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profiler
学习笔记 —— python代码耗时及内存占用测试方法 以及一些零碎的python小工具
这里写目录标题1、手写耗时测试2、开源工具2.1耗时测试cProfileSnakeVizline_
profiler
2.2内存占用测试memory_
profiler
mprofperf(onlyonLinux
昼行plus
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2023-03-31 06:03
HPC
python
学习
numpy
python实战应用讲解-【numpy科学计算】line_
profiler
模块(附python示例代码)
目录Numpy安装line_
profiler
准备工作具体步骤Numpy用line_
profiler
分析代码具体步骤攻略小结
格图素书
·
2023-03-31 01:04
python
numpy
开发语言
Adreno
Profiler
GPU frequency clocks per/second
I'mtryingtoprofileGPUusageduringruntime.IhadAdreno
Profiler
setup,openedagraph,draggedtwographmetrics("
hdanbang
·
2023-03-30 07:17
Andriod
OpenCL编程
gpu
Instrument API介绍
1.Instrumentation介绍 JVMTI(JVMToolInterface)是Java虚拟机所提供的native编程接口,是JVMPI(JavaVirtualMachine
Profiler
Interface
程序猿啊驼
·
2023-03-30 05:06
【J
Profiler
】idea整合J
Profiler
分析内存泄漏
而在idea中也有这么一个插件,就是J
Profiler
。idea插件安装打开idea,进入设置界面安装之后重启即可。安装成功后查看情况(多了一个图标)。
ooooooooooooooxiaosu
·
2023-03-29 05:28
Idea
jprofiler
intellij
idea
求助关于GO富集分析可视化代码问题
还有部分R包使用前再载入):library(dplyr)#数据清洗library(stringr)library(org.Hs.eg.db)#物种注释(Homosapiens)library(cluster
Profiler
weixin_55021421
·
2023-03-29 05:53
r语言
【R语言】——基因GO/KEGG富集分析!超级简单的保姆级教程!
本期介绍使用Rcluster
Profiler
包和RAnnotationHub包对基因进行GO/KEGG功能富集分析、OrgDb包制作以及结
在打豆豆的小潘学长
·
2023-03-29 05:22
功能富集分析
R语言
r语言
用R语言对基因进行KEGG分析(附详细代码)
Users/user/Desktop/结果文件/pathway/数据更新/gene.csv",header=TRUE)install.packages('R.utils')getOption("cluster
Profiler
.download.method
佛系盼毕业
·
2023-03-29 05:21
r语言
开发语言
cluster
profiler
包进行GO与KEGG富集分析
RNA-seq寻找到差异基因后,对比GO与KEGG库进行差异分析rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)DEG<-read.csv('./DEGs_filter.csv',header=T,row.names=1)gene<-DEG$Entrezidgenelist<-data.frame(DEG$Entrezid,DEG$log2FoldChange)he
twistti
·
2023-03-29 04:28
r语言
数据库
富集分析--R包--cluster
Profiler
下载安装与报错分析解决
生信分析中富集分析是必不可少的,最常见是调用cluster
Profiler
包进行分析。cluster
Profiler
包功能也比较强大,主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。
Tian問
·
2023-03-29 04:22
算法
r语言
生物信息学
关于KEGG报错找不到物种的解决办法
cluster
Profiler
包最近变得奇怪起来了,经常找不到物种从网上汇总了一下解决办法,就是修改cluster
Profiler
包里面下载数据库的option建明:library(R.utils)R.utils
咋回事儿啊?
·
2023-03-29 04:51
r语言
学习
cluster
Profiler
进行GSEA富集分析
不同于ORA富集分析(仅需要差异表达基因列表),GSEA富集分析需要基因排序列表(arankedlistofgenes),一般根据logFC对基因排序。1.载入包,读入数据rm(list=ls())setwd("your_dir")#readthefilemydata<-read.csv("your_diff_expr_file",row.names=1)head(mydata)#if(!requ
qq_27390023
·
2023-03-29 04:38
r语言
生物信息学
使用kegg数据库的一点见解
首先我看到y叔的cluster
profiler
这个包的源代码,因为这个包是普遍接受用来做富集分析的。enrichKEGG%gsu
Jorth_1
·
2023-03-29 04:02
数据库
sqlite
r语言
linux
学习方法
使用R语言包cluster
Profiler
做KEGG富集分析时出现的错误及解决方法
使用enrichKEGG做通路富集分析时,一直报错:显示Nogenecanbemapped....k<-enrichKEGG(gene=gene,organism="hsa",pvalueCutoff=1,qvalueCutoff=1)但是之前用同样的基因做分析是能够成功地富集到通路,即便是网上的数据会更新,也不可能变化的这么大吧,我换了一组基因,出现相同的问题。去B站视频教程的评论去找答案,发现
HJ_Tan
·
2023-03-29 03:59
随便写写
R语言
生物信息学
富集分析
KEGG
人工智能
提升Python代码性能的六个技巧
1、代码性能检测1.1、使用timeit库1.2、使用memory_
profiler
库1.3、使用line_
profiler
库2、使用内置函数和库3、使用内插字符串f-string4、使用列表推导式5、
哈桑c
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2023-03-28 22:32
Python自学记录
python
爬虫
算法
pycharm
开发语言
记一次内存泄露排查
安装j
profiler
,开启远程监控使用j
profiler
排查1安装j
profiler
1.1下载j
profiler
的windows版本,远程监控使用;下载地址:https://www.ej-technologies.com
橙子皮皮
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2023-03-28 14:01
技术积累
java
Unity
Profiler
调试手机,找不到设备
unity
profiler
面板链接不到设备的时候,可以通过adb来指定apk。cmd命令行中输入:adbforwardtcp:34999localabstract:Unity-包名
Jayden_JMN
·
2023-03-28 01:32
2021-03-07 cluster
Profiler
学习记录
cluster
Profiler
:universalenrichmenttoolforfunctionalandcomparativestudy(Y叔)1总览图片.png2介绍2.1术语2.1.1genesetsandpathwaygeneset
diyidaoguang
·
2023-03-27 12:26
探索 Android 网络优化方法
常见的网络测试工具有Network
Profiler
、Charles和Stetho。常见的线上网络监控方案有OkHttp的EventListener、NetworkStatsMa
灯不利多
·
2023-03-26 13:29
flutter release apk error :Execution failed for task ':app:lintVitalRelease'
问题Executionfailedfortask':app:lintVitalRelease'.Couldnotresolveallartifactsforconfiguration':app:
profileR
untimeClasspath
Android_开发工程师
·
2023-03-25 21:47
java火焰图工具
1下载编译async-
profiler
gitclonehttps://github.com/jvm-profiling-tools/async-
profiler
cdasync-
profiler
makeall2
薛云龙
·
2023-03-25 09:04
R语言:cluster
Profiler
进行GO富集分析和Gene_ID转换
一、读取文件,ID转换1.读取文件library(cluster
Profiler
)library(org.Hs.eg.db)#读取文件,原始文件中使用空格分割的go_ythdf2<-read.table
superqun
·
2023-03-25 05:19
鸿蒙系统Android手机使用
profiler
时app崩溃
Android手机更新到鸿蒙系统后,使用
profiler
时,app总是崩溃;试了许多方法,以下方法有效1.删除.Android目录WechatIMG7118.jpeg2.删除手机上data/local/
ksnowlv
·
2023-03-24 23:36
安卓知识总结---性能篇(启动优化)
一、怎么记录安卓app的启动速度1)Android
Profiler
,可以设置从启动开始监控,得到cpu内存等信息2)PerfettoUI,开发者模式新增加了一个“系统跟踪”的功能,只有安卓10可以用3)
扒蒜老妹哼哼
·
2023-03-23 07:50
Android Studio(IntellijIDEA) OkHttp
Profiler
plugin
关注我哦背景:用过IntellijIDEA的人应该都知道,有个插件可以查看网络请求相关的各种信息,而相对于App端来说,往往我们在开发过程中集成各种第三方日志输出来查看各种请求信息,本文将介绍一个OkHttp
Profiler
陈不2
·
2023-03-23 05:32
内存泄漏优化
分析工具:1MAT2AndroidStudioMemory-
profiler
https://developer.android.com/studio/profile/memory-
profiler
#performance3LeakCanaryhttps
我默默
·
2023-03-23 05:41
SQL Server 2008的日志跟踪利器- SQL trace
SQLtrace实际上就是没有图形界面操作的SQLServer
Profiler
,因为
Profiler
比较占用资源,不适合长时间的监听数据。
omage
·
2023-03-23 02:13
SQL
Server
程序防止SqlServer使用SqlServer
Profiler
跟踪
大体思路:1、使用默认函数(fn_trace_getinfo)查询跟踪列表;2、调用系统存储过程(sp_trace_setstatus)修改跟踪状态。相关Sql语句:declare@default_trace_idsql_variant--查询数据库默认跟踪idselect@default_trace_id=valuefromsys.configurationswhereconfiguration
某些人
·
2023-03-23 01:01
sql
sqlserver
跟踪
sqlprofiler
Matrix-TraceCanary 实际使用
前言:之前根据AndroidStudio
Profiler
查看卡顿问题已经解决了部分已知问题「即:有明确场景,进而暴露出来的问题」;不足的点是:问题暴露之前寻找卡顿的点,抓取的hprof文件操作复杂,寻找问题时效率较低
badmask
·
2023-03-22 06:20
simpleperf源码阅读-0.Python
简介SimplePref是AndroidNDK自带的
Profiler
工具,官方文档:https://developer.android.com/ndk/guides/simpleperfsimplepref
骆驼骑士
·
2023-03-21 22:58
Unity+Slua使用Lua
Profiler
进行真机调试
Lua
Profiler
项目的Github主页:Miku-Lua
Profiler
Readme中介绍了基本使用方法,这里介绍一下工具的简要原理和如何进行真机调试简要原理实现了一套对Lua的内存、函数耗时进行数据收集
长仙人
·
2023-03-21 12:03
Andoid性能分析-内存
应用的一些性能指标内存CPUGPU网络针对应用的性能的优化,AndroidStudio也在逐渐完善自己的性能分析工具-Android
Profiler
,除此之外还有eclipse提供的一个分析工具MAT,
那远远的云端
·
2023-03-20 17:24
转录因子富集分析
这里还是使用Y叔的R包“cluster
Profiler
”。首先我们要知道哪些基因是转录因子,并且属于哪一个转录因子家族。
Neal_Bio
·
2023-03-20 12:59
Android Profile CPU使用
简介AndroidProfileCPU是Androidstudio自带的一个功能,打开方式:View>ToolWindows>Android
Profiler
。
taoyyyy
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2023-03-20 08:28
cuda nvprof调试的metrics指标
nvprof:
Profiler
User'sGuide有关CUDAnvprof调试的metrics(指标)-fb_help的专栏-CSDN博客
上过小学的人
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2023-03-20 07:08
Kernel函数执行时间统计
通常有三种方式可以用于kernel函数的执行时间统计:-采用CPUTimer-采用GPUTimer,也就是CUDA提供的API-采用NVIDIA
Profiler
,一种是命令行工具nvprof,另一种是图形化界面的
dixiaochuan
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2023-03-19 15:51
Instruments性能检测
本文主要讲解到以下几种常用的检测工具:1、Time
Profiler
——检测CPU内存使用情况2、CoreAnimation——离屏渲染,图层混合等GPU耗时3、Leaks——检测内存的使用情况
走着走着就会敲代码了
·
2023-03-19 15:23
转录组不求人系列(十二): Cell文章最喜欢用的差异基因GO、KEGG富集分析工具
首先最常见的就是对上下调基因的富集分析了,富集分析我们之前出过一期R语言版本的:cluster
Profiler
:基因功能富集分析的惊喜之作这里就不再赘述了,我们介绍一款NCS文章比较喜欢的、出现率较高的功能富集工具
KS科研分享与服务
·
2023-03-19 01:07
JVM
Profiler
整体架构
开篇整个JVM
Profiler
的组件类似于上图,抽象出来主要分为:ClassFileTransformer:负责转换被监控方法的字节码,在前后增加耗时统计。
晴天哥_王志
·
2023-03-18 17:17
关于GSEA富集结果条目数一跑一变的迷思和恍然大悟
状况1:GSEA-GO同样的设定返回了不同的结果在做jimmy大神布置的作业:对比Gorilla,cluster
Profiler
,topGO三种工具作业做到GSEA法##clusterPro
美式永不加糖
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2023-03-16 13:45
mongodb--Profiling慢查询详解
官方查询地址:https://docs.mongodb.com/v3.2/tutorial/manage-the-database-
profiler
/在很多情况下,DBA都要对数据库的性能进行分析处理,
张冲andy
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2023-03-15 14:09
Mongo
Linux安装J
Profiler
11监控SpringBoot项目
1官网下载windows客户端和linuxserver端(https://www.ej-technologies.com/download/j
profiler
/files)J
profiler
官网下载2windows
张九戒
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2023-03-15 10:26
记一次基于Unity的
Profiler
性能分析
A.WaitForTargetFPS:Vsync(垂直同步)功能所,即显示当前帧的CPU等待时间B.Overhead:
Profiler
总体时间-所有单项的记录时间总和。
52031d47791e
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2023-03-13 18:20
使用 Android Studio
Profiler
工具解析应用的内存和 CPU 使用数据
为了帮助开发者开发出更加轻快高效的应用,我们在AndroidStudio3.0以及更高版本中加入了Android
Profiler
工具,用于应用的CPU、内存、网络和能耗分析。
谷歌开发者
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2023-03-12 09:39
matlab 判断整除函数_第三节 Matlab代码优化
然后用matlab工具
profiler
分析代码段中每一行的执行时间。假定待测定的代码段写
weixin_39928099
·
2023-03-12 07:14
matlab
判断整除函数
matlab
找到数组中第一个不连续点
matlab中sim函数
matlab怎么定义矩阵变量
y空间兑换代码
android studio
profiler
崩溃
删除测试手机/data/local/tmp/perfd文件夹重新启动就不会崩溃image.png
陈桐Caliburn
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2023-03-12 06:13
GoLand2019.1更新内容
带来了如下的新功能:支持Memory,CPU,Mutex,andBlock
profiler
sfile对于Test或者Benchmark,点击左侧小箭头可以发现,多了几个选项。
Leonard_Wang
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2023-03-12 04:43
环境配置问题 ImportError: cannot import name ‘trace‘ from ‘tensorflow.python.
profiler
‘
tf问题ImportError:cannotimportname'trace'from'tensorflow.python.
profiler
'原因:windowsconda安装tensorflow-estimator
time_thy
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2023-03-12 04:58
python基础
学习
Paddle模型性能分析工具
Profiler
定位瓶颈点优化程序详解
目录Paddle模型性能分析
Profiler
1.使用
Profiler
工具调试程序性能1.1使用cifar10数据集卷积神经网络进行图像分类1.1.1获取性能调试前模型正常运行的ips1.1.2.开启性能分析器
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2023-03-11 00:35
Unity
Profiler
连接网易(MuMu)模拟器 真机性能检测与调试
2)勾选DevelopBuild和Autoconnect
Profiler
选项。3)尽可能的使用BuildAndRun来启动。如果是IOS或者PC的话,手动的来初始化
Profiler
是比较简单的。
xzhuan
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2023-03-11 00:07
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