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ggraph
7.ggplot2——网络图
可以通过使用
ggraph
进行网络可视化。具有相同功能的其他软件包有:geomnet、ggnetwork和GGally,他们都用于常规网络图,以及ggtree和ggdendro专门用于
denghb001
·
2023-12-23 00:12
生物信息学R分析工具包ggkegg的详细使用方法
ggkegg是从KEGG获取信息并使用ggplot2和
ggraph
进行解析、分析和可视化的工具包,结合其他使用KEGG进行生物功能研究的软件包。该工具旨在利用图形语法来可视化KEGG的复杂组件。
小果运维
·
2023-12-20 14:22
生信分析-bioinfo
R
r语言
开发语言
ggkegg
R 数据可视化 ——
ggraph
图形创建与布局
接下来我们要介绍的是
ggraph
包的使用通常,
ggraph
会和tidygraph一起搭配使用,这两个包都是ThomasLinPedersen写的。
名本无名
·
2023-11-20 17:55
相关性网络图 |显著性标记
1安装和加载相关的R包library(
ggraph
)library(tidygraph)#install.packages("devtools")#devtools::install_github("Hy4m
小杜的生信筆記
·
2023-10-31 20:38
R语言精美图形绘制教程
数据库
开发语言
信息可视化
学习
组学
数据分析
R语言
相关性网络图 | 热图中添加显著性
1安装和加载相关的R包library(
ggraph
)library(tidygraph)#install.packages("devtools")#devtools::install_github("Hy4m
小杜的生信筆記
·
2023-10-31 20:34
R语言精美图形绘制教程
数据库
开发语言
信息可视化
学习
R语言
数据分析
cannot coerce class ‘“igraph“’ to a data.frame
报错代码:
ggraph
(g,"manual",x=V(g)$x,y=V(g)$y)+geom_edge_link0()+geom_scatterpie(cols=c("A","B","C"),data=
今天也是个妖精头子呀
·
2023-10-21 18:44
软件安装经验及报错集锦
css
html5
前端
ggkegg | 用这个神包玩转kegg数据库吧!~(一)
2用到的包rm(list=ls())library(ggkegg)library(ggfx)library(
ggraph
)library(igraph)library(clusterProfiler)libr
生信漫卷
·
2023-10-07 23:53
后端
ggraph
优雅的绘制环状网络图
欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何使用
ggraph
绘制圆形网络图,这里使用了一个R包ccgraph,各位观众老爷细细体会,下面通过一个小例子来进行展示加载R包library(tidygraph)library
R语言数据分析指南
·
2023-09-20 07:40
Dendrogram | 今天是人见人爱、花见花开的环形Dendrogram!~(附完整代码)
~2用到的包rm(list=ls())library(
ggraph
)library(igraph)library(tidyverse)library(RColorBrewer
生信漫卷
·
2023-08-17 16:55
后端
《权力的游戏》关系网络分析——基于 tidygraph 和
ggraph
!本文摘自Shirin'splaygRound!本文仅为自译转载,任何观点都不代表个人观点!不久之前,我曾经做过一个关于冰与火之歌人物关系的图谱分析。在这个分析中,我发现史塔克家族(尤其是Ned和三傻[皮一下很开心])和兰尼斯特家族(尤其是Tyrion),是权利的游戏中,最主要的家族连接点。他们连接着很多故事线,也是整个故事的中心点。在之前的PO文中,我使用了igraphl来描绘和计算关系矩阵。但
混吃等死MrYao
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2023-07-31 19:19
R 数据可视化 ——
ggraph
边与节点
前言将网络图结构与我们平常绘制的数据图进行对比,我们可以发现,图的布局就相当于每个数据点的坐标,而节点就相当于数据点,边就是连接数据点的几何图形,可以是直线、曲线或带箭头的线等。所以,不同的节点形状和不同的边形状进行组合,就绘制出了上节我们展示的各式各样的图形。下面,我们要介绍节点与边的相关操作,图结构如下edges%mutate(corr=sample(-1:1,size=n(),replace
名本无名
·
2023-07-28 04:08
[包]
ggraph
主要是整理官方文件,供自己理解https://
ggraph
.data-imaginist.com/articles/Edges.html提供给
ggraph
的数据有两个表,分别是nodes和edges,tidygraph
JamesMori
·
2023-07-20 17:52
ggraph
做环形网络互作图---一个简单的例子
之前我们写过很多精彩的网络图帖子:❝graph包:圆状网络图的绘制|互作网络图|基因通路网络图新方法---大型网络图绘制---
ggraph
包学做NAR图表:
ggraph
做网络图复现《Cellstemcell
TS的美梦
·
2023-07-19 16:19
互作
网络图
ggraph
【R】微生物网络构建简单方法汇总
偶然发现一本书:里面刚好有微生物网络分析的内容,我就当个搬运工把代码整理了一下(注:书籍和示例数据在公众号PLANTOMIX后台回复“微生物组分析”即可获取下载链接噢):library(
ggraph
)library
研究僧小蓝哥
·
2023-04-06 13:32
ggraph
学习
graph_from_data_frame(d,directed=TRUE,vertices=NULL)directed:whetherornottocreateadirectedgraph;转化之后的结果mygraph<-graph_from_data_frame(connect,vertices=coauth,directed=FALSE)mygraph<-graph_from_data_fr
MJades
·
2023-02-01 10:31
微生物共现网络可视化:实现布局自由
ggraph
包常用于网络数据可视化,其语法特征与ggplot2相同,我们很容易将ggplot2的知识扩展到
ggraph
上。
道阻且长1994
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2022-12-20 07:09
微生物共现网络构建及分析
r语言
微生物生态学
可视化
共现网络
学做NAR图表:
ggraph
做网络图
最近在NAR上看到一篇文章:image.png原文网络图如下:image.png我们借此机会,通过
ggraph
作图解析相关参数。详细注释代码和参数已上传QQ群文件!
KS科研分享与服务
·
2022-10-31 11:04
跟着Nature microbiology学画图~R语言ggplot2画网络图的一个简单小例子
期刊是Naturemicrobiologyimage.pngimage.png之前分享过两篇使用R语言的
ggraph
包画网络图的推文超链接但是今天这个论文里的网络图是两个两个圆形的布局,这个用
小明的数据分析笔记本
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2021-04-13 10:17
javascript框架集结
图形框架1.
ggraph
-图形可视化的凌乱数据。这是一个建立在D3之上的库,目的是改进我们如何处理大型和凌乱的图形。它扩展了节点和链路与节点组的概念。
wangjing_dc
·
2020-07-28 16:12
三种可视化方法,手把手教你用R绘制地图网络图!
下面这篇博客将使用R中的igraph、ggplot2或
ggraph
包来介绍三种在地图上可视化网络图的方法。在对地理位置以及位置的连接关系进行可视化时,还可以在图中展示一些属性。
weixin_34214500
·
2020-07-12 09:51
手把手重现Science的主图Maptree
文章目录手把手重现Science的主图-Maptree写在前面输入文件开始运行初步绘制maptree图形按照物种分类信息上色按照OTU差异进行上色补充一:
ggraph
版本的物种分类树猜你喜欢写在后面手把手重现
刘永鑫Adam
·
2020-07-06 07:22
R
总结一些JavaScript开发的著名开源项目
ggraph
-图形可视化的凌乱数据这是一个建立在D3之上的库,目的是改进我们如何处理大型和凌乱的图形。它扩展了节点和链路与节点组的概念。它非常适用于当多个节点事实上是同一事物或属于同一组时。
dj0379
·
2020-06-23 04:47
Js/H5/Hybrid
三种可视化方法,手把手教你用R绘制地图网络图!
下面这篇博客将使用R中的igraph、ggplot2或
ggraph
包来介绍三种在地图上可视化网络图的方法。在对地理位置以及位置的连接关系进行可视化时,还可以在图中展示一些属性。
大数据文摘
·
2020-02-15 03:38
Laya FairyGui系列二 GObject GComponent
GComponent,GImage,
GGraph
等都继承自GObject。但GObject虽是FGUI的组件基类,但是FGUI的所有组件还是在Laya的基础上进行封装的。
s0ok
·
2020-01-06 08:34
TidyTuesday 可视化学习之 网络图( igraph 和
ggraph
) 绘制
emmm,后面要好好学习一下igraph和
ggraph
的骚操作,虽然图出来了,但是可视化那部分我暂时还是没看懂。所以这里就只是学习了数据清洗操作。
二货潜
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2020-01-03 13:32
Laya FairyGui系列五 GImage
GGraph
图形(
GGraph
)编辑器中使用图形点击侧工具栏中图形按钮即可创建图形,图形支持圆形,矩形,空白三种,空白不消耗任何显示资源,多用于占位。
s0ok
·
2019-12-20 14:47
北京地铁最短路径
站点名称是否为换乘站存储结构typedefstruct{charstation[N];intchange;}sta;typedefstruct{intweight;intL;}G;stavertex[NUM];
Ggraph
31701018王嵩
·
2019-10-15 01:00
汇总一些知名的 JavaScript 开发开源项目
(点击上方公众号,可快速关注)转自:CTOLib,www.ctolib.com/topics-107352.html如有好文章投稿,请点击→这里了解详情
ggraph
-图形可视化的凌乱数据这是一个建立在D3
前端大全
·
2017-10-27 00:00
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