UpSetR

R语言学习case5：NC基于R语言的UpSetR

step1:安装库install.packages("UpSetR")step2:导入包library(UpSetR)step3：读取数据otu_RA0]0:这是一个逻辑条件，它生成一个与otu_RA相同大小的布尔型数据框或矩阵
早起CaiCai·2024-01-22 11:33

R包-VennDiagram韦恩图

如VennDiagram、Venn、UpSetR包等，也有一些在线画韦恩图网站。
新欣enjoy·2024-01-14 08:07

upset 绘制

好久没有更新,今天来一个upset图的绘制1.1安装包#绘制upset的包现在看来有三个##UpSet###最基本的upsetR包,使用方便,但是扩展不方便devtools::install_github
Aech·2023-12-24 03:21

R 数据可视化 —— 集合可视化 UpSetR

今天，我们要介绍的是，当集合数目较多时，该如何绘制我们将使用UpSetR包来绘制下面这种图该图由三个子图组成：表示交集大小的柱状图（上方）表示集合大小的条形图（下左）表示集合之间的交叠矩阵（下右），矩阵的列表示每种交集组合
名本无名·2023-10-15 05:05

ComplexHeatmap复杂热图绘制学习——8.upsetplot

通过R中的UpSetR包中实现。在这里，我们使用ComplexHeatmap包重新实现了UpSet图，并进行了一些改进。
denghb001·2023-09-29 22:16

R语言实现高级的韦恩图可视化（UpSetR）

hello,大家好，不知道下面这张图大家还有印象么图片.png在我之前分享的文章10X单细胞（10X空间转录组）之细胞通讯软件之间的分析比较中，大量采用这样的图进行展示，后来呢，在文章文章中的哑铃图复现（基础知识）尝试完全实现，可惜半路停止，今天就给大家展示如何实现这样的图，不带一点折扣。其实这个图有个专业的名词，叫韦恩图，但是大家熟悉的韦恩图应该是长下面的样子：图片.png少量的情况下非常美观，
单细胞空间交响乐·2023-09-21 01:33

用R绘制五元的Upset图和Venn图并绘制文本表

图VennplotupsetRTexttable代码library(biomaRt)ensembl0.05,]#画UpsetR/venn#install.packages("UpSetR")library
547可是贼帅的547·2023-08-23 18:10

ChIPseeker的upsetplot是怎么写的

在距今2年前的一个日子里，我写了一篇关于upsetR的简单教程。两年过去了，这篇教程是百度搜索的第一位。在这篇教程中，我定了一个计划下一期写一篇Y叔的upsetplot是如何写的。
xuzhougeng·2023-08-22 17:54

使用UpsetR对orthofinder结果可视化

0.9.14.115(降级到0.9)首先找到Results_XX/Orthogroups/Orthogroups.GeneCount.tsv这个文件，它记录着每个orthogroup在各个物种的基因数，由于UpsetR
王梓维·2023-07-18 09:37

进阶版Venn plot：Upset plot入门实战代码详解——UpSetR包介绍

网上已有一些帖子讲解了Upsetplot的背景知识和实现方法，本文旨在从实战角度出发，解读Upsetplot实现的一些途径及其优劣势以及如何通过upsetR包实现Upsetplot的绘制，并提供代码和input
ntuYision·2022-11-25 15:42

R语言绘图包08--森林图的绘制：forestplot

语言绘图包04--GOplot：富集分析结果可视化R语言绘图包05--韦恩图的绘制：ggvenn和VennDiagramR语言绘图包06--基因表达相关性绘图corrplotR语言绘图包07--多集合可视化UpSetR1
Hayley笔记·2022-09-29 14:02

利用UpsetR画图

UpsetR完美地解决了这一问题，简单好用清晰易懂，这里只介绍我比较常用的参数，做个记录，供大家参考。
队长的笔记本·2022-07-23 14:29

R语言绘图包07--多集合可视化UpSetR

R语言绘图包系列：R语言绘图包01--优秀的拼图包patchworkR语言绘图包02--热图pheatmapR语言绘图包03--火山图EnhancedVolcanoR语言绘图包04--GOplot：富集分析结果可视化R语言绘图包05--韦恩图的绘制：ggvenn和VennDiagramR语言绘图包06--基因表达相关性绘图corrplot一般在对数据取交集的时候，通常使用韦恩图。但韦恩图的可视范围
Hayley笔记·2022-07-01 10:20

R语言UpSet包实现集合可视化示例详解

目录前言一、R包及数据二、upset()函数1）基本参数2）queries参数3）attribute.plots参数3.1添加柱形图和散点图3.2添加箱线图3.3添加密度曲线图前言介绍一个R包UpSetR
·2022-06-24 10:30

UpSetR

R语言：排序、筛选以及分类汇总操作https://blog.csdn.net/weixin_40628687/article/details/79381882利用cutree划分pheatmap聚类结果https://cloud.tencent.com/developer/article/1677013获取pheatmap聚类后和标准化后的结果https://blog.csdn.net/qazpl
大胆冒险实践者·2021-11-23 21:09

R语言可视化（十）：集合图绘制

10.UpSet集合图绘制清除当前环境中的变量rm(list=ls())设置工作目录setwd("C:/Users/Dell/Desktop/R_Plots/10upset/")使用UpSetR包绘制集合图
Davey1220·2020-09-15 11:03

R语言之可视化④韦恩图upsetR

目录R语言之可视化①误差棒R语言之可视化②点图R语言之可视化③点图续R语言之可视化④点韦恩图upsetRR语言之可视化⑤R图形系统R语言之可视化⑥R图形系统续======================================Python数据处理从零开始----第四章（可视化）（5）（韦恩图）======================================个人感想：建议还是用R
柳叶刀与小鼠标·2020-07-01 08:41

使用ggupset画韦恩图

为了解决过多的数据集合造成的信息混乱问题，UpsetR包应运而生完美解决了这个问题，这个包的使用教程网上也比较多。今天看见Y叔推荐了ggplot2风格的upsetplot——
你猜我菜不菜·2020-02-09 00:54

【生信技能树】2020-01-19作业：GSE103115 - task1

这里给大家学徒作业，做这8次差异分析，拿到上下调基因，然后上下调基因分开，绘制upsetR这个高级韦
猫叽先森·2020-01-21 02:53

UpSetR：集合可视化神包

还好R语言里新增了一个集合可视化神包--UpSetR。它可视化的结果的基础版本长下面这个样子：UpSe
徐洲更hoptop·2019-11-04 22:45
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