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tidyverse
tidyverse
|数据分析常规操作-分组汇总(sumamrise+group_by)
|本文首发于“生信补给站”https://mp.weixin.qq.com/s/tQt0ezYJj3H7x3aWZmKVEQ一summarise汇总汇总函数summarize(),可以将数据框折叠成一行,多与group_by()结合使用1.1summarize完成指定变量的汇总统计均值,标准差,最小值,个数和逻辑值library(dplyr)iris%>%summarise(mean(Petal.
生信补给站
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2023-09-09 05:54
简单的违约特征探索
pan.baidu.com/s/1mjg8OGSNote:本文同时用了dplyr包(处理速度很快)和sqldf包(sql语句写起来比较方便,但是速度没有dplyr快)的方法进行数据整理导入数据library(
tidyverse
鸣人吃土豆
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2023-09-08 19:46
学习小组Day6笔记——TheCatcher
安装和加载tidyr包因为之前安装过
tidyverse
包,已经将tidyr包含在内,所以就直接library啦,不过以防将来需要,还是学习一下更换镜像的方法tools->globaloptions->packages
The_Catcher
·
2023-09-08 08:11
R数据科学chapter8
library(
tidyverse
)#使用readr进行数据导入#•read_csv()读取逗号分隔文件、#read_csv2()读取分号分隔文件(这在用,表示小数位的国家非常普遍)、#read_tsv
枸杞子岛年
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2023-09-05 08:33
R语言---使用runway进行机器学习模型性能的比较
R语言—使用runway进行机器学习模型性能的比较#dataloadrm(list=ls())#librarylibrary(dcurves)library(gtsummary)library(
tidyverse
MRI_lab
·
2023-09-04 15:19
r语言
机器学习
开发语言
Gviz绘制基因isoform结构
TheGvizUserGuideisoform结构绘图----R包Gviz(IGV菀菀类卿)需要从GTF文件中提取并准备数据rm(list=ls())suppressMessages(library(
tidyverse
落寞的橙子
·
2023-09-02 19:43
推荐-数据科学中的 R 语言
首先介绍下,这是我学习R以来遇到的最好的电子书,作者王敏杰老师,是四川师范大学研究生公选课《数据科学中的R语言》的课程内容,系统介绍HadleyWickham的
tidyverse
和ggplot2包的内容
土豆学生信
·
2023-08-31 05:23
如何解决 R CMD CHECK 出现 NOTE:: No visible binding for global variable
虽然初始目的是为了交互运行的时候减少代码输入方便计算,随着
tidyverse
兴起,大大增加了数据分析效率,NSE用途也越来越广,许多新开发的包都依赖一些采用了NSE的函数。
饮食有度的元气少女
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2023-08-31 02:17
R编程练习
r语言
笔记
利用R作圆环条形图
需要以下步骤:数据处理,将EXCEL中的数据做成3*N的表格导入系统,代码如下:library(
tidyverse
)library(stringr)library(ggplot2)library(viridis
criket
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2023-08-30 07:33
java
数据库
python
R包tidyr,数据预处理
Introducingtidyr:tidyrisnewpackagethatmakesiteasyto“tidy”yourdata.安装失败,尝试安装“
tidyverse
”包,加载失败报错,报错如下:─
赵会成
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2023-08-29 14:43
R 第七章tibble
>#使用tibble>library(
tidyverse
)>atibble(+x=1:5,+y=1,+z=x^2+y+)#Atibble:5x3xyz11122215331104411755126>>x
liyin_d64b
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2023-08-23 14:27
Slingshot | 细胞分化轨迹的这样做比较简单哦!~(一)
2用到的包rm(list=ls())library(slingshot)library(
tidyverse
)library(uwot)library(mclust)library(RColorBrewer
生信漫卷
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2023-08-21 02:23
后端
R - 一行代码从向量中生成两两组合并且生成tibble
个子网络,生成两个子网络之间的连接强度.mod.label=c('SUB','VN','SMN','DAN','VAN','LM','FPN','DMN')网络组合有C(8,2)=4*7=28种预期结果在
tidyverse
Lairai
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2023-08-20 23:10
R数据科学chapter10
#使用stringr处理字符串#正则表达式(regularexpression,regexp)library(
tidyverse
)library(stringr)#字符串基础#可以使用单引号或双引号来创建字符串
枸杞子岛年
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2023-08-19 14:02
Chord diagram | 啧啧啧!~人人必会的Chord diagram你不来学一学吗!?
2用到的包rm(list=ls())library(
tidyverse
生信漫卷
·
2023-08-17 16:25
后端
Dendrogram | 今天是人见人爱、花见花开的环形Dendrogram!~(附完整代码)
~2用到的包rm(list=ls())library(ggraph)library(igraph)library(
tidyverse
)library(RColorBrewer
生信漫卷
·
2023-08-17 16:55
后端
ggrisk | 高分文章必备的三图联动就这样轻松搞定哦!~(附完整教程)
2用到的包rm(list=ls())library(
tidyverse
)library(g
生信漫卷
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2023-08-17 16:55
后端
Wordcloud | 风中有朵雨做的‘词云‘哦!~
2用到的包rm(list=ls())library(
tidyverse
)library(tm)library(wordcloud)3示例数据这里我准
生信漫卷
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2023-08-17 16:25
后端
自制函数【rep_words】
rm(list=ls())library(
tidyverse
)AA<-read.table("测试文档.txt")class(AA)length(row.names(AA))#x=AAc=6a=3for
医只蜗牛
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2023-08-17 14:34
[数据分析与可视化] 数据绘图要点3-意大利面条图
#Librarieslibrary(
tidyverse
)library(hrbrthemes)library(kable
落痕的寒假
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2023-08-16 10:57
数据分析与可视化
R语言
数据分析
R数据科学--使用ggplot2进行数据可视化1
library(
tidyverse
)基础作图ggplot(data=mpg)+geom_point(mapping=aes(x=displ,y=hwy))分别设好xy轴及数据集即可image.png加颜色
Seurat_
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2023-08-14 08:25
Entrez ID 和 gene symbol 和 Ensembl ID转换
手动迁入编程版library(AnnotationDbi)library(org.Hs.eg.db)library(
tidyverse
)如果你有基因gene%unlist()g%unlist()mget
茅逗逗
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2023-08-14 06:02
R语言和生物信息学分析技巧
生物信息
r语言
R语言 列表中嵌套列名一致的多个数据框如何整合为一个数据框
载入R包library(broom)library(
tidyverse
)模拟数据models%group_by(city)%>%do(mod=lm(log2(sales)~factor(month),data
茅逗逗
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2023-08-14 06:30
批量建模和批量处理
r语言
开发语言
数据框筛选和GO富集的小操作
比如下面这个数据框#gene是我随机抽取的基因library(
tidyverse
)library(clusterProfiler)library(org.At.tair.db)data.frame(gene
城管大队哈队长
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2023-08-14 04:40
ggplot2优雅的自定义轴文本颜色
今天来主要介绍如何在不引入外部几何对象的前提下在图形的原有的基础上自定义修改轴文本颜色,也许恰好您正好有此特殊需求,希望对各位观众老爷有所帮助;下面来看具体案例;加载R包library(
tidyverse
R语言数据分析指南
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2023-08-13 17:10
ggplot学习笔记(五)
library(
tidyverse
)extract_lmr%select(country,year,lifeExp)%>%group_by(country)%>%nest(data=c(year,lifeExp
财富经略
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2023-08-13 14:06
基于R做宏基因组结果的PCoA分析
参考原本结果已有的PCA图,尽可能挑选距离较远且聚团的样本选取不同样本属水平的丰度数据,整理成逗号分隔的csv文件代码演示library(vegan)#计算bray距离library(ggplot2)library(
tidyverse
twocanis
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2023-08-12 15:06
生物信息
R语言
数据处理
r语言
开发语言
R语言之探索性数据分析1
首先得把dplyr和ggplot2知识综合起来如果没有安装
tidyverse
这个包的话,会出现错误提示library(
tidyverse
)Errorinlibrary(
tidyverse
):不存在叫‘
tidyverse
分享之家
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2023-08-11 03:46
R语言之探索性数据分析1
数据分析
首次安装RStudio后,一定要做如下操作
如果不修改,你可以试一下,在安装
tidyverse
包时候,
饮食有度的元气少女
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2023-08-09 02:56
R编程练习
笔记
2020-05-10 dplyr包中的distinct()函数
而distinct()函数则是专门为数据框设计的,这也与
tidyverse
系列包的宗旨一致。
cppcwang
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2023-08-07 15:48
R语言
tidyverse
系列 学习笔记(系列6)数据分析 之 写入 导出 多个文件
mypath="/User/sample_files"list.files(path=my_pah,full.names=TRUE)#筛选出_+数字+dot+csv结尾的文件list.files(path=my_pah,pattern="_\\d.csv$")my_file_dir=list.files(path=my_pah,pattern="_\\d.csv$",full.names=TRUE
来份芒果布丁
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2023-08-07 05:12
r语言
数据分析
tidyverse
dplyr
R中可以处理因子的一切-forcats包(二)
library(
tidyverse
)rm(list=ls())options(stringsAsFactors=T)#构建测试数据集df%select(c("rincome","denom"))head
灵活胖子的进步之路
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2023-08-06 14:46
TCGA差异分析——limma, DEseq2, edgeR
一、数据整理这里我们需要count矩阵,以及对应的分组信息rm(list=ls())library(
tidyverse
)library(limma)lib
芋圆学徒
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2023-08-06 11:41
R语言【
Tidyverse
、Tidymodel】的机器学习方法
在各种语言中,R语言以编程简单,方法先进脱颖而出,本次机器学习基于现代R语言,
Tidyverse
,Tidymodel语法。点击查看原文h
Mr.靳靳477302280
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2023-08-02 14:52
机器学习
r语言
r语言
机器学习
开发语言
R语言 Mutate家族
首先是加载相关的包,mutate主要属于dplyr包里,这里我们统一使用
tidyverse
包。
日月其除
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2023-08-02 07:48
库存分析R语言实现方法
R脚本绘制折线图和条形图library(
tidyverse
)library(readxl)library(patchwork)df1%mutate(month=cut(`出售年月(年月日)`,breaks
新欣enjoy
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2023-08-01 15:24
数据操作基本功之slice操作(
tidyverse
就是好)
library(
tidyverse
)rm(list=ls())options(stringsAsFactors=T)#基本用法不贴结果了哈data("mtcars")mtcars%>%slice(1L)
灵活胖子的进步之路
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2023-08-01 04:27
R数据科学第五章——蜂
R数据科学第五章library(
tidyverse
)变量的分布进行可视化ggplot(data=diamonds)+geom_bar(mapping=aes(x=cut))图片.png观测值可以使用dplyr
寂静之巅
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2023-07-29 07:44
2022-04-16:一天就搞了一个这
library(readr)library(ggtree)library(treeio)library(DESeq2)library(ggplot2)library(stringr)library(
tidyverse
小明的数据分析笔记本
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2023-07-28 06:50
1. R语言运行效率分析_小结(6)
library(
tidyverse
)library(scales)ggplot(data[which(data$fun!
灭绝老衲
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2023-07-25 09:10
R 数据处理(三)
前言接下来的部分,我们主要介绍R的一个用于数据科学的集成包
tidyverse
,并用它所包含的各种R包来进行数据处理。
名本无名
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2023-07-23 08:34
【R语言】R包dplyr(一):数据转换
dplyr是
tidyverse
中的一个核心包,用来进行数据操作。主要包括以下5个核心函数。
巩翔宇Ibrahimovic
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2023-07-23 02:35
【想要学习适当技能来处理复杂数据科学项目和“用数据思考”?看《现代数据科学(R语言·第2版)》就对了】
本书对上一版做了全面更新,与日益强大的
tidyverse
套包保持同步,纳入sf、purrr、tidymodels和tidytext等包中的新功能。
清图
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2023-07-22 21:54
数据科学
r语言
数据库
数据分析
ggplot2 画图 X 轴排序问题
data(tips,package="reshape2")library(
tidyverse
)library(scales)#forpercentagescalestips%>%count(day)%>
梦想画家
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2023-07-21 22:27
R语言
r语言
ggplot2
排序
factor因子
探索 ggplot2 的其它图层
加载R包library(
tidyverse
)#install.packages('wesanderson')library(wesanderson)wesanderson包里面提供了很多好看的调色板。
c7a1c4db132c
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2023-07-20 03:27
统计fastq长度分布
1h_S46_L003_R1_val_1.fq.gz|cut-f2>Length.txt得到一列长度数length128150150150150150147150150然后在R中运行画library(
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煮梦斋_bioinfo
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2023-07-18 13:51
superheat | 超级简单的热图绘制解决方案!~(二)(聚类和注释图的添加~)
~2用到的包#devtools::install_github("rlbarter/superheat")library(superheat)library(
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)3示例数据data("mtcars
生信漫卷
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2023-07-16 08:53
后端
【案例实践】R语言生物群落(生态)数据统计分析与绘图实践技术应用
查看原文>>>R语言生物群落分析绘图、多元统计分析、CMIP6、遥感碳储量、GEE林业、InVEST等目录专题一:R和Rstudio简介及入门和作图基础专题二:R语言数据清洗-
tidyverse
包应用专题三
吹翻书页的风
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2023-06-21 10:31
数据语言
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生物群落统计分析
一般线性模型
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生物群落数据
如何提高提高数据分析能力??R语言生物群落(生态)数据统计分析与绘图
包含:《R语言基础》、《
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数据清洗》、《多元统计分析》、《随机森林模型》、《回归及混合效应模型》、《结构方程模型》、《统计结果作图》七合一版本R语言作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析
xiao5kou4chang6kai4
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2023-06-21 10:00
生态
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【技术推文】R语言生物群落(生态)数据统计分析与绘图
一:R和Rstudio简介及入门和作图基础二:R语言数据清洗-
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包应用三:群落数据准备及探索分析四:群落数据非约束排序-PCA、CA、PCoA、NMDS五:群落数据约束排序-RDA、dbRDA
夏日恋雨
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2023-06-21 10:28
r语言
开发语言
数据挖掘
大数据
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