r语言kmeans聚类第38页

R语言提取文字（字符串）中的内容--正则式（2）

科学研究中有时候咱们收集到的数据很乱，不能马上进行分析，如SEER数据，用过都知道，咱们需要对数据进行清洗，从数据中提取咱们需要的东西，才能进行分析，这时候有个有用的东西叫正则式，对于我们在字符串中提取数据非常实用，上一章《R语言提取文字

天桥下的卖艺者·2023-11-30 08:23

R语言dlnm包在时间序列空气污染数据的分布滞后线性和非线性模型的应用(2)

本期应粉丝要求复现一篇6分左右文章的图片，文章名称是：Airpollutionandcoronaryheartdisease–relatedhospitalvisitsinBeijing,China:time-seriesanalysisusingageneralizedadditivemode（空气污染和冠心病相关医院访问,中国北京:时间序列分析应用广义加性模型）作者研究了多种空气污染物与冠心病

天桥下的卖艺者·2023-11-30 08:23

R语言基于Matching包进行倾向评分匹配（PSM）

倾向评分匹配（PropensityScoreMatching，简称PSM）是一种统计学方法，用于处理观察研究（ObservationalStudy）的数据，在SCI文章中应用非常广泛。在观察研究中，由于种种原因，数据偏差（bias）和混杂变量（confoundingvariable）较多，倾向评分匹配的方法正是为了减少这些偏差和混杂变量的影响，以便对实验组和对照组进行更合理的比较。为什么需要做倾向

天桥下的卖艺者·2023-11-30 08:22

R语言rhdf5读写hdf5文件(.h5)展示文件组织结构和数据索引

h5只是一种简单的数据组织格式【层级数据存储格式(HierarchicalDataFormat：HDF)】，该格式被设计用以存储和组织大量数据。在一些单细胞文献中，作者通常会将分析的数据上传到GEO数据库保存为.h5格式文件，而不是我们常见的工程文件(rds文件，表格数据等)，所以为了解析利用这些数据需要对hdf5格式的组织结构有一定的了解。（注：在Seurat包中有现成的函数Seurat::Re

Nh_code·2023-11-30 08:19

Linux 下用R语言打开hdf5(.h5)文件异常的解决方案

6月10日从GEO数据库下载了作者上传的表达矩阵h5格式文件，需用从中提取出表达矩阵然后重构Seurat分析对象；该exp_matrix.hdf5文件在我的Window系统上，可以通过rhdf5::H5Fopen和hdf5r::H5File$new两种方法打开读取文件内容。但是由于文件太大，有6个G，在我24G内存的Windows系统上没办法完全加载出矩阵。于是就把文件上传到服务器集群进行处理，以

Nh_code·2023-11-30 08:19

R语言gWQS包在加权分位数和回归模型的应用

在流行病学研究中，相较于单一因素的暴露，多因素同时暴露的情况更为常见。传统模型在评价多因素联合暴露时存在数据维度高、多重共线性等问题.WQS回归模型的基本原理是通过分位数间距及加权的方法，将多种研究因素的效应综合成为一个指数，再进行回归分析。不同因素赋予的权重反映了其对结局的影响程度。使用该模型时应满足各研究因素对结局影响的方向相同这一基本假设.模型的一般形式为：式中：c表示污染物种类；β0表示截

天桥下的卖艺者·2023-11-30 08:16

R语言学习DAY04：回归分析

Allmodelsarewrong,butsomeareuseful—GeorgeBoxR本身是一门统计语言，主要用于统计分析，前面的语法部分算是基础，接下来开始进入统计模型应用。首先从最常用的回归分析说起。有关线性回归分析模型的基本假定需要注意：1）关于随机干扰项的高斯-马尔科夫定理；2）关于自变量的：不存在共线性；3）关于模型的：模型设定正确。模型拟合lm函数：用最小二乘法估计模型参数x<-s

sonder_943f·2023-11-30 07:54

第四章相似度分析算法——基于MinHash的相似性算法

该算法起初主要用于在搜索引擎中的重复网页检查，现在也应用于解决大规模聚类问题。4.3.1与Jaccard相似性关系采用MinHash可以减小过程中的计算复杂度。

文颜·2023-11-30 07:23

TensorFlow 的基本概念和使用场景。

它可以用来创建各种类型的机器学习模型，如神经网络、决策树、随机森林等，以进行分类、回归、聚类、降维等任务。TensorFlow的核心概念是张量（Tensor）和计算图（Graph）。

昭阳926·2023-11-30 06:54

如何利用轮廓系数（Silhouette Coefficient）来判断模糊c均值聚类FCM的聚类簇数量

文章目录前言一、轮廓系数的计算方法二、具体流程前言轮廓系数（SilhouetteCoefficient）是一种评价聚类效果的指标，它可以用于判断模糊C均值聚类的聚类簇数量。

小桥流水---人工智能·2023-11-30 04:38

模糊C均值聚类（Fuzzy C-means clustering，FCM）的基本概念，详细流程以及广泛应用！

文章目录1.基本概念2.FCM的详细流程3.FCM的应用1.基本概念模糊C均值聚类（FuzzyC-meansclustering，FCM）是一种软聚类方法，它允许数据点属于多个聚类中心，每个聚类中心都有一个权重

小桥流水---人工智能·2023-11-30 04:06

R语言ggplot2绘制Y轴截断柱形图

有时候做柱形图如果其中某一两个数值非常大，作图的时候其他柱子就非常低，看起来就不是很美观，其中一种办法是对Y轴进行截断，如果单纯使用ggplot2的代码实现起来还是相对比较麻烦的，Y叔（ggtree/clusterProfiler等R包的作者）开发的ggbreak可以很方便的实现Y轴截断参考链接SetAxisBreakforggplot2(r-project.org)

小明的数据分析笔记本·2023-11-30 03:37

跟着Cell学单细胞转录组分析(三):单细胞转录组数据质控（QC）及合并去除批次效应

构建完Seurat对象之后，我们还需对数据进行一些列的质控，参能进行降维聚类分析，QC对于后续的分析影响还是比较大的，所以要重视。

KS科研分享与服务·2023-11-30 02:34

异常数据检测 | Python实现孤立森林(IsolationForest)异常检测

该算法不采样任何基于聚类或距离的方法，因此他和那些基于距离的的异常值检测算法有着根本上的不同，孤立森林认定异常值的原则是异常值是少数的和不同的数据。它通常用于网

算法如诗·2023-11-30 02:48

异常数据检测 | Python实现PCA和KMeans模型异常数据检测

文章概述异常值检测（outlier）是一种数据挖掘过程，用于确定数据集中发现的异常值并确定其出现的详细信息。当前自动异常检测至关重要，因为大量数据无法手动标记异常值。自动异常检测具有广泛的应用，例如信用卡欺诈检测，系统健康监测，故障检测以及传感器网络中的事件检测系统等。今天我们就通过使用python来实现异常值的自动检测系统的实战开发。时间序列可视化下面我们根据时间对价格进行可视化。df.plot

算法如诗·2023-11-30 02:46

R语言绘制小RNA丰度条形图

R语言绘制小RNA丰度条形图小RNA中的丰度分布十分不均，少数种类小RNA的丰度占全部的比例较高，研究重点也都放在丰度较高的小RNA上，小RNA长度分布图可以有效筛选丰度较高的小RNA，我们以文献CharacterizationofmouseserumexosomalsmallRNAcontent

纪伟讲测序·2023-11-30 00:09

IF：4+ 鉴定与股骨头坏死软骨氧化应激相关的Hub基因和通路

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你75篇原创内容-->公众号现在肿瘤的文章已经很多很多了

90066456ace6·2023-11-30 00:53

学习小组Day4-Bossa

day4mind.png初识R语言软件的安装R软件的安装从官网下载对应版本，下载地址为：R语言官网。

七比比·2023-11-30 00:57

2020-05-13 常用的数据分析与挖掘工具

常用的数据分析与挖掘工具R语言是由奥克兰大学统计系的Robert和Ross共同开发的，并在1993年首次亮相。其具备灵活的数据操作、高效的向量化运算、优秀的数据可视化等优点，受到用户的广泛欢迎。

程凉皮儿·2023-11-29 19:39

R绘制堆积柱形图

前面给大家讲了☞【R语言】百分比表格删除两行重新计算百分比，有小伙伴对文中的两个堆积柱形图比较感兴趣。那么今天我们就来聊聊这两张图是如何绘制出来了。

生信交流平台·2023-11-29 19:15

《R语言实战》自学笔记56-方差分析术语

第9章方差分析9.1术语速成为便于理解方差分析的相关名词，我构建一个案例：假如我们研究氮肥用量和玉米品种对玉米产量影响。设置一个田间试验，试验包括氮肥用量两个N1（200kg/ha）和N2（300kg/ha），玉米品种两个先玉335（XY335）和郑单958（ZD958），3次重复，测定指标为玉米产量。1、田间试验相关概念试验处理(experimentaltreatments)：事先设计好的实施在

zjh9280·2023-11-29 19:12

明天修改

各类聚类职级3人3人以上，20人以内人员规模，按实际计划引入400-500配置，人员标准及表格删除

简简单_a1ba·2023-11-29 18:40

R语言rvest包网络爬虫

R语言网络爬虫初学者指南（使用rvest包）钱亦欣发表于今年06-0414:505228阅读作者SAURAVKAUSHIK译者钱亦欣引言网上的数据和信息无穷无尽，如今人人都用百度谷歌来作为获取知识，了解新鲜事物的首要信息源

weixin_33883178·2023-11-29 15:26

R语言实现MapReduce的协同过滤算法

原文地址：http://www.tuicool.com/articles/63EjqiAuthor：张丹(Conan)Date:2013-04-07Weibo:@Conan_ZEmail:[email protected]:http://www.fens.me/blogAPPs:@晒粉丝http://www.fens.me@每日中国天气http://apps.weibo.com/chin

张小琦·2023-11-29 12:28

R sort、rank、order、arrange排序函数

本文转载自：https://www.cnblogs.com/hider/p/10019536.htmlR语言中排序有几个基本函数：sort()、rank()、order()、arrange()一、总结sort

淡水鱼Ada·2023-11-29 11:31

“SRP模型+”多技术融合在生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价及拓展应用

生态环境脆弱性驱动力研究生态环境脆弱性研究热点二、文献可视化软件介绍及常用功能介绍VOSViewer文献可视化及研究热点分析；Citespace文献可视化及研究热点分析；ArcGIS软件介绍及安装技巧R语言环境部署

Teacher.chenchong·2023-11-29 08:18

SRP模型丨生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价；地理探测器运行等；集成云端、桌面端等环境，结合遥感云计算、GIS空间分析、R语言统计分析的优势

集成云端、桌面端等环境，结合遥感云计算、GIS空间分析，R语言统计分析的优势，以分析生态环境脆弱性的时空演变为主线。

小艳加油·2023-11-29 08:47

电商零售商家需求预测及库存优化问题（第1问）

电商零售商家需求预测及库存优化问题数据和题目来源于2023年MathorCup高校数学建模挑战赛——大数据竞赛只有第一问，使用ARIMA做预测，使用聚类算法做特征相似性1数据读取和处理1.1清除重复值注意附件

王小葱鸭·2023-11-29 08:34

shell语言练习for循环和if判断的小脚本

目录需求：ping一下当前网段下的所有地址，能ping通的加入一个文件，不能ping通则加入另一个文件这个for语言写法是仿C写法，可能是之前语言的印象比较深吧，也可以使用foriin{1..254}for

丨析木丨·2023-11-29 07:32

PCL点云处理(008)-euc_cluster

欧式聚类是一种基于距离的聚类算法，可以将点云中距离较近的点聚集在一起，形成一个簇。在PCL库中，欧式聚类的实现原理是将点云中的每个点看作一个向量，然后计算这些向量之间的欧式距离。

zwhdldz·2023-11-29 05:40

r语言相关性作图_R语言：多个基因的相关性分析与展示

weixin_39747721·2023-11-29 03:03

r语言相关性作图_用R语言进行相关性分析：画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值...

excel表格的，对于读取excel，此处有一个小技巧读取excel方法1.把excel文件另存为CSV文件1png2.png3.png4.png2.按照读取csv文件方法读取dat此名为excel1文件被R语言读取二

JunyuanLI·2023-11-29 03:03

r语言相关性作图_R语言绘图：相关性分析及绘图展示

rm(list=ls())#先把我们的R清空一下datafile="C:\\Users\\gaom\\Desktop\\R语言绘图\\相关性分析\\",header=T,=1,sep="\t")#读取数据

董振业·2023-11-29 03:02

ROC及曲线面积汇总学习

目录ROC基础生成模拟数据率的计算R语言计算测试ROCR：pROCROC绘制单个ROC两个ROCLogistic回归的ROC曲线timeROCROC基础ROC曲线的横坐标是假阳性率，纵坐标是真阳性率，需要的结果是这个率表示疾病阳性的率

hx2024·2023-11-29 03:32

r语言相关性作图_R语言做相关性分析

黑潮制作所·2023-11-29 03:32

r语言相关性作图_R绘图：相关性分析与作图

公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程：生物信息学教学相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能，单基因的批量相关性分析，可以用于做单基因的GO，KEGG富集分析和GSEA分析，也有多基因之间的相关性分析，或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据，挑选一些基因做相关性分析，并用不同的R包展示。load(file="mRNAdata.Rda")#加载数据library(tidyv

知乎剧综·2023-11-29 03:32

R语言rayrender包，microfacet微面材料

R语言rayrender包，microfacet微面材料#TueJul1303:14:532021-#字符编码：UTF-8#R版本：R4.1x64forwindow11#cgh163email@163.

youmigo·2023-11-28 23:58

2021-05-16 scRNA基础分析：差异基因富集分析

此前的分析我们按转录特征把细胞分成了很多类别，例如seurat聚类分析得到的按cluster分类，singleR分析得到的按细胞类型分类，monocle分析得到的按拟时状态（state）分类。

学习生信的小兔子·2023-11-28 18:03

4D雷达目标检测跟踪算法设计

1.算法流程4D雷达点云跟踪处理沿用3D毫米波雷达的处理流程，如下图：从接收到点云开始，先对点云做标定、坐标转换、噪点剔除、动静分离，再分别对动态目标和静态目标做聚类，然后根据聚类结果做目标的特征分析和检测等

奔袭的算法工程师·2023-11-28 15:44

机器学习复习笔记

机器学习复习笔记第一章绪论基本术语监督学习：分类、回归分类:离散值二分类：好瓜；坏瓜多分类：冬瓜；南瓜；西瓜回归:连续值如：瓜的成熟度/瓜的价格无监督学习：聚类聚类：无标记信息如：按某些特征把物体归为一类

Mr.小蔡·2023-11-28 15:23

R语言-matrix函数创建矩阵特殊情况

R语言-matrix函数创建矩阵特殊情况创建矩阵的函数为matrix(data=x,nrow=y,ncol=z,byrow=FALSE,dimnames=NULL)data参数为矩阵元素；nrow参数：

dogplays·2023-11-28 14:32

DNA 11. 识别肿瘤蛋白质三维结构上突变热点(HotSpot3D)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你125篇原创内容-->公众号桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程

90066456ace6·2023-11-28 14:46

pandas教程：Introduction to scikit-learn scikit-learn简介

里面包含了很多监督式学习和非监督式学习的模型，可以实现分类，聚类，预测等任务。虽然scikit-learn并没有和pandas深度整合，但

Cachel wood·2023-11-28 10:15

Liam_ml·2023-11-28 07:34

R语言统计系列第13篇-K-M生存曲线与logrank检验

今天是各类统计方法R语言实现的第13期，我们主要介绍R语言统计系列第13篇-K-M生存曲线与logrank检验。

拾光_2020·2023-11-28 04:04

使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第五章)

ATAC-seq数据(第一章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第二章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第三章)使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第四章)第5章:使用ArchR聚类大部分单细胞聚类算法都在降维后空间中计算最近邻图

xuzhougeng·2023-11-28 03:00

R语言结果输出方法

R语言结果输出方法在R语言中，有多种方法可以将结果输出到控制台或保存到文件中。下面将介绍几种常用的输出方法，并提供相应的源代码示例。

DevCyberX·2023-11-28 01:37

代做data课程设计作业、代写R程序设计作业、代做R语言作业、代做linear model作业代写R语言编程|帮做C/C++编程

ProblemAConsiderthemodellingofhousesellingprice.ThedatacanbedownloadedintoRusing:read.table(url(“http://pages.uwf.edu/acohen/teaching/glm/house.txt”))Thedatacontainsthefollowingvariables:price(in$1000

zoumangu·2023-11-28 01:19

R语言编程-Tidyverse 书籍-第一章（2）

此部分的内容，全部是对张敬信博士书籍的学习总结。出发点：因为tidyverse简洁编码，使R代码更加易读。我就想系统再次学习下R，这样让自己写的R代码更加简洁。关于“for循环运行速度慢”的说法，实际上已经过时了，现在的R、Matlab等软件经过多年的内部优化已经不慢了，之所以表现出来慢，是因为你没有注意两个关键点：提前为保存循环结果分配存储空间；为循环体中涉及的数据选择合适的数据结构。apply

Hello育种·2023-11-27 18:06

python之dbscan算法

DBSCAN全称是Density-BasedSpatialClusteringofApplicationswithNoise，即基于密度的聚类算法，是一种非常常见的聚类算法。

愚公搬程序·2023-11-27 18:20

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