医学图像分割

[Transormer]MT-UNet：Mixed transformer UNet for medical image segmentation

MTUNet:混合Transformer模型用于医学图像分割AbstractSectionIIntroductionSectionIIMethodsPart1OverallStructureDesignPart2MixedTransformerModulePart3Local-GlobalGaussian-WeightSelf-AttentionPart4ExternalAttentionSect
黄小米吖·2022-12-19 13:23

MA-Net：用于肝脏和肿瘤分割的多尺度注意力网络

摘要近年来为了提高医学图像分割的性能，提出了大量基于多尺度特征融合的UNet变体。
不想敲代码的小杨·2022-12-19 11:34

医学图像分割框架

1、CoTr：基于CNN和Transformer进行3D医学图像分割3D2021年GitHub-YtongXie/CoTr:[MICCAI2021]CoTr:EfficientlyBridgingCNNandTransformerfor3DMedicalImageSegmentation2
c_daofeng·2022-12-18 07:43

Inconsistency-aware Uncertainty Estimation for Semi-supervised Medical Image Segmentation

2021IEEETransactionsonMedicalImaging(TMI)语义分割、医学图像分割论文目录前言一、主要亮点二、理论方法1.ProblemAnalysis1.1twocost-sensitivesettings1.2CertainregionandUncertainregion2
LANG_C_·2022-12-17 22:40

【论文精读】Semi-supervised Medical Image Segmentation through Dual-task Consistency

语义分割论文CVPR2021基于双任务一致性的半监督医学图像分割代码：GitHub-HiLab-git/DTC:Semi-supervisedMedicalImageSegmentationthroughDual-taskConsistency
LANG_C_·2022-12-17 22:10

论文解读《Semi-supervised Contrastive Learning for Label-efficient Medical Image Segmentation》

论文解读《半监督对比学习高效标签的医学图像分割》期刊名：MICCAI2021代码：代码地址论文地址：论文地址一、摘要：1）深度学习在医学图像分割中，依赖标注数据的监督训练。
渔歌畅晚·2022-12-17 22:07

《论文阅读》FocalMix: Semi-Supervised Learning for 3D Medical Image Detection

留个笔记自用FocalMix:Semi-SupervisedLearningfor3DMedicalImageDetection做什么3D医学图像分割，也是传统应用了，就是把图像分成若干个特定的、具有独特性质的区域并提出感兴趣目标的技术和过程
未知丶丶·2022-12-17 22:06

翻译：Semi-supervised Medical Image Segmentation through Dual-task Consistency

Semi-supervisedMedicalImageSegmentationthroughDual-taskConsistency（基于双任务一致性的半监督医学图像分割）文献：Semi-supervisedMedicalImageSegmentationthroughDual-taskConsistency
阿里云小仙女·2022-12-17 22:06

SimpleITK 中连通分量大小计算 GetPhysicalSize

利用全卷积神经网络解决医学图像分割问题，使用移除最小连通分量后处理分割结果。假设只做2分类：每个连通分量的大小计算方式：统计每个连通区域，首先从分割结果中统计连通区域，为每个连通区域设置不同的标签。
开心就哈哈·2022-12-17 21:52

常用的医学图像分割评价指标

常用的图像分割评价指标非常多，论文中常用的指标包括像素准确率，交并比（IOU）,Dice系数，豪斯多夫距离，体积相关误差。下面提到的所有案例都是二分类，标签中只有0和1目录一：像素准确率二：交并比IOU三：骰子系数Dice四：Hausdorffdistance豪斯多夫距离五：CPA-类别像素准确率六：MPA-类别平均像素准确率七：MIOU(平均交并比)一：像素准确率定义：它是图像中正确分类的像素百
不想敲代码的小杨·2022-12-17 13:35

python-医学图像分割指标Dice代码实现

1.代码效果输出每张图片的Dice值及所有图片的Dice平均值，且最后生成一张Dice分布图：以100张图片为例，横坐标是图片序号，纵坐标是每张图片的Dice值。2.图片格式要求1.模型生成的标记图片和正确的标记图片要求是严格的二值图片。如下图：2.图片名称按序为：1.png2.png3.png...（图片格式可以在代码里改，如png，jpg等）3.代码（计算单张图片的Dice值）代码中white
生信研究猿·2022-12-17 13:33

U2-Net：用于多域医学图像分割的3D通用U-Net

一、论文原文：《3DU2-Net:A3DUniversalU-NetforMulti-DomainMedicalImageSegmentation》https://arxiv.org/abs/1909.06012二、关键词条：医疗分割任务深度可分离卷积解决各种域的结构异质性基于3DU-Net和Vnet设计三、模型原理：图1：基于可分离卷积的域适配器，主要介绍的是如何组装域特定的信道卷积（alter
小肉包老师·2022-12-16 12:28

Anaconda下载simpleITK包和pytorch包

Anaconda下载simpleITK包ITK是一个开源的C++代码库，包含了大量的最新医学图像分割和配准基础函数和通用框架。简单来说，使用ITK，大家可以直接站在一大批国际大牛的肩上来进行开发。
啊哈biubiubiu~·2022-12-16 07:17

[Transformer]U-Net Transformer: Self and Cross Attention for Medical Image Segmentation

UNetTransformer:UNet结合自注意力和交叉注意力用于医学图像分割AbstractSectionIIntroductionSectionIIU-TransformerNetworkSectionIIIExperimentsSectionIVConclusionPaperAbstract
黄小米吖·2022-12-15 07:08

【论文】U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation

论文题目：U-Net:ConvolutionalNetworksforBiomedicalImageSegmentationu-net，用于生物医学图像分割的卷积网络1.Introduction深度神经网络在视觉领域发展非常迅猛
狂野摇摇车·2022-12-14 15:29

nnU-Net论文笔记

论文标题：nnU-Net:Self-adaptingFrameworkforU-Net-BasedMedicalImageSegmentation一种基于U-Net的医学图像分割自适应框架论文链接：arxiv
滴嘟滴嘟dzj·2022-12-14 14:30

nnUNet框架小结（CUDA9.0+torch1.1\使用nrrd数据集）

nnUNet可谓医学图像分割的大杀器。本文将介绍在使用nnUNet途中的心路历程，帮助同需要使用该框架的小伙伴解决困惑。笔者使用的服务器的基础环
苏东坡哦哦·2022-12-12 22:32

03_FAST、BRIEF、ORB算法原理

深度估计、超分辨率、3D目标检测、CNN、GAN、目标跟踪、竞赛解决方案、人脸识别、数据增广、人脸检测、数据集、NAS、AutoML、图像分割、SLAM、实例分割、人体姿态估计、视频目标分割、Re-ID、医学图像分割
qq_1041357701·2022-12-12 00:14

U-Net网络:Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation

U-Net:卷积网络用于生物医学图像分割摘要  人们普遍认为，对深度网络作品的成功训练需要成千上万的注释训练样本。
落花满蹊径·2022-12-11 19:19

【U-Net】Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation

对比FCN优点如下：尺度适合超大图像分割，适合医学图像分割听说，官方的数据集只有一张t
117瓶果粒橙·2022-12-11 19:49

深度剖析monai(一) Data和Transforms部分

它是一个优秀的基于pytorch的医学深度学习框架，包括了Tansformers(负责数据的读取和数据增强)、Lossfunctions(包含常见的损失函数)、Networkarchitectures(实现了常用的医学图像分割
遇到坎就得迈过去·2022-12-11 08:09

Nvidia力作：医学图像分割网络

来源：投稿作者：梦飞翔编辑：学姐引自Unetr:Transformersfor3dmedicalimagesegmentation1.序言本文将以Nvidia团队最近提出的一种新的医学图像分割网络作为切入点
深度之眼·2022-12-11 01:04

论文解析[3] U-Net and its variants for Medical Image Segmentation : A short review

2.2U-Net20152.3U-Net++20192.4R2U-Net20182.5AttentionU-Net20182.6TransU-Net20213.Disscussion论文概要本论文是一篇使用U-Net及其变形进行医学图像分割的简短综述
默_silence·2022-12-09 12:31

Medical Image Segmentation Review:The Success of U-Net

目录医学图像分割综述：UNet的成功1.摘要与介绍2.分类2.1.2DUnet2.23DUNet3.UNet扩展3.1对于跳跃连接的增强与改进3.1.1--增加跳跃连接数量3.1.2--对跳跃连接过程中的特征进行处理
不想敲代码的小杨·2022-12-09 12:25

UNETR:用于3D图像分割的Transformer

Transformersfor3DMedicalImageSegmentation论文地址：https://arxiv.org/pdf/2103.10504.pdf摘要近年来，具有收缩路径和扩展路径（例如，编码器和解码器）的全卷积神经网络（FCNN）在各种医学图像分割应用中表现出突出的地位
北方骑马的萝卜·2022-12-09 08:03

MedT：用于医学图像分割的Transformer

表现SOTA！并提出局部-全局训练策略(LoGo)，进一步提高性能，优于Res-UNet、U-Net++等网络，代码刚刚开源！MedicalTransformer:GatedAxial-AttentionforMedicalImageSegmentation作者单位：JHU,新泽西州立大学代码：https://github.com/jeya-maria-jose/Medical-Transform
Amusi（CVer）·2022-12-09 08:24

MedT：医学图像分割新网络

点击下方卡片，关注“CVer”公众号AI/CV重磅干货，第一时间送达本文作者：AdamLau|来源：知乎（已授权）https://zhuanlan.zhihu.com/p/355299643论文阅读：MedicalTransformer:GatedAxial-AttentionforMedicalImageSegmentation论文：https://arxiv.org/abs/2102.1066
Amusi（CVer）·2022-12-09 08:24

3D-resnet50 医学图像分割，训练及验证代码python

#3D_resnetbasedonTencentMedicalNetimporttorchfromtorchimportnnimporttorch.nn.functionalasFfromtorch.autogradimportVariablefromfunctoolsimportpartialimportosimportnumpyasnpfromtorch.utils.dataimportDat
dr_yingli·2022-12-08 16:52

深度学习论文精读[6]：UNet++

UNet本身是针对医学图像分割任务而提出来的网络结构，该任务不像自然图像分割，对分割精度要求并不是十分严格。但对于医学图像而言，器官和病灶的分割则要求
louwill12·2022-12-08 15:43

基于多智能体强化学习的迭代细化的交互式三维医学图像分割

论文笔记：Iteratively-RefinedInteractive3DMedicalImageSegmentationwithMulti-AgentReinforcementLearningAbstract1.Introduction2.Relatedwork3.Methodology3.1Overview3.2.Multi-agentRLframeworkforinteractiveim-S
wowowoj·2022-12-08 09:56

METD-Medical Transformer：用于医学图像分割的门控轴向注意力Transformer

目录Title:MedicalTransformer:GatedAxial-AttentionforMedicalImageSegmentation摘要-Abstract本文的提出动机方法-Method网络整体结构图自注意力机制回顾AxialAttention（轴向注意力机制）门控轴向注意力局部-全局训练策略Title:MedicalTransformer:GatedAxial-Attention
不想敲代码的小杨·2022-12-07 13:20

Medical image segmentation

CoTr：基于CNN和Transformer进行3D医学图像分割UNETR:Transformersfor3DMedicalImageSegmentationSwin-unet：用于医学图像分割的类UNET
Fiona_12·2022-12-07 13:48

MedT: Medical Transformer 论文阅读 MICCAI2021

MedT:MedicalTransformer论文阅读MICCAI2021Tranformer医学图像分割题目：《MedicalTransformer:GatedAxial-AttentionforMedicalImageSegmentation
Mo和Gao的树洞·2022-12-07 13:46

[医学图像Transformer] Medical Transformer: Gated Axial-Attention for Medical Image Segmentation

医学图像Transformer：一种用于医学图像分割的门控轴向注意力网络论文地址开源代码摘要大多数现有的基于Transformer的网络架构用于视觉应用，但需要大规模数据集来正确训练。
XL_Dylan·2022-12-07 13:16

医学图像分割

医学影响分割综述总结方法内容监督学习骨干网络的选择、网络块的设计、损失函数的改进弱监督学习数据增强、迁移学习、交互式分割研究医学图像分割的难点：医学图像的特征提取，因为医学影像中存在模糊、噪声、对比度低等问题
摆烂的卷王·2022-12-07 10:48

python医学图像分割_医学图像分割如何入门?

既然是入门，搞明白下文术语的意思就入门了，把术语搜索搜索就差不多了。提升嘛，就把相关【最原始】论文看看，用opencv或者scimage跑跑算法看看效果。看论文一定是看最原始论文就够了，至于对原始方法进行改进(执行效率优化除外)、修补、应用的论文都没看头，即使作者是大佬，这是对于学习和研究来说的。至于写论文嘛，看看改进、修补、应用类论文的摘要就够了，可以做做人情，帮忙加引用数。==========
开源故事·2022-12-07 10:16

【医学图像边界显示】

文章目录前言一、读取图片二、图片二值化三、轮廓检测四、绘制轮廓前言医学图像分割的精确度往往就体现在图像边界的分割上，网上找了很多都没有重点显示图像边缘的分割，本文对此做一个简单分享。
千面(●—●)·2022-12-07 10:37

Transformer VS MLP

最近一直在看transformer和MLP的论文，对于进行医学图像分割时到底用哪个暂时还没头绪，针对最近看的论文和其他博客总结，我的小结如下：1、两者都是如何处理输入图片的答案：transformer和
A徒手摘星星·2022-12-06 23:14

MIXED TRANSFORMER U-NET FOR MEDICAL IMAGE SEGMENTATION（医学图像分割）

目录ABSTRACT1.INTRODUCTION2.METHODS2.1网络整体结构2.2MixedTransformerModule（MTM模块）2.3Local-GlobalGaussian-WeightedSelf-AttentionLocal-GlobalSelf-AttentionGaussian-WeightedAxialAttentionExternalAttentionABSTRA
A徒手摘星星·2022-12-06 23:44

语义分割损失函数系列(3):Dice损失

Dice损失在医学图像分割任务中使用得极多，用于度量两个集合得相似性，dice系数的定义如下：DiceCoefficient=2∣A∩B∣∣A∣+∣B∣DiceCoefficient=\frac{2|A
spectrelwf·2022-12-06 23:02

医学图像分类_ASNG：用于3D医学图像分割的自动数据增广

据作者称，这是首次在医学图像分割任务中采用可微分的自动数据增广，实验表明，所提出的方法明显优于现有的模型（如SCNA、nnUNet等），性能表现SOTA！
weixin_39870199·2022-12-06 21:11

python图像分割 框架_nnU-Net是一个专为医学图像分割而设计的框架

nnU-NetIn3Dbiomedicalimagesegmentation,datasetpropertieslikeimagingmodality,imagesizes,voxelspacings,classratiosetcvarydrastically.Forexample,imagesintheLiverandLiverTumorSegmentationChallengedataseta
weixin_39681161·2022-12-06 21:40

论文解读《基于伪标签自训练的局部对比损失半监督医学图像分割》

论文解读《Localcontrastivelosswithpseudo-labelbasedself-trainingforsemi-supervisedmedicalimagesegmentation》代码：代码链接论文：论文地址摘要：一、半监督/自监督学习利用未标记的数据和有限的标签来解决这一限制。最近的自监督学习方法使用对比损失从无标记的图像中学习良好的全局层次表示，并在流行的自然图像数据集
渔歌畅晚·2022-12-06 21:39

医学图像分割

医学图像分割1、用于分割的数据集2、关于分割的论文介绍2.1nnU-Net:aself-configuringmethodfordeeplearning-basedbiomedicalimagesegmentation2.2
落花逐流水·2022-12-06 21:33

nnUNet安装踩坑-自适应医学图像分割框架

nnunet是由德国学者提出来的一个用于医学图像分割的通用自适应框架项目地址：https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNet最近想在电脑上部署一下，顺便踩踩坑，感觉其中最大的坑就是
老中医5555·2022-12-06 21:03

nnUNet一个医学图像分割神仙算法

很多年之前接触过UNet的细胞分割，这次突然拿出来做一个三维的腿骨分割，突然有点不知所措了，可能我的技术只局限于二维的吧，经过一个月的研究差不多鼓捣明白了一点，欢迎有经验的大佬赐教一些知识，我这就写写我自己做的过程吧。一训练前的准备工作算法框架搭建以及环境配置必要程序，环境就搞了我好多天，以为虚拟机就够了，结果配置还是不行，果断换成双系统，这个就不写了，网上太多了而且也不难，我以前都是用的虚拟机或
CZC_Boy·2022-12-06 21:00

医学图像分割 3D nnUNet全流程快速实现

前言nnUNet作为医学图像分割的各项SOTA实现的基础框架，基本是所有医学图像分割的研究者需要掌握的方法。
打南边来了个阿楠·2022-12-06 21:30

【图像分割】终于跑通数据集了

跑的是一个unet++的pytorch实现，主要针对基于UNet++的图像分割模型的代码：在PyTorch中实现的用于医学图像分割的嵌套U-Net架构。
33好好写代码·2022-12-06 11:47

【DRIVE】U-Net眼底血管分割数据集下载

DRIVE:DigitalRetinalImagesforVesselExtraction医学图像分割常用的数据集下载地址把数据集转到码云上了，不用就可以下载，在DRIVE文件夹里。
小丫么小阿豪·2022-12-06 11:37

总结2-深度学习网络搭建学习

分享一个PyTorch医学图像分割开源库从实战的角度看看，稍微有点收获，视频：CNN从0到1助你快速入门PyTorch和TensorFlow。
三世·2022-12-06 07:59
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