r语言随机森林

R语言学习笔记--列表list、数据框

列表1-列表列表可以包含不同类型的对象，也就是说，列表不是将某些具体的值组织起来，而是组织R对象。列表将数据组织在一个一维集合中。列表非常好用，因为它可以装任何类型的对象，不要求数据之间是同质的。创建列表list()>list1list1[[1]][1]100101102103104105106107108109110111112113114115116[18]117118119120121122
饮食有度的元气少女·2023-07-26 07:52

【R语言】factoextra生成发表级PCA主成分分析图（一）

前面给大家介绍过主成分分析☞R做PCA主成分分析今天我们来给大家介绍另一个做PCA分析并绘图的R包factoextra，很多SCI文章中都用到了这个R包。换句话说这个R包画出来的PCA图是发表级的。#首先我们需要安装下面这两个R包install.packages("factoextra")install.packages("FactoMineR")#加载这两个R包library(FactoMine
生信交流平台·2023-07-26 05:29

R语言Nomo图制作---DynNom以及shinyPredict

二元logistic-Nomo-lrm#数据准备-data5#install.packages("rms")rm(list=ls())library(survival)library(rms)library(dplyr)#mutate依赖环境library(magrittr)#%>%依赖setwd(
MRI_lab·2023-07-26 04:57

R语言--GBM-梯度提升机

##GBMset.seed(123)folds<-createFolds(y=data$Groups,k=5)#建一个放auc值的空向量auc<-as.numeric()Errorrate<-as.numeric()accuracy<-as.numeric
MRI_lab·2023-07-26 04:26

R语言--森林图制作

#数据准备-data5#install.packages("rmda")rm(list=ls())library(MASS)library(rmda)library(dplyr)#mutate依赖环境library(magrittr)#%>%依赖setwd("D:/R/nomo5new2")data
MRI_lab·2023-07-26 04:55

Startup Files代做、代写Computer Systems、代写c/c++程序设计、代做c++代做R语言程序|调试Matlab程

02/09/2019StartupFilesforWorkshopsandAssignments:ComputerSystems(2000_7081Combined)https://myuni.adelaide.edu.au/courses/44936/pages/startup-files-for-workshops-and-assignments1/2StartupFilesforWorksh
jy25407·2023-07-26 02:26

R语言学习笔记,（1）基础及向量操作

一、基础部分（持续更新）1、大小写明感2、source（“d:/test.R”）：可以执行对应目录下得test.R脚本。R中\符号为转义字符，所有目录中需使用/或者\\.。3、sink（“d:/out.txt”）：将后续的输出由终端转向一个外部文件，本例中为d;/out.txt。如果需要重新恢复到终端使用sink（）。4、print（x）：打印x值。5、注释只能使用#，单行注释，不支持多行注释。二
kgzhw·2023-07-26 00:02

R语言学习感悟

如同婴儿学步，看到了目标，要走到那一步却很难，看到别人一步一步抵达目标的线路，自己却走不通。或许，我们应该要保持婴儿的耐心。终会蹒跚行走。
神奇公子·2023-07-26 00:40

2020-03-11 方差分析

参考学习资料：《R语言实战（第二版）》第九章前面记录了通过量化的预测变量来预测量化的响应变量的回归模型。这部分内容能将名义型或有序型因子作为预测变量进行建模。
程凉皮儿·2023-07-25 21:20

R语言_seq()函数用法

前言：微博参与话题#给你四年时间你也学不会生信#————导师赠与之醒世名言SequenceGeneration:生成规律的序列。seq是一个带有默认方法的标准通用。seq.int是一种原始的东西，它可以快得多，但也有一些限制。seq_along和seq_len是两个常见情况的参数。使用方法：##DefaultS3method:seq(from=1,to=1,by=((to-from)/(lengt
谢俊飞·2023-07-25 20:50

Python基础教程:sklearn机器学习入门

Scikit-Learn支持多种常见的机器学习算法，如线性回归、逻辑回归、决策树、支持向量机、随机森林、K近邻、聚
Rocky006·2023-07-25 17:12

数据文件智能读取: R语言vroom包

最近折腾Shiny的时候接触到了一款非常好用的数据读取包。写一下备忘录。1.自动识别分隔文件vroom有自动识别文件格式功能，所以不管是csv，还是tsv文件都只需要同一个读取指令vroom(”xxx.csv”)就可以。library(vroom)dataObservations:336,776#>Variables:19#>chr[4]:carrier,tailnum,origin,dest#>
Jason数据分析生信教室·2023-07-25 14:48

R语言中运用rio包轻松读入/输出xlsx、csv、txt文件

R语言中读取xls文件比较麻烦，但是发现rio包能轻松解决这一问题，记录一下。
队长的笔记本·2023-07-25 12:36

最新基于Citespace、vosviewer、R语言文献计量学可视化分析技术及全流程文献可视化SCI论文高效写作方法

目录专题一文献计量学方法与应用简介专题二主题确定、检索与数据采集专题三VOSviewer可视化绘图精讲专题四Citespace可视化绘图精讲专题五R语言文献计量学绘图分析专题六论文写作专题七论文投稿文献计量学是指用数学和统计学的方法
WangYan2022·2023-07-25 12:04

SCI论文高效写作方法教程

详情点击链接：于Citespace、vosviewer、R语言的文献计量学可视化分析技术及全流程文献可视化SCI论文高效写作方法一，文献计量学方法1.文献计量学方法2.与其他综述方法区别联系3.各学科领域应用趋势近况
慢腾腾的小蜗牛·2023-07-25 12:55

R语言运行效率分析_小结（6）

小结（6）本节把前面所有数据综合起来进行分析。1000
灭绝老衲·2023-07-25 09:10

区间预测 | MATLAB实现QRFR随机森林分位数回归多输入单输出区间预测

区间预测|MATLAB实现QRFR随机森林分位数回归多输入单输出区间预测目录区间预测|MATLAB实现QRFR随机森林分位数回归多输入单输出区间预测效果一览基本介绍模型描述程序设计参考资料效果一览基本介绍
机器学习之心·2023-07-25 08:21

区间预测 | MATLAB实现基于QRF随机森林分位数回归时间序列区间预测模型

区间预测|MATLAB实现基于QRF随机森林分位数回归时间序列区间预测模型目录区间预测|MATLAB实现基于QRF随机森林分位数回归时间序列区间预测模型效果一览基本介绍程序设计参考资料效果一览基本介绍1
机器学习之心·2023-07-25 08:21

基于R语言的水文、水环境模型优化技术及快速率定方法与多模型案例实践

目录专题一、最速上升法、岭分析以及响应曲面模型专题二、Kriging插值与优化方法专题三、启发式算法专题四、采样方法专题五、高斯过程回归专题六、基于模型的高斯过程/贝叶斯优化设计专题七、最优化的快速化专题八、高级高斯过程模型专题九、异方差性专题十、综合案例更多推荐在水利、环境、生态、机械以及航天等领域中，数学模型已经成为一种常用的技术手段。同时，为了提高模型的性能，减小模型误用带来的风险；模型的优
小艳加油·2023-07-25 08:29

R语言手动安装包

包安装问题解决方案1.Biocmanager安装2.手动安装文章目录包安装问题解决方案前言一、Rstudio手动安装二、conda手动安装R包2.1在Linux环境中使用R2.2anaconda官网包下载总结前言大家好✨，这里是bio。点赞+关注不迷路。在上一篇blog中为大家介绍了install.packages()安装包的原理、出错的原因、解决方案以及BiocManager安装方法。但是这并不
Bio大恐龙·2023-07-25 08:27

R语言-logistic回归

#logistic-caret::train#划分数据集set.seed(123)folds<-createFolds(y=data$Groups,k=10)#建一个放auc值的空向量auc<-as.numeric()Errorrate<-as.numeric()accuracy<-as.numeric()sensitivity<-as.numeric()specificity<-as.numer
MRI_lab·2023-07-25 08:57

R语言 PCA筛选变量

#PCA-筛选变量X<-data[,2:415]pca<-prcomp(X,center=TRUE,scale.=TRUE)#进行主成分分析summary(pca)#查看各个主成分的解释方差比例library(factoextra)#碎石图依赖-fvizfviz_eig(pca,addlabels=T)#碎石图X_selected<-pca$x[,1:20]#选择前n个主成分#通常大于PCA1+P
MRI_lab·2023-07-25 08:57

五、模型训练

目录1.线性模型1.1Lasso回归1.2Ridge回归2.树模型2.1随机森林（RandomForest，RF）2.2梯度提升树（GBDT）2.3XGBoost2.4LightGBM2.5CatBoost2.6
路哞哞·2023-07-25 06:07

跟着Nature Microbiology学作图：R语言ggplot2做散点图添加拟合曲线和p值

本地文件s41564-021-00997-7.pdf论文ProtectiveroleoftheArabidopsisleafmicrobiotaagainstabacterialpathogenimage.png今天的推文来重复一下论文中的figure3c散点图添加拟合曲线image.png读取数据集library(readxl)df<-read_excel("41564_2021_997_MOE
小明的数据分析笔记本·2023-07-25 03:38

python实现随机森林的特征变量重要性排序

随机森林的特征变量重要性排序在特征选择和特征分析中具有广泛的用途。它可以用来识别哪些特征对目标变量的预测最为重要，从而帮助我们理解数据中的关键特征和影响因素。
带我去滑雪·2023-07-25 02:28

学习小组Day4笔记--饭饭

2020-04-06今日学习主题：R语言基础一、认识R和RstudioR是什么？R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。Rstudio是什么？
a饭饭o·2023-07-25 02:54

生态系统模型：SolVES、DNDC、CMIP6、GEE林业、APSIM、InVEST、META分析、文献计量学、无人机遥感、ArcGIS Pro模型等

原文链接】：【科研必备软件教程】气象、生态、遥感、水文、洪水、语言、人工智能、地质等领域模型应用https://mp.weixin.qq.com/s/KgSvl20fIjTY0ZWDyF0-8A【目录】：R语言在生态环境领域中的实践技术应用
weixin_贾·2023-07-25 01:00

2018数模国赛c题r语言,2018年数模国赛回顾(B题)

先上题，题做出不来，就删博客图1是一个智能加工系统的示意图，由8台计算机数控机床(ComputerNumberController，CNC)、1辆轨道式自动引导车(RailGuideVehicle，RGV)、1条RGV直线轨道、1条上料传送带、1条下料传送带等附属设备组成。RGV是一种无人驾驶、能在固定轨道上自由运行的智能车。它根据指令能自动控制移动方向和距离，并自带一个机械手臂、两只机械手爪和物
weixin_39943101·2023-07-24 23:12

R 基础知识：数据结构（data.frame & matrix & array）

1.data.framedata.frame是R语言用来处理表格式数据的数据结构。
小盐罐儿·2023-07-24 22:54

sklearn随机森林算法对乳腺癌的预测

1.导入需要的库fromsklearn.datasetsimportload_breast_cancerfromsklearn.ensembleimportRandomForestClassifierfromsklearn.model_selectionimportGridSearchCVfromsklearn.model_selectionimportcross_val_scoreimportm
qq_30895747·2023-07-24 21:51

大数据分析案例-基于LightGBM算法构建乳腺癌分类预测模型

如果文章对你有帮助的话，欢迎评论点赞收藏加关注+喜欢大数据分析项目的小伙伴，希望可以多多支持该系列的其他文章大数据分析案例合集大数据分析案例-基于随机森林算法预测人类预期寿命大数据分析案例-基于随机森林算法的商品评价情感分析大数据分析案例
艾派森·2023-07-24 20:27

R语言-数据分析及建模（第1节）分类与预测问题简介

小伙伴们，今天我们学习R语言-数据分析及建模（第1节）分类与预测问题简介01-分类与预测问题简介◆分类和预测是预测问题的两种主要类型，分类主要是预测分类标号（离散属性），而预测主要是建立连续值函数模型，
211统计课堂·2023-07-24 20:13

R语言---使用RTCGA包获取TCGA数据---笔记整理

原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247486585&idx=1&sn=3035f6420904aad2c8161b362cdeb472&chksm=9b484cc2ac3fc5d479fc5bce3d68d4666b763652a21a55b281aad8c0c4df9b56b4d3b353cc4c&scene
浅沫～·2023-07-24 20:04

解决R语言读取数据自动置换符号问题，例如把TCGA样本中的-读取为·

解决方案在使用R语言read.csv()函数读取csv文件时，会自动把TCGA样本中的-替换为.，为后续数据处理带来不便。
is_colorful·2023-07-24 20:02

组间差异分析：Anosim

，而且不同物种的敏感环境因子不同，因此基于正态分布的参数检验难以满足分析需要，要进行多元非参数检验（non-parametricmultivariatestatisticaltests）来计算显著性，R语言
SYSU星空·2023-07-24 20:13

pythondash交互式表格_【呆鸟译Py】Python交互式数据分析报告框架~Dash介绍

只因去年下半年的时候，用R语言的博哥和龙少有Shiny这样的框架可以开发交互式整合Web数据分析报告，让我这个成天鼓吹用Python做数据分析的人眼馋不已。
weixin_39942400·2023-07-24 19:48

数据分享|R语言逻辑回归、Naive Bayes贝叶斯、决策树、随机森林算法预测心脏病...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=23061这个数据集（查看文末了解数据免费获取方式）可以追溯到1988年，由四个数据库组成。克利夫兰、匈牙利、瑞士和长滩。"目标"字段是指病人是否有心脏病。它的数值为整数，0=无病，1=有病（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。数据集信息：目标:主要目的是预测给定的人是否有心脏病，借助于几个因素，如年龄、胆固醇水平、胸痛类型等。我们在这个问题上
拓端研究室TRL·2023-07-24 17:03

【Matlab】基于随机森林算法的数据回归预测（Excel可直接替换数据）

【Matlab】基于随机森林算法的数据回归预测（Excel可直接替换数据）1.模型原理2.数学公式3.文件结构4.Excel数据5.分块代码6.完整代码7.运行结果1.模型原理随机森林（RandomForest
敲代码两年半的练习生·2023-07-24 16:50

【生信技能树】R语言高级练习题

安装一些R包数据包：ALL,CLL,pasilla,airway软件包：limma，DESeq2，clusterProfiler工具包：reshape2绘图包：ggplot2了解ExpressionSet对象，比如CLL包里面就有data(sCLLex)，找到它包含的元素，提取其表达矩阵(使用exprs函数)，查看其大小参考：https://github.com/bioconductor-chin
函数IsLazy·2023-07-24 16:18

R语言实战（第2版）：第一章 R语言介绍

时间：2019年11月29日1、简单的进行代码书写x<-rnorm(5)#它包含5个来自标准正态分布的随机偏差##10名婴儿的月龄和体重age<-c(1,3,5,2,11,9,3,9,12,3)weight<-c(4.4,5.3,7.2,5.2,8.5,7.3,6.0,10.4,10.2,6.1)##使用mean(),sd(),cor()函数分别获得体重的均值，标准差，及月龄和体重的相关度mean
小杜的生信筆記·2023-07-24 14:12

根据vcf文件计算SNP密度并用circlize可视化结果

vcftools--vcfsnp.bialles.vcf--SNPdensity100000--outStatResults/SNPdensity100000是指定窗口长度--out是输出文件的前缀使用R语言中的
小明的数据分析笔记本·2023-07-24 13:16

学习小组Day4笔记--尤书书

Day4-R语言基础.pngR数据科学--详解ggplot2RforDataScience1.安装R和RstudioRstudio相当于R语言的一个人性化/图形的界面果子学生信给自己一个全新的R语言环境之前有装过
SHore_1913·2023-07-24 02:23

04Kaggle竞赛案例-泰坦尼克获救预测

1.数据介绍2.数据预处理3.回归模型4.随机森林模型5.特征选择image.pngimage.pngimage.pngimage.png使用均值填充缺失的值‘image.png对男女进行数值处理image.pngimage.png
逍遥_yjz·2023-07-24 02:03

R语言混合效应（多水平/层次/嵌套）模型及贝叶斯实现技术应用

回归分析是科学研究中十分重要的数据分析工具。随着现代统计技术发展，回归分析方法得到了极大改进。混合效应模型（Mixedeffectmodel），即多水平模型（Multilevelmodel）/分层模型(HierarchicalModel)/嵌套模型(NestedModel)，无疑是现代回归分析中应用最为广泛的统计模型，代表了现代回归分析主流发展方向。混合效应模型形式灵活可以应对现代科学研究中各种数
Mr.靳靳477302280·2023-07-24 01:13

R语言ROC曲线包

R语言有多种包可以画ROC曲线，如比较出名的有ROCR包，pROC包等。如有2个以上变量，则可单独画在一张图上，也可以变量为单位分开画。下面主要讲pROC包，也会提一下经典的ROCR。
装在瓶子里的阳光_2a70·2023-07-23 20:43

【R语言】根据映射关系来替换数据框中的内容

前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub，还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。假设我们手上有这个一个转录本ID和基因名字之间的对应关系，第一列是转录本ID，第二列是基因名字然后我们手上还有一个这样的bed文件，里面是对应的5个基因的CDs区域在
生信交流平台·2023-07-23 10:18

R语言z-score转p.value

z-score计算方法为：Z=（x-μ）/σμ为均值，σ为标准差。以下是R中将z-score转为p.value的方法：pnorm(q,mean=0,sd=1,lower.tail=TRUE)q就是z-score；zscore=12.7#Left-tailedtestpnorm(q=zscore,lower.tail=TRUE)#Right-tailtestpnorm(q=zscore,lower.
生信编程日常·2023-07-23 10:00

生信小白开始接活——文本处理（三）

经过前几天的学习，终于到了文本处理完结篇，就是站在前人的肩膀上处理自己的数据，如下黄框中的数据（GSE178341），处理数据的过程艰辛异常，主要是没有R语言的思维，代码看得懂，但是不会用，只能照葫芦画瓢
璇而微珏·2023-07-23 06:24

【R语言】R包dplyr(一):数据转换

日常在工作中会碰到很多数据批量处理的问题，有的时候单独造轮子很费时间，这个时候我发现了dplyr这个R包，能帮助你解决数据处理中的绝大多数难题。dplyr是tidyverse中的一个核心包，用来进行数据操作。主要包括以下5个核心函数。filter()按值筛选观测arrange()对行进行重新排序select()按名称选取变量mutate()使用现有变量的函数创建新变量summarize()将多个值
巩翔宇Ibrahimovic·2023-07-23 02:35

《学习小组Day4笔记--哇哈哈》

今天开始入门R语言一.查看当前目录,设置新储存目录getwd()setwd()##路径要双斜杠//二.显示文件list.file()dir三.计算+求和1+2sum(1,2,3,4,5)四.赋值x<-1
哇哈哈_2·2023-07-23 01:54
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