tidyverse

科研绘图系列：R语言扩展物种堆积图（Extended Stacked Barplot）

加载R包knitr::opts_chunk$set(warning=F,message=F)library(tidyverse)library(phyloseq)library(g

生信学习者1·2024-09-09 16:10

9.字符串

1.1加载包本节介绍的字符串操作使用的是stringr包，它是tidyverse核心部分之一。library(tidyverse)2字符串基础可以使用单引号或双引号创建字符串。

denghb001·2024-09-05 17:44

科研绘图系列：R语言组合堆积图（stacked barplot with multiple groups）

加载R包knitr::opts_chunk$set(warning=F,message=F)library(tidyverse)library(cowplot)library(patchwork)导入数据数据可从以下链接下载

生信学习者2·2024-09-02 01:45

R 数据处理（四）

下面我要介绍的是tidyverse中的readr包提供的读取矩阵型数据的方式readr的目标是提供一种快速友好的方式来读取矩阵型数据，如csv,tsv和fwf等。

名本无名·2024-08-25 18:15

R语言安装包tidyverse时，报Error: package or namespace load failed for ‘tidyverse’ 错误

R语言再安装tidyverse包时，宝如下的错误：>library(tidyverse)#操作Error:packageornamespaceloadfailedfor‘tidyverse’inlibrary.dynam

石榴花专场·2024-03-13 06:26

R语言编程-Tidyverse 书籍-第二章（1）

本章节主要讲数据操作三个关键点向量化编程思维和函数式编程思维，应用在数据框或更高级的数据结构中将复杂数据操作分解为若干基本数据操作的能力：数据连接、数据重塑（长宽变换/拆分合并列）、筛选行、排序行、选择列、修改列、分组汇总接受数据分解的操作思维1管道操作magrittr包引入了管道操作，能够通过管道将数据从一个函数传给另一个函数，从而用若干函数构成的管道依次变换你的数据。例如x%>%f()%>%g

Hello育种·2024-02-26 00:04

2019-02-03

R4DSwj2019,2,2library(tidyverse)library(nycflights13)library(forcats)library(lubridate)library(modelr

蜀山黔水·2024-02-19 21:46

R语言编程-Tidyverse 书籍 - 第三章 - 统计建模

1整洁模型结果-broom包tidyverse主张以‘‘整洁的”数据框作为输入，但是lm,nls,t.test,kmeans等模型的输出结果，却是‘‘不整洁的”列表。

Hello育种·2024-02-10 16:12

dplyr1.0.0 重点内容 across()、slice_*()、nest_by()、mutate(.keep, .names, .before, .after)、rowwise()、rel...

翻译链接为：MyFavoritedplyr1.0.0Features加载包和数据#install.packages("AmesHousing")library(AmesHousing)library(tidyverse

热衷组培的二货潜·2024-02-09 10:01

生信星球学习小组第129期Day6-爆爆

今天以dplyr为例学习R包，可怜我的小破电脑安装不了包，只能先将文字版本整理下来dplyr包是用于数据清理的高效R包，是tidyverse的核心包之一安装和加载R包设置镜像https://mp.weixin.qq.com

爆不了米花·2024-02-08 11:21

docker数据科学与spark镜像源与使用常见问题疑难解答

rocker/tidyverse:此镜像包含用于R语言的tidyverse数据科学包。jupyter/scipy-notebook:此镜像包含用于Python语言的SciPy科学计算库。rstudio

DreamNotOver·2024-02-08 01:16

单细胞分析常用包

install.packages("devtools",dependencies=T)install.packages("BiocManager",dependencies=T)install.packages("tidyverse

Drgexy·2024-02-05 10:18

R语言小作业-中级

首先需要完成R语言练习题-初级，在http://www.bio-info-trainee.com/3793.html#设置镜像，安装包，使用循环嵌套cran_packages<-c('tidyverse

weixinsuoxian·2024-02-02 22:48

Scillus——提高scRNA-seq数据的处理和可视化(二)

数据处理1.加载原始数据首先要加载scRNA-seq原始数据：library(Scillus)library(tidyverse)library(Seurat)library(magrittr)scRNA500&

denghb001·2024-02-01 23:51

ggplot2回顾(2): 图层语法入门

library(ggplot2)library(tidyverse)1.散点图mpg%>%ggplot(aes(x=displ,y=hwy,color=as.factor(cyl)))+geom_point

TOP生物信息·2024-02-01 21:20

DAY7+ 学习笔记 by 康康

《R与tidyverse——数据分析入门》学习笔记R与tidyverse——数据分析入门3.dataframe和tibbleR中的多变量数据的标准保存形式是dataframe；tibble是dataframe

ReneeeeKKKK·2024-02-01 21:23

ggplot2 在 R 中自定义相关热图

corrgram、ggcorrplot等，这些R包都有丰富的功能，但是如果需要对图像进行自定义难免受到他人函数约束，下面介绍如何自定义准备ggplot2需要的相关性数据下载并加载R包package.list=c("tidyverse

R语言数据分析指南·2024-01-30 05:22

dplyr总结篇

%(1:10)用法比较重要-arrange用于排列行，desc()用于设定降序排列，这一点与sort函数类似slice用于删减行，可以按位置索引进行删减举基因表达矩阵的例子来说明更生动library(tidyverse

医科研·2024-01-27 05:40

R语言应用-1：数据整理

spm=1001.2014.3001.5502目录一.数据整理--tidyverse包1.数据导入导出及读取2.类似数据库操作：mu

up_xin·2024-01-26 04:40

dplyr 1.0.0 之列操作

dplyr1.0.0之列操作加载包library(tidyverse)多列进行同样的操作比如:对数据df中的a、b、c、d列都取他们的平均值：df%>%group_by(g1,g2)%>%summarise

热衷组培的二货潜·2024-01-19 11:14

ggplot2绘制折线图

加载需要的R包：library(reshape2)library(tidyverse)library(ggplot2)导入数据：data<-read.

钿璎纍纍佩珊珊·2024-01-19 04:09

tidyverse包简介

tidyverse包是对一些具有相同思想，且可以一同工作的R包的收集。载入tidyverse包的时候提醒哪些包是一同载入的，哪些包是有冲突的。

LeoinUSA·2024-01-17 19:33

R 数据可视化 —— 图形排列之 cowplot

安装install.packages("cowplot")#安装最新的开发版本remotes::install_github("wilkelab/cowplot")导入相关包library(tidyverse

名本无名·2024-01-11 09:21

ggplot2绘制圆形热图

这节来介绍如何通过ggplot2绘制圆形热图，为了方便各位观众老爷观看，我制作了一个交互式文档https://mp.weixin.qq.com/s/lbTqk8ZlLp6A-VX-MYLgFA加载R包library(tidyverse

R语言数据分析指南·2024-01-10 13:53

单因素方差分析--R

数据library(tidyverse)library(reshape2)#install.packages("gplots")library(gplots)dfF)#variable259352529676245.62.2

All_Will_Be_Fine噻·2024-01-10 10:40

【R>>ggplot2】坐标轴刻度位置调整

下面以ToothGrowth为例：rm(list=ls())library(tidyverse)library(ggsci)data(ToothGrowth)head(ToothGrowth)ToothGrowth

高大石头·2024-01-08 18:48

ggplot2优雅的自定义分面轴刻度

本节来解释如何使用ggh4x自带的facetted_pos_scales()来自定义分面图形的轴刻度加载R包library(tidyverse)library(ggh4x)数据清洗air_df%pivot_longer

R语言数据分析指南·2024-01-08 06:29

听说你的单细胞对象需要一个思维导图？

library(Seurat)library(tidyverse)pbmc%NormalizeData()%>%FindVariableFeatures()%>%ScaleData()%>%RunPCA

周运来就是我·2024-01-03 10:52

ggplot2回顾(12): 一页多图

library(tidyverse)library(grid)p1%ggplot(aes(x=mpg,y=wt,color=factor(cyl)))+geom_point()p2%ggplot(aes

TOP生物信息·2024-01-02 11:57

R: Introduction to the Tidyverse

1.datawranglinglibrary(gapminder)/*加载数据集*/library(dplyr)gapminder/*checkthedataset*/Thefilterverb#Singleconditiongapminder%>%filter(year==1957)#Multipleconditionsgapminder%>%filter(year==2002,country=

610今天长脑子了吗·2023-12-31 15:16

使用R优雅的处理压缩文件

本节介绍在R中如何生成zip，tar.gz等格式的压缩文件，并批量读取压缩文件，废话不多说直接开干安装并加载R包package.list=c("tidyverse","archive","readr")

R语言数据分析指南·2023-12-29 23:35

r 函数返回多个值_哈佛R语言课程8.Tidyverse

原文链接：https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/08_intro_tidyverse.html系列目录推荐一套来自哈佛的

weixin_39639040·2023-12-26 06:51

RStudio实现空气质量数据可视化

使用工具：RStudio使用包：RMySQL，Tidyverse，Openair数据来源：真气网绘图所用数据：长春市每日数据前言：在前期的文章中，我们学会了如何用Python实现各地空气质量数据的抓取，

鲨瓜·2023-12-23 19:58

R语言中使用ggplot2绘制散点图箱线图，附加显著性检验

加载R包与数据library(ggpubr) library(patchwork) library(ggsci)library(tidyverse)# 使用R语言自带的iris数据集，

生信分析笔记·2023-12-23 07:07

R语言【tidyselect】——all_of，专门在select函数中传递字符型向量，比如select(all_of(vars))，必须保证所有传入值都有用，否则报错

Examplelibrary(tidyverse)#Forb

ALittleHigh·2023-12-23 02:15

R语言编程-Tidyverse 书籍-第一章（1）

出发点：因为tidyverse简洁编码，使R代码更加易读。我就想系统再次学习下R，这样让自己写的R代码更加简洁。

Hello育种·2023-12-22 23:08

[13] 《R数据科学》使用dplyr进行数据转换

准备工作library(nycflights13)library(tidyverse)ny

灰常不错·2023-12-21 13:39

R语言生物群落（生态）数据统计分析与绘图丨R语言基础、tidyverse数据清洗、多元统计分析、随机森林模型、回归及混合效应模型、结构方程模型、统计结果作图

R语言的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂，涉及众多统计分析方法。本教程以生物群落数据分析中的最常用的统计方法回归和混合效应模型、多元统计分析技术及结构方程等数量分析方法为主线，通过多个来自经典研究中的实例，详细讲述各方法的R语言实现途径（详见教学内容）。主要特点为聚焦生态学研究领域，从R语言基础操作和作图、数据准备整理，到各种数量分析方法的应用情景分

小艳加油·2023-12-20 06:01

用tidyr包进行长数据和宽数据的相互转换

笔记说明tidyr包是一个用于整理数据结构的r包，也是tidyverse的核心包之一。本次笔记介绍tidydata、长数据、宽数据的相关概念以及用于长数据、宽数据相互转换的函数。

新云旧雨·2023-12-18 15:16

小tips: 如何画简单的correlation图并调整图距

library(tidyverse)library(ggpubr)r%round(.,digits=3),0.6543%>%round(.,d

土豆西红柿青椒·2023-12-16 21:03

installation of package ‘blob’ had non-zero exit status

今天想要安装tidyverse，但是遇到这个问题install.packages("tidyverse",dependencies=TRUE)Warningininstall.packages:installationofpackage

土豆西红柿青椒·2023-12-16 21:03

R | 提取GO分类下的所有基因

问题描述有时候我们想知道与某一个GO注释分类相关的基因有哪些，那么我们就需要一种方法将注释到这个GOterm所有的基因提取出来解决方案在搜索一轮后，发现可以通过以下代码解决：library(tidyverse

尘世中一个迷途小书僮·2023-12-15 22:26

使用tibble实现简单数据框

tibble包是tidyverse的核心R包，其所提供的简单数据框更易于在tidyverse中使用。

生信编程日常·2023-12-06 15:07

统计注释出的基因数目，基因长度，外显子和CDS长度

1.首先统计基因数目，直接使用linux统计：awk'$3=="gene"'myannotation.gff|wc-l##统计注释文件中第三列为gene的行数，即为基因的数目2.统计基因长度，使用tidyverse

纵纵纵小鸮·2023-12-04 01:52

使用R自带的数据集 Titanic，绘制以下图形 R语言

请确保已安装并加载了ggplot2和tidyverse这两个R包，它们将帮助我们进行数

TechInk·2023-12-02 08:51

R脚本进行长宽数据转换

1.R脚本进行长宽数据转换library(tidyverse)df=tibble(Class=c("1班","2班"),Name=c("张三，李四，王五","赵六，钱七"))df###Atibble:2x2

R语言爱好者·2023-12-01 03:36

2021-05-16 scRNA基础分析：差异基因富集分析

基因差异表达分析#基因差异表达分析library(Seurat)library(tidyverse)library(patchwork)l

学习生信的小兔子·2023-11-28 18:03

R语言编程-Tidyverse 书籍-第一章（2）