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Linux
tidyverse
R优雅的进行多因素方差分析
欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何使用R做单因素与多因素方差分析,绘制并排堆砌条形图并添加显著性字母标记,下面来看具体例子安装并加载R包library(
tidyverse
)library(multcompView
R语言数据分析指南
·
2023-03-15 12:32
使用 R 语言计算各个城市距离北上广深的距离
根据培训班的一个小伙伴的需要,我再帮大家计算一下中国各个地级市距离北上广深的距离,首先加载相关的R包:library(
tidyverse
)library(sf)读取各个城市的地理数据:read_sf("
微信公众号RStata
·
2023-03-12 18:26
多个10x单细胞对象的合并和批次校正--seurat锚点整合+Harmony
library(Seurat)library(harmony)library(
tidyverse
)library(patchwork)rm(list=ls())一.多个单细胞样本
Hayley笔记
·
2023-02-18 10:06
关于双分组(每组组分均大于3)柱状图的绘制(带散点,带mean+sd,带显著性)
ggplot2版本library(ggpubr)library(scales)library(Rmisc)library(readxl)library(RColorBrewer)library(
tidyverse
leoxiaobei
·
2023-02-17 18:13
excel行列转置
library(
tidyverse
)X<-read.csv(file="data_RNA_Seq_v2_mRNA_median_Zscores.csv",sep="\t",header=T,row.names
梦幻天堂_ccd5
·
2023-02-06 11:00
ggplot2作图之PCA图
library(
tidyverse
)theme_set(theme_test())library(vegan)pca.data%mutate(Sepal.Length=scale(Sepal.Length
编码农夫
·
2023-02-06 07:22
ggplot2
前端
开发语言
r语言
R进行三因素方差分析
欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何使用R做三因素方差分析,绘制并排堆砌条形图并添加显著性字母标记,下面来看具体例子清理变量rm(list=ls())安装并加载R包package.list=c("
tidyverse
R语言数据分析指南
·
2023-02-06 00:21
R
tidyverse
学习
Tidyverse
是一系列优秀R包的合集,其中最常用的7个package包括ggplot2/tibble/tidyr/readr/purrr/dplyr/stringr/forcat。
生信小白2018
·
2023-02-05 20:53
R(
tidyverse
包)常用操作
提取列对列进行选择select函数提取行对行进行选择filter函数slice():按位置提取行filter():提取符合特定逻辑条件的行。例如,iris%>%filter(Sepal.Length>6)。filter_all(),filter_if()和filter_at():过滤变量然后选择行。这些函数复制所有变量或变量选择的逻辑标准。sample_n():随机选择n行sample_frac(
奔跑的Forrest
·
2023-02-05 17:26
用R来试试小学三年级数学题
jpg2.R解决办法:#定义函数,筛选最终值----------------------------------------------------------------------library(
tidyverse
木䬕
·
2023-02-05 12:24
应用回归分析——线性回归
导入文件查看默认存储路径,再将csv文档存入文件夹打开:(使用逗号作为小数点、分号作为字段分隔符的地区中使用csv2)getwd()read.csv("titanic.csv")导入所需包library(
tidyverse
小新122
·
2023-02-04 04:29
左手python右手R
代码丢这了,有机会说说如何用
tidyverse
分析数据吧。这里写了多数代码,剩下流程差不多的就放弃写了。还有机器
邵扬_Barnett
·
2023-02-03 04:50
哥俩好-ggplot2优雅的绘制配对条形图
欢迎关注R语言数据分析指南本节来介绍如何使用ggplot2包绘制配对条形图,下面通过一个小案例进行展示安装并加载R包package.list=c("
tidyverse
","ggtext","ggnewscale
R语言数据分析指南
·
2023-02-03 01:11
R 字符串分割(strings split)
,n=Inf,simplify=FALSE)str_split_fixed(string,pattern,n)str_split_n(string,pattern,n)https://stringr.
tidyverse
.org
夏夏LJ
·
2023-02-02 03:06
Ubuntu 20.04安装R和Rstudio--记录安装过程和踩过的坑
Docker-rstudiohttps://hub.docker.com/r/rocker/rstudio/tags使用文档见:RockerProject-rstudio,
tidyverse
,verse
linuxonly801
·
2023-02-01 17:37
ubuntu
r语言
散点图(包括添加边际图和地毯线)
1.散点图library(ggplot2)library(
tidyverse
)library(cowplot)#准备数据set.seed(1000)small_diamondscor.test(small_diamonds
余绕
·
2023-02-01 13:24
数据框中分割列
用tidyversepackagelibrary(
tidyverse
)separate(dataframe,col="separatecolum",into=c("A","B"),sep="")用strsplit
多克托刘
·
2023-01-27 10:39
R_柱状图(加误差线,显著性差异)
先放最终效果图结果图#bar_plot2021/01/19#导入所需的包library(ggplot2)library(ggthemr)library(ggsignif)library(
tidyverse
奔跑的Forrest
·
2023-01-26 22:51
玩转生存分析,这一篇就够了
1.导入数据library(
tidyverse
)library("survival")library("survminer")test_data=read.table("survival.txt",header
TOP生物信息
·
2023-01-22 18:58
生物信息
ggstatsplot | 一个满足你日常统计需求的高颜值R包(四)
写在前面点图用处非常广泛,可以展示变量的分布情况,变量之间的相关性,回归结果等本期介绍的是ggstatsplot包中绘制dotplot,scatterplot相关函数2.用到的包rm(list=ls())library(
tidyverse
生信漫卷
·
2023-01-19 15:28
r语言
开发语言
ggstatsplot | 一个满足你日常统计需求的高颜值R包(三)
本期使用ggstatsplot中的函数进行统计分析^_~2.加载需要的R包rm(list=ls())library(
tidyverse
)library(ggstatsplot)library(ggsci
生信漫卷
·
2023-01-19 15:28
r语言
开发语言
R语言dplyr包
R语言之dplyr包1.使用filter()筛选行2.使用arrange()排列行3.使用select()选择列4.使用mutate()添加新变量本文将介绍如何使用
tidyverse
中的另一个核心R包—
hence..
·
2023-01-09 13:50
R语言数据分析
r语言
数据挖掘
开发语言
几行代码,一个逼真的圣诞树,圣诞快乐
圣诞快乐~上代码library(
tidyverse
)library(rlang)source("R/grow_tree.R")#step1、插上树枝angle_fun1<-function(angle)
qq_21478261
·
2023-01-09 03:21
#
蓝桥杯
圣诞节
可视化
计算机视觉
机器学习
limma | 分层样本的差异分析这样搞!(二)
2用到的包rm(list=ls())library(
tidyverse
)library(limma)library(GEOquery)3示例数据这里我们还是利用上期介绍的GEO数据库上的dataset。
生信漫卷
·
2023-01-07 13:14
后端
R语言机器学习系列-随机森林多分类代码解读
1、包部分,也就是加载各类包,包括随机森林包randomForest,数据相关包
tidyverse
、skimr、DataExplorer,模型评估包caret、pROC。
Mrrunsen
·
2023-01-05 02:21
R语言大学作业
机器学习
决策树
算法
使用R语言绘制散点图
老师的R语言的学习分享今天学习的主要内容是关于绘制散点图学习内容下面是学习的主要内容直接上代码,大家可以查看视频,我也的注释也比较详细在使用%>%这个符号的时候,快捷键为control+Mlibrary(
tidyverse
无你想你
·
2022-12-24 11:01
R语言学习
r语言
开发语言
Study Notes- Smoothers and Generalised Additive Models
PreliminariesPreliminariesInthispracticalwewilldosomemodelcheckingandmodelchoiceinR.Weneedthefollowingpackagesggplot2-PackagetoimplementtheggplotlanguageforgraphicsinR.
tidyverse
-Thispackageisdesignedt
「已注销」
·
2022-12-22 20:34
R
数据分析
数据分析
统计学
R - 简单随机抽样
本文使用的包library(
tidyverse
)library(moderndive)使用的数据集,总共有2400个红球和白色球:bowl此处采用简单随机抽样,从2400个球中估算出红球所占比例。
无涯024
·
2022-12-21 22:19
R
r语言
机器学习
深度学习
R语言相关性分析和相关性分析可视化常用方法汇总
0.相关数据library(learnasreml)library(
tidyverse
)data(fm)str(fm)dd=fm%>%select(-c(1:5))head(dd)1.相关性分析1.1R
育种数据分析之放飞自我
·
2022-12-14 17:56
R语言
r语言
开发语言
数据挖掘
ComplexHeatmap | 你的热图注释还挤在一起看不清吗!?
2用到的包rm(list=ls())library(
tidyverse
)library(circlize)library(ComplexHeatmap)3示例数据这里我们随机生成一个矩阵,20
生信卷
·
2022-12-14 11:48
后端
Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(经典归一化与降维方法)(二)
2用到的包rm(list=ls())library(Seurat)library(
tidyverse
)library(SingleR)library(celldex)library(RC
生信卷
·
2022-12-07 04:58
后端
Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(差异分析与细胞注释)(五)
2用到的包rm(list=ls())library(Seurat)library(
tidyverse
)library(SingleR)library(celldex)library(RColorBrewer
生信卷
·
2022-12-07 04:58
后端
limma | 配对样本的差异分析怎么搞!?(一)
2用到的包rm(list=ls())library(
tidyverse
)library(limma)library(GEOquery)3示例数据这里我从GEO数据库上download了一个dataset
生信卷
·
2022-12-07 04:28
后端
Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(基础质控与过滤)(一)
2.用到的包rm(list=ls())library(Seurat)library(
tidyverse
)library(SingleR)library(celldex)library(RColorBrewer
生信卷
·
2022-12-07 04:28
服务器
前端
数据库
R包安装教程 | 熟悉的配方但不一样的味道
2.1安装单个R包install.packages("
tidyverse
")install.pa
生信卷
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2022-12-07 04:27
后端
Seurat | 强烈建议收藏的单细胞分析标准流程(细胞周期的影响去除)(三)
2用到的包rm(list=ls())library(Seurat)library(
tidyverse
)library(ggsci)3示例数据exp.mat<-read.tab
生信卷
·
2022-12-07 04:56
后端
R语言把某些数替换成na_R语言必知必会之
tidyverse
(四):行列操作和分组汇总...
征得张敬信老师同意,本号将转载张老师关于R语言
tidyverse
包一系列文章,为大家进行医学研究提供助力。
weixin_39881167
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2022-12-06 00:26
R语言把某些数替换成na
【R语言】方差分析
#载入示例数据data(iris)#载入包library(
tidyverse
)library(lme4)#生成个体idiris$ID1.96indicatesthatp%+geom_boxplot(position
c34d
·
2022-12-03 16:37
个人笔记
r语言
mantel test 简单教程
1packagelibrary(vegan)library(geosphere)library(
tidyverse
)library(ggcor)#前三个包可以直接安装,ggcor安不上去的话考虑用devtools
顽强的火锅
·
2022-12-01 15:13
R语言综合数据处理习题分享
内容简介:本文主要聚焦于R语言中
tidyverse
、dplyr、ggplot2、stringr等包进行数据处理及可视化的应用目录习题一:探索nycflights13数据集习题二:探索diamonds数据集习题三
皖渝
·
2022-11-23 02:37
R语言
R语言
ggplot
数据处理
可视化
单细胞分析实录(5): Seurat标准流程
1.导入数据,创建Seurat对象library(Seurat)library(
tidyverse
)tes
TOP生物信息
·
2022-11-21 15:19
R语言做kaggle中California Housing Prices数据集
/www.kaggle.com/c/house-prices-advanced-regression-techniques数据集是kaggle里面的HousePrices加载所需要的包library(
tidyverse
sixk
·
2022-11-21 00:35
R
数据分析
机器学习
r语言
kaggle
分布数据图-R/python
数据的分布主要有以下几种表现形式:直方图密度图箱线图点图+箱线图塔夫特箱线图小提琴图金字塔图数据前准备Rlibrary(
tidyverse
)library(plotrix)##全局主题设置options
songyi10
·
2022-11-19 01:46
科研绘图
python
r语言
排序数据图-R/python
数据排序的主要表现形式如下所示:条形图棒棒糖图点图坡度图哑铃图数据前准备Rlibrary(
tidyverse
)##全局主题设置options(scipen=999)#关掉像1e+48这样的科学符号#颜色设置
songyi10
·
2022-11-19 01:16
科研绘图
python
r语言
临床数据据清洗 临床表型数据 phenodata phe
表型信息提取临床信息提取自建函数提取种方法数据框里面进行取子集操作,坐标、列名和逻辑判断每列满足某个要求每行满足某个要求按条件筛选数据库dataframehttps://www.r-bloggers.com/2021/04/
tidyverse
-in-r-complete-tutorial
YoungLeelight
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2022-11-02 11:54
数据处理
dataframe
tibble
数据清洗
r语言
开发语言
tidyquant 如何下载多个 股票到 一个 数据框
tidyquant网速问题,搜我博客解决library(
tidyverse
)#forworkingwithdatalibrary(tidyquant)#forimportingstockdatastock
Mrrunsen
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2022-10-30 18:14
R语言大学作业
r语言
R 语言编程— 基于
tidyverse
读书笔记(20221018)
R语言更多的是与数据打交道,本章正式进入
tidyverse
系列,将全面讲解‘‘管道流、整洁流’’操作数据的基本语法,包括:数据读写、数据连接、数据重塑,以及各种数据操作。
chao_china
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2022-10-22 22:02
R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect model|附代码数据
knitr::opts_chunk$set(echo=TRUE)library(
tidyverse
)#数据处理library(lme4)#lmerglmer模型me_data<-read_c
拓端研究室
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2022-10-14 07:34
拓端tecdat
拓端数据tecdat
tecdat
r语言
开发语言
2021-12-15 R 求多个栅格地图叠加后的平均值(时间序列或其他叠加) & 多个栅格地图叠加后的栅格值提取
以worldclim网站的降水数据集为例(https://www.worldclim.org):方法一:算总体的平均值library(raster)library(
tidyverse
)#先设置输入和输出路径
今年你还可以修改亿次昵称
·
2022-10-10 11:30
R语言基础5--tidyr包的函数及用法
R语言基础系列:R语言基础1--R数据格式:.rds和.rda的区别R语言基础2--数据排序与长宽型数据的转换R语言基础3--
tidyverse
包总结R语言基础4--dplyr包的函数及用法tidyr包的应用
Hayley笔记
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2022-10-08 16:45
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