rna甲基化最新进展第4页

一文掌握R包DESeq2的差异基因分析过程

例如，肿瘤患者与正常人群相比哪些编码蛋白或非编码RNA分子发生了失调，这些失调分子是否是引发或加速肿瘤进程的潜在因素？

纪伟讲测序·2024-01-26 12:20

#AIGC##LLM##RAG# RAG：专补LLMs短板_减少LLM幻觉并多模态/RAG 技术最新进展

RAG技术，即检索增强生成，标志着自然语言处理领域的重大进展。通过整合先前知识，它提升了大型语言模型的性能，广泛应用于多模态领域和垂直行业。本文深入探讨了RAG技术的演进历程、技术发展、LLMs问题及其解决方案，为读者提供了对这一前沿技术的全面理解。RAG与LLMsRAG演进历程RAG技术的演进历程可以分为几个关键阶段，总结如下：预训练阶段：RAG概念首次于2020年提出，初期研究侧重于如何通过预

向日葵花籽儿·2024-01-26 11:23

钟汉良日记：乐买买新增37个粉丝，微信加24个好友

钟汉良日记·2024-01-26 08:12

基于TriDet的时序动作检测算法训练自己的slowfast数据

最近一直在研究时序动作识别和检测，也一直关注着目前的最新进展，有好的算法，我都会在我自己的数据集上运行看看，一方面是为自己累积相关算法，另一方面也是想看看，目前最新的算法是否可以应用到一些项目上。

骑走的小木马·2024-01-26 04:48

RNA-Seq：差异表达分析案例

白利合子酵母菌在乙酸或铜胁迫下早期反应的转录谱分析摘要：醋酸在食品工业和生物技术中是非常重要的微生物抑制化合物，而非传统酵母种白利合子酵母菌对醋酸有显著的耐受性。Zbhaa1是酿酒酵母haa1基因的功能同源物，是一种能调节白利合子酵母菌对醋酸和铜胁迫的适应性反应的双功能转录因子。在2018年5月发表的一篇文章TranscriptionalprofilingofZygosaccharomycesba

DumplingLucky·2024-01-25 22:35

2022-06-23

单细胞RNA测序的研究表明，总mRNA含量与肿瘤表型息息相关。然而，目前为止，还未出现能够对总mRNA进行大规模泛癌检查的技术。近期，美国安德森癌症中心

图灵基因·2024-01-25 21:45

文献阅读-2022-11-23-RNA结构-5'UTR的review

题目：2018_Functional5′UTRmRNAstructuresineukaryotictranslationregulationandhowtofindthem摘要:RNA分子能折叠成复杂的形状

不学无术吗·2024-01-25 13:53

2022-11-22

题目：DeterminationofinvivoRNAstructureinlow-abundancetranscripts摘要：RNA二级结构在多种生物过程中扮演重要的角色，但是，目前，大部分体内的RNA

不学无术吗·2024-01-25 04:06

Nat.Biotechnol|能靶向冠状病毒RNA的新型CRISPR工具问世

图片下载：右键此处另存为可保存此图片Cas13酶沿着RNA行走的景象。

PaperRSS·2024-01-25 01:09

17β-Estradiol high sensitivity ELISA kit

雌激素能促使细胞合成DNA、RNA和相应组织内各种不同的蛋白质。β-雌二醇(17β-Es

Neobioscience·2024-01-24 12:18

全反式维甲酸（ATAR）诱导白血细胞的染色质构象改变而影响分化进程

AlterationsofspecificchromatinconformationaffectATRA-inducedleukemiacelldifferentiation期刊：CellDeath&Disease影响因子：6.044主要技术：Hi-C、ATAC-seq、ChIP-seq、RNA-seq

d5c9c866171f·2024-01-24 11:45

2021-03-01 ner最新进展

2021.3.11.ACL2020|TriggerNER：高效命名实体识别框架摘要：本文由南加州大学和亚马逊联合发布，文章题目为《TriggerNER:LearningwithEntityTriggersasExplanationsforNamedEntityRecognition》，已经被ACL2020录用。文章针对命名实体识别中存在的需要大量耗时耗力的人工标注工作现状提出了方法TriggerN

你若安好_4a49·2024-01-24 03:24

2021-11-26

丨非小细胞肺癌单细胞分析细化了肿瘤分类和患者分层原创珍奇图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：珍奇IF：31.743推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本研究通过多尺度单细胞分析对更大的患者队列进行分析，从而定义在肿瘤微环境中诱导的分子免疫状态；通过测序将免疫细胞的单细胞RNA

图灵基因·2024-01-23 22:41

翻译（4）siRNA

siRNAs在植物中，约90％的小RNA是来源于双链前体的siRNA。它们的长度可以进一步分为21-nt，22-nt和24-nt类。

Yancey_Yan·2024-01-23 19:50

TPM、RPKM与FPKM相互转换

RNA数据下机后，如果处理成readcountsmatrix的话，是一定要进行基于基因长度的标准化的（TMP，RPKM，TPKM等）。

Seurat_Satija·2024-01-23 18:39

石蜡包埋组织RNA提取步骤

产品特点◎裂解液、消化液经专门优化，无需过夜温育即可从福尔马林固定的、石蜡包埋组织中高效纯化基因组RNA；◎提取的RNA纯度高，A260/A280为1.8-2.0；◎产率高，同样的样本量提取的RNA更多

清风拂面vv·2024-01-23 17:03

StringTie在注释基因组时的注意事项

在利用RNA-seq注释基因组时，有一个问题就是，我将不同组织来源的转录组数据和参考基因组比对之后，那下一步是1）先将这三个比对结果进行合并，然后用StringTie进行预测，还是2）用StringTie

xuzhougeng·2024-01-23 14:16

高温季节，植物病毒病如何防治？？？

植物病毒在寄主细胞中进行核酸（RNA或DNA）和蛋白质外壳的复制，组成新的病毒粒体。植物病毒粒体或病

农事巴巴·2024-01-23 09:23

2023年全球软件架构师峰会（ArchSummit深圳站）：核心内容与学习收获（附大会核心PPT下载）

在峰会中，与会者可以了解到数字化、AIGC、ToB业务、金融技术、稳定性保障等领域的最新进展和前沿技术。同时，峰会还邀请了多位业内专家和优秀实践者发表演讲，分享他们在软件架构领域的实践经验和解决方案。

百家峰会·2024-01-23 03:58

生物信息学导论-北大-新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq 1

ref:https://www.coursera.org/learn/sheng-wu-xin-xi-xue/home本文主要来自本课的讲义+搜索内容。Real-TimeqRT-PCR基于互补杂交反应（complementaryhybridizationreaction），PCR技术的发展促进了本技术的发展，缺点是：1.低通量2.需要有转录本序列的先验知识。步骤：Real-TimeQuantita

陆沙·2024-01-23 00:50

关于文章发表中McrBC实验需配备的图

McrBC是一种检测基因组小部分区段的DNA甲基化情况的核酸内切酶。只能降解甲基化的区域，对未甲基化区域不起作用。

热衷组培的二货潜·2024-01-22 20:40

Reads, Metagenomic assembly, and custom MAGs的区别与联系解读

研究者通常会涉及到以下三个数据类型，每个都有其独特的角色和应用：Reads（读数）:定义：Reads是从原始测序数据（例如Illumina测序的FASTQ文件）中获得的短序列片段，通常包含原始样本中的DNA或RNA

WDPLA·2024-01-22 15:18

无人机应用介绍

本文从无人机平台、小型化高光谱传感器、系统集成、数据观测和预处理等方面介绍了无人机载高光谱遥感的最新进展。此外，还介绍了无人机在农业、林业

qq_35990565·2024-01-22 15:44

转录组测序1-测序原始数据说明

样品制备到产出测序数据过程，是RNA提取建库和测序的试验环节。在使用Illumina

纪伟讲测序·2024-01-22 08:45

零代码进行转录组数据分析实战（一）：质量控制

RNA提取、片段化、逆转录以及上机测序。生信：生物信息分析阶段。数据质控、比对、定量，以及差异表达基因分析等。从本文开始，着眼于生信阶段，开始带领大家进行转录组实战。首先就是测序数据质控。

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-22 08:49

深度学习和大数据技术推动自然语言处理迈向新高度

能力工场小马哥·2024-01-22 07:03

累⊙﹏⊙

不过我可以做好我自己～《平凡的世界》里晓霞死了，虽然挽回了一个年幼的生命，但还是很令人揪心；《破冰行动》里马雯中弹了，不开心(;_;)说句不好听的，为什么不是陈珂…希望明天提RNA一切顺利！

阿喵同鞋·2024-01-21 23:47

【论文解读】用于代码处理的语言模型综述

.简要介绍2.代码处理的语言模型的评估3.通用语言模型4.用于代码处理的特定语言模型5.语言模型的代码特性6.软件开发中的LLM7.结论与挑战1.简要介绍在这项工作中，论文系统地回顾了在代码处理方面的最新进展

合合技术团队·2024-01-21 15:23

周报第二十八周

science文章《SinglecellDNAmethylationand3Dgenomearchitectureinthehumanbrain》，改文章主要用了integration的数据集利用dna甲基化的信息来进行计算

Twenrr·2024-01-20 22:48

两条命令就跑完RNA差异分析

它就是simpleRNA，居然只要两条命令就能跑完复杂的RNA差异分析，并生成结果矩阵和结果图！

基因组学研究生·2024-01-20 18:01

【卡梅德生物】如何制备纳米抗体?

纳米抗体的制备通常涉及到从动物源（如骆驼、羊驼）提取RNA或cDNA，然后通过分子生物学技术将其克隆并表达。

卡梅德生物·2024-01-20 12:37

第4周：Pytorch——综合应用和实战项目 Day 28-30: 学习资源和社区参与

M.D·2024-01-20 06:27

【生信知识】---Nanopore测序分析软件nanopolish

github.com/jts/nanopolish.gitcdnanopolishmake或者，通过conda安装：condainstallnanopolish2.主要功能：call-methylation：识别甲基化

卡布达b1·2024-01-20 02:44

【学习笔记】mark一篇推荐系统的文章

在做一道RNA中Dropout事件填充的建模题，里面要用到低秩矩阵的填充，基于矩阵分解的填充方法参考了推荐系统的相关算法。mark一篇推荐系统的文章基于矩阵分解的推荐算法

Jweeeeee·2024-01-19 23:53

ceRNA：一种全新的基因表达调控模式

竞争性内源RNA（ceRNA）是近几年来备受学术界关注的对象，它代表了一种全新的基因表达调控模式，相比miRNA调控网络，ceRNA调控网络更为精细和复杂，涉及更多的RNA分子，包括mRNA、编码基因的假基因

Seurat_Satija·2024-01-19 08:51

ALKBH5通过m6A-dependent表观遗传沉默pre-miR-181b-1/YAP信号轴抑制骨肉瘤的进展

N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA中最丰富的可逆甲基化修饰。近年来，许多研究集中在m6a修饰的mRNA的生物学功能上。m6A修饰被

博士苑·2024-01-19 03:27

不做WB或免疫组化，也能轻松完成蛋白验证 | 蛋白组数据库推荐

其利用转录组学和蛋白质组学技术，从RNA和蛋白水平研究人类不同组织和器官中的蛋白表达

尐尐呅·2024-01-19 00:30

新型冠状病毒

1.遗传物质：RNA2.作用特点：传染性强、致死率低3.必须寄生生活，无法独立生存。4.防护建议：病毒会从口、眼睛、鼻子等体内与外界相通的地方进入体内，建议出门戴口罩，不用手触碰眼睛。

希望珍贵·2024-01-19 00:03

结构变异SV分析(WGS/WES)和融合基因检测（RNA）

69种工具检测SV对比https://www.jianshu.com/p/85ff211b4b4ehttps://zhuanlan.zhihu.com/p/87408242?utm_campaign=rss&utm_medium=rss&utm_source=rss&utm_content=title最终决定使用wham和Manta组合，其实最优组合应该是wham，inGAP-SV组合或者inGA

wo_monic·2024-01-18 16:31

唾液 RNA 提取试剂提取后的 RNA 可用于核酸检测使用？

产品特点◎提取RNA纯度高，无抑制剂，A260/A280为1.8-2.0；◎产率高，同样的样本量提取的RNA更多；◎可用于唾液样本中RNA的提取，提取后的RNA可用于核酸检测使用；◎不含苯酚和氯仿等有毒溶剂

清风拂面vv·2024-01-18 15:19

05-IF4+从DNA修复基因的角度构建胶质瘤的预后模型

一.研究背景表观遗传时钟，或DNA甲基化年龄，已被证明与年龄高度相关。同时有研究在结直肠癌中观察到表观遗传年龄加速，即DNA甲基化年龄与个体年龄差异。

AAA肿瘤信息学王协·2024-01-18 15:42

纯生信分析套路甲基转移酶相关因子的预后分析

今天跟大家分享的是2020年4月底发表在FrontiersinOncology（IF:4.85）上的一篇文章，有套路（分型-筛marker-预后模型构建,简单吧），只是关注的点变成甲基化转移酶相关因子。

音十千寻·2024-01-18 13:04

文献阅读：单细胞 RNA 测序揭示分子定义的肌间神经元类别的多样化

文献介绍「文献题目」Diversificationofmolecularlydefinedmyentericneuronclassesrevealedbysingle-cellRNAsequencing「研究团队」UlrikaMarklund（KarolinskaInstitutet）「发表时间」2020-12-07「发表期刊」NatureNeuroscience「影响因子」25.0「DOI」10

Tiger Z·2024-01-18 12:30

时空预测 | 基于图神经网络的时空预测

机器学习之心·2024-01-18 09:14

一文带你读懂单细胞测序

单细胞转录技术（scRNA-seq）非常适合研究样本中各个细胞基因表达的异质性，其经典流程：分离单细胞（核），将RNA转换为cDN

生信大碗·2024-01-18 00:53

2022-07-01

NatureCellBiology|活细胞动态RNA成像技术原创苏安图灵基因2022-07-0109:13发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术撰文：苏安IF：28.824推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本文的作者带我们回顾了

图灵基因·2024-01-18 00:28

HDMAC-不会R语言也可以用Lasso筛选高维数据了

医科研·2024-01-16 22:18

互联网方法论之十三——依靠广度感知细微变化

于是再往内在走，通过穿刺获得样本，分析那些核心部位的DNA和RNA分子，蛋白质分子。越往内在走，要求的

891e64c433d2·2024-01-16 20:18

低代码高逻辑谱写IT组织和个人的第二成长曲线 | 专访西门子Mendix中国区总经理王炯

近日，LowCode低码时代访谈了西门子Mendix中国区总经理王炯，详细解读了低代码技术的最新进展，特别是Mendix如何在快速变化的领域中保持领先。

RPA中国·2024-01-16 13:27

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