rna甲基化最新进展第8页

单细胞从理论到实践-这一本书就够了

生信交流平台·2023-12-23 03:13

RNA-seq下游分析之PCA画图

RNA-seq下游分析之PCA图_欧阳火火的博客-CSDN博客rm(list=ls())mydata1,]head(dds2)rld1<-rlog(dds2)plotPCA(rld1,intgroup=

ECHO1216·2023-12-22 20:28

NGS Mapping 软件 Bowtie 算法介绍

简介Bowtie是目前流行的一款DNA、RNA序列比对软件，开源免费。Bowtie的技术路线基于BWT-FM。BWT-FM法对内存的消耗很小，被很多工具采用。

茄子_0937·2023-12-22 18:49

从RNA定向互作看基因组组织

我们最近开始了解非编码RNA（ncRNA）在此类过程中的原始作用，现在已知几种类型的RNA对调节基因表达至关重要：在细胞核中，长非编码RNAs（lncRNAs）、增强子RNAs（eRNAs）、稳定的内含子序列

Ss_y·2023-12-22 13:06

【circRNA】circRNA简介（1）

cirRNA是非编码RNA中的一大类，它由一种非经典剪接方式——反向剪接(backsplicing)产生；当反向剪接发生时，下游剪接位点与上游剪接位点共价连接闭合。

jjjscuedu·2023-12-22 05:54

Cell：脑肿瘤免疫微环境图谱 | 癌症研究数据资源

通过整合多参数FCM分析、RNA序列数据、TME细胞培养分析、蛋白质阵列和空间组织特征，揭示了来自不同

尐尐呅·2023-12-22 00:31

TCGA数据库详解

NationalHumanGenomeResearchInstitute（NHGRI，美国国家人类基因组研究所）于2006年联合启动的项目，收录了各种人类癌症（包括亚型在内的肿瘤）的临床数据，基因组变异，mRNA表达，miRNA表达，甲基化等数据

-麦_子-·2023-12-21 16:10

VIGC: Visual Instruction Generation and Correction---------VIGC：视觉指令生成和纠正

上海人工智能实验室Abstract视觉编码器和大语言模型（LLM）的集成推动了多模态大语言模型（MLLM）的最新进展。然而，视觉语言任务的高质量指令调整数据的稀缺仍然是一个挑战。

Mars_prime·2023-12-21 08:35

DiseaseMeth 人类疾病相关的甲基化信息数据库

DNA甲基化作为表观遗传的一种标记，在生长发育和疾病发生过程中扮演着重要角色。

生信修炼手册·2023-12-21 07:44

多切片联合构建3D生物空间图谱

通过对多个切片进行联合建模，将其与单细胞RNA测序数据进行整合，STitch3D同时识别出具有一致基因表达水平的3D空间区域，并

tzc_fly·2023-12-21 07:47

2021-10-15

单细胞RNA测序显示微生物群的缺失使TME倾向于促肿瘤巨噬细胞。2.从机制上讲，本文发现微生物群衍生的干扰素基因刺激因子（STI

图灵基因·2023-12-21 06:47

越是艰难的时候，越要好好生活

和往年的热闹喧嚣不同，今年春节假期，多数人都宅在家里关心着抗击疫情的最新进展。纵使再艰难，有家的地方就有温暖。然而宅得太久，也有人开始抱怨日复一日地在家会无所事事，

沙沙桑·2023-12-21 04:52

四价流感疫苗（鼻喷雾）

流感病毒为RNA病毒，根据核蛋白和基质蛋白分为甲、乙、丙、丁四型，目前感染人的主要是甲型流感病毒中的H1N1、H3N2亚型及乙型流感病毒中的Victoria和Yamagata系。

Tree_Ye·2023-12-21 01:23

Seurat用自定义的 cell type 做差异表达

Rcodemarkers%dplyr::glimpse()Formalclass‘Seurat’[package“SeuratObject”]with13slots…@assays:Listof1……$RNA

Janine_1991·2023-12-21 01:19

预告|万博智云CTO孙琦将出席2023 OpenInfra Days China，并发表最新容灾方案，欢迎报名参会！

大会主题本次活动是时隔两年来的首次线下盛会，聚集了全球社区的技术专家、行业领袖以及国内开源基础设施技术企业的代表，旨在交流研究OpenInfra基金会旗下各个开源基础设施项目的最新进展，探讨全球前沿基础设施技术的成功实践

万博智云OneProCloud·2023-12-20 23:12

拭子（痰液）核酸提取中如何高效地分离核酸

3.样本处理：a)拭子：向无RNA酶

清风拂面vv·2023-12-20 19:29

生物学上描述DNA/RNA的长度常用的kb\nt\bp是指什么？

kb=千碱基对kilobase(pair).是kbp的简写nt=核苷酸nucleotidebp=碱基对basepair1Mb=1000kb=1000000bp

大大的世界和小小的人儿·2023-12-20 15:08

基因表达差异分析R工具包DESeq2的详细使用方法和使用案例

DESeq2是一种常用的差异表达基因分析工具，可用于RNA-seq数据的差异表达分析。下面是DESeq2的详细使用步骤和全部脚本示例。

小果运维·2023-12-20 14:23

生信分析代谢通路可视化分析R工具包ggkegg的使用案例

assign_deseq2log2FoldChangecolumnnumeric_combinemean在这里，我们使用RNA-Seq数据

小果运维·2023-12-20 14:22

使用深度学习的微光图像和视频增强：综述

mytzs123·2023-12-20 06:12

2021-01-26基因ID+TMP

TumorProteinP53的简写，RNF180是RingFingerProtein180的简写ID号1.最常见的就是EntrezGene2.在gene数据库里面对于转录本和蛋白的编号是以NM和NP开头的3.非编码的RNA

小森的生统笔记·2023-12-20 00:15

本周最新文献速递20210704

20210704一、精细解读文献一文献题目：Geneticdriversofm6Amethylationinhumanbrain,lung,heartandmuscle不想看英文题目：人脑、肺、心脏和肌肉中m6A甲基化的遗传驱动因素研究杂志和影响因子

橙子牛奶糖·2023-12-19 23:28

新版TCGA表达矩阵整理简单版

很多人因为网络原因不能使用TCGAbiolinks这个神包下载TCGA的RNA-seq数据，只能通过浏览器访问GDCTCGA的官网进行下载，而下载后得到的是一个个文件夹，对于如何整理成一个表达矩阵也是很麻烦的

医学和生信笔记·2023-12-19 20:16

《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 1

前言最近在阅读欧剑虹老师《生物信息学生R入门教程》非常适合于刚入手NGS的初学者使用，这里我仅做我个人的读书笔记使用本书分为八个章节：1.R/Bioconductor简介2.基因芯片的数据分析3.RNA-seq

小潤澤·2023-12-19 19:08

细胞RNA提取的操作步骤

操作步骤（请自行准备无水乙醇、异丙醇、灭菌1.5mL离心管）：1.取出洗涤液，按以下操作：a)洗涤液A：按终浓度30%比例加入无水乙醇，如7mL加入3mL无水乙醇；21mL加入9mL无水乙醇，充分混匀。b)洗涤液B：按终浓度70%比例加入无水乙醇，如3mL加入7mL无水乙醇；9mL加入21mL无水乙醇，充分混匀。c)配制好的洗涤液如出现沉淀，可在37℃溶解，摇匀后使用。2.取1.5mL离心管，加入

清风拂面vv·2023-12-19 18:26

RNA剪接机制

根据中心法则，DNA编码的遗传信息被转录成RNA，然后翻译成蛋白质。在将初级mRNA翻译成蛋白质之前，必须先对其进行修饰和编辑。

阿尔法约塔·2023-12-19 16:54

RNA-seq数据如何做PCA

PCAworksbestwhentheinputdataisapproximatelynormallydistributedoneachdimension.Itwouldbeagoodideatodosomeinitialdataqualitycheckstoverifythatthisisthecase(andtransformthedataappropriatelyifnot),oratlea

OmicsAcademy·2023-12-19 08:49

体内内源基因调控之CRISPRi与CRISPRa

众所周知，CRISPR/Cas9系统可以用来操纵基因组：规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA（gRNA）的指引下，靶向基因组中的特定区域并切割DNA，产生DNA双链断裂

辛晓红·2023-12-19 04:19

人和狗的年龄换算公式

科学家们已经可以通过DNA的甲基化水平，跟

超甜吖·2023-12-18 16:04

每周文献 2021-08-02

大家好，最近因为有需要了解甲基化作用，看到这篇文献，拿出来给大家分享一下，这是一篇关于揭示蛋白BANP与基因组的CGCG基序结合，从而激活必需基因表达的文章。

杨博士聊生信·2023-12-18 10:54

生信数据挖掘单细胞测序

其收稿要求涵盖了癌基因的结构和功能的各个方面，尤其是:细胞癌基因及其激活机制，其编码蛋白的结构和功能，DNA和RNA的癌基因，肿瘤病毒，人类肿瘤的分子肿瘤学，肿瘤抑制基因，生长调控基因，细胞周期控制生长

概普生信·2023-12-18 10:06

最IN的云原生架构，阿里云 Serverless 事件总线 EventBridge 重磅发布

了解阿里云Serverless产品家族的最新进展，包括函数计算FC、Serverless应用引擎SAE和Serverless事件总线EventBridge。

阿里云云栖号·2023-12-18 07:46

2022-03-18

NatComm|非编码RNA参与DNA修复调控机制原创图灵基因图灵基因收录于话题#前沿分子生物学机制瑞典Karolinska研究所的研究人员发表了一篇论文，展示了某些RNA分子如何控制癌细胞中受损DNA

图灵基因·2023-12-17 21:52

教会羊驼说话：Instruction Tuning的最新进展

深度学习自然语言处理分享整理：Winnie本文翻译自以下高天宇博士的博客，感谢作者的分享。Title:TeachLlamastoTalk:RecentProgressinInstructionTuningLink:https://gaotianyu.xyz/blog/2023/11/30/instruction-tuning/前言大型语言模型（LLM），凭借其数十亿的参数和数万亿token的庞大训

zenRRan·2023-12-17 19:26

血液微生物RNA提取注意事项

操作步骤（请自行准备无水乙醇、异丙醇和1.5mL灭菌RNase-free离心管）1.取出洗涤液，按以下操作：a)洗涤液A：按终浓度30%比例加入无水乙醇，如7mL加入3mL无水乙醇；21mL加入9mL无水乙醇，充分混匀。b)洗涤液B：按终浓度70%比例加入无水乙醇，如3mL加入7mL无水乙醇；9mL加入21mL无水乙醇，充分混匀。2.取1.5mLRNase-free灭菌离心管，加入200μL血液样

清风拂面vv·2023-12-17 19:58

Nat. Mach. Intell. | 通过深度神经网络联合建模多个切片来构建一个三维全生物体空间图谱

通过联合建模多个切片并将其与单细胞RNA测序数据整合，S

DrugAI·2023-12-17 19:06

石蜡包埋组织RNA提取步骤有哪些？

操作步骤：1.请自行准备：无水乙醇、异丙醇、灭菌双蒸水、二甲苯及1.5mL离心管。2.取出洗涤液，按以下操作：a)洗涤液A：按终浓度30%的比例加入无水乙醇，如7mL加入3mL无水乙醇，14mL加入6mL无水乙醇，充分混匀。b)洗涤液B：按终浓度70%的比例加入无水乙醇，如3mL加入7mL无水乙醇；6mL加入14mL无水乙醇，充分混匀。c)配制好的洗涤液如出现沉淀，可在37℃溶解，摇匀后使用。3.

清风拂面vv·2023-12-17 18:00

Improving IP Geolocation with Target-Centric IP Graph (Student Abstract)

虽然基于以路由器为中心（router-centric）的IP图的最新进展被认为是前沿的，但一个挑战仍然存在：稀疏IP图的流行（14.24%，少于10个节点，9.73%孤立）限制了图的学习。

别致的SmallSix·2023-12-17 18:41

亚马逊云科技数据库最新进展：助力应用程序面向未来

关键字:[AmazonWebServicesre:Invent2023,AmazonAurora,Databases,Redshift,GenerativeAi,VectorSimilaritySearch]本文字数:2600,阅读完需:13分钟视频如视频不能正常播放，请前往bilibili观看本视频。>>利用亚马逊云科技数据库助力应用程序面向未来_哔哩哔哩_bilibili导读在快速发展的IT环

李白的好朋友·2023-12-17 14:49

《C++20设计模式》---桥接模式学习笔记

c++20设计模式第7章桥接模式7.1Pimpl模式7.2桥接模式介绍7.3总结7.4代码第7章桥接模式如果你一直关注C++编译器（特别GCC，Clang和MSVC）的最新进展，那么可能已经注意到编译速度提高了

BirdsLife·2023-12-17 12:20

你将被机器人取代！数据科学即将迎来“无代码”时代

现在，每一周都会有一些自动代码行业的最新进展。创业公司的集成产品是有一些进展的，不过更多见的是基于现有分析平台供应商新添加的功能或模块。

yoku酱·2023-12-17 06:28

逆转录酶性质 – 六个关键注意事项

DNA聚合酶活性RNaseH活性热稳定性持续合成能力保真度末端核苷酸转移酶（TdT）活性逆转录酶是从RNA模板合成互补DNA（cDNA）链过程中的必需试剂。

evolisgreat·2023-12-17 00:17

派森诺转录+代谢组联合分析，4.599分的项目文章

文章题目：MetabolomeandTranscriptomeAnalysisofLiverandOocytesofSchizothoraxo’connoriRaisedinCaptivity技术手段：RNA-seq

felix108·2023-12-16 23:08

人工智能计算机视觉：解析现状与未来趋势

本文将深入探讨人工智能在计算机视觉方面的最新进展、关键挑战以及未来可能的趋势。1.简介计算机视觉是人工智能的一个重要分支，其目标是使机器具备类似于人类视觉的能力。

鳗小鱼·2023-12-16 18:14

2021-11-17

CanRes|抑制前列腺肿瘤的RNA分子原创图灵基因图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制尽管许多前列腺癌患者接受了阻断促进肿瘤生长的激素的治疗，但大多数患者对这些治疗产生了耐药性。

图灵基因·2023-12-16 16:34

7+m6A+分型+实验，甲基化方向的生信思路，没有思路的同学可参考

今天给同学们分享一篇生信文章“Landscapeanalysisofm6Amodificationregulatorsrelatedbiologicalfunctionsandimmunecharacteristicsinmyastheniagravis”，这篇文章发表在JTranslMed期刊上，影响因子为7.4。结果解读：MG相关m6A修饰调控因子的鉴定在这项研究中，作者比较了MG样本和健康样

生信风暴·2023-12-16 14:36

读论文：HINet: Half Instance Normalization Network for Image Restoration

《HINet:HalfInstanceNormalizationNetworkforImageRestoration》发表于CVPR2021，是旷视科技&复旦大学&北大在图像复原方面的的最新进展，所提方案取得了

木水_·2023-12-16 08:17

CeRNA才是人生赢家，一篇著名的赤果果的文(tao)献(lu)

首先肯定要先搞清楚ceRNA是个啥，英文名competingendogenousRNAs，咱给翻译成——竞争性内源RNA。

医科研·2023-12-15 19:06

实验1：总RNA的提取——Trizol

实验一：细胞中总RNA的提取及鉴定一、目的：掌握Trizol提取总RNA的原理和步骤，学习电泳鉴定总RNA的方法。二、原理：RNA是核酸，具有较好的水溶性。

猪莎爱学习·2023-12-15 14:47

大模型在Text-to-sql领域的应用和论文

论文2022-RecentAdvancesinText-to-SQL:ASurveyofWhatWeHaveandWhatWeExpect文本到SQL的最新进展，包括数据集（第2节）和方法（第3节）。

O&REO·2023-12-15 13:56

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