医学图像第19页

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医学图像——数据读取和预处理医学图像——数据读取和预处理目录3D图像读取1、ITK-SNAP软件2、python包读取(1)nii数据——SimpleITK(2)nrrd数据图形预处理1、归一化处理2、

苹果秋律师·2022-11-30 10:01

医学图像处理——数据类型与图像类型

数字图像在数字化处理另外一个重要的前提就是类型格式，不同的函数的输入是有着固定的数据格式的，在过图像处理这关时学得先熟悉这些个知识才能游刃有余！想要杀牛首先要对牛体构造十分清楚，这就是庖丁解牛告诉我们的！今天小白就带大家了解数据格式和图像格式两大“技能”数据类虽然我们处理的坐标是整数的，但是需注意的是MATLAB中的像素值并不一定是整数。以下一张“秘籍”请大家收好！注意！Double类型的数据是最

乔巴哈哈·2022-11-30 10:28

Transformer-Unet：医学图像分割新工作

第一时间送达转载自：集智书童Transformer-Unet:RawImageProcessingwithUnet论文：https://arxiv.org/abs/2109.08417本文提出了一种用于医学图像分析的基于

Amusi（CVer）·2022-11-30 05:16

Swin-VoxelMorph

摘要可变形医学图像配准广泛应用于医学图像处理中，具有可逆一对一的映射。虽然最先进的图像配准方法是基于卷积神经网络，但很少有人尝试用Transformer的方法。

PKSolar·2022-11-30 05:11

医学图像多分类的评价指标（包括混淆矩阵，metrics.classification_report等）

最近在做一个四分类的医学图像分类，记录下到处凑来的分类效果评价指标吧：y_true,y_pred,outProb都是列表发现了一个问题：metrics.classification_report不会打出多分类的特异度

aajianga·2022-11-30 01:17

医学图像处理的SCI期刊和顶会

医学图像处理的SCI期刊和顶会1SCI期刊2顶会2.1CV方向2.2医学图像处理3持续更新。。。

Philo`·2022-11-29 21:44

[Transformer]Transformer-Unet: Raw Image Processing with Unet

ConclusionUnet)Abstract医学图像分割任务在医学图像分析领域十分重要，精确的分割结果可以帮助医生进行诊

黄小米吖·2022-11-29 11:01

图像配准概述

图像配准在医学图像领域是一项重要的技术，在许多的临床诊断中，为了分析患者的状况，常常需要采集患者的扫描影像，例如，X线、MRI、CT和超声，这些扫描影像可以对患者的诊断提供依据，然而，在独立的影像中，临床信息并不是十分明显

灵客风·2022-11-29 09:13

基于深度学习的医学图像配准综述

zlinzju·2022-11-29 09:39

医学图像配准中的深度学习综述论文解读

点击上方“小白学视觉”，选择加"星标"或“置顶”重磅干货，第一时间送达来源：https://zhuanlan.zhihu.com/p/92032320作者：莫云非本文来自知乎专栏，仅供学习参考使用，著作权归作者所有。如有侵权，请私信删除。这里笔者尝试解读一篇2019年预发表的《DeepLearninginMedicalImageRegistration:ASurvey》论文综述，在这篇综述中，原作

小白学视觉·2022-11-29 09:07

视网膜血管分割代码(Pytorch实现)

简单介绍一下，我的研究方向是计算机视觉（侧重于语义分割），主要做一些医学图像分割算法和偏工程的机器视觉部署方面的工作，具体研究课题是基于深度学习的视网膜血管分割算法研究。

lee-zq·2022-11-29 09:33

【Image Registration】图像配准综述

文章目录一、图像配准定义二、图像配准应用场景2.1医学图像领域2.2其他领域三、图像配准分类四、图像配准过程4.1特征检测（Featuredetection）4.2特征匹配（Featurematching

何以少团栾。·2022-11-29 09:00

医学报告生成论文阅读笔记

1.TransformersinMedicalImaging:ASurvey综述了Transformers在医学图像分割、检测、分类、重建、合成、配准、临床报告生成和其他任务中的应用。

cskywit·2022-11-29 01:01

model.load_state_dict(state_dict)报错出现参数与模型不匹配

项目场景：最近在使用UNETR做医学图像的分割，当遇到如下问题：在训练的途中突然断掉需要拿之前保存的checkpoint加载后继续训练或者使用训练好的预训练模型继续训练就需要用到预训练的命令和代码，成为微调问题描述输入命令行如下

ElaineLiu0307·2022-11-28 21:47

UneXt 基于MLP的快速医学图像分割网络

1.multilayerperceptron(MLP)多层感知机2.参数量减少了72倍，计算复杂度降低了68倍，推理速度（inferencespeed）提高了10倍根据其实验结果表，同结构U-Net参数量31.13M，UNeXt参数量1.47M3.transformer可以学习到对图像的全局理解4.几乎所有的上述工作都集中在提高网络的性能（精度），而不是太关注计算复杂度、推理时间或参数的数量，这些

Pr Young·2022-11-28 17:01

[MLP]UNeXt: MLP-based Rapid Medical Image Segmentation Network

UNeXT:基于MLP的快速医学图像分割网络AbstractSectionIIntroductionSectionIIUNeXTSectionIIIExperimentsandResultsSectionIVDiscussionSectionVConclusionfromJHUAbstractUNet

黄小米吖·2022-11-28 17:24

UNeXt: MLP-based Rapid Medical Image Segmentation Network

原文链接Abstract近年来，UNet及其最新扩展(如TransUNet)一直是领先的医学图像分割方法。但是，这些网络不能有效地用于护理应用中的快速图像分割，因为它们参数繁重，计算复杂且使用

Never_Jiao·2022-11-28 17:49

DS-UNeXt

DS-UNeXt:depthwiseseparableconvolutionnetworkwithlargeconvolutionalkernelformedicalimagesegmentation用于医学图像分割的大卷积核深度可分卷积网络论文

别再摆烂了，摆烂没有未来·2022-11-28 17:18

3DConvCaps：3DUNet与卷积胶囊编码器用于医学图像分割

摘要卷积神经网络需要大量的训练数据，无法处理物体的姿态和变形。此外其中的池化层也倾向于丢弃位置等重要的信息。CNN对旋转和仿射变换非常敏感。胶囊网络是最近出现的一种新型体系结构，其通过动态路由和卷积步长代替池化层，在部分整体表示中获得了更好的鲁棒性。本文提出了一种基于卷积胶囊编码器的三维编码器-解码器网络，利用卷积层学习低级特征，同时利用胶囊层建模高级特征Introduction在U型编解码器结构

不想敲代码的小杨·2022-11-28 08:54

3D-SKIPDENSESEG医学图像分割

蓝色三角、黄色三角、红色三角相对应。得到第三个featuremap，反卷积会恢复到原来的尺寸Denseblock，通道增加了Transition，池化用正则表达式把里面的h5文件匹配一下吧os.path.join()把两个部分的路径拼一下root_path—data_train*.h5，不管名字是什么，只要后缀是h5，就把它匹配一下glob，遍历所有.h5文件得到data_train里面的八个su

fu_gui_mu_dan·2022-11-28 07:56

[论文精度系列][1]语义分割综述: Image Segmentation Using Deep Learning: A Survey(1)

基于深度学习的图像分割综述:ImageSegmentationUsingDeepLearning:ASurvey(1)摘要图像分割在图像处理和计算机视觉中扮演着关键的角色，在许多应用中发挥着重要的作用，例如:场景理解、医学图像分析

NullerCV·2022-11-28 07:15

LUNA16结节可视化及世界（CT)坐标与体素（图像）坐标的转换

DICOM医学图像读取涉及到的医学坐标体系_sunyao_123的博客-CSDN博客_dicom坐标系关于坐标名称，看了许多博文，有像素坐标，真实坐标，体素坐标，图像坐标，世界坐标搞得一头雾水。

CHENxiaoni_·2022-11-27 23:22

ITK入门教程（17）nii,mhd,stl之间的相互转换

本文细说一下医学图像中常见的文件格式之间的转换。1.如何将raw/mhd转换为Nifti/nii您应该能够使用SimpleITK来完成。

求则得之，舍则失之·2022-11-27 22:33

[CVPR2022] BoostMIS: Boosting Medical Image Semi-Supervised Learning With Adaptive Pseudo Labeling a

BoostingMedicalImageSemi-SupervisedLearningWithAdaptivePseudoLabelingandInformativeActiveAnnotation要点：1、新型的半监督学习框架——BoostMIS，结合了自适应伪标记和信息性主动标注，充分发挥医学图像半监督学习的潜力

nightluo·2022-11-27 18:09

TCIA (The Cancer Imaging Archive)--医学影像数据集

TCIA(TheCancerImagingArchive)：是一个包含常见肿瘤（肺癌、前列腺癌等）医学图像及相应临床信息（治疗方案细节、基因、病理等）的大规模公用数据库，其影像模态包括MRI、CT等，图像格式均为

彭素华·2022-11-27 18:34

【QT数字图像处理】（一）读取图像

这学期修“医学图像处理”这门课，最后的大作业是搭一个图像处理系统，要求用C++写界面，不能调库。我本科阶段学的是机械工程，没有接触过C++，只好边学边做。听说MFC已死，就选择了QT平台进行开发。

嵌入式小马·2022-11-27 15:48

论文(二)：Kernel Self-Attention for Weakly-supervised Image Classification using Deep Multiple Instance

在某些情况下，特别是在医学图像分析中，一个标签对应于一个实例包(例如图像补丁)，为

小王不叫小王叭·2022-11-27 15:11

UNet网络实现及解析

简介 Unet是受到FCN启发针对医学图像做语义分割，且可以利用少量的数据学习到一个对边缘提取十分鲁棒的模型，在生物医学图像分割领域有很大作用。

huserblog·2022-11-27 10:16

UNet网络结构

UNet是医学图像处理方面著名的图像分割网络，过程是这样的：输入是一幅图，输出是目标的分割结果。继续简化就是，一幅图，编码，或者说降采样，然后解码，也就是升采样，然后输出一个分割结果。

lianghe77·2022-11-27 10:44

UNet - unet网络

u-net网络搭建3.1DoubleConv3.2Down下采样3.3Up上采样3.4网络输出3.5UNet网络UNet网络forward前向传播3.6网络的参数4.完整代码1.u-net介绍Unet网络是医学图像分割领域常用的分割网络

Henry_zs·2022-11-27 10:12

文本自动生成研究进展与趋势之图像到文本的生成

图像到文本的生成1国际研究现状图像到文本的生成技术是指根据给定的图像生成描述该图像内容的自然语言文本，例如新闻图像附带的标题、医学图像附属的说明、儿童教育中常见的看图说话、以及用户在微博等互联网应用中上传图片时提供的说明文字

jinhao_2008·2022-11-27 04:02

【Transformer】医学分割TransFuse: Fusing Transformers and CNNs for Medical Image Segmentation

transfuse医学分割背景网络简介transformer分支原论文地址：https://doi.org/10.48550/arXiv.2102.08005背景卷积神经网络(CNN)在众多医学图像分割任务中取得了无与伦比的性能

香博士·2022-11-26 21:14

[论文阅读] TransFuse: Fusing Transformers and CNNs for Medical Image Segmentation

论文地址：https://arxiv.org/abs/2102.08005发表于：MICCAI’21Abstract医学图像分割，这一众多临床需求的先决条件–已经被卷积神经网络(CNN)的最新进展大大促进了

xiongxyowo·2022-11-26 21:43

TransFuse：融合Transformers和CNN用于医学图像分割

最近transformer网络真的非常火，尤其是在语义分割中，人们提出了各种各样的组合方法。我上一篇提到了一篇文章：TransUnet。这里另外一篇基于transformer的网络也出来了。比较出名，在这里推荐给大家。废话不多说直接上整个网络的结构框架这一篇文章相比于前面那篇，整个彻底的去掉了传统的CNN网络结构。直接使用了transformer.这样做的目的是在不损失low-level细节的定位

skyfengye·2022-11-26 21:11

【医学图像分割】泛读论文系列 1

【医学图像分割】泛读论文系列1文章目录【医学图像分割】泛读论文系列1TitleAbstractKeywordCoreproblemMethodNoveltyShort-comingConclusionTitle

一年练一次深蹲·2022-11-26 21:40

TransFuse论文

TransFuse[融合transformer和CNN用于医学图像分割]摘要基于CNN的方法在建模远程关系是存在局限性，现有的方法为了建模远程关系的手段是加深编码器结构通过更多的下采样操作来达到一个更大感受野

YTKQ_YTKQ·2022-11-26 21:08

医学分割学习记录-AMOS22数据预处理(nnUnet)

cropping,resample,normalization三个步骤.Github源码:GitHub-MIC-DKFZ/nnUNet但是Github项目的代码比较复杂,知乎有一篇文章写的更清晰:如何针对三维医学图像分割任务进行通用数据预处理

weixin_45116056·2022-11-26 20:24

nnUNet使用教程（使用自己的数据训练自己的模型）

1.制作自己的数据集nnunet作为unet的一种改进，在3d医学图像上使用有非常好的效果，本篇教程主要说明nnunet在2d图像上的应用，也是相对来说更贴近我们平时使用的方向。

SetMaker·2022-11-26 20:22

nnUNet（代码）-预处理

nnU-Net:aself-configuringmethodfordeeplearning-basedbiomedicalimagesegmentationFabian1.背景动机：简单来说医疗数据尤其是在3D医学图像领域

lryjy·2022-11-26 20:21

医学图像处理医学图像处理-卷积神经网络卷积神经网络_小白也能看懂的卷积神经网络原理...

公众号“计算机视觉与深度学习”，专注人工智能，计算机视觉，深度学习，机器学习，自然语言处理，slam等前沿技术，从入门到进阶全覆盖，定期分享知识。小编在市面看了很多介绍计算机视觉的知识，感觉都非常深奥，难以理解和入门。因此总结出了一套容易理解的教程，希望能够和大家分享。一.人工神经网络人工神经网络是一种模拟人脑构建出来的神经网络，每一个神经元都具有一定的权重和阈值。仅有单个神经元的图例如下所示：从

weixin_39612110·2022-11-26 12:39

【语义分割项目实战】Augmentor数据增强与U-Net的综合应用

工具的语义分割中常见几种数据增强方式（一）_Bill～QAQ～的博客-CSDN博客以及简单的复现U-Net网络【语义分割项目实战】制作语义分割数据集，并使用U-Net进行实战检测_Bill～QAQ～的博客-CSDN博客_unet医学图像分割实战现在我们需要将两者综合运用起来

Bill～QAQ～·2022-11-26 05:32

医学图像处理——DeepDrr工具CT生成DRR

医学图像处理——DeepDrr工具CT生成DRR一、DeepDrr工具介绍二、DeepDRR工具使用三、测试DeepDRR工具3.1测试数据集3.1.1阿里云数据3.1.2LIDC-IDRI肺结节dicom

吃胡萝卜的兔酱·2022-11-26 03:29

【记录】python使用nibabel和sitk读取保存nii.gz文件

nii.gz格式是医学图像常用的压缩格式，python中可用nibabel和sitk来读取保存。

脆鲨Nana7mi·2022-11-26 03:58

医学图像处理-安装nibabel包命令

医学图像处理-安装nibabel包命令问题与解决方案问题与解决方案直接使用pipinstallnibabel出现如下报错：尝试使用conda命令安装，conda官网查命令：condainstall-cconda-forgenibabelcondainstall-cconda-forge

吃胡萝卜的兔酱·2022-11-26 03:58

Lasso回归系列一：用LASSO回归做特征筛选踩坑记

Lasso回归的原理（请看我的另一篇博客：Lasso回归系列二：Lasso回归/岭回归的原理）顺便结合最近实验犯的错误，给大家谝一谝（陕西的都懂哈）我采用如下pipeline来进行医学图像分类(数据集包含

咻咻咻哈·2022-11-25 23:40

[论文翻译] Learning with Limited Annotations: A Survey on Deep Semi-Supervised Learning for Medical

https://arxiv.org/abs/2207.14191Abstract医学图像分割是许多图像引导的临床方法中的基本和关键步骤。

xiongxyowo·2022-11-25 22:23

基于matlab生物医学影像处理,基于MATLAB的医学图像处理

基于MATLAB的医学图像处理届别2012届学号200814350135毕业设计(论文)基于MATLAB的医学图像处理姓名唐涛系别、专业计算机科学系、通信工程专业导师姓名、职称朱卫平、副教授完成时间2012

考试点·2022-11-25 21:39

医学图像处理期末复习

文章目录一、填空题第一章医学图像处理概论第二章医学图像处理基础第三章医学图像的运算第五章医学图像增强第六章医学图像分割二、计算题三、简答题一、填空题第一章医学图像处理概论1.现代医学影像技术的发展源于德国科学家伦琴于

若逢雪初霁·2022-11-25 21:35

医学图像中的部分评价指标小结

1.随机取块的方式相对于整张图片来说更容易收敛2.关于准确率与召回率的问题：先理解这四个参数：TP、FP、TN、FN，在理解的时候，先看第二个符号，第二个符号代表我们的结果，第一个符号代表系统对我们的结果给出的判断。比如说TP，第二个符号P代表我们认为是正确的，T代表我们的猜测是正确的，那就说明真正的标签是正确的且我们猜对了。比如说TN，第二个符号N代表我们认为是错误的，T代表我们的猜测是正确的，

躺鸡小能手·2022-11-25 16:20

医学图像分割——U-Net解读与个人笔记

最近开始尝试医疗影像分割的任务，先从之前的Unet开始阅读，记录一部分笔记以供回顾。论文地址：http://www.arxiv.org/pdf/1505.04597.pdf摘要作者提出了一个相对当时来说全新的网络，Unet。Unet主要由contractingpath（特征提取通路），symmetricexpandingpath（合成扩张通路）组成，运行速度很快，且远胜于当时最好的方法——基于滑动

零壹博弈·2022-11-25 16:19

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