富集

GSEA的分析汇总-转载

我以前也写过用法教程:用GSEA来做基因集富集分析批量运行GSEA，命令行版本原理但说到统计学原理，就有点麻烦了，我试着用自己的思路阐释一下：假设芯片或者其它测量方法测到了2万个基因，那么这两万个基因在
天涯清水·2021-05-18 20:57

云享富集团董事长何演婷

云享富集团董事长何演婷，今天在北京接受新闻媒体采访。云享富走智慧地球致富之路。云享富理念：融合资源、创新创变、共赢未来。云享富使命：让世界走进中国，让中国走向世界。云享富愿景:立足中国，引领全球。
风物九天·2021-05-18 19:26

GSVA计算原理

ssGSEA(singlesampleGSEA,单样品GSEA)对每个样品进行GSEA，R包GSVA(GeneSetVariationAnalysis)可以用来进行ssGSEA，GSVA可以将表达矩阵转换成通路富集分数
小潤澤·2021-05-15 11:31

clusterProfiler挑选背景集做GO富集

我们一般在利用clusterProfiler做GO富集的时候，往往都是默认用全部基因集去当背景集去做的，由于富集分析的假设检验利用的是fisher检验，传送门：fisher检验因此，我们利用GO函数：ego
小潤澤·2021-05-14 11:28

一文极速读懂 KEGG 数据库

目录image一、介绍在进行生物学实验或者生物信息的学习中，都会听说KEGG富集分析，而且该方法在高通量测序分析中已然成为数据分析中必不可少的一环。
白墨石·2021-05-14 06:53

2018-01-10 二八定律

006h8zNbzy6YlQcUg1T75&690.jpg提起二八定律，我们通常定义是80%的社会财富集中在20%的人手里，而80%的人只拥有社会财富的20%。下面，就来具体学习一下二八定律。
snailwww·2021-05-13 17:08

GSEA算法学习

该基因集为已知功能注释的某一个通路所含基因（如一个GOterm中所用基因）；LeadingEdegeSubset：核心基因集，通常为位于ES的某一侧（或者RankGeneList的某一端）2.计算方法步骤1：富集分数的计算通过计算基因富集分数
瞌睡斋主人·2021-05-13 00:15

优势富集理论让一般普通人也能获得想要的生活——《超越性思维》

《超越性思维》由创新思维研究者王健所著，书中首次提出这样一个理论：优势富集理论，这个理论被广泛应用于企业、组织、个人。现在看来，尤以对个人的启发作用非常深刻。
言不同·2021-05-12 21:28

开启你的百万年薪成长之路 - 职场大咖分享系列1

曹炜MichaelCaoMichaelCao-Vans(范斯)中国区总经理/威富集团战略业务副总裁从快速消费品行业到服装零售，历任柯达，耐克，威富公司高管，Michael每一步都走得稳健扎实。
洪老爷·2021-05-11 03:04

长富理财1万月标收益274

长富理财，上市系，江西银行存管进入技术对接阶段，详情见官网公告，投融家亲兄弟，香港主板上市公司投融长富集团全资控股平台，平台远期战略规划为金交所，与其他兄弟平台发展方向不同。
小不啦·2021-05-10 04:24

GO和KEGG富集倍数（Fold Enrichment）如何计算

前面我们简单介绍过ggplot2画KEGG富集柱形图，其实GO富集结果的展示相对于KEGG来说要复杂一点点，因为GO又进一步可以划分成三个类。BP:biologicalprocess,生物学过程。
生信交流平台·2021-05-08 20:01

#30天专注橙长计划＃茶课笔记之茶时＃Day4

春：春天雨水充沛，气温温和，茶树经过一个冬季的休眠后，积累了丰富的养分，使得茶树生长旺盛，芽叶肥厚，有效成分富集，不仅使茶滋味醇厚鲜美，香气浓郁，而且保健作用更佳。
明明似我·2021-05-08 09:15

云享健～2018年，云享富集团董事长何演婷响应国家号召，关注生态文明，强力推出云享健！

2018年，云享富集团董事长何演婷响应国家号召，关注生态图片发自App图片发自App图片发自App文明，强力推出云享健！
云享健·2021-05-07 13:36

领略生命

大自然是美好的，因为富集着
沧海涤尘·2021-05-03 10:28

异事富集

那么，那一百人的亲人、朋友将视之为灵异，在悲伤淡去后，他会记住“异事”，然后将其宣扬，于是，“异事”便会“富集”。即使一个人仅听过其中十件，他也有只够的理由相信：“人能预见死亡！”
九赕·2021-04-28 02:16

首富换人了, 马化腾身价缩水排第二, 许家印已进入前三

腾讯今年受业绩影响，腾讯控股的市值蒸发近千亿美元，股东财富集体缩水，当然会影响马化腾的个
花开花洛又是雨季·2021-04-26 06:11

得到香帅 | 金融的本质

为什么要学习金融在这个时代，金融仍然是少数“精英的游戏”，金融的门槛将普通人挡在了门外，而金融的杠杆效应又让越来越多的财富集中在越来越少的人手里。
杨宁victor·2021-04-25 20:19

（转帖）有意思的-GO enrichment (Easier)

原文地址：https://mp.weixin.qq.com/s/cFX51WjlgS-SetbM8THqdg上次给大家分享的绘制上下调基因GO富集图的方法好像还是比较麻烦，需要用到R和AI，还要自己调试参数
苏慕晨枫·2021-04-25 03:06

详解如何获取物种所有基因对应的GO注释

GeneOntology是研究基因功能的重要数据库之一，在进行GO的富集分析时，需要提供所有基因对应的GO注释信息，本文介绍几种获取该信息的方式。
生信修炼手册·2021-04-24 14:22

NGS二代测序技术与转化医学研究--2.RNA-seq部分

但不少转化医学项目往往选择传统的polyA富集建库，只拿到mRNA数据而丢掉了其它非编码RNA信息（常规的mRNA甚至单细胞RNA-seq已经发布有I
星尘_ec92·2021-04-24 03:08

面料中有哪些毒有害物质会损害人体健康

尤其是难代谢、易生物积累的重金属和有机污染物，越来越多的数据显示这类物质潜在的生理毒害性在自然条件下会持续作用很长时间，并可通过食物链在人体富集。那么，应该如何检
快乐的小星星呀·2021-04-24 01:45

RNA-seq分析：从软件安装到富集分析详细过程

RNA-seq分析简洁版,用重新下载的肝癌数据进行从头分析，包含了以下详细过程的几乎所有流程代码和部分关键结果。同时，KEGG可视化部分用了ClusterProfiler的结果。并把counts结果，DEGs结果和genesymbols全部整合到一个矩阵中。---------------------------------------------------------------RNA-seq详
Y大宽·2021-04-23 23:49

TCGA转录组差异分析后多种基因功能富集分析：从GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID转换）

测序上游分析系列：mRNA-seq转录组二代测序从rawreads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从rawreads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从rawreads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】其他文章系列：ggplot2作图篇：（1
ZZZZZZ_XX·2021-04-19 11:34

力行·思考题 | 奶嘴娱乐思考

与会者认为，全球化会加剧贫富差距，会使财富集中在全球20%的人手上，而另外80%的人则被“边缘化”。那么
有孚在道·2021-04-19 05:30

泡过药的花生种子，不生虫

生物毒素是富集的，当我们这样想的时候会发现无论我们在种植养殖时，还是要考虑到万物循环过来，最顶端的食物链是我们人类。我想起小时候在家里吃的蔬
猫一儿·2021-04-19 04:00

『R画图脚本进阶』TBtools两个富集分析结果合并一键可视化

为啥搞这个之前写过一个用ggplot2画TBtools富集分析结果的代码，用ggplot2做富集分析气泡图,发现大家确实喜欢花里胡哨的东西....其实我感觉柱状图就已经挺能说明问题的，当然一张花里胡哨的图小概率可以成为论文的加分项
ShawnMagic·2021-04-18 06:27

ggpubr-专为学术绘图而生（二）

01生存曲线R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵R语言GEO数据挖掘02-解决GEO数据中的多个探针对应一个基因R语言GEO数据挖掘03-limma分析差异基因R语言GEO数据挖掘04-功能富集分析如果没有时间精力学习代码
医科研·2021-04-18 05:27

三月week1文献阅读（上）:Pathway enrichment analysis and visualzation of omics data using g:Profiler,GSEA,C...

：Pathwayenrichmentanalysisandvisualzationofomicsdatausingg:Profiler,GSEA,CytoscapeandEnrichmentMap通路富集分析和可视化组学的软件数据使用
米妮爱分享·2021-04-18 01:09

盘点：普洱茶临沧区最著名的几个山头（地理位置、口感特色、生产形态和茶种）

茶树资源十分丰富，是云南省生物多样性最富集的区域之一，是古茶树遗产存量最大、最具代表性的地区之一。
茶者坞·2021-04-17 14:39

R语言可视化之ggplot2——GO富集分析

1.数据准备DAVID是一个可以做ID转换、富集分析等多种生信分析的综合数据库。
zrh_h·2021-04-15 10:27

几年过去了，现在这种简单而又烂大街的生信SCI还有期刊接收

几年前，这种下载GEO数据～差异分析～功能分析（GO富集分析、KEGG富集分析、PPI分析）～筛选hub基因～hub基因进行生存分析的生信发文套路非常火爆，文章相对比较好发。
SCI狂人团队·2021-04-15 05:06

董事长何演婷云享富集团旗下品质电商，女神专区献礼节目——旗袍秀《太湖美》。

图片发自App董事长何演婷云享富集团旗下品质电商，女神专区献礼节目——旗袍秀《太湖美》。图片发自App董事长何演婷云享富集团旗下品质电商，女神专区献礼节目——旗袍秀《太湖美》。
云享健·2021-04-14 09:36

比特币创造者中本聪最担心的事要发生了：比特币财富集中化

最近的比特币涨幅最高达42,000美元，主要是由机构投资者突然醒来并意识到该资产的长期价值潜力推动的，而他们的反应是立即购买，毕竟如果比特币最终流行起来，他们有朝一日就不必支付更高的价格。尽管寻求保护财富的富人也因为FOMO情绪一直在给加密货币投资者带来回报，但比特币和财富的持续集中可能会带来危险的后果，而该资产的创造者（中本聪）却一直在努力避免这种后果，这就是为什么机构购买浪潮可能没有表面上看起
块说财经·2021-04-13 15:52

已经做完GO enrichment,例如david结果, ggplot2可视化

有一些已经做完了GOenrichment,得到了结果，才发现很多软件都是直接给genelist做富集。
rapunzel0103·2021-04-13 03:51

画图专题 | 差异表达基因结果展示系列之柱状图

如何将好几张功能富集结果中的柱状图的横坐标的范围全部调整为一样的？
淇酱酱爱吃棒棒鸡·2021-04-13 00:45

几年过去了，现在这种简单而又烂大街的生信SCI还有期刊接收

几年前，这种下载GEO数据～差异分析～功能分析（GO富集分析、KEGG富集分析、PPI分析）～筛选hub基因～hub基因进行生存分析的生信发文套路非常火爆，文章相对比较好发。
Sc_RNA_seq·2021-04-13 00:20

单细胞转录组功能分析（超详细clusterProfiler,GSEA,GSVA分析）

单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异，因此，功能分析在单细胞分析中相当重要.功能分析的方法很多，这儿我们主要讲述3种功能分析方法，一是基于筛选的差异基因，采用超几何检验判断上调或下调基因在哪些GO或KEGG或其它定义的通路富集
清竹饮酒·2021-04-10 13:23

基因功能富集shiny

最近看Y叔的推送这个大神做了个shiny，某某某某某特用户：sangram_ksahu我们可以看到，这个功能还是比较强大的，支持1700+物种的功能富集，所以对于做一些非模式生物的同学，这将是一个福音我们可以从他的
小潤澤·2021-04-08 00:54

2021-03-23 GO富集分析气泡图

先在AgriGO进行差异基因的GO富集分析得到的txt结果文件的表头。用R进行画图，以下代码。
1f9e79f37c42·2021-03-23 23:26

如何优雅展示GO富集结果

图片好像加载不出来，可移步：https://blog.csdn.net/qq_38774801/article/details/114952565不知道分析过转录组的小伙伴有没有碰到过这样的问题：转录组后续做GO富集的时候
TOP生物信息·2021-03-17 23:44

ChIp-Seq,ATAC-seq, DAP-seq

简单原理：首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。
斩毛毛·2021-03-13 15:43

川西北高原的绿洲——若尔盖县

若尔盖县若尔盖县地域辽阔，资源富集，优势突出。旅游资源丰富而独特，既有黄河九曲第一湾、热尔大草原、纳摩神居峡、降扎温泉、国家级湿地自然保护区、省级铁布梅花鹿
18047607672·2021-03-11 18:41

连载 | 2.5 UNIT整体介绍

image上一节课我们介绍了需要搭建一个对话系统的五个步骤,这节课我们先来复习一下:1.我们需要定义对话系统；2.我们需要富集数据资源；3.我们需要搭建系统、训练、评价和调优；4.我们需要系统接入；5.
李佳芮_chatbot·2021-03-11 12:22

GO 与KEGG分析，调整坐标及其字体大小

1整理表格，使symbol转entrezid，利于后面的富集分析。
找兔子的小萝卜·2021-02-23 17:39

SPATA：基因集驱动的空间转录组分析框架

我们知道，高通量转录组数据分析落脚点往往是一个基因集，有了这个基因集我们可以富集出通路，查看调控关系等。以往的分析往往是用一种方法先得到一个基因集再
周运来就是我·2021-01-26 06:53

hive解决数据倾斜问题_数据倾斜原因和解决方法

数据分布正常的数据分布理论上都是倾斜的，就是我们所说的20-80原理：80%的财富集中在20%的人手中,80%的用户只使用20%的功能,20%的用户贡献了80%的访问量,不同的数据字段可能的数据倾斜一般有两种情况
蒋叶婷·2021-01-10 19:36

学习：StatQuest-Fisher’s Exact test

前言这次我们谈论下富集分析的检验，富集分析通常是来看我们感兴趣的内容知否在某个数据集中有富集富集分析算法这里引用大佬之前总结的：https://www.jianshu.com/p/988d90484f77
小潤澤·2021-01-09 12:15

宏转录组分析

所以现在的分析思路是：1#对rRNA部分进行taxonomy分析，阿尔法、beta分析2#对非rRNA部分（暂时就叫mRNA）,做功能注释、DEGs、富集分析,kegg，ko3#对每个样本病原体分析4#
蚂蚁爱吃饭·2021-01-06 19:44

转录组测序2-测序数据质控

RNAseq涉及到原始数据，数据质控，基因组比对，差异基因鉴定，差异基因功能富集分析，重要基因如转录因子激酶的靶基因预测等，我们用10讲的时间，全面讲解转录组测序报告，及在上百个项目中遇到的近百个常见问题
纪伟讲测序·2021-01-02 12:03

腾讯云 Serverless 应用初探 —— 印象笔记

印象笔记是最具影响力的知识管理工具，它既是管理个人信息的智能助手、同时也是提高团队效率的企业工具、富集高价值信息的内容平台、优秀知识和信息相关智能硬件的生产商。
Serverless·2020-12-17 00:19
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