医学图像分割

语义分割损失函数系列(3):Dice损失

Dice损失在医学图像分割任务中使用得极多，用于度量两个集合得相似性，dice系数的定义如下：DiceCoefficient=2∣A∩B∣∣A∣+∣B∣DiceCoefficient=\frac{2|A
spectrelwf·2022-12-06 23:02

医学图像分类_ASNG：用于3D医学图像分割的自动数据增广

据作者称，这是首次在医学图像分割任务中采用可微分的自动数据增广，实验表明，所提出的方法明显优于现有的模型（如SCNA、nnUNet等），性能表现SOTA！
weixin_39870199·2022-12-06 21:11

python图像分割 框架_nnU-Net是一个专为医学图像分割而设计的框架

nnU-NetIn3Dbiomedicalimagesegmentation,datasetpropertieslikeimagingmodality,imagesizes,voxelspacings,classratiosetcvarydrastically.Forexample,imagesintheLiverandLiverTumorSegmentationChallengedataseta
weixin_39681161·2022-12-06 21:40

论文解读《基于伪标签自训练的局部对比损失半监督医学图像分割》

论文解读《Localcontrastivelosswithpseudo-labelbasedself-trainingforsemi-supervisedmedicalimagesegmentation》代码：代码链接论文：论文地址摘要：一、半监督/自监督学习利用未标记的数据和有限的标签来解决这一限制。最近的自监督学习方法使用对比损失从无标记的图像中学习良好的全局层次表示，并在流行的自然图像数据集
渔歌畅晚·2022-12-06 21:39

医学图像分割

医学图像分割1、用于分割的数据集2、关于分割的论文介绍2.1nnU-Net:aself-configuringmethodfordeeplearning-basedbiomedicalimagesegmentation2.2
落花逐流水·2022-12-06 21:33

nnUNet安装踩坑-自适应医学图像分割框架

nnunet是由德国学者提出来的一个用于医学图像分割的通用自适应框架项目地址：https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNet最近想在电脑上部署一下，顺便踩踩坑，感觉其中最大的坑就是
老中医5555·2022-12-06 21:03

nnUNet一个医学图像分割神仙算法

很多年之前接触过UNet的细胞分割，这次突然拿出来做一个三维的腿骨分割，突然有点不知所措了，可能我的技术只局限于二维的吧，经过一个月的研究差不多鼓捣明白了一点，欢迎有经验的大佬赐教一些知识，我这就写写我自己做的过程吧。一训练前的准备工作算法框架搭建以及环境配置必要程序，环境就搞了我好多天，以为虚拟机就够了，结果配置还是不行，果断换成双系统，这个就不写了，网上太多了而且也不难，我以前都是用的虚拟机或
CZC_Boy·2022-12-06 21:00

医学图像分割 3D nnUNet全流程快速实现

前言nnUNet作为医学图像分割的各项SOTA实现的基础框架，基本是所有医学图像分割的研究者需要掌握的方法。
打南边来了个阿楠·2022-12-06 21:30

【图像分割】终于跑通数据集了

跑的是一个unet++的pytorch实现，主要针对基于UNet++的图像分割模型的代码：在PyTorch中实现的用于医学图像分割的嵌套U-Net架构。
33好好写代码·2022-12-06 11:47

【DRIVE】U-Net眼底血管分割数据集下载

DRIVE:DigitalRetinalImagesforVesselExtraction医学图像分割常用的数据集下载地址把数据集转到码云上了，不用就可以下载，在DRIVE文件夹里。
小丫么小阿豪·2022-12-06 11:37

总结2-深度学习网络搭建学习

分享一个PyTorch医学图像分割开源库从实战的角度看看，稍微有点收获，视频：CNN从0到1助你快速入门PyTorch和TensorFlow。
三世·2022-12-06 07:59

自己实现的unet3+模型，以及简单分析 (unet3plus tensorflow2 keras)

文章目录简介一、unet3+二、完整代码（keras）1.引入库2.辅助函数3.搭建网络4.创建模型简介很早之前看了unet3+医学图像分割的论文，本来想直接去github找keras/Tensorflow
求你涨点吧·2022-12-05 08:11

TransUNet: Transformers Make StrongEncoders for Medical Image Segmentation文章详解(结合代码)

1.摘要医学图像分割是开发医疗保健系统，特别是疾病诊断和治疗计划的必要前提。在各种医学图像分割任务中，U形架构（也称为U-Net）已成为事实上的标准，并取得了巨大的成功。
Orange_sparkle·2022-12-05 01:54

dice系数作为损失函数的网络模型如何加载（ValueError: Unknown loss function:dice_coef_loss）

使用深度学习做医学图像分割时，经常会用dice系数作为损失函数。定义的方式网上有很多就不讲了，但在加载时经常遇到麻烦。
weixin_41783077·2022-12-04 23:05

LA-Net: A Multi-task Deep Network For The Segmentation of The Left Atrium

2021IEEETransactionsonMedicalImaging(TMI)语义分割、医学图像分割论文摘要目录语义分割论文文章目录一、LA-Net:AMulti-taskDeepNetworkForTheSegmentationofTheLeftAtrium
LANG_C_·2022-12-04 17:44

【文献阅读】医学图像分割中的loss函数选择-Loss odyssey in medical image segmentation loss

参考文献：Lossodysseyinmedicalimagesegmentationloss函数代码库github-SegLoss本文在四个典型的三维分割任务上对20个一般的损失函数进行了首次大规模的分析，涉及10多个医疗中心的六个公共数据集。结果显示，没有一个损失函数能在四个分割任务上持续取得最佳性能，但复合损失函数（如DicewithTopKloss,focalloss,Hausdorffdi
RainyMacondo·2022-12-04 14:57

【论文笔记】TransUNet: Transformers Make StrongEncoders for Medical Image Segmentation

DigitalTwin论文标题：TransUNet:TransformersMakeStrongEncodersforMedicalImageSegmentationTransUNet:Transformer为医学图像分割提供强大的编码器论文链接
来自γ星的赛亚人·2022-12-04 11:23

UNET详解和UNET++介绍（零基础）

一·背景介绍背景介绍：自2015年以来，在生物医学图像分割领域，U-Net得到了广泛的应用，目前已达到四千多次引用。至今，U-Net已经有了很多变体。
浩瀚之水_csdn·2022-12-04 10:36

基于深度学习的医学图像分割学习笔记（九）UNet 3+

UNet3+:AFull-ScaleConnectedUNetforMedicalImageSegmentation原文链接代码dateset：131例腹部增强CT(3D)用于肝脏分割和49例脾脏数据集融合多尺度的特征是实现精确分割的重要因素之一。UNet++没有从全尺度上探索足够信息，本文提出了UNet3+，重新设计跳跃连接，利用full-scale跳跃连接和深度监督。full-scale跳跃连
Demon果·2022-12-04 03:10

医学图像分割：UNet++

使用一系列的网格状的密集跳跃路径来提升分割的准确性。在这篇文章中，我们将探索UNet++:ANestedU-NetArchitectureforMedicalImageSegmentation这篇文章，作者是亚利桑那州立大学的Zhou等人。本文是U-Net的延续，我们将把UNet++与Ronneberger等人的U-Net原始文章进行比较。UNet++的目标是通过在编码器和解码器之间加入Dense
孙琪翔·2022-12-04 03:10

FCN、Unet、Unet++：医学图像分割网络一览

作者丨Error@知乎来源丨https://zhuanlan.zhihu.com/p/159173338转自|极市平台导读本文先厘清了语义分割、实例分割和全景分割等定义的区别。在此基础上，进一步分析了FCN、Unet、Unet++等算法在医学图像上的适用情况。先上目录：相关知识点解释FCN网络算法的理解Unet网络算法的理解Unet++网络算法的理解Unet+++网络算法的理解DeepLabv3+
机器学习算法那些事·2022-12-04 03:10

segmentation

(用于医学图像分割的金字塔医学transformer)PyramidMedicalTransformerforMedicalImageSegmentation基于CNN的模型通过低效地堆叠卷积层来捕获长期依赖性
南吕十七·2022-12-03 18:12

基于C++的ITK图像分割与配准学习笔记3（图像分割）

ITK学习参考资料整理汇总(包含ItkSoftwareGuide.PDF英文版、ItkSoftwareGuide-2.4.0-中文版、医学图像分割与配准(1ITK初步分册)(1)PDF、医学图像分割与配准
亦我飞也·2022-12-03 16:47

基于C++的ITK图像分割与配准学习笔记2（图像滤波）

ITK学习参考资料整理汇总(包含ItkSoftwareGuide.PDF英文版、ItkSoftwareGuide-2.4.0-中文版、医学图像分割与配准(1ITK初步分册)(1)PDF、医学图像分割与配准
亦我飞也·2022-12-02 22:45

基于C++的ITK图像分割与配准学习笔记1(图像数据表达-图像)

ITK学习参考资料整理汇总(包含ItkSoftwareGuide.PDF英文版、ItkSoftwareGuide-2.4.0-中文版、医学图像分割与配准(1ITK初步分册)(1)PDF、医学图像分割与配准
亦我飞也·2022-12-02 22:15

【医学图像分割】读论文系列 1

【医学图像分割】读论文系列1文章目录【医学图像分割】读论文系列1TitleIntroductionAbstractKeywordMethodExperimentConclusionTitle标题：NoisyLabelsareTreasure
一年练一次深蹲·2022-12-02 19:52

[Transformer]UTNet:A Hybrid Transformer Architecture for Medical Image Segmentation

UTNet：用于医学图像分割的混合Transformer框架
黄小米吖·2022-12-02 18:41

图像分割论文阅读笔记——U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation

u-net-convolutional-networks-for-biomedical标题U-Net:ConvolutionalNetworksforBiomedicalImageSegmentationU-Net:用于生物医学图像分割的卷积网络作者单位德国弗莱堡大学计算机科学系和生物信号研究中心方法简介提出一种网络和训练策
不喜欢敲代码的小白·2022-12-02 16:30

医学图像分割之肝脏分割（2D）

文章目录肝脏分割数据集一、预处理二、图像增强三、训练四、测试总结肝脏分割数据集肝脏分割分割主要有三个开源数据集：LiTS17，Sliver07，3DIRCADbLiTS17包含131个数据，可以用于肝脏及肿瘤的分割Sliver07包含20个数据，但仅仅包含肝脏，并没有肿瘤的金标准3DIRCADb包含20个数据，可以用于肝脏及肿瘤的分割提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考一、预处理这三个肝
飞翔的视野·2022-12-01 20:33

UNet为什么在医学图像分割表现好？

本文将为大家推荐在医学图像分割中表现性能较好的网络--UNet。
人工智能与算法学习·2022-11-30 23:20

Unet神经网络为什么会在医学图像分割表现好？

点击上方“小白学视觉”，选择加"星标"或“置顶”重磅干货，第一时间送达问题：Unet神经网络为什么会在医学图像分割表现好？
小白学视觉·2022-11-30 23:48

[Transformer]MedT:Medical Transformer: Gated Axial-Attention for Medical Image Segmentation

MedicalTransformer:门控轴向注意力用于医学图像分割AbstractSectionIIntroductionSectionIIMedicalTransformer(MedT)Part1Self-AttentionOverviewPart2GatedAxial-AttentionSectionIIIExoerimentsSectionIVConclusionAppendixPart1
黄小米吖·2022-11-30 19:46

Medical Transformer: Gated Axial-Attention for Medical Image Segmentation

MedicalTransformer:GatedAxial-AttentionforMedicalImageSegmentation医学转换器：用于医学图像分割的门控轴向注意力Abstract在过去的十年中
Never_Jiao·2022-11-30 19:11

UNet的Pytorch实现

UNet的pytorch实现原文本文实现训练过的UNet参数文件提取码：1zom1.概述UNet是医学图像分割领域经典的论文，因其结构像字母U得名。
Natuski_·2022-11-30 17:23

图像分割必备知识点 | Dice损失 理论+代码

欢迎各路朋友爱好者加我的微信讨论问题：cyx645016617.在很多关于医学图像分割的竞赛、论文和项目中，发现Dice系数(Dicecoefficient)损失函数出现的频率较多，这里整理一下。
微信公众号[机器学习炼丹术]·2022-11-30 13:27

医学图像分割评判标准及程序代码

文章目录1.图像分割指标2.两个问题3.IOU和假阳性率4.准确率(Accuracy),精确率(Precision),召回率(Recall)和F1-Measure参考资源：1.https://blog.csdn.net/zichen_ziqi/article/details/804084652.https://blog.csdn.net/HXG2006/article/details/796491
JH灰色·2022-11-30 13:49

Transformer-Unet：医学图像分割新工作

点击下方卡片，关注“CVer”公众号AI/CV重磅干货，第一时间送达转载自：集智书童Transformer-Unet:RawImageProcessingwithUnet论文：https://arxiv.org/abs/2109.08417本文提出了一种用于医学图像分析的基于Transformer和UNet的神经网络，Transformer直接处理原始图像而不是提取的特征图，性能优于Trans-U
Amusi（CVer）·2022-11-30 05:16

[Transformer]Transformer-Unet: Raw Image Processing with Unet

ConclusionUnet)Abstract医学图像分割任务在医学图像分析领域十分重要，精确的分割结果可以帮助医生进行诊
黄小米吖·2022-11-29 11:01

视网膜血管分割代码(Pytorch实现)

简单介绍一下，我的研究方向是计算机视觉（侧重于语义分割），主要做一些医学图像分割算法和偏工程的机器视觉部署方面的工作，具体研究课题是基于深度学习的视网膜血管分割算法研究。
lee-zq·2022-11-29 09:33

医学报告生成论文阅读笔记

1.TransformersinMedicalImaging:ASurvey综述了Transformers在医学图像分割、检测、分类、重建、合成、配准、临床报告生成和其他任务中的应用。
cskywit·2022-11-29 01:01

UneXt 基于MLP的快速医学图像分割网络

1.multilayerperceptron(MLP)多层感知机2.参数量减少了72倍，计算复杂度降低了68倍，推理速度（inferencespeed）提高了10倍根据其实验结果表，同结构U-Net参数量31.13M，UNeXt参数量1.47M3.transformer可以学习到对图像的全局理解4.几乎所有的上述工作都集中在提高网络的性能（精度），而不是太关注计算复杂度、推理时间或参数的数量，这些
Pr Young·2022-11-28 17:01

[MLP]UNeXt: MLP-based Rapid Medical Image Segmentation Network

UNeXT:基于MLP的快速医学图像分割网络AbstractSectionIIntroductionSectionIIUNeXTSectionIIIExperimentsandResultsSectionIVDiscussionSectionVConclusionfromJHUAbstractUNet
黄小米吖·2022-11-28 17:24

UNeXt: MLP-based Rapid Medical Image Segmentation Network

原文链接Abstract近年来，UNet及其最新扩展(如TransUNet)一直是领先的医学图像分割方法。但是，这些网络不能有效地用于护理应用中的快速图像分割，因为它们参数繁重，计算复杂且使用
Never_Jiao·2022-11-28 17:49

DS-UNeXt

DS-UNeXt:depthwiseseparableconvolutionnetworkwithlargeconvolutionalkernelformedicalimagesegmentation用于医学图像分割的大卷积核深度可分卷积网络论文
别再摆烂了，摆烂没有未来·2022-11-28 17:18

3DConvCaps：3DUNet与卷积胶囊编码器用于医学图像分割

摘要卷积神经网络需要大量的训练数据，无法处理物体的姿态和变形。此外其中的池化层也倾向于丢弃位置等重要的信息。CNN对旋转和仿射变换非常敏感。胶囊网络是最近出现的一种新型体系结构，其通过动态路由和卷积步长代替池化层，在部分整体表示中获得了更好的鲁棒性。本文提出了一种基于卷积胶囊编码器的三维编码器-解码器网络，利用卷积层学习低级特征，同时利用胶囊层建模高级特征Introduction在U型编解码器结构
不想敲代码的小杨·2022-11-28 08:54

3D-SKIPDENSESEG医学图像分割

蓝色三角、黄色三角、红色三角相对应。得到第三个featuremap，反卷积会恢复到原来的尺寸Denseblock，通道增加了Transition，池化用正则表达式把里面的h5文件匹配一下吧os.path.join()把两个部分的路径拼一下root_path—data_train*.h5，不管名字是什么，只要后缀是h5，就把它匹配一下glob，遍历所有.h5文件得到data_train里面的八个su
fu_gui_mu_dan·2022-11-28 07:56

UNet网络实现及解析

简介 Unet是受到FCN启发针对医学图像做语义分割，且可以利用少量的数据学习到一个对边缘提取十分鲁棒的模型，在生物医学图像分割领域有很大作用。
huserblog·2022-11-27 10:16

UNet - unet网络

u-net网络搭建3.1DoubleConv3.2Down下采样3.3Up上采样3.4网络输出3.5UNet网络UNet网络forward前向传播3.6网络的参数4.完整代码1.u-net介绍Unet网络是医学图像分割领域常用的分割网络
Henry_zs·2022-11-27 10:12

【Transformer】医学分割TransFuse: Fusing Transformers and CNNs for Medical Image Segmentation

transfuse医学分割背景网络简介transformer分支原论文地址：https://doi.org/10.48550/arXiv.2102.08005背景卷积神经网络(CNN)在众多医学图像分割任务中取得了无与伦比的性能
香博士·2022-11-26 21:14

[论文阅读] TransFuse: Fusing Transformers and CNNs for Medical Image Segmentation

论文地址：https://arxiv.org/abs/2102.08005发表于：MICCAI’21Abstract医学图像分割，这一众多临床需求的先决条件–已经被卷积神经网络(CNN)的最新进展大大促进了
xiongxyowo·2022-11-26 21:43
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