医学图像第16页

SimpleITK 中连通分量大小计算 GetPhysicalSize

利用全卷积神经网络解决医学图像分割问题，使用移除最小连通分量后处理分割结果。假设只做2分类：每个连通分量的大小计算方式：统计每个连通区域，首先从分割结果中统计连通区域，为每个连通区域设置不同的标签。

开心就哈哈·2022-12-17 21:52

SimpleITK三维图像分析

SimpleITK三维图像分析1、去除3D小连通域2、【医学图像处理】之腹部骨骼提取（SimpleITK）1、去除3D小连通域在一些计算机视觉任务中，需要对模型的输出做一些后处理以优化视觉效果，连通域就是一种常见的后处理方式

落花逐流水·2022-12-17 21:22

【联邦学习】联邦学习的应用领域、开源平台

文章目录一、联邦学习的应用二、联邦学习的开源平台参考链接一、联邦学习的应用联邦学习已经被应用于计算机视觉领域，例如医学图像分析。联邦学习也被应用于自然语言处理和推荐系统领域。

想变厉害的大白菜·2022-12-17 21:09

常用的医学图像分割评价指标

常用的图像分割评价指标非常多，论文中常用的指标包括像素准确率，交并比（IOU）,Dice系数，豪斯多夫距离，体积相关误差。下面提到的所有案例都是二分类，标签中只有0和1目录一：像素准确率二：交并比IOU三：骰子系数Dice四：Hausdorffdistance豪斯多夫距离五：CPA-类别像素准确率六：MPA-类别平均像素准确率七：MIOU(平均交并比)一：像素准确率定义：它是图像中正确分类的像素百

不想敲代码的小杨·2022-12-17 13:35

python-医学图像分割指标Dice代码实现

1.代码效果输出每张图片的Dice值及所有图片的Dice平均值，且最后生成一张Dice分布图：以100张图片为例，横坐标是图片序号，纵坐标是每张图片的Dice值。2.图片格式要求1.模型生成的标记图片和正确的标记图片要求是严格的二值图片。如下图：2.图片名称按序为：1.png2.png3.png...（图片格式可以在代码里改，如png，jpg等）3.代码（计算单张图片的Dice值）代码中white

生信研究猿·2022-12-17 13:33

TPU编程竞赛系列｜基于TPU-MLIR实现UNet模型部署，比“快”更快！

图像分割是图像处理和计算机视觉领域的一个重要课题，广泛应用于场景理解、医学图像分析、机器人感知、视频监控、增强现实和图像压缩等领域，UNet作为经典

算能开发者社区·2022-12-16 16:59

python 医学图像k-space下采样/傅里叶变换

对图像进行k-sapce下采样程序仓库：https://github.com/DejaVuyan/pythonfromutilimportsave_image,mkdirs,fft_2D,read_imageimportargparseimportos"""将文件夹中的图片进行k-space下采样后输出"""if__name__=='__main__':#初始化对象parser=argparse.

深夜不安静，音乐听听而已·2022-12-16 16:43

U2-Net：用于多域医学图像分割的3D通用U-Net

一、论文原文：《3DU2-Net:A3DUniversalU-NetforMulti-DomainMedicalImageSegmentation》https://arxiv.org/abs/1909.06012二、关键词条：医疗分割任务深度可分离卷积解决各种域的结构异质性基于3DU-Net和Vnet设计三、模型原理：图1：基于可分离卷积的域适配器，主要介绍的是如何组装域特定的信道卷积（alter

小肉包老师·2022-12-16 12:28

【医学图像处理】 8 VTK&ITK软件开发平台

VTK&ITK1VTK简介2ITK简介1VTK简介 VTK（TheVisualizationToolKit）：可视化的开源工具包。可自由使用的图像处理和可视化的三维计算机图形学软件系统，被世界各地成千上万的研究人员和开发人员使用。类似的还有opencv VTK不是一个公司，一个单位开发出来的，而是全世界科学工作者贡献得到的 VTK由C++代码组成的，其大量的库都是由C++编写，但是它提供了几

不断进步的咸鱼·2022-12-16 09:20

Anaconda下载simpleITK包和pytorch包

Anaconda下载simpleITK包ITK是一个开源的C++代码库，包含了大量的最新医学图像分割和配准基础函数和通用框架。简单来说，使用ITK，大家可以直接站在一大批国际大牛的肩上来进行开发。

啊哈biubiubiu~·2022-12-16 07:17

SimpleITK、pydicom的安装使用——踏上python生物医学图像处理的初学之路

一、两个库的安装pip均可直接安装。这里说说conda怎么安装SimpleITK。首先这个库是不在默认的channel里面的所以不能够直接安装。因此需使用：来寻找SimpleITK库的channel。应该会在结果当中找到SimpleITK/SimpleITK这个"channel/package"的项目。然后：来寻找SimpleITK库的channel。应该会在结果当中找到SimpleITK/Sim

hdpai2018·2022-12-16 07:44

ITK对应python中SimpleITK库的常用函数举例

在医学图像上经常使用的一个库-SimpleITK，很多处理都只懂个大概或者只会简单的读取，保存图像，这里对常用的一些操作进行总结：importSimpleITKassitk1、sitk.Cast(sitk.ReadImage

jancis·2022-12-16 07:14

Python中SimpleITK库的常用函数

在医学图像上经常使用的一个Python库SimpleITK，下面介绍其常用的函数:importSimpleITKassitk#1.读取图像，如.mhd.nii.nrrd等sitk.ReadImage(图像路径

Joker 007·2022-12-16 07:11

一文速览医学多模态进展

同时，获取有标注的医学图像领域的数据集通常需要大量的专业知识和较高的成本，所以从对应的放射学报告中得到有效监督从而提高性能成为一种可能。本文主要介绍医学的多模态模型的进

zenRRan·2022-12-15 22:54

深度学习----医学图像预处理

知乎预处理概念https://www.zhihu.com/question/417508279/answer/1461278406预处理是肝脏分割重要的一步，良好的预处理过程可以有效的提高分割的准度。1.1窗口设置：窗宽和宽口水平窗口设置是CT扫描的图像处理功能，有助于突出显示关键的解剖结构/发现，从而使图像解释尽可能容易。单位Hounsfieldunites（HU）。其中，HU值越高，对象越密集

GvoL·2022-12-15 18:57

[Transformer]U-Net Transformer: Self and Cross Attention for Medical Image Segmentation

UNetTransformer:UNet结合自注意力和交叉注意力用于医学图像分割AbstractSectionIIntroductionSectionIIU-TransformerNetworkSectionIIIExperimentsSectionIVConclusionPaperAbstract

黄小米吖·2022-12-15 07:08

[pytorch] Resnet3D预训练网络 + MedMNIST 3D医学数据分类

而MedMNISTv2，是一个大规模的类似MNIST的标准化生物医学图像集合，包括12个2D数据集和6个3D数据集。所有图

liyihao76·2022-12-14 23:36

3D-Resnet-50 医学图像分类（二分类任务）torch代码（精简版）-图像格式为NIFTI

dr_yingli·2022-12-14 23:29

3D-Resnet-50 医学图像分类（二分类任务，需要mask）训练代码-图像格式为nrrd（附带验证代码）

img_list格式如下E:\...\3.nrrdE:\...\3.nrrd0E:\...\4.nrrdE:\...\4.nrrd1训练代码importtorchfromtorchimportnnimportosimportnumpyasnpfromtorch.utils.dataimportDatasetfromscipyimportndimagefromtorchimportoptimfrom

dr_yingli·2022-12-14 23:54

OpenCV介绍与入门

.OpenCV的未来；OpenCV介绍OpenCV是计算机视觉的框架关于OpenCV1.OpenCV能做什么；目标识别i.人脸识别ii.车辆识别iii.物体识别等自动驾驶i.车道识别ii.障碍物识别等医学图像分析

jartins·2022-12-14 18:49

【论文】U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation

论文题目：U-Net:ConvolutionalNetworksforBiomedicalImageSegmentationu-net，用于生物医学图像分割的卷积网络1.Introduction深度神经网络在视觉领域发展非常迅猛

狂野摇摇车·2022-12-14 15:29

纹理分析及其在医学成像中的应用

鉴于纹理分析应用广泛，本研究主要集中在生物医学图像分析领域，并整理了一份最新的生物组织和器官相关的疾病产生的纹理变化的列表，可用于查阅疾病的发病和进展。

思影科技·2022-12-14 15:23

医学图像标注终极指南

医学图像注释是标记医学成像数据的过程，例如X射线、CT、MRI扫描、乳房X光检查或超声波。它用于训练用于医学图像分析和诊断的AI算法，帮助医生节

Meta.Qing·2022-12-14 14:43

nnU-Net论文笔记

论文标题：nnU-Net:Self-adaptingFrameworkforU-Net-BasedMedicalImageSegmentation一种基于U-Net的医学图像分割自适应框架论文链接：arxiv

滴嘟滴嘟dzj·2022-12-14 14:30

图像分割（三）—— Swin-Unet: Unet-like Pure Transformer for Medical Image Segmentation

swin-unetsAbstractIntroductionMethod3.1Architectureoverview3.2SwinTransformerblockAbstract在过去的几年中，卷积神经网络(CNNs)在医学图像分析中取得了里程碑

黑洞是不黑·2022-12-14 06:50

基于MATLAB的数字图像处理的设计与实现转

目的：改善医学图像质量，使图像得到增强。方法：利用Matlab工具箱函数,采用灰度直方图均衡化和高通滤波的方法对一幅X线图像进行增强处理。结果：用直方图均

wfx0002·2022-12-14 06:42

这9个方向有钱途；AIGC再添霸榜应用Lensa；美团SemEval2022冠军方法分享；医学图像处理工具箱… | ShowMeAI资讯日报

日报合辑|AI应用与工具大全|公众号资料下载|@韩信子2023年9个有前途的AI创业方向https://www.aiplusinfo.com/blog/9-promising-artificial-intelligence-startup-ideas-for-2023/2022年，AI应用全面落地开花，越来越多企业和个人在尝试将AI技术融入到日常的生产生活中。现在，是时候创建一家提供AI解决方案的

ShowMeAI·2022-12-13 22:27

【医学图像处理】 7 图像区域特征

图像特征图像区域特征：（1）周长和面积：周长：区域边缘线上的所有像素点，这些像素点的总数为周长面积：区域边缘线内部像素点的数量（2）圆心，半径（区域大小的尺度）：圆心：中心点为离区域边缘距离都最远的点。求取方式如下：半径：边缘上的点到圆心（中心点）距离的一半，并且这个距离为最小的距离。（3）中心距、朝向：如果能知道图像的朝向，那么就能很好的对图像进行校正，利于扫描文

不断进步的咸鱼·2022-12-13 21:48

图像恢复论文简记——Uformer: A General U-Shaped Transformer for Image Restoration

后来的医学图像去噪架构Eformer就是Uformer基础上改进而来，看来还是值得一读，简单记录下。知乎同名账号同步发布。

umbrellalalalala·2022-12-13 18:14

nnUNet框架小结（CUDA9.0+torch1.1\使用nrrd数据集）

nnUNet可谓医学图像分割的大杀器。本文将介绍在使用nnUNet途中的心路历程，帮助同需要使用该框架的小伙伴解决困惑。笔者使用的服务器的基础环

苏东坡哦哦·2022-12-12 22:32

医学图像查看软件MicroDicom官网

wwee1223·2022-12-12 20:25

03_FAST、BRIEF、ORB算法原理

深度估计、超分辨率、3D目标检测、CNN、GAN、目标跟踪、竞赛解决方案、人脸识别、数据增广、人脸检测、数据集、NAS、AutoML、图像分割、SLAM、实例分割、人体姿态估计、视频目标分割、Re-ID、医学图像分割

qq_1041357701·2022-12-12 00:14

影像组学初学者指南

影像组学是放射学领域的一个相对较新的词，意思是从医学图像中提取大量的定量特征。人工智能（AI）大体上被定义为一组先进的计算算法，可以对所提供的数据模式进行学习，以便对未知的数据集进行预测。

思影科技·2022-12-11 22:25

Radiology：影像组学：图像不仅仅是图片，它们还是数据

在过去十年中，随着模式识别方法的增加和数据集大小的增加，医学图像分析领域的研究越来越多。

思影科技·2022-12-11 22:25

U-Net网络:Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation

U-Net:卷积网络用于生物医学图像分割摘要人们普遍认为，对深度网络作品的成功训练需要成千上万的注释训练样本。

落花满蹊径·2022-12-11 19:19

【U-Net】Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation

对比FCN优点如下：尺度适合超大图像分割，适合医学图像分割听说，官方的数据集只有一张t

117瓶果粒橙·2022-12-11 19:49

【文献阅读】SLAKE——医学图像的VQA双语数据集（Bo Liu等人，ArXiv，2021）

一、背景文章题目：《SLAKE:ASemantically-LabeledKnowledge-EnhancedDatasetforMedicalVisualQuestionAnswering》文章下载地址：https://arxiv.org/pdf/2102.09542.pdf文章引用格式：BoLiu,Li-MingZhan,LiXu,LinMa,YanYang,Xiao-MingWu."SLAK

全部梭哈迟早暴富·2022-12-11 19:13

史上最全 | 基于深度学习的3D分割综述（RGB-D/点云/体素/多目）

摘要3D目标分割是计算机视觉中的一个基本且具有挑战性的问题，在自动驾驶、机器人、增强现实和医学图像分析等领域有着广泛的应用。它受到了计算机视觉、图形和机器学习社区的极大关注。

自动驾驶之心·2022-12-11 17:33

多模态医学图像数据集

多模态医学图像数据集参考博客：数据集:一文道尽医学图像数据集与竞赛医学影像系列：一数据集合集最新最全医学图像数据集汇总医学影像数据集集锦医学影像开源数据集脑的数据一般可以多模态，MRI-T1/T2etc

海绵baby强无敌·2022-12-11 09:41

医学图像开源数据集汇总

编辑丨极市平台3D-IRCADB脏器分割数据集数据集链接：http://m6z.cn/6x5OSn3D-IRCADb-01数据库由10名女性和10名男性75%的肝肿瘤患者的3DCT扫描组成。20个文件夹对应20个不同的患者，可以单独下载也可以联合下载。下表提供了图像信息，例如肝脏大小（宽度、深度、高度）或根据Couninaud分割的肿瘤位置。它还表明肝脏分割软件可能遇到的主要困难是由于与邻近器官的

极市平台·2022-12-11 09:39

深度剖析monai(一) Data和Transforms部分

它是一个优秀的基于pytorch的医学深度学习框架，包括了Tansformers(负责数据的读取和数据增强)、Lossfunctions(包含常见的损失函数)、Networkarchitectures(实现了常用的医学图像分割

遇到坎就得迈过去·2022-12-11 08:09

MONAI Transform 分析和使用

最近在学习深度学习，了解了monai框架，随着学习的不断深入，发现Transform这个模块很重要在做医学图像处理的时候需要用到图像增强，就需要用到个Transform中的各种API进行增强变换所以在这里记录下

@左左@右右·2022-12-11 08:38

医学图像工具包monai--中心裁剪

monai.transform包中有多个裁剪方法，其中包括空间裁剪SpatialCropd,中心裁剪CenterSpatialCropd,以及前景裁剪CropForegroundd。这篇文章主要是针对于本课题需要的目的只进行了中心裁剪，在这边记录以方便后面使用。由于没有标签数据，只对MRA原始图像进行了裁剪。首先需要有data_dict列表，列表中保存了关于key=image的字典。然后我们需要一

努力努力再努力的月月·2022-12-11 08:08

python图像增强算法_图像增强算法小结（直方图、Gamma变换、CLAHE 和 Retinex）

注：我处理的是医学图像，所以某些细节问题可能不太一样(比如对RGB不考虑，全部转为灰度图)环境：win10、python3.6.6、JupyterNotebook、opencv3.4.2相关代码已上传至个人

weixin_39984403·2022-12-11 01:40

数字图像处理

用途：医学图像处理、卫星图像处理、自动字符识别、军事保障第二章人眼的结构（锥状体，杆状体）P24杆状体：单色夜视、暗视觉、单色信号敏感（灰度传感器）光通量范围106-100ML整个视网膜锥

mao____mao·2022-12-11 01:07

Nvidia力作：医学图像分割网络

来源：投稿作者：梦飞翔编辑：学姐引自Unetr:Transformersfor3dmedicalimagesegmentation1.序言本文将以Nvidia团队最近提出的一种新的医学图像分割网络作为切入点

深度之眼·2022-12-11 01:04

nii数据的各种处理详解

数据本身是除了矩阵信息（也就是图像信息之外），还有和物理坐标相关的仿射矩阵以及Header头文件信息.把nii数据转成png格式会损失很多信息，因为png格式图像的灰度值有256阶，因此直接使用nii的医学图像做输入会更好一点

L_bloomer·2022-12-10 23:32

图像的连通域标记算法及工具介绍

实际上估计不是太多的人懂得标记连通域的原理，加上在医学图像处理中，我们常常用到3维图像，而上述工具只解决了2维图像上的情况，并不支持3维图像的标记(目前还不支持)，因此有必要对这个连通域标记算法进行进一步说明

此人姓于名叫罩百灵·2022-12-09 19:03

论文解析[3] U-Net and its variants for Medical Image Segmentation : A short review

2.2U-Net20152.3U-Net++20192.4R2U-Net20182.5AttentionU-Net20182.6TransU-Net20213.Disscussion论文概要本论文是一篇使用U-Net及其变形进行医学图像分割的简短综述

默_silence·2022-12-09 12:31

Medical Image Segmentation Review:The Success of U-Net

目录医学图像分割综述：UNet的成功1.摘要与介绍2.分类2.1.2DUnet2.23DUNet3.UNet扩展3.1对于跳跃连接的增强与改进3.1.1--增加跳跃连接数量3.1.2--对跳跃连接过程中的特征进行处理

不想敲代码的小杨·2022-12-09 12:25

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