rna甲基化最新进展第6页

RNA_seq:将修剪后的序列比对到参考基因组

比对参考基因组的2种软件：hisat2、subjunchisat2软件1、构建索引：官网下载：https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/manual.shtmlhisat2官网下载官方索引通过hisat2-build构建基因组索引：（不推荐）2、关于hisat2：Hisat2主要是用来进行转录组数据的比对。使用--help查看选项和参数hisat2主要参数：-x##索

javen_spring·2024-01-08 15:16

祈福长宁：所谓来生太过于渺茫，所以今生你必须珍惜！

级地震一场新的考验瞬间席卷了全国据中央电视台的新闻报道宜宾市在一个小时内共发生了5次地震，震感强烈看到这样一个新闻，都让人的心整个揪在了一起因为在11年前的汶川大地震，仿佛这一切还历历在目大家不断的刷的微博，看着地震的最新进展朋友圈陆陆续续的很多人在祝福宜宾

菠萝星球娱乐·2024-01-08 07:47

m6A图文复现01-文献解读|在人的四种不同组织中m6A甲基化的遗传驱动因素

1.文献信息标题：Geneticdriversofm6Amethylationinhumanbrain,lung,heartandmuscle发表时间：2021年7月1日杂志：NatureGenetics（2020IF=27.605）作者：麻省理工学院计算机与人工智能实验室ManolisKellis课题组数据和方法主要数据image-20210711235626527.pngm6AmeRIP–se

_十三·2024-01-07 20:36

氨基酸密码子表及偏好性（2022-05-03）

密码子（codon）是指信使RNA（mRNA）分子中每相邻的三个核苷酸编成一组，在蛋白质合成时，代表某一种氨基酸的规律。信使RNA在细胞中能决定蛋白质分子中的氨基酸种类和排列次序。

会飞的老猫·2024-01-07 18:42

【NLP】2024年改变人工智能的前六大NLP语言模型

在本文中，我们将深入研究大规模语言模型的最新进展，探讨每个模型引入的增强功能、它们的功能和潜在的应用程序。

架构师研究会·2024-01-07 07:32

外泌体多组学07-骨髓肥大细胞来源外泌体lncRNA与miRNA的有效数据量

目前市面上有很多公司外泌体RNA测序推荐的数据量很少，为了合理评价一个合适的有说服力的有效数据量，我们对公开发表的相关外泌体文章和数据进行检索和信息收集，此次文章如下：文章信息文献标题：Characterizationofprotein

_十三·2024-01-07 05:24

2018-12-23

刘强东深夜致歉，章泽天的反应让人意外，12月21日刘强东事件有了最新进展，美国检方公布刘强东涉嫌性侵案结果：不予起诉刘强东，刘强东律师声明称一切都是女方自愿，当天，美国明尼苏达州亨内平郡检察官办公室宣布

水分子简书·2024-01-07 02:30

真核原核生物常用的启动子分类

常见的真核和原核表达系统的启动子真核启动子编号启动子主要用途RNA转录本描述表达备注1CMV常规表达用m

巩翔宇Ibrahimovic·2024-01-07 00:18

微波遥感用于农业干旱监测:最新进展与挑战

Microwaveremotesensingforagriculturaldroughtmonitoring:RecentdevelopmentsandchallengesMariette微波遥感用于农业干旱监测:最新进展与挑战农业干旱是多种水文气象过程相互作用的极端事件

lihongli000·2024-01-06 23:40

粪便RNA该如何提取？

操作步骤：1.请自行准备：无水乙醇、异丙醇、PBS、1.5mLRNase-free灭菌离心管。2.取出洗涤液，按以下操作：a)洗涤液A：21mL加入9mL无水乙醇；42mL加入18mL无水乙醇，混匀。b)洗涤液B：18mL加入42mL无水乙醇；36mL加入84mL无水乙醇，混匀。c)配制好的洗涤液如出现沉淀，可在37℃溶解，摇匀后使用。3.取200mg的粪便于1.5mLRNase-free灭菌离心

清风拂面vv·2024-01-06 19:52

cellranger处理单细胞数据的一些错误记录

不完整报错报错信息原因解决方案2、化学版本选择错误报错信息原因解决方案1、由于fastq不完整报错报错信息[error]Pipestancefailed.Errorlogat:YS2310077_T_C_5/SC_RNA_COUNTER_CS

微光**·2024-01-06 14:11

空间转录组分析流程（使用Seurat对空间数据集进行分析）

使用Seurat对空间数据集进行分析，可视化和集成1、介绍本教程演示了如何使用Seurat（>=3.2）分析空间分布的RNA-seq数据。

微光**·2024-01-06 14:41

Bulk-RNA-seq流程——从测序数据到count文件(AGSdata)

2022-2-11软件安装conda的安装和配置wget-chttps://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shchmod777Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh#给执行权限bashMiniconda3-latest-Linux-x86_64.sh#运行当命令行前面出现(base)

璐璐璐璐璐952·2024-01-06 14:40

RNA-seq + 下游分析：一条龙代码

这段时间太多事，生信学习耽误了很长一段时间，这几天终于撸完了生信技能树B站的RNA-seq视频。本人黑眼圈纯粹是熬夜学生信写代码所致，无任何不良嗜好，请大家放心交友。

颗粒神经园·2024-01-06 14:08

bulk-RNA seq测序数据分析流程

假如有bulk-RNA测序的数据：TH1，TH2，TH3三个重复（实验组），TW1，TW2，TW3三个重复（对照组）准备工作需要安装的软件（如FastQC、Trimmomatic、HISAT2、StringTie

微光**·2024-01-06 14:38

从零开始的“RNA-seq“分析（STAR进行mapping)

前言在用trim_galore进行trimming后，要进行RNA-seq分析的核心部分：mapping实验室一直购买着CLCGenomicsWorkbench的版权，用户友好，使用简便，但一年大概要花费

YY生物日记·2024-01-06 14:38

体内内源基因调控之CRISPRi与CRISPRa

众所周知，CRISPR/Cas9系统可以用来操纵基因组：规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA（gRNA）的指引下，靶向基因组中的特定区域并切割DNA，产生DNA双链断裂

Seurat_Satija·2024-01-06 13:35

NGS基础概念

来源自：华大科技知识库组学研究细胞、组织或是整个生物体内某种分子（DNA、RNA、蛋白质、代谢物或其他分子）的所有组成内容，称之为“组学”（-omics），”-omics”术语代表了对怎样思考生物学和生物体系工作方式的重新定位

问菊22·2024-01-05 22:30

病毒的威胁

答：病毒分为DNA病毒（以下简称D病毒）和RNA病毒（以下简称R病毒）。

听月_·2024-01-05 04:33

东航空难有最新进展丨这部9.6分的空难纪录片突然引起大家的关注

图｜来源网络如需转载｜请后台留言3月21日下午，搭载132人的MU5735东航飞机在广西藤县坠落。最新消息显示，一部黑匣子已经找到。这几天，紧急搜救一直在进行中。据报道，事故现场，震耳欲聋的爆炸声、滚滚浓烟和火苗四溅、刺鼻的烟味、地上的巨大坑洞、还有大量的飞机残骸，当地居民对当时的情况依然心有余悸。直接说明了当时现场的惨烈。尽管，藤县坠机事故现场开始下起了大雨，现场已经一片泥泞，对搜寻造成了一定阻

顾小宝·2024-01-04 13:51

机器学习笔记 - 从2D数据合成3D数据

但随着LiDAR、RGB-D相机（RealSense、Kinect）和3D扫描仪等3D传感器的可用性和价格的提高，3D采集技术的最新进展取得了巨大飞跃。

坐望云起·2024-01-04 08:50

你是这样的人吗？

年前放假到现在已经两个半月没有上班了，起初还很开心，后来新冠肺炎爆发，所有注意力都放在了疫情上，每天都在不停的刷新闻，看疫情最新进展情况，随着数字的不断攀升，焦虑恐惧的心情也在不断增加。

笑里有清风XJ·2024-01-04 06:07

Deep Inception Generative Network for Cognitive Image Inpainting

风之羁绊·2024-01-04 05:14

NCBI的primer picker设计qRT-PCR染色法引物

mRNAandprotein此处有NRxxxxx数字，为NCBI给出的标准mRNA序列，选择一个点进去tips，选择的时候可以去页面上方，看看实际图，对应的mRNA的在基因上的对应位置再向下有NRxxxxx数字，这是非编码RNA

盘山路·2024-01-03 22:34

R语言：一致性聚类 ConsensusClusterPlus

这类文章一般会对表达量或甲基化等数据进行聚类分析，选出最优聚类数；对聚出的类组进行差异化表达分析得到DEGs，差异表达基因做GO、pathway一系列分析，在分析一下与生存的关系、免疫细胞丰度的区别，等等

生信频道·2024-01-03 20:47

分子生物学知识整理

表观遗传变异定义：是指碱基序列不变，通过DNA甲基化、组蛋白乙酰化、RNA编辑、基因沉默在、休眠转座子激活等方式影响了基因的活性，导致基因控制的性状发生改变，这种变化是可逆的，可能遗传。

雪切丝·2024-01-03 19:20

一篇关于大模型在信息抽取（实体识别、关系抽取、事件抽取）的研究进展综述

为了全面系统地回顾和探索LLMs在信息提取任务中的应用，本研究对这一领域的最新进展进行了调查。首先，我们进行了广泛的概述，将这些研

AI知识图谱大本营·2024-01-03 17:48

国自然中标小能手「m6A修饰」的新功能研究

近日，来自美国芝加哥大学、中国科学院、同济大学等多家机构的研究人员合作在《Science》发表了其最新研究成果，揭示了RNA的m6A甲基化修饰调控染色质状态和转录活性的重要机制。m6A是什么？

尐尐呅·2024-01-03 15:25

易基因｜组学研究：人类胎儿发育过程的DNA羟甲基化(5hmC)和RNA m5C动态重编程

易基因｜组学研究：人类胎儿发育过程的DNA羟甲基化(5hmC)和RNAm5C动态重编程大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。

易基因科技·2024-01-03 15:32

享知行·思维：自我催化，让你的生活像游戏一样上瘾

在生物学中，核酶具有酶的催化活性可在预选位点剪切RNA的反义RNA又称酶RNA。RNA具有催化能力的发现，改变了酶都是蛋白质的传统概念。按底物，核酶

java程序员思维·2024-01-03 13:07

对比开源大语言模型的自然语言生成SQL能力

随着GPT-4、Llama2和Falcon等大型语言模型(LLM)开发的最新进展，业界和学术界对NL

数大招疯·2024-01-03 11:28

《颈椎病效方400首》

该书反映了我国近１０年来中医药及中西医结合在治疗颈椎病方面所取得的最新成果和最新进展，具有较强的实用价值。可供从事颈椎病专业的临床、科研、教学人员参考和借鉴，亦可供广大中医爱好者及患者学习使用。

leonbamboo·2024-01-03 10:06

48个实用的生信在线工具

.Exon-IntronGraphicMaker工具链接：ttp://www.wormweb.org/exonintronimageRNA二级结构2.Mfold工具链接：http://unafold.rna.albany.edu

东风008·2024-01-03 05:49

电信珊瑚卡是哪里的套餐？电信珊瑚卡靠谱吗?

首先，可以通过关注中国电信的官方渠道（官网、官方微信公众号等）获取有关电信珊瑚卡的信息和最新进展，以便及时了解办理的具体方法。关注公众号【卡卡西神卡】大流量卡免费领！简单科普下为什么会有这么好的套餐？

百佣专注省钱·2024-01-02 20:29

RNA-seq最强综述名词解释&思维导图|关于RNA-seq，你想知道的都在这（续）

前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞

生信宝典·2024-01-02 16:05

单细胞RNA速率（RNA velocity）

RNA丰度是单个细胞状态的有力指标。单细胞RNA测序可以以高定量精度、灵敏度和通量揭示RNA丰度。然而，这种方法仅捕获某个时间点的静态快照，这对分析胚胎发生或组织再生等时间分辨现象提出了挑战。

生信小鹏·2024-01-02 14:33

ISEI日本干细胞—帕金森可以通过早期发现和早期治疗得到改善

他将解释早期症状，如何检测该疾病，以及治疗的最新进展。帕金森可以通过早期发现和早期治疗得到改善…不断发展的治

d691a545f139·2024-01-02 04:50

序列比对简介1

序列比对是生物信息学中非常重要的一部分，它可以帮助我们识别DNA、RNA和蛋白质序列中的相似性和差异性，从而推测它们在生物体内的功能。比对两个序列最简单的方法是将它们放在一起，并逐个字符进行比较。

Bioinfotec·2024-01-01 10:37

哪款试剂盒适合提取FFPE样本核酸？

提取试剂盒的选择一共14个试剂盒，包含了16种提取DNA和RNA的方法，其中RecAll和AllPrep既可以提取RNA又可以提取DNA。

evolisgreat·2024-01-01 08:39

16 RNA-seq原理及应用

image.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.pngimage.png

whykm·2024-01-01 07:38

外泌体多组学14-血浆外泌体不同建库试剂盒和比对方法和稳定性测试

最近在血液中发现的细胞外rna，包括细胞外囊泡(EVs)中的rna，再加上低起始量rna测序的进展，使科学家能够研究它们在人类疾病中的作用。

_十三·2023-12-31 20:13

2019-03-01

图片发自App缺锌将妨碍身体细胞内RNA和DNA的形成，一般人的身体组织中都含有锌，且锌主要集中在眼睛和精液里。他对于体内蛋白质的合成和多种酶发挥功效非常关键。

知识改变生活·2023-12-31 19:00

本周最新文献速递2021-03-28

Assessingtheroleofgenome-wideDNAmethylationbetweensmokingandriskoflungcancerusingrepeatedmeasurements:theHUNTstudy不想看英文题目：通过重复测量评估全基因组DNA甲基化在吸烟与肺癌风险之间的作用

橙子牛奶糖·2023-12-31 18:49

Analysis of single cell RNA-seq data 学习笔记(七)

今天我们来讨论下Seurat这个包的用法QC首先我们先介绍下UMI这个概念，UMI其实就是区分每个测序分子片段的barcode，这么做可以区分每个分子是哪一个cell表达的我们还是采用deng这个数据做例子首先我们构造Seurat的单细胞对象：library(SingleCellExperiment)library(Seurat)library(mclust)library(dplyr)seuse

小潤澤·2023-12-31 13:27

发布“最强”AI大模型，股价大涨，吊打GPT4的谷歌股票值得投资吗？

来源：猛兽财经作者：猛兽财经谷歌在AI领域的最新进展，引发投资者关注在谷歌-C(GOOGL)谷歌-A（GOOG）昨日发布了最新的AI大模型Gemini后，其股价就出现了大幅上涨，更是引发了投资者的密切关注

猛兽财经官网·2023-12-31 12:15

Rosalind 023 Perfect Matchings and RNA Secondary Structures

背景：这个题目是关于RNA二级结构和完美匹配的。题目给出了一个RNA字符串，要求计算在它的键合图中，有多少种可能的完美匹配。

Kyookk·2023-12-31 10:27

癌症基因组重测序第一讲

一、基本组学结构A,T,C,G所构成的人类基因组信息可经过修饰，由一套DNA遗传基因组延伸至带有甲基化、乙酰化等修饰的表观遗传组，同时基因组也可以按照中心法则衍生出RNA和protein，即分别为转录组和蛋白组

不想透明的小透明·2023-12-31 08:25

生信软件10 - DNA/RNA/蛋白多序列比对图R包ggmsa

R包安装BiocManager::install("ggplot2")BiocManager::install("ggmsa")DNA多序列比对图#导入内置核酸序列nt_sequences<-system.file("extdata","LeaderRepeat_All.fa",package="ggmsa")ggmsa(nt_sequences,color="Chemistry_AA",font

生信与遗传解读·2023-12-31 08:53

pyrEF双筛系统介绍

基于pyrE基因可实现双向筛选：1)该基因缺失，会造成突变株无法从头合成尿嘧啶，导致细菌死亡；2)该基因存在，可将培养基中5-FOA转化为5-FU，而5-FU可掺入DNA和RNA分子中导致细菌死亡。

自由_95ee·2023-12-31 07:34

R-loop及两种测序技术的介绍

简介：R环是一种特殊的染色体结构，由一条RNA：DNA杂合链和一条单链DNA所组成。

许我少年·2023-12-31 02:15

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