rna甲基化最新进展第2页

10.单细胞 RNA-seq：聚类分析

学习目标：评估是否存在聚类过程产生的技术误差使用PCA和UMAP图确定聚类质量，并了解何时重新聚类评估已知的细胞类型标记与假设簇的细胞类型同一性单细胞RNA-seq聚类分析现在我们已经进行了整合，我们想知道我们的细胞群中存在哪些不同细胞类型

denghb001·2024-02-13 01:02

新版EvidenceModeler基因组注释方法

EvidenceModeler用于将多种方法的注释结果合并整理从头预测的结果，同源注释结果，RNA-seq辅助注释结果，EST注释结果等等。

在学生信秃头中·2024-02-12 22:41

GPT最新进展：推出视频功能！迭代即将来临！

随着人工智能的不断进步，ChatGPT正准备以其全新的视频功能大跃进，同时，备受期待的GPT-5也即将在今年露面，预示着AI领域即将迎来一场变革。在最近一期充满激情的UnconfuseMe播客中，OpenAI的首席执行官SamAltman与技术界的巨擘BillGates进行了一次深刻的对话，首次透露了ChatGPT即将推出的新功能。GPT-5的推出无疑将标志着AI技术的一个新纪元。Altman透露

赵闪闪168·2024-02-12 10:04

小鼠嗅球的单细胞rna-seq揭示了细胞的异质性和成体神经元活性依赖的分子普查

Single-CellRNA-SeqofMouseOlfactoryBulbRevealsCellularHeterogeneityandActivity-DependentMolecularCensusofAdult-BornNeurons题目：小鼠嗅球的单细胞rna-seq

猫姐Lily·2024-02-12 06:26

链特异性测序及在IGV中的可视结果

dUTP方法是先利用随机引物合成RNA的一条cDNA链，在合成第二条链的时候用dUTP代替dTTP，加adaptor后用UDGase处理，将有U的第二条cDNA降解掉。

LeoinUSA·2024-02-11 09:26

lncRNA转录组分析泌乳母猪热应激机制

长链非编码RNA(Longnon-codingRNAs,lncRNAs)在转录和转录后调控中发挥重要作用。但是，lncRNA在母猪下丘脑-垂体-乳腺轴上表达影响泌乳性能的机制尚不清楚。

felix108·2024-02-11 06:37

官方通报幼儿园被曝使用生蛆淋巴肉，称「当事人已全部到案，正接受调查」，若属实食品安全问题将如何惩治？

鹤然奶爸聊育儿·2024-02-11 01:32

温故知新之CRISPR/Cas9原理

温故知新之CRISPR/Cas9原理CRISPR/Cas9基因编辑系统由一个具有核酸内切酶功能的Cas9蛋白(或其他同源蛋白)和一条单链向导RNA(singleguide,sgRNA)组成。

Seurat_·2024-02-10 22:19

2021-08-09 iCLIP解析HNRNPC在可变剪接中的调控机制

CLIP-seq（UVcross-linkingandimmunoprecipitationwithhigh-throughputsequencing）是研究RNA结合蛋白（RNAbindingprotein

NAome·2024-02-10 14:10

3D Gaussian Splatting 应用场景及最新进展【附10篇前沿论文和代码】

CV玩家们，知道3D高斯吗？对，就是计算机视觉最近的新宠，在几个月内席卷三维视觉和SLAM领域的3D高斯。不太了解也没关系，我今天就来和同学们一起聊聊这个话题。3DGaussianSplatting（3DGS）是用于实时辐射场渲染的3D高斯分布描述的一种光栅化技术，具有高质量和实时渲染的能力。如果说NeRF等辐射场方法彻底改变了多张照片或视频主导的场景新视角合成的算法生态，那么3D高斯则是在NeR

深度之眼·2024-02-10 10:24

百度Apollo：CTO级无人车大牛不稀缺，我们这也就百八十个吧

贾浩楠发自凹非寺量子位|公众号QbitAI中国路况场景下的无人化车队实况、自动驾驶商业化的最新进展……刚刚，在百度Apollo技术开放日上，关于自动驾驶的最前沿探索成果，都一一展现。

QbitAl·2024-02-10 07:19

真相

今天上午，国人瞩目的重庆万州公交车坠江事件，终于有了最新进展。有关部门公布的事故原因是：在公交车行驶过程中，一名乘客与驾驶员争吵，并多次攻击驾驶员，对驾驶员造成严重干扰。

薛之明·2024-02-09 15:04

2018 年诺贝尔化学奖「蛋白质进化」在我们生活中实际应用

而后，1912年Sabatier的金属催化加氢反应、1918年Haber的合成氨工业，以及近来的非平衡态热力学、基元反应研究、RNA催化、小分子/

ferrymanzrq·2024-02-09 13:23

三维基因组｜分子生物学简介 (1)

分子生物学涉及生命从组成到活动的所有分子基础，包括DNA、RNA、蛋白质之间的相互作用、它们的生物合成以及这些相互作用的调节。

冷冻工厂·2024-02-09 09:10

Week9 — 遗传DNA甲基化在早期胚胎发育中对染色质开放性的调控机制研究

第9周2018—7.16-7.21原文链接：InheritedDNAmethylationprimestheestablishmentofaccessiblechromatinduringgenomeactivationdoi:10.1101/gr.228833.1172018年5月发表于GenomeRes.概括提出问题：动物受精后表观修饰会从配子全部或部分遗传给后代，这个过程需要正确的转录调控，

六六_ryx·2024-02-09 05:46

mRNA新冠疫苗会制造“转基因人”？没那么容易被“转”

加上最近美国《科学》杂志发表的一篇文章称，有证据证明，如果注射mRNA新冠疫苗，新冠病毒的部分RNA（核糖核酸）可能会整合到人的遗传物质DNA中，虽然不解其意，但许多人也忧心忡忡。

BBCearth·2024-02-08 14:56

看了老大比较基因组学视频后扩展的小内容

老大视频比较基因组在IGV看了http://www.bio-info-trainee.com/2218.htmlwes：探针捕获rna-seq：不会出现外显子两边下降chip-seq：不会出现整齐，得到的文件是

小梦游仙境·2024-02-08 12:56

生信绘图：在线绘制序列 Logo 图

网站链接：WebLogo3-About(threeplusone.com)1序列Logo图序列Logo是一种常用于可视化DNA、RNA或氨基酸序列中保守性和模式的图形化方法。

Ningbo_JiaYT·2024-02-08 07:09

Java 20 超神版正式发布，展示了 Java 技术的最新进展

作用域值（ScopedValues）进入孵化阶段记录模式（RecordPatterns）进入第2预览阶段switch模式匹配（PatternMatchingforswitch）进入第4预览阶段外部函数和内存API（ForeignFunction&MemoryAPI）进入第2预览阶段虚拟线程（VirtualThreads）进入第2预览阶段结构化并发（StructuredConcurrency）进入第

永钊源码·2024-02-08 05:46

STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner

SchlesingerF,etal.STAR:ultrafastuniversalRNA-seqaligner[J].Bioinformatics,2012,29(1).ABSTRACTMotivation:高通量RNA-seq

sunlight_yy·2024-02-07 14:29

文献笔记八十六：植物小RNA百科全书

论文PmiREN:acomprehensiveencyclopediaofplantmiRNAshttps://academic.oup.com/nar/article/48/D1/D1114/5585553本地文件名gkz894

小明的数据分析笔记本·2024-02-07 11:43

2022-09-07

-0710:15发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：风不止步IF=47.99推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：文章开发第一个通用平台US-align，用于统一对齐不同大分子的单体和复合结构--蛋白质、RNA

图灵基因·2024-02-07 10:48

学习：StatQuest-RNA-seq技术重复

概念首先我们先辨析一下生物学重复和技术重复，我们的RNA-seq的data产生差异是正常的，关于差异来自于几个方面：生物学多样性，个体间差异，即便是同一物种（基因组相同），其转录本也未必都相同image.png

小潤澤·2024-02-07 09:11

前沿Perspective | 空间转录组数据分析方法最新进展

空间转录组学是一个迅速发展的领域，有望以单细胞或亚细胞分辨率全面表征组织结构。计算方法的发展对从原始数据中提取生物信号起着重要作用；下游分析工具将空间组织和细胞间通信描述为可量化属性，并提供算法来推导此类属性；集成管道进一步将多个工具组合在一个包中，使生物学家能够方便地从头到尾分析数据。近日，来自美国的研究人员在《GenomeResearch》发表Perspective，总结了空间转录组数据分析方

尐尐呅·2024-02-07 08:31

2022-11-29 RNA-seq差异表达分析

最近看到一篇文章提到当样本量很大的时候差异表达分析使用秩和检验效果较好。文章题目：ExaggeratedfalsepositivesbypopulardifferentialexpressionmethodswhenanalyzinghumanpopulationsamplesGenomeBiol.2022Mar15;23(1):79.doi:10.1186/s13059-022-02648-4.

Zheng_xy·2024-02-06 21:20

RNA-seq-Li

李老师RNA-seqPRC1.6-Gene和PRC1.6-Repeat数据分析读取要处理的文件library(ggplot2)library(VennDiagram)file.listlog2FoldChange_cutoff

bred·2024-02-06 17:31

几种RNA和蛋白互作检测的实验技术

今天给大家分享几种RNA和蛋白互作检测的实验技术，实验方法在这里没有详细描述，只是让大家对这几种实验技术原理有个初步的认识了解。感兴趣的可以专门阅读文献去深入学习，下面我们来看下这几种实验技术。

去学习一下啊·2024-02-06 17:45

基于LLM的数据漂移和异常检测

新缸中之脑·2024-02-06 13:53

2022-08-14

上一次写随笔还是两周前八月第一周在玩异度之刃3.....第二周把EGO数据库挖掘的内容结束了，另外学了chip-seq全流程，这一次感觉比rna-seq那一趟顺利多了，当然，数据量也是大多了，分析结束后还要把

佳奥·2024-02-06 09:00

学习：StatQuest-Heatmap

Heatmapimage.png在RNA-seq中热图往往用于衡量不同样本不同基因的表达情况（主要看上下表达），这个图就是个热图，横坐标表示不同样本，纵坐标表示基因。

小潤澤·2024-02-06 05:17

MMLAB的实例分割算法mmsegmentation

我爱派生·2024-02-06 01:47

文献分享-Cas9系统中引导RNA的研究进展

本文是一篇中文综述，于2018年12月发表于《生物技术通报》，文章对CRISPR/Cas9系统中的引导RNA研究进展进行了综述，围绕引导RNA的序列组成、结构特征以及转录产生方式这3方面内容，展望引导RNA

去学习一下啊·2024-02-05 23:40

RNA-seq转录组数据分析

B站：RNA-seq转录组数据分析入门实战1linux常用命令touchtext.txt#新建文件rm-rf/var/log/httpd/access#将会删除/var/log/httpd/access

医学小白学生信·2024-02-05 15:35

生命初期1000天

早在胚胎期就开始发生作用了，它可以改变胎儿甲基化代谢，影响DNA甲基化模式的形成，从而调节胎儿基因的表达，进而调控器官的形成，最终通过调节

crystalbal_0d12·2024-02-05 14:15

一文读懂环状RNA

环状RNA的定义是什么？circRNAs（CircularRNAs，环形RNA分子）是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。

Seurat_Satija·2024-02-05 09:01

比对软件索引构建与效率比较

最近接触下组学的rawdata分析，慢慢学咯~下载参考基因组【直播】我的基因组（五）:测试数据及参考基因组的准备比对原创10000+生信教程大神给你的RNA实战视频演练比对效率5款流行比对工具大比拼

王诗翔·2024-02-05 08:18

“诺如病毒”爆发导致的腹泻，如何避免宝宝中招？

诺如病毒是属于杯状病毒科的单链正股RNA病毒，是引起全世界病毒性急性胃肠炎散发和暴发的主要病原体之一，也是儿童急性肠胃炎常见诱因之一

小风车儿科·2024-02-05 06:53

2021-10-14

单细胞表观遗传组学研究肿瘤细胞异质性和可塑性原创楠烟不可言图灵基因今天收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：楠烟不可言IF=38.33推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本文分析了近期两项表征了神经胶质瘤的单细胞DNA甲基化组的研究

图灵基因·2024-02-05 01:12

每日paper - 20211111 - 哺乳动物基因表达调控的全局定量分析

基因表达是一个多步骤的过程，包括转录、翻译和信使RNA与蛋白质的周转（turnover，应该是类似于代谢、降解的意思？）。

阿芃·2024-02-04 21:49

GitHub上高标星开源智能体框架汇总！最高33K+！

在当今人工智能领域，智能体框架已经成为开发高效、灵活和可扩展应用的关键工具，而GitHub作为全球最大的开源代码托管平台，汇聚了众多优秀的智能体框架项目，这些项目展示了智能体技术的最新进展。

AI热心分享家·2024-02-04 15:58

2022年全球市场RNA靶向小分子药物总体规模、主要企业、主要地区、产品和应用细分研究报告

本文研究全球市场、主要地区和主要国家RNA靶向小分子药物的销量、销售收入等，同时也重点分析全球范围内主要厂商（品牌）竞争态势，RNA靶向小分子药物销量、价格、收入和市场份额等。

GIR-环洋咨询·2024-02-03 22:43

Inﬂammasome Activation Triggers Caspase-1- Mediated Cleavage of cGAS to Regulate Responses to DNA...

作者研究了利用DNA病毒感染ASC-/-与Casp-/巨噬细胞，发现这两个分子的缺陷会导致IFN的产生增加，但RNA病毒的感染却未有此表型。

backup备份·2024-02-03 21:17

借助NMF的力量对单细胞RNA和单细胞ATAC进行联合分析

hello，大家好，礼拜天了，明天又要上班了，但是很想写一点东西，留下点足迹，但是又不想太动脑子，所以分享一篇代码文，分享给大家，单细胞转录组和ATAC的联合分析。Jointdefinitionofcelltypesfromsingle-cellgeneexpressionandchromatinaccessibilitydata说起liger，大家应该不陌生，大家可以参考我的文章10X单细胞（空

单细胞空间交响乐·2024-02-03 20:19

稚肩·2024-02-03 19:14

200826 Circ之旅3-构建人类基因组索引

注：后面可能还会构建鼠源的x参考：RNA-seq(5):序列比对：Hisat2人类基因组hg19、hg38构建bwa索引生物信息学习——bowtie2使用手册bwabowtie2salmonsubreadhisat2

dicklim·2024-02-03 15:13

scifi-RNA-seq 2021

题目：Ultra-high-throughputsingle-cellRNAsequencingandperturbationscreeningwithcombinatorialfluidicindexing期刊：NatureMethods通讯作者：ChristophBock奥地利科学院分子医学研究中心，维也纳，奥地利人工智能研究所，医学统计、信息学和智能系统中心，维也纳医科大学，奥地利维也纳我们

韧_7e6f·2024-02-03 12:07

2024年第九届信号与图像处理国际会议(ICSIP 2024)

ICSIP每年召开一次，在过去的七年中吸引了1200多名与会者，是展示信号和图像处理领域最新进展的领先国际会议之一。

爱科会易·2024-02-03 08:56

血液提取RNA

②RNA血液保存液12000rpm离心5min，弃上清后加1毫升RNase-freeddH2O。③200

杏子柠檬茶·2024-02-03 07:54

阿里女员工案件最新进展

阿里巴巴公司大楼针对阿里女员工被侵害案件的调查和行动有了最新进展。

星辰阅读·2024-02-03 03:46

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