频地址：https://v.qq.com/x/page/l0

oddxix·2023-09-20 14:08

RNAseq教程（3.1）

IntroductiontoRNAsequencingInstallationReferenceGenomesAnnotationsIndexingRNA-seqDataPre-AlignmentQC2.Module2-RNA-seqAlignmentandVisualizationAdapterTrimAlignmentIGVAlignmentVisualizationA

周小钊·2023-09-20 14:08

2021-06-17

结合GSEA，解释permutationtest：首先，有两种phenotype（treat和control）的RNA-seq的结果，即每个基因在这两种phenotype中的表达量。

孟婆给咱来碗汤_cc67·2023-09-20 05:26

代码分析 | 单细胞转录组clustering详解

聚类可视化NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞

生信宝典·2023-09-20 04:14

单细胞转录组在心血管系统发育、疾病与医学中的研究

需要一步一步去咀嚼，不要在头脑中模棱两可Single-cellRNAsequencingincardiovasculardevelopment,diseaseandmedicine导读：在过去的10年里，单细胞RNA

不如好好学生信吧·2023-09-20 03:27

Pr和Ae学哪个好?

Pr是横编软件，主要针对视频做编辑合成，着重于画面剪接，基础风格调色，加字幕，配音，初级特效。一般用于多段视频和音频的复合编辑。Ae，则是一个特效合成软件。

圈点摄影·2023-09-19 20:05

（2）10X单细胞聚类

image.pnglibrary(Seurat)library(ggplot2)library(dplyr)options(stringsAsFactors=F)##第1步：读入表达矩阵data=250&nFeature_RNA

呆呱呱·2023-09-19 10:34

2020疫情之下的人生思考（1）

2019年的农历春节令人难忘，可以说人生当中唯一的春节发生了，人类被一个单链体RNA，还不算是细胞的东东搞得全国轰动，让我得以认真地思考2020这个世界末日之下作为人类存在的意义是什么？

张程_ec27·2023-09-19 03:45

外泌体该如何提取

BIOG产品特点◎操作简便快速，可在半小时内获得理想的RNA；◎提取RNA纯度高，无抑制剂，A260/A280为1.8-2.0；◎产量更高，较国内同类产品高出20%；◎可用于小量（200μL）血清、血浆

清风拂面vv·2023-09-19 00:56

一篇综述搞懂m6A、非编码RNA、肿瘤干性调控关系

Theinterplaybetweenm6AmodificationandnoncodingRNAincancerstemnessmodulation:mechanisms,signalingpathways,andclinicalimplicationsm6A修饰和非编码RNA

概普生信·2023-09-18 15:53

易基因：MeRIP-seq等揭示mRNA m6A甲基化调控拟南芥的抗寒性分子机制｜植物抗逆

在转录后水平上，这些冷应激应答转录本经历可变剪接、microRNA介导的调控和可变多腺苷酸化等。

易基因科技·2023-09-18 14:36

易基因： WGBS等揭示DNA甲基化调控林地草莓植株高度和果实大小的分子机制｜植物发育

RNA介导的DNA甲基化(RNA-directedDNAmethylation，RdDM)通路调控植物中所有三种序列背景下的novoDNA甲基化。RdDM通路非常复杂，由许多蛋白质和非编码RNA组成。

易基因科技·2023-09-18 14:36

TBtools的开发只是为了赶课题(一)

启动基金的支持和广东省教育厅的创新团队项目的支持，课题组成员，HR编辑以及匿名审稿人在文章整理过程中提出的宝贵建议高大上又接地气的HorticultueResearch微信公众号，已经推了一文，即《华南农大青年千人夏瑞课题组概述了园艺作物小分子RNA

生信石头·2023-09-18 10:39

表观遗传学-siRNA与miRNA介导的调控

一、TraditionalRNAsimage.png二、非编码RNA（调控作用）1、InterferenceRNA(RNAi)2、ShortinterferingRNA(siRNA)3、MicroRNA

Zhigang_Han·2023-09-18 08:20

单细胞测序的纯生信套路

单细胞RNA测序揭示细菌性肺炎继发脓毒症发病机制中的免疫细胞功能障碍背景知识：在脓毒症期间，宿主对感染病原体的免疫反应失调会导致器官功能障碍。

概普生信·2023-09-18 06:26

《人类》——关于幸福

纪录片中，受访者只站在纯黑色的背景中细诉自己的故事，没有花巧的剪接，甚至不多赘述受访者的身份。每个人自身的经历，足以为

开心panda·2023-09-17 11:13

m6A都有哪些相关验证实验？来看一下吧

嘉因小助手·2023-09-17 09:25

单细胞分析实录(11): inferCNV的基本用法

InferCNV可以用于肿瘤单细胞RNA-Seq数据中鉴定大规模染色体拷贝数变异，例如整个染色体或大片段染色体的扩增或缺失。

TOP生物信息·2023-09-17 08:29

单细胞教程04-09

发了几次总是被锁定，哎，再发一次吧04单细胞测序质量控制https://mp.weixin.qq.com/s/Q8TtPfELASf0E5u2WsXg0g05单细胞RNA-seq：归一化和PCA理论https

土豆学生信·2023-09-17 03:18

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