TransUnet

医学类 使用TransUNet、UNet、DeepLabV3+、HRNet、PSPNet 模型对息肉分割数据集进行训练、评估和可视化 EDD2020息肉数据集分割数据集

息肉数据集/息肉瘤分割项目解决（已处理好:EDD2020数据集(EndoscopyDiseaseDetectionandSegmentationChallenge)该息肉分割数据集主要包含人体生长的（肠胃）息肉用于器官内部息肉瘤分割，息肉目标检测，息肉定位任务息肉分割是一个重要的医学影像分析任务，特别是在内窥镜检查中。EDD2020数据集是一个很好的起点。我们将使用几种流行的深度学习模型（如Tra
计算机C9硕士_算法工程师·2025-01-26 07:56

【代码复现】TransUNet代码实现流程

文章目录一.classVisionTransformer()1.self.transformer()1.1.self.embeddings()1.1.1.self.hybrid_model()1.1.(2)1.(2)1.2.self.encoder()1.2.1.classBlock()1.2.1.1.self.attn(x)1.2.1.(2)1.2.1.2.self.ffn(x)1.2.1.(3
Cpdr·2024-01-19 14:47

Da-transunet:将空间和通道双重关注与Transformer u-net相结合用于医学图像分割

DA-TRANSUNET:INTEGRATINGSPATIALANDCHANNELDUALATTENTIONWITHTRANSFORMERU-NETFORMEDICALIMAGESEGMENTATION1
毕竟是shy哥·2023-11-28 22:19

transformer入坑指南

免责声明:1\此方法仅提供参考2\搬了其他博主的操作方法,以贴上路径.3*场景一:Attentionisallyouneed场景二:VIT场景三:Swinv1场景四:Swinv2场景五:SETR场景六:TransUNet
weeksooo·2023-10-30 22:16

【知识链接】WGAN Transformer Vit Swin-Transformer Swin-Unet Res-Vit TransUNet MAE Bra ADDA

WassersteinganTransformerVITResvitResidualvisiontransformersformulti-modalmedicalimagesynthesis（TMI2022)TransUNet
求求你来BUG行不行·2023-09-29 13:58

UNext：基于 MLP 的快速医学图像分割网络

TokenizedMLPStage实验1.对比实验2.消融实验2.1模块的消融实验2.2通道数的探索可借鉴参考会议分析期刊（会议）名：MICCAI2022会议信息：属于顶会了有代码：UNxet摘要UNet及其最新扩展（如TransUNet
Philo`·2023-09-15 17:46

TransUNet：用于医学图像分割的Transformers强大编码器

TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentation这个作者也公布了源码。感兴趣的人可以去关注一下。
skyfengye·2023-08-13 09:35

二十五章：TransUNet：Transformer为医学图像分割提供强大的编码器

0.摘要医学图像分割是发展医疗系统的重要先决条件，特别是对于疾病诊断和治疗计划。在各种医学图像分割任务中，U型架构，也称为U-Net，已成为事实上的标准，并取得了巨大的成功。然而，由于卷积操作的固有局部性，U-Net在明确建模长距离依赖性方面通常存在局限性。Transformer是为序列到序列预测而设计的，具有固有的全局自注意机制，但由于缺乏低级细节，可能导致定位能力有限。在本文中，我们提出了Tr
Joney Feng·2023-07-24 18:39

pip install requirements.txt 的安装方法

首先，我们要cd到包含requirements.txt的文件夹中，然后使用pipinstall-r命令第一步cd到文件夹cd/home/stu/zy/TransUNet-main第二步输入以下命令pipinstall-rrequirements.txt
波尔德·2023-07-16 18:30

【解决】ValueError: Axes=(0, 1) out of range for array of ndim=0.

TransUnet训练自己制作自己的数据集时遇到报错遇到报错：File"/home/zafu/XD/M-UNET/TransUNet-main/datasets/dataset_synapse.py",
九磅十五便士丶·2023-06-17 15:23

MedSegDiff-V2

transformer的conditionalUNet框架一种新的Spectrum-SpaceTransformer(SSFormer)来建模噪声和语义特征之间的交互引言将基于transformer的UNet(如TransUNet
松下直子·2023-04-05 16:35

Pytorch计算模型的参数量

比如说我计算TransUNet（Transformer+UNet）的参数量（计算之前需要安装thop库pipinstallthop）fromthopimportprofile,clever_formatflops
这就是算法·2023-03-21 17:21

论文解读《TransUNet: Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation》

论文解读《TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentation》TransUNet:用于医学图像分割的变压器强编码器发表期刊
渔歌畅晚·2023-02-01 20:16

transUnet

TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentation.背景：医学图像分割是开发医疗保健系统(尤其是疾病诊断和治疗计划)的必要前提
Miss.至·2023-02-01 20:45

TransUNet：使用自己的数据集完成训练后进行测试

训练完成后，会保存模型，会显示权重保存的路径snapshot_path1.修改test.py文件，需要与train.py中设置参数保持一致test_save_dir为测试结果的路径同样的与train.py中相同，配置自己数据集的相关信息接着添加一下权重路径2.修改utils.py中的test_single_volume函数，可以根据自己的分割类别修改，自定义不同颜色所代表的分割种类deftest_
真憨假憨xzh·2023-02-01 20:41

TransUnet训练自己的数据集

github的源代码https://github.com/Beckschen/TransUNet一.先对自己的数据集进行处理1.原始数据集如下图所示分images和labels，若数据集是png/jpg
真憨假憨xzh·2023-02-01 20:36

运行TransUnet踩坑记录

运行TransUnet踩坑记录数据集制作问题在运行train.py过程中遇到的问题数据集制作问题数据集制作要用到一些*.py文件，基本参照这篇博主的记录，就能制作自己的https://blog.csdn.net
Ponylamb·2023-01-29 19:44

KeyError: ‘Transformer/...query\\kernel is not a file in the archive‘(已解决)

最近在研究Transformer在医疗图像分割的应用，解决TransUNet和SwimUnet源码的坑KeyError:'Transformer/encoderblock_0/MultiHeadDotProductAttention
astro35·2023-01-27 10:05

Transformer前沿——语义分割

RethinkingSemanticSegmentationfromaSequence-to-SequencePerspectivewithTransformers（CVPR2021）网络结构图实验效果ADE20K数据集上效果PascalVoc数据集上的效果TransUNet
深读·2023-01-04 19:14

transformer进行医学图像分割文章

Transformersfor3DMedicalImageSegmentationSwin-unet：用于医学图像分割的类UNET纯transformerTransBTS：基于transformer的多模式脑肿瘤分割TransUNet
空想AI主义者·2023-01-01 14:58

论文：DS-TransUNet 医学图像分割

DS-TransUNet:DualSwinTransformerU-NetforMedicalImageSegmentation论文：https://arxiv.org/abs/2106.06716SwinTransformer
cztAI·2023-01-01 14:51

DS Transunet：用于医学图像分割的双Swin-Transformer U-Net

得益于深度学习的发展，医学图像自动分割技术取得了长足的进步。然而，现有的大多数方法都是基于卷积神经网络（CNN），由于卷积运算中感受野的限制，无法建立长期依赖关系和全局上下文连接。受Transformer成功的启发，一些研究人员花费了大量精力设计基于Transformer的U-Net的健壮变体，Transformer的自我注意机制具有强大的建模远程上下文信息的能力。此外，视觉转换器中使用的面片分割
@@南风·2023-01-01 14:20

TransUNet实现多波段影像语义分割

首先修改网络输入的通道数量vit_seg_modeling_resnet_skip.py，将网络输入的通道数由3改成4。修改数据加载代码dataset_synapse.py，定义一个多波段影像读取函数，并将像素值inf替换为1，若不替换会导致后续训练出现损失为nan的情况。最后修改预测代码test.py，同样修改为能够加载多波段影像。
Xcs_h·2022-12-29 16:22

TransUnet Synapse 数据集共享

这是TransUNet需要用到的Synapse数据集（共6G左右），对应的论文是TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentation有需要的朋友可以点击百度网盘连接下载
波尔德·2022-12-19 13:26

【一、整理-加上数据图片】MT-Unet模型的复现使用【个人记录学习】

、复现MT-UNet1.思路：先复现MT-UNet-main，再用我们的数据集跑2.代码中有ACDCdataset数据，但我们要跑Synapsedataset.3.找dataset数据：根据作者提示去TransUnet
OWN CODE WORLD·2022-12-19 13:18

医学图像分割框架

GitHub-YtongXie/CoTr:[MICCAI2021]CoTr:EfficientlyBridgingCNNandTransformerfor3DMedicalImageSegmentation2、TransUNet
c_daofeng·2022-12-18 07:43

Medical image segmentation

Transformersfor3DMedicalImageSegmentationSwin-unet：用于医学图像分割的类UNET纯transformerTransBTS：基于transformer的多模式脑肿瘤分割TransUNet
Fiona_12·2022-12-07 13:48

关于Resize()和RandSpatialCropd()

用随机裁剪RandSpatialCropd(keys=[“image”,“label”],roi_size=(224,224),random_size=False),成224X224会报错(网络用的是TransUnet
海洋大盗·2022-12-06 14:18

TransUNet

TransUnet:Transformers和Unet的强强联合论文题目：TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentation
没拖拉机的斯基·2022-12-05 01:27

【图像分割】TransUNet学习笔记

论文名称：TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentation论文地址：https://arxiv.org/pdf/2102.04306
穆清plus·2022-12-05 01:25

TransUNet: Transformers Make StrongEncoders for Medical Image Segmentation文章详解(结合代码)

1.摘要医学图像分割是开发医疗保健系统，特别是疾病诊断和治疗计划的必要前提。在各种医学图像分割任务中，U形架构（也称为U-Net）已成为事实上的标准，并取得了巨大的成功。然而，由于卷积运算的内在局部性，U-Net在显式建模长程依赖性方面通常表现出局限性。Transformer是为序列间预测而设计的，它已经成为具有天生的全局自我关注机制的替代架构，但由于低级细节不足，定位能力有限。在本文中，我们提出
Orange_sparkle·2022-12-05 01:54

【论文笔记】TransUNet: Transformers Make StrongEncoders for Medical Image Segmentation

声明不定期更新自己精度论文，通俗易懂，初级小白也可以理解涉及范围：深度学习方向，包括CV、NLP、DataFusion、DigitalTwin论文标题：TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentationTransUNet
来自γ星的赛亚人·2022-12-04 11:23

论文解析[8] TransUNet: Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation

发表时间：2021论文地址：https://arxiv.org/abs/2102.04306代码地址：https://github.com/Beckschen/TransUNet文章目录1摘要2相关工作
默_silence·2022-12-04 10:25

TransUnet官方代码训练自己数据集

文章目录遇到的bug修复1.缺失包遇到的bug修复1.缺失包Nomodulenamed‘ml_collections’pipinstallml_collectionsNomodulenamed‘tensorboardX’pipinstalltensorboardXNomodulenamed‘medpy’pipinstallmedpy
鱼与钰遇雨·2022-11-28 22:08

[MLP]UNeXt: MLP-based Rapid Medical Image Segmentation Network

AbstractSectionIIntroductionSectionIIUNeXTSectionIIIExperimentsandResultsSectionIVDiscussionSectionVConclusionfromJHUAbstractUNet及其Transformer版本-TransUNet
黄小米吖·2022-11-28 17:24

UNeXt: MLP-based Rapid Medical Image Segmentation Network

原文链接Abstract近年来，UNet及其最新扩展(如TransUNet)一直是领先的医学图像分割方法。但是，这些网络不能有效地用于护理应用中的快速图像分割，因为它们参数繁重，计算复杂且使用
Never_Jiao·2022-11-28 17:49

TransFuse：融合Transformers和CNN用于医学图像分割

我上一篇提到了一篇文章：TransUnet。这里另外一篇基于transformer的网络也出来了。比较出名，在这里推荐给大家。
skyfengye·2022-11-26 21:11

从rookie到基佬~008：Transformer

一天一个变弯小技巧今日份洗脑：TransformerCV计算机视觉语义分割结论：TransFuse、TransUNet、SETR一、TransFuse论文链接：https://arxiv.org/abs
清远隽永·2022-11-26 21:10

Github复现之TransUnet更新

上一篇关于TransUnet的GitHub复现，大家反映效果不好，调参也不好调，我把模型单独拿出来，放到另外一个框架，供大家参考学习（上一篇链接：https://blog.csdn.net/qq_20373723
普通网友·2022-11-24 13:59

Github复现之TransUNet之踩坑

Github复现之TransUNet代码复现TransUnet可以看这篇文章，博主写的还是很详细的。
带脑子的程序猿·2022-11-24 13:27

几种Transformer+CNN（U-net）网络

一.对比U-NetTransformer优点融合深层语义信息和高精度特征所含信息提取全局信息不足无法对距离较远的特征的上下文关系进行建模缺少局部细节处的信息二.网络1.TransUNet文章：TransUNet
Bright Guo·2022-11-21 17:37

TransUnet官方代码训练自己数据集&测试自己的数据集

流程参考：https://blog.csdn.net/qq_37652891/article/details/123465472https://blog.csdn.net/qq_37652891/article/details/123470578注意权重路径：
胖子工作室·2022-11-20 05:45

TransUNet

github：https://github.com/Beckschen/TransUNet论文：https://arxiv.org/abs/2102.04306TransU-net就是transformer
不秃头不成功·2022-11-20 05:45

TransUnet: 结构解析

github来源原文论文最近在学习TransUnet的算法，希望能应用到降雨预测中论文中本人认为没有对此结构进行非常清晰的解释，尤其是CNN代码块部分。
ripple970227·2022-11-20 05:10

TransUNet：Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation用于医疗图像分割的transformers编码器详解

原文地址：https://arxiv.org/pdf/2102.04306.pdf收录：CVPR2021代码:https://github.com/Beckschen/TransUNet首篇将transformers
山城火锅有点甜·2022-11-20 05:08

TransUNet：基于 Transformer 和 CNN 的混合编码网络

VisualTransformerAuthor：louwillMachineLearningLab在深度学习医学图像分割领域，UNet结构一直以来都牢牢占据着主导地位。自从2015年提出U形结构以来，后续在UNet基础上做出的魔改网络不可计数。Tranformer结构逐渐开始用于视觉领域之后，基于UNet和Tranformer结合的相关结构和研究逐渐兴起。UNet用了这么多年，效果好是毋庸置疑的。
louwill12·2022-11-20 05:06

Github复现之TransUNet（Transformer用于语义分割）

Transformer最近应该算是一个发文章的新扩展点了，下面给出了三个网络的结构分别是TransFuse，TransUNet，SETR。
如雾如电·2022-11-20 05:27

TransUNet论文笔记

TransUNet论文笔记TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentationAbstract医学图像分割是开发医疗保健系统
麻花地·2022-11-20 05:47

TransUNet：用于医学图像分割的Transformers强大编码器

TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmen
Amusi（CVer）·2022-11-20 05:15

医学图像分割2 TransUnet:Transformers Make Strong Encoders for Medical Image Segmentation

TransUnet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentation这篇文章中你可以找到一下内容：-Attention是怎么样在CNN中火起来的
yumaomi·2022-11-20 05:11
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