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Linux
tidyverse
R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect model|附代码数据
knitr::opts_chunk$set(echo=TRUE)library(
tidyverse
)#数据处理lib
·
2023-06-14 23:38
R语言
tidyverse
系列学习笔记(系列5)dplyr 数据分析之across
成绩单scoreinstall.packages("dplyr")library(dplyr)install.packages("tibble")library(tibble)install.packages("stringr")library(stringr)score=tibble(ID=c("1222-1","2001-0","3321-1","4898-0","2782-0","1002-
来份芒果布丁
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2023-06-14 20:34
r语言
数据分析
tidyverse
dplyr
生信
拓端数据tecdat|R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect model
knitr::opts_chunk$set(echo=TRUE)library(
tidyverse
)#数据处理library(lme4)#lmerglmer模型me_data<-read_csv
·
2023-06-14 18:36
tidyverse
高效数据处理
title:"
tidyverse
高效数据处理"author:"黄天元"date:"rSys.Date()"output:prettydoc::html_pretty:theme:caymanhighlight
蓝色滑行
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2023-06-14 13:44
R语言
tidyverse
系列学习笔记(系列2)表格的处理
创建一个得分表scoreinstall.packages("dplyr")library(dplyr)install.packages("tibble")library(tibble)install.packages("stringr")library(stringr)score=tibble(ID=c("1222-1","2001-0","3321-1","4898-0","2782-0","1
来份芒果布丁
·
2023-06-13 13:07
r语言
tidyverse
数据分析
dplyr
生信
R语言
tidyverse
系列学习笔记(系列3)具体任务的处理(成绩单为例)
score成绩单install.packages("dplyr")library(dplyr)install.packages("tibble")library(tibble)install.packages("stringr")library(stringr)score=tibble(ID=c("1222-1","2001-0","3321-1","4898-0","2782-0","1002-
来份芒果布丁
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2023-06-13 13:07
r语言
tidyverse
数据分析
R语言
dplyr
R语言
tidyverse
系列学习笔记(系列4)PlantGrowth - percentage table
本篇学习数据分析,Excel表格制作Task:创建一个行百分比表格rowpercentagetable先看一下PlantGrowth数据集library(dplyr)data("PlantGrowth")view(PlantGrowth)给数据集新加一列weight_cat,并用case_when自定义名称PG=PlantGrowth|>mutate(weight_cat=case_when(we
来份芒果布丁
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2023-06-13 13:36
r语言
生信
tidyverse
数据分析
Tidyverse
包安装出现问题
Tidyverse
包安装出现如下问题:Warningininstall.packages:installationofpackage‘
tidyverse
’hadnon-zeroexitstatus。
多克托刘
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2023-06-13 08:22
# WGCNA | 不止一个组的WGCNA怎么分析嘞!?~(四)(共识网络分析-第四步-共识模块与性状相关联)
2用到的包rm(list=ls())library(
tidyverse
)library(WGCNA)3示例数据我们这个时候要把前面清洗好,构建好的网络数据拿出来吧。load("./Co
生信漫卷
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2023-06-11 16:03
后端
R语言生物群落(生态)数据统计分析与绘图(从数据整理到分析结果展示)
R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等3)R语言数据文件读取、整理及存储等4)R语言基础绘图(含ggplot):基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储专题二:R语言数据清洗-
tidyverse
asyxchenchong888
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2023-06-09 21:17
生态
环境
r语言
开发语言
stringr | 文本处理方法(Ⅰ-1):字符串处理函数(上)
stringr是
tidyverse
系列包中专门用于文本处理的工具包,其中字符串处理的函数均遵循str_*的命名方式。library(stringr)本篇先简单介绍部分str_*()系列函数。
R语言学堂
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2023-06-09 14:25
字符串
python
js
css
正则表达式
r语言
tidyverse
教程:5 字符串处理stringr
文章目录R语言系列:编程基础循环语句向量、矩阵和数组列表、数据帧排序函数apply系列函数
tidyverse
:readrtibbletidyrdplyrstringrstringr是
tidyverse
的字符串处理函数
微小冷
·
2023-06-09 14:52
R语言
r语言
tidyverse
stringr
字符串
R语言
tidyverse
系列学习笔记(系列1)
tidyverse
译“洁净的宇宙”=>“极乐净土”以iris鸢尾花数据集为例**查看数据集****查看维度dimention**dim(iris)iris数据集有150个对象(observation),
来份芒果布丁
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2023-06-08 22:28
r语言
tidyverse
数据分析
生信
1030 chapter13 & 14
不要使用管道的情况操作步骤超过10个多个输入和输出操作步骤构成有复杂依赖关系的有向图其他工具
tidyverse
中所有包都会自动加载%>%%T>%返回左侧想%<>%可以进行赋值操作创建函数选择函数名称列举
森尼啊
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2023-06-08 15:02
r语言
tidyverse
教程:4 dplyr
文章目录简介和数据准备行列筛选mutate数据概述集合运算R语言系列:编程基础循环语句向量、矩阵和数组列表、数据帧排序函数apply系列函数
tidyverse
:readrtibbletidyrdplyr
微小冷
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2023-06-07 10:16
R语言
r语言
开发语言
tidyverse
dplyr
mutate
conda-安装R包
r_de.yaml,并在其中输入环境的名字、安装包的channels和需要的包name:r-dechannels:-conda-forge-biocondadependencies:-r-base=4.1-r-
tidyverse
尘世中一个迷途小书僮
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2023-05-20 11:01
2021-05-04ggplot2绘制雷达图
原文链接数据获取和准备devtools::install_github("JaseZiv/worldfootballR")#安装包library(worldfootballR)#用于网页信息爬取library(
tidyverse
iColors
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2023-04-21 17:08
2021-05-11 scRNA基础分析: 降维与聚类
寻找高变基因##寻找高变基因library(Seurat)library(
tidyverse
)library(patchwork)library(dplyr)rm(list=ls())#加载数据scRNA
学习生信的小兔子
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2023-04-20 15:43
数据分享|R语言决策树和随机森林分类电信公司用户流失churn数据和参数调优、ROC曲线可视化|附代码数据
library(
tidyverse
)# 电信客户流失率数据churn % trang()chuest % tesg()#在训练数据集上创建交叉
·
2023-04-18 22:40
数据挖掘深度学习机器学习算法
R包开发实例
准备加载devtools包,它是一组支持包开发的各个方面的包library(devtools)仅出于表示的目的,我们使用fs(用于文件系统工作)和
tidyverse
(用于轻量级数据处理)。
小天冲冲冲
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2023-04-18 20:42
r语言
开发语言
R语言stringr包处理字符串
stringr包是R数据处理神器
Tidyverse
包中的工具之一,是处理字符串很好用的工具,结合正则表达式,可以发挥巨大作用。
亘心37
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2023-04-17 17:17
新手如何理解管道符号
R语言的管道符号%>%出自R包
tidyverse
,表示前一句代码的输出作为后一句代码的输入。举个栗子补充:iris是一个R语言内置数据框,filter
小洁忘了怎么分身
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2023-04-17 08:58
使用ggplot2画 点图、箱线图、小提琴图、蜂窝图、云雨图
使用ggplot2画点图、箱线图、小提琴图、蜂窝图、云雨图加载包library(
tidyverse
)library(cowplot)library(ggrepel)library(ggsci)library
μμ豆奶
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2023-04-17 07:27
r语言
r语言
Rdata004 使用tibble实现简单数据框
本章会介绍tibble包,其所提供的简单数据框更易于在
tidyverse
中使用。多数情况下,我们会交替使用tibble和数据框这两个术语
caoqiansheng
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2023-04-12 14:37
ggplot2回顾(3): 图层语法基础
library(ggplot2)library(
tidyverse
)library(scales)library(nlme)1.图层图层五要素数据集:每个图层都可以有自己的数据集一组图形属性的映射:设定和映射之间的区别几何对象
TOP生物信息
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2023-04-11 19:49
2020-05-18 GGplot2主题和拓展包
image.png71个注册的ggplot2拓展包https://exts.ggplot2.
tidyverse
.org/gallery/imageggQQunifStar2MakeQQplotsforbigdataexpectedtobeuniformlydistributed
iColors
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2023-04-11 09:44
R语言处理数据——janitor包的介绍及使用
janitor是一个对标
tidyverse
的包。具体来讲,它与%>%这一pipeline配合的很好,并针对清理re
小八四爱吃甜食
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2023-04-11 02:29
r语言
excel
开发语言
[R构建函数基础篇] 计算多样性指数及绘图
本节来介绍如何R来自定义构建函数来进行多样性指数计算及绘图加载R包library(
tidyverse
)library(vegan)library(rstatix)library(ggpubr)library
R语言数据分析指南
·
2023-04-09 11:29
【R】微生物网络构建简单方法汇总
我就当个搬运工把代码整理了一下(注:书籍和示例数据在公众号PLANTOMIX后台回复“微生物组分析”即可获取下载链接噢):library(ggraph)library(vegan)library(MCL)library(
tidyverse
研究僧小蓝哥
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2023-04-06 13:32
ggplot2绘制带误差线的折线图(经典版)
本节来介绍如何通过ggplot2绘制带误差线的折线图,介绍2种方法一种传统方法&经典方法加载R包library(
tidyverse
)library(ggsci)library(patchwork)传统方法传统方法依然是先整理数据
R语言数据分析指南
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2023-04-05 20:48
R: 距离,聚类,建树
1输入数据library(
tidyverse
)#datamanipulationlibrary(
小白菜学生信
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2023-04-04 15:17
[读书笔记r4ds]14. Strings
r4dsIIDataWrangleDataWrangle分为3个步骤:import,tidytransformation.image.png这一章讲字符串的操作,用到的R包主要是Stringr.library(
tidyverse
茶思饭
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2023-04-03 14:04
R语言生物群落数据统计分析与绘图
包含:《R语言基础》、《
tidyverse
数据清洗》、《多元统计分析》、《随机森林模型》、《回归及混合效应模型》、《结构方程模型》、《统计结果作图》七合一版本R语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析
xiao5kou4chang6kai4
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2023-04-02 19:05
农业
环境
生态
r语言
数据挖掘
数据分析
linux学习100篇3:Error in open.connection(3L, "rb") 换个时间点就打开了
>library(
tidyverse
)>cell_markers%+tidyr::unite("cellMarker",tissueType,cancerType,cellName,sep=",")%>
Seurat_Satija
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2023-04-01 21:25
R可视化——地图绘制及数据的添加
加载所需R包rm(list=ls())setwd('D:\\map')#设置工作环境#加载包library(
tidyverse
)library(sf)library(ggspatial)数据获取与加载1
科研那点事儿
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2023-04-01 20:32
处理因子的一些函数
forcats包是一个专门用于处理因子(factor)的r包,现在也成为了
tidyverse
的核心包之一。本次笔记介绍处理因子的一些函数,不全都是forcats包里的。
新云旧雨
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2023-04-01 11:38
R for data science chap21——使用ggplot2进行图形化沟通
library(
tidyverse
)21.2标签1、labs()ggplot(mpg,aes(displ,hwy))+geom_point(aes(color=class))+geom_smooth(se
陆慕熙
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2023-03-30 10:48
2021-04-28corrmorrant包快速绘制相关图
corrmorrant.html)一行代码轻松绘制相关图安装包remotes::install_github("r-link/corrmorant")加载包和绘图library(corrmornt)library(
tidyverse
iColors
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2023-03-30 03:43
tidyverse
学习
最近数据格式太繁杂了,感觉想要写出简单漂亮的代码还是需要学习一下
tidyverse
。
KK_f2d5
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2023-03-29 06:53
R中可以处理因子的一切-forcats包(一)
forcats包是
tidyverse
生态中的一个,所以直接加载
tidyverse
就好了哈library(
tidyverse
)rm(list=ls())options(stringsAsFactors=T
灵活胖子的进步之路
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2023-03-27 13:24
ggplot2优雅的绘制华夫图
R包安装与加载package.list=c("
tidyverse
","wesanderson","lubridate","ggstream",ggwaffle"waffle","extrafont")for
R语言数据分析指南
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2023-03-27 00:42
R中重命名数据框的列名
library(
tidyverse
)my_data%rename(sepal_length=Sepal.Length,sepal_width=Sepal.Width)使用R基本函数进行重命名首先使用names
小白_加油
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2023-03-26 22:44
morning 是字符串的内容变成good_小洁详解《R数据科学》--第十章 使用stringr处理字符串(上)...
1.准备工作library(
tidyverse
)library(stringr)2.字符串基础单引号和双引号没有区别转义符号\,对于反斜杠和引号需要转义。
weixin_39836803
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2023-03-25 21:04
morning
是字符串的内容变成good
R 下载和整理KEGG ORTHOLOGY文件
library(rjson)library(jsonlite)library(
tidyverse
)KO%unnest(cols=c("children.name","children.childr
leoxiaobei
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2023-03-25 17:23
制作fasta文件(标准化)
文件及其index索引文件fasta文件更改headerrm(list=ls())suppressMessages(library(Biostrings))suppressMessages(library(
tidyverse
落寞的橙子
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2023-03-24 14:33
2021年你应该学会的20个R包
包功能
tidyverse
家族dplyr变量操控tidyr数据(结构)整理ggplot2画图purrr定义、应用函数,操作lists等stringr字符操作lubridate日期
多多爸
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2023-03-21 03:21
R语言——ggplot
导入所需包install.packages("
tidyverse
")library(
tidyverse
)绘图模板:ggplot(data=)+(mapping=aes())【注】ggplot()的第一个参数是要在图中使用的数据集
小新122
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2023-03-21 00:16
R语言dplyr
导入所需包install.packages("nycflights13")library(nycflights13)library(
tidyverse
)打开文件getwd()##查看默认存储路径,再将csv
小新122
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2023-03-20 09:27
R 实现聚类分析_07Jul2020
聚类分析层次聚类#01Jun2018library(
tidyverse
)library(DataExplorer)library(NbClust)data(nutrient,package="flexclust
liang_rujiang
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2023-03-19 19:47
R中可以处理因子的一切-forcats包(三)
library(
tidyverse
)rm(list=ls())options(stringsAsFactors=T)#计算每个因子的数量gss_cat$relig%>%fct_count(prop=T,
灵活胖子的进步之路
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2023-03-18 05:50
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